; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh14G009780 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh14G009780
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationCmo_Chr14:5235919..5236716
RNA-Seq ExpressionCmoCh14G009780
SyntenyCmoCh14G009780
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581321.1 Chlorophyll a-b binding protein 3C, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.6e-15099.62Show/hide
Query:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MATMALSSTFTGKAIPLN PTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_008447450.1 PREDICTED: chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucumis melo]2.6e-14695.85Show/hide
Query:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MA MALSSTFTGK +PLNAPTE+SSSVRSN R+SMR+SGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGV FGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_022934504.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucurbita moschata]2.9e-150100Show/hide
Query:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_022983188.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucurbita maxima]5.0e-15099.62Show/hide
Query:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MATMALSSTFTGKAIPLNAPTE+SSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_038903667.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Benincasa hispida]3.0e-14797.36Show/hide
Query:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MA MALSSTFTGKA+PLNAPTE+SSSVRSN RVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BHH5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.2e-14695.85Show/hide
Query:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MA MALSSTFTGK +PLNAPTE+SSSVRSN R+SMR+SGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGV FGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A5D3DAB9 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.2e-14695.85Show/hide
Query:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MA MALSSTFTGK +PLNAPTE+SSSVRSN R+SMR+SGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGV FGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1F2S5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.4e-150100Show/hide
Query:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1GAK0 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic8.1e-14695.47Show/hide
Query:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MA MALSSTFTGKA+PLNAPTE+ SSVRSN RVSMR+SGKPA+SSGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1J722 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic2.4e-15099.62Show/hide
Query:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MATMALSSTFTGKAIPLNAPTE+SSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07369 Chlorophyll a-b binding protein 3C, chloroplastic4.1e-13186.52Show/hide
Query:  ATMAL-SSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPA--ASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        +TMAL SSTF GKA+ L+     SS +  N RV+MR++   A  ASSGSPWYGPDRVKYLGP SGE PSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
Subjt:  ATMAL-SSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPA--ASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        VIH RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV DP+YPGGSFDPLG
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LADDPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P08221 Chlorophyll a-b binding protein of LHCII type I, chloroplastic (Fragment)1.1e-13187.64Show/hide
Query:  TFTGKAIPL--NAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAM
        T  G+A+ L  NAP      ++ N++ +MR++   + SSGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAM
Subjt:  TFTGKAIPL--NAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAM

Query:  LGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAF
        LGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAF
Subjt:  LGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAF

Query:  AELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        AELKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  AELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P09756 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic1.6e-13086.79Show/hide
Query:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        ++MALSS +  GKA+      ++  S     RVSMR++     SSGSPWYGPDRVKYLGP SGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLA PVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P12330 Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic7.1e-13186.14Show/hide
Query:  ATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSG---KPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        ATMALSS    +A P       SS++   +R++MR++    KPAASSGSPWYG DRV YLGPLSGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
Subjt:  ATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSG---KPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        VIHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGEV DP+YPGG+FDPLG
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LADDPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P27497 Chlorophyll a-b binding protein M9, chloroplastic4.9e-13286.19Show/hide
Query:  ATMALSST-FTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRS---GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL
        +TMALSST F GKA+       + SS+   +RV+MR++    KPAASSGSPWYGPDRV YLGPLSGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL
Subjt:  ATMALSST-FTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRS---GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL

Query:  EVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPL
        EVIHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWA QVVLMGA+EGYR+AGGPLGEV DP+YPGG+FDPL
Subjt:  EVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        GLADDPEAFA++KVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29910.1 chlorophyll A/B binding protein 39.2e-12682.77Show/hide
Query:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        +TMALSS  F GKA+ L   +  +S V  + RV+MR++  KP   SGSPWYG DRVKYLGP SGE PSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT1G29920.1 chlorophyll A/B-binding protein 29.2e-12682.77Show/hide
Query:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        +TMALSS  F GKA+ L   +  +S V  + RV+MR++  KP   SGSPWYG DRVKYLGP SGE PSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT1G29930.1 chlorophyll A/B binding protein 17.0e-12682.77Show/hide
Query:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        +TMALSS  F GKA+ L   +  +S V  + RV+MR++  KP   SGSPWYG DRVKYLGP SGE PSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B23.2e-12683.15Show/hide
Query:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        +TMALSS  F GKA+        +S V  + RV+MR++  KP   SGSPWYG DRVKYLGP SGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRS-GKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34430.1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B14.4e-12883.46Show/hide
Query:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        +TMALSS   TGKA+ L   +  +S V    R++MR++ KP   SGSPWYG DRVKYLGP SGEPPSYL GEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEVI
Subjt:  ATMALSS-TFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLGL
        HSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLGL
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        A DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFG+FVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAACCATGGCTCTTTCATCTACATTCACCGGAAAGGCTATTCCTTTGAACGCACCAACTGAGATCTCATCCTCGGTTCGCAGCAACAGTAGAGTCTCAATGAGGAG
ATCTGGAAAGCCAGCAGCTTCCTCTGGCAGCCCATGGTACGGTCCCGACCGTGTCAAGTACCTTGGACCACTGTCTGGTGAGCCACCATCTTACCTCAAAGGAGAGTTCC
CTGGTGACTATGGTTGGGACACTGCAGGTCTATCAGCTGATCCCGAGACCTTTGCCAAGAACCGAGAGCTGGAAGTGATTCACAGCAGATGGGCCATGCTTGGAGCTCTA
GGATGTGTATTCCCAGAGCTTCTTTCCAGAAATGGAGTCAAGTTTGGTGAAGCAGTTTGGTTCAAGGCTGGTTCACAAATCTTCAGTGAGGGTGGCCTAGACTATCTTGG
AAACCCAAGTCTTATTCACGCACAGAGCATTTTGGCCATTTGGGCATCTCAAGTAGTGCTAATGGGTGCAGTTGAAGGTTACCGTATTGCTGGAGGACCACTTGGAGAAG
TTACCGATCCCATCTACCCCGGCGGTAGCTTTGATCCCCTCGGGCTGGCTGACGATCCCGAGGCGTTTGCAGAGCTTAAGGTTAAAGAACTCAAGAACGGCCGTCTTGCA
ATGTTTTCCATGTTCGGATATTTTGTACAGGCCATTGTAACAGGAAAAGGTCCTTTGGAGAACCTCGCAGATCATCTTGCAGATCCTGTCAACAACAATGCATGGGCTTA
TGCTACCAACTTCGTCCCTGGGAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAACCATGGCTCTTTCATCTACATTCACCGGAAAGGCTATTCCTTTGAACGCACCAACTGAGATCTCATCCTCGGTTCGCAGCAACAGTAGAGTCTCAATGAGGAG
ATCTGGAAAGCCAGCAGCTTCCTCTGGCAGCCCATGGTACGGTCCCGACCGTGTCAAGTACCTTGGACCACTGTCTGGTGAGCCACCATCTTACCTCAAAGGAGAGTTCC
CTGGTGACTATGGTTGGGACACTGCAGGTCTATCAGCTGATCCCGAGACCTTTGCCAAGAACCGAGAGCTGGAAGTGATTCACAGCAGATGGGCCATGCTTGGAGCTCTA
GGATGTGTATTCCCAGAGCTTCTTTCCAGAAATGGAGTCAAGTTTGGTGAAGCAGTTTGGTTCAAGGCTGGTTCACAAATCTTCAGTGAGGGTGGCCTAGACTATCTTGG
AAACCCAAGTCTTATTCACGCACAGAGCATTTTGGCCATTTGGGCATCTCAAGTAGTGCTAATGGGTGCAGTTGAAGGTTACCGTATTGCTGGAGGACCACTTGGAGAAG
TTACCGATCCCATCTACCCCGGCGGTAGCTTTGATCCCCTCGGGCTGGCTGACGATCCCGAGGCGTTTGCAGAGCTTAAGGTTAAAGAACTCAAGAACGGCCGTCTTGCA
ATGTTTTCCATGTTCGGATATTTTGTACAGGCCATTGTAACAGGAAAAGGTCCTTTGGAGAACCTCGCAGATCATCTTGCAGATCCTGTCAACAACAATGCATGGGCTTA
TGCTACCAACTTCGTCCCTGGGAAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATMALSSTFTGKAIPLNAPTEISSSVRSNSRVSMRRSGKPAASSGSPWYGPDRVKYLGPLSGEPPSYLKGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGAL
GCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLA
MFSMFGYFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK