; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh14G007060 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh14G007060
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionmucin-1-like
Genome locationCmo_Chr14:3637272..3637982
RNA-Seq ExpressionCmoCh14G007060
SyntenyCmoCh14G007060
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581073.1 hypothetical protein SDJN03_21075, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.6e-9193.2Show/hide
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XP_022934589.1 mucin-1-like [Cucurbita moschata]8.8e-98100Show/hide
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XP_022983389.1 mucin-1-like [Cucurbita maxima]1.9e-7681.78Show/hide
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        ADTPADTPA+TPAD PAASSESSPSP+ASAPTSPSEAPASNSPDSSPDSSPSVSPSP TDSPAASPADSGSPAASPDSDSSSPPSPTPDAADSPVADGPS
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        E DGP+            SDSPAD+PDGDADSGTS+LKLTSAAVCG  AVAVAGLFAF
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XP_023529000.1 classical arabinogalactan protein 6-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.9e-8587.21Show/hide
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        ADTPADTPAETP+DAPAASSESSPSPSASAPTSPSEAPASNSPDSSPDSSPSVSPSPATDSPAASPADSGSPAASPDSDSSSPPSPTPDAADSPVADGPS
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        EADGPSEADGP      ISDSPADSPDGDADSGTSALKLTSAAVCG  AVAVAGLFAF
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XP_031737954.1 classical arabinogalactan protein 11 [Cucumis sativus]1.0e-3256.18Show/hide
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        MASQ+ VLVFALIF+AAVAG FAEAPT +PS SP+PK++PSDSE+ SPSSS                   +PAG+P  +P  T                 
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          SPSP+AS+P+S S+AP SNSP SSP SSPSVSPSPATDSP+ SPA S SP              AASPDSD SSPPS  PDAAD+P ADGP+ ADGP+
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         ADGP+ ADG + +DSPADSP  D  SGT  LKLTSA V G VA  G FAF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LDP4 Uncharacterized protein2.4e-2453.56Show/hide
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        MASQ+ VLVFALIF+AAVAG FAEAPT +PS SP+PK++PSDSE+ SPSSS                   +PAG+P  +P  T                 
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          SPSP+AS+P+S S+AP SNSP SSP SSPSVSPSPATDSP+ SPA S SP              AASPDSD SSPPS  PDAAD+P ADGP+ ADGP+
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Query:  EADGPSEADG-TISDSP--ADSPDGDADSGTSALKLTSA
         ADGP+ ADG T +D P  AD P   AD  T+A   T+A
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A0A1S3BND1 mucin-11.7e-2554.25Show/hide
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        MASQS VLVFALIFVAAVAG FAEAPT +PS SP+PK++PSDSE+ SPSSS                                       +PA +P ASS
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        E +SPSP+AS+P +S S+AP S+SP SSP SSPSVSPSPATDSPA SPA + SP         AASPDSD SSPPS  PDAAD+P A           AD
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        GP  ADG  +DSPADSP GD  S  + LKLTSA V G +A AG +AF
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A0A5A7VIK3 Mucin-11.3e-2554.25Show/hide
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        MASQS VLVFALIFVAAVAG FAEAPT +PS SP+PK++PSDSE+ SPSSS                                       +PA +P ASS
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Query:  E-SSPSPSASAP-TSPSEAPASNSPDSSPDSSPSVSPSPATDSPAASPADSGSP---------AASPDSDSSSPPSPTPDAADSPVADGPSEADGPSEAD
        E +SPSP+AS+P +S S+AP S+SP SSP SSPSVSPSPATDSPA SPA + SP         AASPDSD SSPPS  PDAAD+P A           AD
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        GP  ADG  +DSPADSP GD  S  + LKLTSA V G +A AG +AF
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A0A6J1F318 mucin-1-like4.3e-98100Show/hide
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        ESSPSPSASAPTSPSEAPASNSPDSSPDSSPSVSPSPATDSPAASPADSGSPAASPDSDSSSPPSPTPDAADSPVADGPSEADGPSEADGPSEADGTISD
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        SPADSPDGDADSGTSALKLTSAAVCGAVAVAGLFAF
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A0A6J1J779 mucin-1-like9.3e-7781.78Show/hide
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        ADTPADTPA+TPAD PAASSESSPSP+ASAPTSPSEAPASNSPDSSPDSSPSVSPSP TDSPAASPADSGSPAASPDSDSSSPPSPTPDAADSPVADGPS
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Query:  EADGPSEADGPSEADGTISDSPADSPDGDADSGTSALKLTSAAVCG--AVAVAGLFAF
        E DGP+            SDSPAD+PDGDADSGTS+LKLTSAAVCG  AVAVAGLFAF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O10341 Uncharacterized 29.3 kDa protein2.7e-0440.91Show/hide
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        +PT TP+ SP P   P+ +   +P+ SP  +PA +P  TP+ T + TP+ TP  TP+ TP+ TP+ TP  +P  S   +PSP+ S   +PS  P + SP 
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Query:  SSPDSSPSVSPSPA-TDSPAASPADSGSPAASPDSDSSSPPSPTPDAADSPVAD
         SP  SP+ +PSP  + +P  SP  S +P  SP    + PPSPTP  + SP+ D
Subjt:  SSPDSSPSVSPSPA-TDSPAASPADSGSPAASPDSDSSSPPSPTPDAADSPVAD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTCAGTCTTTTGTTCTTGTTTTTGCTCTGATCTTCGTCGCCGCCGTCGCCGGAGCTTTTGCTGAGGCACCCACCGCCACCCCATCGGAATCCCCCGCGCCGAA
ATCCGCGCCTTCTGACTCCGAAGCGTCTTCTCCATCTTCATCTCCGGCTTCCTCTCCAGCGGATACTCCAGCGGACACTCCGGCGGATACTCCGGCAGATACTCCGGCAG
GTACACCGGCAGATACTCCGGCAGATACACCGGCAGATACTCCAGCGGAAACTCCGGCGGACGCTCCAGCGGCCTCATCTGAGTCGTCTCCATCCCCGTCAGCCTCTGCT
CCGACTTCGCCCTCCGAGGCTCCGGCGAGCAACTCGCCCGACAGCTCCCCGGATTCCTCCCCTTCCGTTTCTCCTTCTCCAGCCACCGACTCACCAGCTGCGTCTCCCGC
CGACTCCGGCTCCCCCGCTGCCTCGCCTGATTCCGATTCGTCTTCTCCCCCCTCTCCCACCCCCGACGCCGCCGATAGCCCCGTTGCTGATGGCCCTTCGGAGGCTGATG
GCCCTTCGGAGGCTGATGGCCCTTCGGAGGCTGATGGCACCATCTCTGATTCTCCGGCTGATTCACCCGACGGTGATGCCGACAGCGGCACTTCTGCTCTGAAACTCACC
TCCGCCGCCGTCTGTGGTGCCGTCGCCGTCGCCGGACTCTTTGCATTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCTCAGTCTTTTGTTCTTGTTTTTGCTCTGATCTTCGTCGCCGCCGTCGCCGGAGCTTTTGCTGAGGCACCCACCGCCACCCCATCGGAATCCCCCGCGCCGAA
ATCCGCGCCTTCTGACTCCGAAGCGTCTTCTCCATCTTCATCTCCGGCTTCCTCTCCAGCGGATACTCCAGCGGACACTCCGGCGGATACTCCGGCAGATACTCCGGCAG
GTACACCGGCAGATACTCCGGCAGATACACCGGCAGATACTCCAGCGGAAACTCCGGCGGACGCTCCAGCGGCCTCATCTGAGTCGTCTCCATCCCCGTCAGCCTCTGCT
CCGACTTCGCCCTCCGAGGCTCCGGCGAGCAACTCGCCCGACAGCTCCCCGGATTCCTCCCCTTCCGTTTCTCCTTCTCCAGCCACCGACTCACCAGCTGCGTCTCCCGC
CGACTCCGGCTCCCCCGCTGCCTCGCCTGATTCCGATTCGTCTTCTCCCCCCTCTCCCACCCCCGACGCCGCCGATAGCCCCGTTGCTGATGGCCCTTCGGAGGCTGATG
GCCCTTCGGAGGCTGATGGCCCTTCGGAGGCTGATGGCACCATCTCTGATTCTCCGGCTGATTCACCCGACGGTGATGCCGACAGCGGCACTTCTGCTCTGAAACTCACC
TCCGCCGCCGTCTGTGGTGCCGTCGCCGTCGCCGGACTCTTTGCATTCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASQSFVLVFALIFVAAVAGAFAEAPTATPSESPAPKSAPSDSEASSPSSSPASSPADTPADTPADTPADTPAGTPADTPADTPADTPAETPADAPAASSESSPSPSASA
PTSPSEAPASNSPDSSPDSSPSVSPSPATDSPAASPADSGSPAASPDSDSSSPPSPTPDAADSPVADGPSEADGPSEADGPSEADGTISDSPADSPDGDADSGTSALKLT
SAAVCGAVAVAGLFAF