CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh14G007980
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	transportin-3 isoform X1
Genome location	Cmo_Chr14:4082382..4098827
RNA-Seq Expression	CmoCh14G007980
Synteny	CmoCh14G007980
Gene Ontology terms	GO:0015074 - DNA integration (biological process) GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
InterPro domains	IPR011989 - Armadillo-like helical IPR016024 - Armadillo-type fold

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6581155.1 Transportin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.1e-294

99.81

Show/hide

Query:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
        MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
Subjt:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE

Query:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
        EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
Subjt:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML

Query:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
        EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
Subjt:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI

Query:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
        CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFAST SEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
Subjt:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS

Query:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
        NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
Subjt:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH

Query:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
        MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
Subjt:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI

XP_022934436.1 transportin-3 isoform X1 [Cucurbita moschata]

2.3e-295

100

Show/hide

Query:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
        MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
Subjt:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE

Query:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
        EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
Subjt:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML

Query:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
        EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
Subjt:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI

Query:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
        CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
Subjt:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS

Query:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
        NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
Subjt:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH

Query:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
        MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
Subjt:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI

XP_022934438.1 transportin-3 isoform X2 [Cucurbita moschata]

2.3e-295

100

Show/hide

Query:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
        MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
Subjt:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE

Query:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
        EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
Subjt:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML

Query:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
        EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
Subjt:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI

Query:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
        CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
Subjt:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS

Query:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
        NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
Subjt:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH

Query:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
        MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
Subjt:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI

XP_023526726.1 transportin-3 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

5.1e-295

99.81

Show/hide

Query:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
        MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
Subjt:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE

Query:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
        EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
Subjt:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML

Query:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
        EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
Subjt:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI

Query:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
        CDQEPDLVEAY+NFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
Subjt:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS

Query:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
        NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
Subjt:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH

Query:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
        MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
Subjt:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI

XP_023526727.1 transportin-3 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

5.1e-295

99.81

Show/hide

Query:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
        MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
Subjt:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE

Query:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
        EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
Subjt:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML

Query:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
        EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
Subjt:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI

Query:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
        CDQEPDLVEAY+NFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
Subjt:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS

Query:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
        NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
Subjt:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH

Query:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
        MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
Subjt:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BN70 transportin-3 isoform X1

1.2e-281

96.58

Show/hide

Query:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
        ML+ARPSNEIKG+MCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFE  NLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
Subjt:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE

Query:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
        EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNA SLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTE T DDPMFSLLIVFWPML
Subjt:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML

Query:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
        EKLLRCEHMENGNLS AACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYG HQEKFGHLFITTFERFTYAASV+AINSSYI
Subjt:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI

Query:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
        CDQEPDLVEAY+NFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
Subjt:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS

Query:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
        NILYALLGVSAMSRVHKCAT+LQQLAAICSVSERTDLK VLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDE + NYGH
Subjt:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH

Query:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNV
        MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNI N+
Subjt:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNV

A0A6J1F1T5 transportin-3 isoform X1

1.1e-295

100

Show/hide

Query:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
        MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
Subjt:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE

Query:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
        EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
Subjt:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML

Query:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
        EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
Subjt:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI

Query:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
        CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
Subjt:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS

Query:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
        NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
Subjt:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH

Query:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
        MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
Subjt:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI

A0A6J1F7N6 transportin-3 isoform X2

1.1e-295

100

Show/hide

Query:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
        MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
Subjt:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE

Query:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
        EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
Subjt:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML

Query:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
        EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
Subjt:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI

Query:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
        CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
Subjt:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS

Query:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
        NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
Subjt:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH

Query:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
        MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
Subjt:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI

A0A6J1J0X3 transportin-3 isoform X2

4.6e-294

99.24

Show/hide

Query:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
        MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
Subjt:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE

Query:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
        EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEH+PDDPMFSLLIVFWPML
Subjt:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML

Query:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
        EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVI+EEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
Subjt:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI

Query:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
        CDQEPDLVEAY+NFASIFLRCSHKEILAA GSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
Subjt:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS

Query:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
        NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
Subjt:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH

Query:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
        MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
Subjt:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI

A0A6J1J969 transportin-3 isoform X1

4.6e-294

99.24

Show/hide

Query:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
        MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE
Subjt:  MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDE

Query:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML
        EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEH+PDDPMFSLLIVFWPML
Subjt:  EEVVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPML

Query:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
        EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVI+EEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI
Subjt:  EKLLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYI

Query:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
        CDQEPDLVEAY+NFASIFLRCSHKEILAA GSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS
Subjt:  CDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVS

Query:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
        NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH
Subjt:  NILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGH

Query:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
        MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI
Subjt:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G12930.1 ARM repeat superfamily protein

1.0e-192

66.86

Show/hide

Query:  SARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDEEE
        S RPS+E+KG + +VYRSLA+VVGSY R IS F ++ARPLLLFLA GI+E + SHACA ALRKICEDA AVI E  NL+IL+WIGE LE+  L LEDEEE
Subjt:  SARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDEEE

Query:  VVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPMLEK
        V++A+++ILGSV NKEL++ LL +LLSSSY  + KLVDED   S RQ+PATYT++L+S  RGLYR+GTVFSHLATSL +    D P+ SLL VFWP+LEK
Subjt:  VVSAVSLILGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPMLEK

Query:  LLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYICD
        L R EHME+G+L+ AACRALS+A+QSSG+HF+ LLP VLDCLS NF+ F   ECYI+TA VI EE+  H+E++G LFITTFERFT A+S+  INSSYICD
Subjt:  LLRCEHMENGNLSTAACRALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYICD

Query:  QEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVSNI
        QEPDLVEAY NFAS  +R  HKE+L  SG+LLE+SF KAAICCTAMHRGAALAAMSYLS FL+VSL+SM+E  ++ S+GSF+ + + V+SH GEGL+SN+
Subjt:  QEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAASGSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVSNI

Query:  LYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNY--GH
        +YALLGV+AMSRVHKC+T+LQQLAAICS+ ERT  K +L W+SL GWL SAV ALP EYLK GE E++V  W +ALG A  DYLE+KSC+    N   GH
Subjt:  LYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAVLRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNY--GH

Query:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRN
        MQGK GR LKRLVR+FAD HRN
Subjt:  MQGKGGRVLKRLVREFADGHRN

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATGCTGTCTGCTAGACCGTCAAATGAGATTAAAGGAATAATGTGCCTTGTTTATAGATCCCTGGCAGAAGTTGTTGGGTCTTACTTTAGGTCAATATCTGCTTTTCACAC
TGATGCCAGACCCTTGTTATTATTTCTTGCTACTGGGATCACGGAATCTGTTTCTTCACATGCTTGTGCCTTCGCCCTCCGTAAAATTTGTGAAGATGCAACCGCTGTAA
TCTTTGAACTGCAAAATTTGGAAATTTTGATTTGGATCGGAGAGAGTCTGGAGAAGTTGCATTTACCTTTGGAGGACGAGGAAGAAGTAGTTAGTGCTGTAAGTTTGATT
CTTGGTTCAGTTCCTAATAAAGAACTGAAGAGCAACTTGTTGGCTAGACTGCTTTCATCAAGTTATGAAGCAATTGAGAAACTAGTTGATGAAGATAACGCACAATCTCT
GAGACAGAATCCTGCTACTTACACGAAAATCTTAACCTCCGCTGTGAGAGGCCTGTATAGGATGGGAACTGTATTTAGCCATCTAGCTACATCTTTGTCAACCGAGCATA
CTCCAGATGATCCTATGTTTTCTTTGTTGATAGTTTTTTGGCCAATGCTAGAGAAACTTCTAAGGTGTGAACACATGGAGAATGGTAATCTCTCTACGGCAGCTTGTCGT
GCGCTATCTCTAGCCATCCAGTCCTCAGGTCAACACTTTGTTACGTTGCTGCCAAAAGTCTTGGATTGCTTATCGACAAATTTTGTTTTGTTCCATGGTCATGAATGTTA
CATTAAAACAGCTTCAGTTATTGTTGAAGAATATGGCCATCATCAAGAAAAATTTGGGCATTTGTTTATCACCACTTTTGAAAGGTTTACTTATGCAGCATCCGTAAATG
CTATTAATTCGTCGTACATATGTGACCAAGAACCTGATTTGGTGGAGGCTTACTCAAATTTTGCATCAATTTTTCTCCGATGCTCTCATAAGGAAATATTAGCCGCATCT
GGTTCTCTTTTGGAGGTTTCATTCCAGAAGGCTGCTATATGTTGCACAGCCATGCATCGTGGGGCAGCATTAGCAGCAATGTCATACCTATCTTGTTTCTTGGATGTTAG
TCTAGCATCAATGTTAGAATTTGCTAGTACCAATTCTGAGGGATCATTCAATTCTATGGTAATACACGTTCTATCCCACAGCGGCGAGGGACTTGTATCAAACATTCTAT
ATGCTTTGCTTGGTGTGTCAGCAATGTCACGGGTTCATAAGTGTGCAACAGTTCTGCAACAGTTGGCAGCAATTTGCAGTGTCAGTGAAAGAACGGACTTGAAAGCTGTC
CTGCGCTGGGAATCTTTGCATGGCTGGCTACTATCAGCGGTGCAGGCTCTCCCACTTGAATATTTAAAACCAGGGGAAGTAGAAACTCTTGTACCACTATGGTTAAAGGC
GCTTGGAGATGCAGCCTGCGACTACCTTGAAAGTAAAAGTTGTGATGAATTAAAGACGAATTATGGACATATGCAAGGGAAGGGTGGAAGAGTCTTGAAGCGTCTAGTTC
GTGAATTTGCTGATGGTCACCGCAATATTCTTAATGTGATTTAATTGCTGAATGGCATCTATATAACATCATCATTAGAGGAGCCCCAGCTCATAGCTTTTCTGCTTATG
CCCCATTCTGTCGTTGGGCTTATTTGGCAGCTGAAAGTTCAGGCTGGTTTGGAAGCTTCGGTCAATCCTGGGCAATGTCCTGCATAAATTATGAACATCCTCTTCTTTTT
TTTTCCTTTTTTTCTTCCTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTGTACAGTGCTGTATTTCAATTTTGTAAGATCACCAAATGTTGAAATTTGTTCATATCATTCATTCTT
TTTGCCTCTCAAGCTCAGGTCTGATCGTTATGGCTATTGGAGATGATTAAGTAGTAATGTGTTATAGTTACTTCTTCGCTGCTCGTTGATCGTGGGATAGGCGTATAAGC
TATACTTTGCACTCTCGAGGGACGAAAAGATGAACCAAAACCTCATTATTTATTGGTAAGGAAAGCCTCGTAGAAGCTAAATACTATACCATACCAAGATTTGAAGAATT
CCTTGGATGAAAGCAGCCTGTTGGTGATGGAAAAAGGCCCTATATTGATCGTGCAAGGATACAAATAATAGCTACTGTATAAGGATTACCAGTAAAGGATAGAGTATAAG
TATCCTTTCAAGCATTACTTCTTTTCAGTGTTCAGAAGGTGAATGACTCATTTTTTGGCTGTAAACTAGATGCCAAT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MLSARPSNEIKGIMCLVYRSLAEVVGSYFRSISAFHTDARPLLLFLATGITESVSSHACAFALRKICEDATAVIFELQNLEILIWIGESLEKLHLPLEDEEEVVSAVSLI
LGSVPNKELKSNLLARLLSSSYEAIEKLVDEDNAQSLRQNPATYTKILTSAVRGLYRMGTVFSHLATSLSTEHTPDDPMFSLLIVFWPMLEKLLRCEHMENGNLSTAACR
ALSLAIQSSGQHFVTLLPKVLDCLSTNFVLFHGHECYIKTASVIVEEYGHHQEKFGHLFITTFERFTYAASVNAINSSYICDQEPDLVEAYSNFASIFLRCSHKEILAAS
GSLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYLSCFLDVSLASMLEFASTNSEGSFNSMVIHVLSHSGEGLVSNILYALLGVSAMSRVHKCATVLQQLAAICSVSERTDLKAV
LRWESLHGWLLSAVQALPLEYLKPGEVETLVPLWLKALGDAACDYLESKSCDELKTNYGHMQGKGGRVLKRLVREFADGHRNILNVI

CmoCh14G007980 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome