| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6581189.1 THO complex subunit 4C, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 3.9e-143 | 92.63 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGG+AVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Query: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWS--------RGLGGGGGRGLGGGGRGRGR--------GSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDK
TSESGRTGSS+AVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWS RGLGGGGGRGLGGGGRGRGR GSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDK
Subjt: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWS--------RGLGGGGGRGLGGGGRGRGR--------GSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDK
Query: ELENYHAEAMQT
ELENYHAEAMQT
Subjt: ELENYHAEAMQT
|
|
| XP_022935328.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita moschata] | 1.1e-148 | 98.31 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Query: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
Subjt: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima] | 1.6e-141 | 93.51 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Query: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGG--------GRGRGR----GSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELEN
TSESGRTGSS+AVNPFPGPSHRGGLRS GRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGG GRGRGR GSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELEN
Subjt: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGG--------GRGRGR----GSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELEN
Query: YHAEAMQT
YHAEAMQT
Subjt: YHAEAMQT
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 6.8e-148 | 97.97 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Query: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
TSESGRTGSS+AVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
Subjt: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida] | 1.6e-128 | 88.18 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
MATPLDMSLEDVIKK+NREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VV+GSVRRGPLGINAR SA+SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
YVSNLDYGV+KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDG+PMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Query: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
T ESGRT SS+ VNPFPGPSHRGGLR+ GRGRGRGGW+RG G GG GGGGRGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 2.3e-125 | 86.15 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI K + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKL
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVL
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Query: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
T ESGR + + VNPFPGPSHRGGLR+ RGRGRG W+RG+G GG GGGRGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A5D3BPA9 THO complex subunit 4D | 3.8e-96 | 82.76 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKL---------------------------MK
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KASFKL MK
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKL---------------------------MK
Query: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
NVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
Subjt: NVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
Query: GDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTSESG
GDNA+ PVSARINVTG NGR+RRTVVLT SG
Subjt: GDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTSESG
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 4.8e-123 | 86.15 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL IN RPSAFSISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNA+ PVSARINVTG+NGRSRRTVVL
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Query: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
TSESGRT SS VN FPGPS+RG L RGRGRGRGGWSR G+G GGGRGRGR GRGRG GRKK VEKSS ELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 5.1e-149 | 98.31 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Query: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
Subjt: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 7.9e-142 | 93.51 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISK + MKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRRTVVL
Query: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGG--------GRGRGR----GSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELEN
TSESGRTGSS+AVNPFPGPSHRGGLRS GRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGG GRGRGR GSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELEN
Subjt: TSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGG--------GRGRGR----GSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELEN
Query: YHAEAMQT
YHAEAMQT
Subjt: YHAEAMQT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O08583 THO complex subunit 4 | 2.1e-30 | 35.88 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSIS-------KASFKLMKNV--QWQHDLFEDSLRASGI
MA +DMSL+D+IK N ++ G RGR GG V RG + RP+ + A + K + +WQHDLF+ G
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSIS-------KASFKLMKNV--QWQHDLFEDSLRASGI
Query: SGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVN
+G+E G KL VSNLD+GV+ DI+ELF+E G LK+ A+HYD++GR G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+PM I+++ DT
Subjt: SGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVN
Query: GRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRG-RGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYH
RR + ++N RGG+ RG G G GGGG RG RG GRGRG GR + S+ ELD +L+ Y+
Subjt: GRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRG-RGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYH
Query: A
A
Subjt: A
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 8.0e-67 | 55.48 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTK
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGR G RRGPL +NARPS+F+I+K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--ADTPVSAR--INVTGVNGRSR
L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N ++ P+S R +NVTG+NGR +
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--ADTPVSAR--INVTGVNGRSR
Query: RTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGW-SRGL-----GGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGR---KKPVEKSSAELDKEL
RTVV+ G RG +R GRG GRG SR L GGG RG GG R RGRG+G GRGRG GR KKPVEKS+A+LDK+L
Subjt: RTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGW-SRGL-----GGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGR---KKPVEKSSAELDKEL
Query: ENYHAEAMQT
E+YHA+AM T
Subjt: ENYHAEAMQT
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 9.3e-39 | 43.87 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS---------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G RR + AR + +S + + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS---------
Query: -GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVT
G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P +
Subjt: -GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVT
Query: GVNGRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGW-SRGLGGGGGRGLGGGGRG-RGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKEL
+ + + +E+ F G + G +G RGRGRGG+ R GGG G G GGRG RGRG GRG G GR + S+ +LD EL
Subjt: GVNGRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGW-SRGLGGGGGRGLGGGGRG-RGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKEL
Query: ENYHAEAMQT
+ YH EAM+T
Subjt: ENYHAEAMQT
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 2.1e-38 | 42.19 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEI
M+T LDMSL+D+I KN ++RG A RG G G + R P + R + + +KA W HD+F ED +GIE
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEI
Query: GTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRR
GTKLY+SNLDYGV EDI+ELF+E+G+LKR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMKIE++G N T
Subjt: GTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVTGVNGRSRR
Query: TVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAE-LDKELENYHAEAMQ
+ SGR + ++ G RG G+GRGG RG GG GG G GGGGRGR G G P EK SAE LD +L+ YH+ M+
Subjt: TVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAE-LDKELENYHAEAMQ
Query: T
T
Subjt: T
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 4.9e-64 | 53.35 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---YNGGRAVVIGSVRRGPLGINARP-SAFSISKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRA
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGR G VRRGPL +N RP S+FSI+K + + +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---YNGGRAVVIGSVRRGPLGINARP-SAFSISKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRA
Query: SGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADT-PVSARINV
G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N ++ PV+AR+NV
Subjt: SGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADT-PVSARINV
Query: TGVNGRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGL---GGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGR---GQGRKKPVEKSSAE
TG+NGR +R+V F G RGG R GRGRG G G L GG GG RGRGRG+G GRG G+G KKPVEKS+A+
Subjt: TGVNGRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGL---GGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGR---GQGRKKPVEKSSAE
Query: LDKELENYHAEAM
LDK+LE+YHAEAM
Subjt: LDKELENYHAEAM
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.5e-65 | 53.35 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---YNGGRAVVIGSVRRGPLGINARP-SAFSISKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRA
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGR G VRRGPL +N RP S+FSI+K + + +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---YNGGRAVVIGSVRRGPLGINARP-SAFSISKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRA
Query: SGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADT-PVSARINV
G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N ++ PV+AR+NV
Subjt: SGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADT-PVSARINV
Query: TGVNGRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGL---GGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGR---GQGRKKPVEKSSAE
TG+NGR +R+V F G RGG R GRGRG G G L GG GG RGRGRG+G GRG G+G KKPVEKS+A+
Subjt: TGVNGRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGL---GGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGR---GQGRKKPVEKSSAE
Query: LDKELENYHAEAM
LDK+LE+YHAEAM
Subjt: LDKELENYHAEAM
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.5e-65 | 53.35 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---YNGGRAVVIGSVRRGPLGINARP-SAFSISKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRA
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGR G VRRGPL +N RP S+FSI+K + + +++ W Q+DL+E++LRA
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---YNGGRAVVIGSVRRGPLGINARP-SAFSISKASFKLMKNVQW--QHDLFEDSLRA
Query: SGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADT-PVSARINV
G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N ++ PV+AR+NV
Subjt: SGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADT-PVSARINV
Query: TGVNGRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGL---GGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGR---GQGRKKPVEKSSAE
TG+NGR +R+V F G RGG R GRGRG G G L GG GG RGRGRG+G GRG G+G KKPVEKS+A+
Subjt: TGVNGRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGL---GGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGR---GQGRKKPVEKSSAE
Query: LDKELENYHAEAM
LDK+LE+YHAEAM
Subjt: LDKELENYHAEAM
|
|
| AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.6e-40 | 43.87 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS---------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G RR + AR + +S + + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLF--EDSLRAS---------
Query: -GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVT
G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P +
Subjt: -GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNADTPVSARINVT
Query: GVNGRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGW-SRGLGGGGGRGLGGGGRG-RGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKEL
+ + + +E+ F G + G +G RGRGRGG+ R GGG G G GGRG RGRG GRG G GR + S+ +LD EL
Subjt: GVNGRSRRTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGW-SRGLGGGGGRGLGGGGRG-RGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKEL
Query: ENYHAEAMQT
+ YH EAM+T
Subjt: ENYHAEAMQT
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 5.7e-68 | 55.48 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTK
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGR G RRGPL +NARPS+F+I+K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--ADTPVSAR--INVTGVNGRSR
L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N ++ P+S R +NVTG+NGR +
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--ADTPVSAR--INVTGVNGRSR
Query: RTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGW-SRGL-----GGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGR---KKPVEKSSAELDKEL
RTVV+ G RG +R GRG GRG SR L GGG RG GG R RGRG+G GRGRG GR KKPVEKS+A+LDK+L
Subjt: RTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGW-SRGL-----GGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGR---KKPVEKSSAELDKEL
Query: ENYHAEAMQT
E+YHA+AM T
Subjt: ENYHAEAMQT
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 6.1e-70 | 54.49 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTK
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGR G RRGPL +NARPS+F+I+K + ++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSYNGGRAVVIGSVRRGPLGINARPSAFSISKASFKLMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTK
Query: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--ADTPVSAR--INVTGVNGRSR
L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N ++ P+S R +NVTG+NGR +
Subjt: LYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--ADTPVSAR--INVTGVNGRSR
Query: RTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQ
RTVV+ GR G P P S R + + +G GG G GG RG G GGRGRG G G+G KKPVEKS+A+LDK+LE+YHA+AM
Subjt: RTVVLTSESGRTGSSHAVNPFPGPSHRGGLRSGRGRGRGRGGWSRGLGGGGGRGLGGGGRGRGRGSGSGRGRGQGRKKPVEKSSAELDKELENYHAEAMQ
Query: T
T
Subjt: T
|
|
