; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh14G011470 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh14G011470
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationCmo_Chr14:8601531..8612764
RNA-Seq ExpressionCmoCh14G011470
SyntenyCmoCh14G011470
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581683.1 Tryptophan synthase alpha chain, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.8e-15287.99Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRAL RETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGV+GLVVPDVPLEETAVLREEAVK NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKE------------------------------------VTEKPVAVGFGISKPE
        TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSS+GVTGARTSVSGRVQSLLEEIKE                                    VTEKPVAVGFGISKPE
Subjt:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKE------------------------------------VTEKPVAVGFGISKPE

Query:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGL
        HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGL
Subjt:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGL

XP_008465320.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]1.6e-15088.78Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR LPLNKIP T I SPRPC ISV Q+KRFAP+AAL A P  GLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEET VLR+EAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK IVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVSGRVQ+LLEE+KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ETFTKSLRSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ETFTKSLRSALS

XP_022932801.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita moschata]2.4e-167100Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ETFTKSLRSALS
        ETFTKSLRSALS
Subjt:  ETFTKSLRSALS

XP_023528646.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-16699.36Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRAL RETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ETFTKSLRSALS
        ETFTKSL+SALS
Subjt:  ETFTKSLRSALS

XP_038906368.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Benincasa hispida]2.6e-15088.78Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        M IAFKSS F PLNKIP++ I SPRPC ISVF+SKRFAP+A L ASP  GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYN ILKRGIENF+M I+DAGVRGLVVPDVPLEET +LR+EAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMK+I EASEGFVYLVSSVGVTG RTSVSGRVQ+LLEE+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ETFTKSLRSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ETFTKSLRSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD81 Tryptophan synthase9.2e-14988.14Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LPLNKIP T I SPRPC ISV QSKRFAP+AAL A P  GLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELS P+SLF+YYNPILKRG+ENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEET VLR+EAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMKNIVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVS RVQ+LLEE+KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ETFTKSLRSALS
        E FT+SL+SALS
Subjt:  ETFTKSLRSALS

A0A1S3CNL8 Tryptophan synthase7.5e-15188.78Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR LPLNKIP T I SPRPC ISV Q+KRFAP+AAL A P  GLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEET VLR+EAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK IVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVSGRVQ+LLEE+KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ETFTKSLRSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ETFTKSLRSALS

A0A5D3E2H9 Tryptophan synthase7.5e-15188.78Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFK SR LPLNKIP T I SPRPC ISV Q+KRFAP+AAL A P  GLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATR+LARETNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFMM I+D GVRGLVVPDVPLEET VLR+EAVK+NIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPK+RMK IVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVSGRVQ+LLEE+KEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ETFTKSLRSALS
        E FTKSL+SALS
Subjt:  ETFTKSLRSALS

A0A6J1DQS1 Tryptophan synthase1.7e-15089.46Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALT-ASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGV
        MD+AFKSS+ LPLNK+P+  I  P PCTISV QSKR AP+AALT ASPA GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALT-ASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAA TR+LAR+TNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTI+DAGVRGL+VPDVP EET +LR+EAVKYNIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE
        TTPTTPKDRMK+IVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQ+LL EIKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADG+IVGSAMVKLLGEAQS EEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKE

Query:  LETFTKSLRSALS
        LE FTKSL+SALS
Subjt:  LETFTKSLRSALS

A0A6J1EXE2 Tryptophan synthase1.2e-167100Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
        MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
        TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL
Subjt:  TPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKEL

Query:  ETFTKSLRSALS
        ETFTKSLRSALS
Subjt:  ETFTKSLRSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B0C6F8 Tryptophan synthase alpha chain5.7e-7955.56Show/hide
Query:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYN
        +S+ F +LR++G+ ALIP++TAGDPDL+TTA AL+ L   G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATRAL R T  + ++ M+  + PE+  P+ LF+YYN
Subjt:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYN

Query:  PILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVT
        PI  RG+  F+  I  AGVRGLVVPD+PLEE+  L ++A    IE+ LL  PT+ K+R++ I   S+GF+YLVS+ GVTG RT V  RVQ L+ ++++VT
Subjt:  PILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVT

Query:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELETFTKSLRSAL
        +KP+ VGFGIS+ EH +QV  WGAD  IVGSA V  L E  SP +GL  + TF +SL+S+L
Subjt:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELETFTKSLRSAL

B8HPH2 Tryptophan synthase alpha chain1.6e-7856.11Show/hide
Query:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYN
        +S  F+ LR++ + ALIP+ITAGDP L  TA+AL+VL   G+D+IELGVPYSDPLADGP IQAAATRAL + T  +A++ M+  V P L  P+ LF+YYN
Subjt:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYN

Query:  PILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVT
        PI  RG+E F+  +  AGV+GLVVPD+PLEE   +  +A    IEL LL  PTTP+ R+  I E S+GF+YLVS+ GVTG R+ V GRV  LL E+++VT
Subjt:  PILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVT

Query:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELETFTKSLRSALS
        +KP+ VGFGIS+PEH +QV  WGAD  IVGSA VK L E  +PE+GL  +  F +SL++AL+
Subjt:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELETFTKSLRSALS

O22765 Tryptophan synthase alpha chain1.3e-11578.36Show/hide
Query:  TASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPV
        T S   GLSETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA R+L + TNFN+IISMLK VIP+LSCP+
Subjt:  TASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPV

Query:  SLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLL
        +LF+YYNPIL+RG+EN+M  I++AGV GL+VPDVPLEET  LR EA K+ IELVLLTTPTTPK+RM  IVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV+ +VQSLL
Subjt:  SLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLL

Query:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELETFTKSLRSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGVIVGSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FTKSL+SAL
Subjt:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELETFTKSLRSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic6.9e-8555.41Show/hide
Query:  IPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAA
        +P     +P P  +   Q+      AA     +  +S+T   L  +GK A IPYITAGDPDL+TTAEAL++L  CG+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+ 
Subjt:  IPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAA

Query:  TRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIVEA
         RALA  T  +A++ ML+ V PELSCPV L SYY PI+ R +      +++AGV GL+VPD+P      L  EA   N+ELVLLTTP  P+DRMK I +A
Subjt:  TRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIVEA

Query:  SEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELETFTKSLRSAL
        SEGFVYLVS  GVTG R +V+ RV+SL++E+K+VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADGVI+GSAMV+ LGEA SP++GL+ LE + + +++AL
Subjt:  SEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELETFTKSLRSAL

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic1.6e-11871.75Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFL---PLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAAL-TASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIE
        M IAFKS  F    P ++I   R  SP   ++S    KRF P+A+L T+SP  GL++TF +L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIE
Subjt:  MDIAFKSSRFL---PLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAAL-TASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIE

Query:  LGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIEL
        LGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L R TN ++I+ ML  V+P++SCP+SLF+YYNPILKRG+  FM +IR  GV+GLVVPDVPLEET +LR+EA+  +IEL
Subjt:  LGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIEL

Query:  VLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEG
        VLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS+GVTGAR+SVSG+VQSLL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+AGWGADGVIVGSAMVKLLG+A+SP EG
Subjt:  VLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEG

Query:  LKELETFTKSLRSAL
        LKELE  TKSL+SAL
Subjt:  LKELETFTKSLRSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain1.2e-11971.75Show/hide
Query:  MDIAFKSSRFL---PLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAAL-TASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIE
        M IAFKS  F    P ++I   R  SP   ++S    KRF P+A+L T+SP  GL++TF +L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIE
Subjt:  MDIAFKSSRFL---PLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAAL-TASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIE

Query:  LGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIEL
        LGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L R TN ++I+ ML  V+P++SCP+SLF+YYNPILKRG+  FM +IR  GV+GLVVPDVPLEET +LR+EA+  +IEL
Subjt:  LGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIEL

Query:  VLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEG
        VLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS+GVTGAR+SVSG+VQSLL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+AGWGADGVIVGSAMVKLLG+A+SP EG
Subjt:  VLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEG

Query:  LKELETFTKSLRSAL
        LKELE  TKSL+SAL
Subjt:  LKELETFTKSLRSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein9.2e-11778.36Show/hide
Query:  TASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPV
        T S   GLSETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA R+L + TNFN+IISMLK VIP+LSCP+
Subjt:  TASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPV

Query:  SLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLL
        +LF+YYNPIL+RG+EN+M  I++AGV GL+VPDVPLEET  LR EA K+ IELVLLTTPTTPK+RM  IVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV+ +VQSLL
Subjt:  SLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLL

Query:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELETFTKSLRSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGVIVGSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FTKSL+SAL
Subjt:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELETFTKSLRSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATATTGCTTTCAAATCTTCGAGGTTTCTTCCCCTCAACAAGATACCCACTACGCGCATCGTTTCCCCACGTCCTTGTACCATTTCCGTCTTCCAATCCAAGCGCTT
TGCTCCGATTGCGGCCCTTACAGCCTCCCCTGCAGCTGGATTGTCCGAAACATTCAACAAATTGAGAGAGCAGGGCAAGGTCGCATTGATCCCCTACATCACTGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCAACCACGGCTGAGGCATTGAAGGTGCTTTCCACCTGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGGGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCGGTT
ATACAGGCTGCAGCCACTCGGGCCTTGGCTAGGGAGACAAACTTTAATGCAATCATTTCTATGCTGAAGGGGGTAATTCCTGAACTATCTTGTCCAGTTTCCCTTTTTTC
GTATTACAACCCTATTCTTAAACGTGGCATTGAGAACTTCATGATGACAATTAGAGATGCTGGGGTACGAGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGCAG
TTTTGAGAGAGGAAGCTGTGAAGTACAATATTGAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCAAAAGATAGGATGAAAAACATCGTTGAAGCTTCAGAAGGATTTGTA
TATCTTGTGAGCTCTGTTGGAGTTACAGGTGCCCGCACATCAGTAAGTGGTAGAGTTCAATCTCTCCTTGAGGAAATTAAAGAGGTTACGGAAAAACCAGTAGCAGTTGG
TTTTGGTATATCGAAACCCGAGCACGTGAAACAGGTGGCTGGCTGGGGGGCAGATGGTGTTATTGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAGTCCCCTG
AGGAGGGTTTGAAGGAGCTTGAAACCTTCACCAAATCCTTAAGATCTGCACTCTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CATTCTGCCGCCATTCTTTTAGCCTCTGGTTTTCGAAAACTTGTCGATACAACAACGCAACACTGCTTGTTCTTGGCAACTACAGCGGTGTAAACCAAATAAAAAACCGA
AACTCCATTGACAATCTGAAATTCCACCAAACCCCTCTTTAACAAATGGATATTGCTTTCAAATCTTCGAGGTTTCTTCCCCTCAACAAGATACCCACTACGCGCATCGT
TTCCCCACGTCCTTGTACCATTTCCGTCTTCCAATCCAAGCGCTTTGCTCCGATTGCGGCCCTTACAGCCTCCCCTGCAGCTGGATTGTCCGAAACATTCAACAAATTGA
GAGAGCAGGGCAAGGTCGCATTGATCCCCTACATCACTGCTGGTGATCCTGATCTTTCAACCACGGCTGAGGCATTGAAGGTGCTTTCCACCTGTGGATCAGATATAATT
GAACTTGGGGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCGGTTATACAGGCTGCAGCCACTCGGGCCTTGGCTAGGGAGACAAACTTTAATGCAATCATTTCTATGCT
GAAGGGGGTAATTCCTGAACTATCTTGTCCAGTTTCCCTTTTTTCGTATTACAACCCTATTCTTAAACGTGGCATTGAGAACTTCATGATGACAATTAGAGATGCTGGGG
TACGAGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGCAGTTTTGAGAGAGGAAGCTGTGAAGTACAATATTGAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCA
AAAGATAGGATGAAAAACATCGTTGAAGCTTCAGAAGGATTTGTATATCTTGTGAGCTCTGTTGGAGTTACAGGTGCCCGCACATCAGTAAGTGGTAGAGTTCAATCTCT
CCTTGAGGAAATTAAAGAGGTTACGGAAAAACCAGTAGCAGTTGGTTTTGGTATATCGAAACCCGAGCACGTGAAACAGGTGGCTGGCTGGGGGGCAGATGGTGTTATTG
TTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAGTCCCCTGAGGAGGGTTTGAAGGAGCTTGAAACCTTCACCAAATCCTTAAGATCTGCACTCTCTTGATTGAAT
AACGGAGGGCTGTTTCTTTCATCTATAAACAGATCGAGTGTGTGCGTTGTTATGCGATCCCAACAACTGGTATCGATCCCCAACACCCCTTCCCACATCAGAAAAACCCC
GCCTAGCACCCAAATCGCCGCCGCGAGGGAACGCCATCGTCATTGCCAGATCCGACATCAAAAGGATTTAAACGCTTACATAGGAAGAAGGCTCAGTTCGAGGGGAGTCG
GACTGACGTTGATTAGGAAAGGCCAAGAAAGCAGATCCTCTAGTAAGGGACATGCCTATTGAAACTAAACGTTTTGTTTTTTTGAAAAATGGGTCAAACATAATTGTCCT
ATGGCTAGGTGCTGTATAATCTGATTGCCGAGTGTAATTTGATTGTTGTGTGTGTAATCTGATCGCTGTGTGTGTAATCTGATCGCTCTGGGTAATTGTGTGTAACCTGA
TTGTGGTGTAATATGGTTAGGTTGTGTTGTTGTGTAACCTGATTGTGGTGTAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAFKSSRFLPLNKIPTTRIVSPRPCTISVFQSKRFAPIAALTASPAAGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTCGSDIIELGVPYSDPLADGPV
IQAAATRALARETNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIRDAGVRGLVVPDVPLEETAVLREEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKNIVEASEGFV
YLVSSVGVTGARTSVSGRVQSLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELETFTKSLRSALS