; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh14G012280 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh14G012280
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description(S)-2-hydroxy-acid oxidase
Genome locationCmo_Chr14:10434840..10437079
RNA-Seq ExpressionCmoCh14G012280
SyntenyCmoCh14G012280
Gene Ontology termsGO:0009854 - oxidative photosynthetic carbon pathway (biological process)
GO:0005777 - peroxisome (cellular component)
GO:0003973 - (S)-2-hydroxy-acid oxidase activity (molecular function)
GO:0010181 - FMN binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000262 - FMN-dependent dehydrogenase
IPR008259 - FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase, active site
IPR012133 - Alpha-hydroxy acid dehydrogenase, FMN-dependent
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR037396 - FMN hydroxy acid dehydrogenase domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581777.1 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.4e-20996.19Show/hide
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KAG6581778.1 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.2e-17384.26Show/hide
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XP_022955688.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X2 [Cucurbita moschata]8.4e-19492.39Show/hide
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XP_022955691.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X5 [Cucurbita moschata]8.4e-19492.39Show/hide
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XP_022980628.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X3 [Cucurbita maxima]1.6e-18488.32Show/hide
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A0A6J1GUB4 (S)-2-hydroxy-acid oxidase1.4e-17384.01Show/hide
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A0A6J1GUJ8 (S)-2-hydroxy-acid oxidase4.1e-19492.39Show/hide
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A0A6J1GUN9 (S)-2-hydroxy-acid oxidase4.1e-19492.39Show/hide
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A0A6J1GVS5 (S)-2-hydroxy-acid oxidase1.4e-17384.01Show/hide
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A0A6J1IZV1 (S)-2-hydroxy-acid oxidase7.7e-18588.32Show/hide
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B8AKX6 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO12.5e-10853.59Show/hide
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        VV A  G++ V LDGGVRRGTDVFKA+ALGA  V IGRPV+F LAA+GE GVR VL M++ E E++MALSGC  + DITR+H+ T  D+L
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B8B8K5 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO49.5e-12459.59Show/hide
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        PVNV +++ELA+ ALPK+ YDY  GGAEDEHTLRENI A+ RI +RPRVLVDVS+IDMSTT+LGY + +PI++APT  HKLA PE               
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                    GE ATARAAA+ N IM+LS+SS+C +E+VASSCNA+RF+QL++ K R++SA LV+RAE  G+KA++LT DTP LGRREADIRNKM+  
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           NLEGLM+I D ++  GS+LE +    LD S+ W+DI WL+SIT++PI +KGI+T EDA +AVEAGV G+IVSNHGARQLD+APAT++ LEE   VV 
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        AV G V VL+DGG+RRGTDVFKA+ALGA+AV+   PV FGLAA+GE G R V+EML  ELE++MAL GC  + +ITRSHV T  D++ S+L
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Q24JJ8 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO32.1e-13965.55Show/hide
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        VNV++F+ELA+ ALPK+YYD+Y GGAED+HTL EN+QAF RI  RPRVLVDVS+IDMST ILGYPISAPI++APT  HKLA PE                
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                   GE ATA+AAAA NTIMI+SY S+C+ EE+ASSCNAVRF Q+++ KRRDI+A +V+RAE+ G+KAIVLT D PRLGRREADI+NKMI   
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        +KN EGL S +V   +GS ++A+ +   DAS  W+DI WLRSIT LPIL+KGILT EDA KAVEAGVDGIIVSNHG RQLD++PAT++VLEE   VV  V
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        +G++ VLLDGGVRRGTDVFKA+ALGAQAVLIGRP+++GLAAKGE GV+ V++MLKNE EI+MALSGCP I DITR+HVRT  ++L SML
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Q8H3I4 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO43.9e-12559.85Show/hide
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        PVNV +++ELA+ ALPK+ YDY  GGAEDEHTLRENI A+ RI +RPRVLVDVS+IDMSTT+LGY + +PI++APT  HKLA PE               
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                    GE ATARAAA+ N IM+LS+SS+C +E+VASSCNA+RF+QL++ K R++SA LV+RAE  G+KA++LT DTP LGRREADIRNKM+  
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           NLEGLM+  D ++  GS+LE +    LD S+ W+DI WL+SIT++PI +KGI+T EDA +AVEAGV G+IVSNHGARQLD+APAT++ LEE   VV 
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        AV G V VL+DGG+RRGTDVFKA+ALGA+AV++GRPV FGLAA+GE G R V+EML  ELE++MAL GC  + +ITRSHV T  D++ S+L
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Q9LJH5 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO46.6e-14165.04Show/hide
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        VNV++F+ELA+ ALPK+YYD+Y GGAED+HTL EN+QAF RI  RPRVLVDVS IDMST++LGYPISAPI++APT+ HKLA P+                
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                   GE+ATA+AAAA NTIMI+S+ STC++EEVASSCNAVRF Q+++ KRRD++A +V+RAE+ G+KAIVLT D PRLGRREADI+NKMI   
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        +KN EGL+S +V  ++GS +EA+ +   DAS+ W+DI WLRSIT LPIL+KG+LT EDA KAVEAGVDGI+VSNHGARQLD++PAT++VLEE   VV AV
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        KG++ VLLDGGVRRGTDVFKA+ALGAQAVLIGRP+++GLAAKGE GV+ V++MLKNE EI+MALSGCP I D+TR+HVRT  +++ SML
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G14130.1 Aldolase-type TIM barrel family protein4.7e-14265.04Show/hide
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        VNV++F+ELA+ ALPK+YYD+Y GGAED+HTL EN+QAF RI  RPRVLVDVS IDMST++LGYPISAPI++APT+ HKLA P+                
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                   GE+ATA+AAAA NTIMI+S+ STC++EEVASSCNAVRF Q+++ KRRD++A +V+RAE+ G+KAIVLT D PRLGRREADI+NKMI   
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        +KN EGL+S +V  ++GS +EA+ +   DAS+ W+DI WLRSIT LPIL+KG+LT EDA KAVEAGVDGI+VSNHGARQLD++PAT++VLEE   VV AV
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AT3G14150.1 Aldolase-type TIM barrel family protein1.5e-14065.55Show/hide
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        VNV++F+ELA+ ALPK+YYD+Y GGAED+HTL EN+QAF RI  RPRVLVDVS+IDMST ILGYPISAPI++APT  HKLA PE                
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                   GE ATA+AAAA NTIMI+SY S+C+ EE+ASSCNAVRF Q+++ KRRDI+A +V+RAE+ G+KAIVLT D PRLGRREADI+NKMI   
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        +KN EGL S +V   +GS ++A+ +   DAS  W+DI WLRSIT LPIL+KGILT EDA KAVEAGVDGIIVSNHG RQLD++PAT++VLEE   VV  V
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        +G++ VLLDGGVRRGTDVFKA+ALGAQAVLIGRP+++GLAAKGE GV+ V++MLKNE EI+MALSGCP I DITR+HVRT  ++L SML
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AT3G14150.2 Aldolase-type TIM barrel family protein1.5e-14065.55Show/hide
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        VNV++F+ELA+ ALPK+YYD+Y GGAED+HTL EN+QAF RI  RPRVLVDVS+IDMST ILGYPISAPI++APT  HKLA PE                
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Query:  TFFLDDICDLSGELATARAAAAANTIMILSYSSTCSMEEVASSCNAVRFFQLHISKRRDISALLVQRAERFGYKAIVLTADTPRLGRREADIRNKMIGFP
                   GE ATA+AAAA NTIMI+SY S+C+ EE+ASSCNAVRF Q+++ KRRDI+A +V+RAE+ G+KAIVLT D PRLGRREADI+NKMI   
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Query:  VKNLEGLMSIDVESDQGSKLEAYYNELLDASIRWEDIGWLRSITNLPILIKGILTHEDATKAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEGMQVVDAV
        +KN EGL S +V   +GS ++A+ +   DAS  W+DI WLRSIT LPIL+KGILT EDA KAVEAGVDGIIVSNHG RQLD++PAT++VLEE   VV  V
Subjt:  VKNLEGLMSIDVESDQGSKLEAYYNELLDASIRWEDIGWLRSITNLPILIKGILTHEDATKAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEGMQVVDAV

Query:  KGKVAVLLDGGVRRGTDVFKAVALGAQAVLIGRPVLFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEISMALSGCPCIKDITRSHVRTPYDKLPSML
        +G++ VLLDGGVRRGTDVFKA+ALGAQAVLIGRP+++GLAAKGE GV+ V++MLKNE EI+MALSGCP I DITR+HVRT  ++L SML
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AT3G14420.1 Aldolase-type TIM barrel family protein3.4e-10852.84Show/hide
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        E  NV ++  +A+  LPK+ YDYYA GAED+ TL+EN  AF RI  RPR+L+DVS+IDM+TT+LG+ IS PI++APT+  K+A P+              
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Query:  HATFFLDDICDLSGELATARAAAAANTIMILSYSSTCSMEEVASSCNAVRFFQLHISKRRDISALLVQRAERFGYKAIVLTADTPRLGRREADIRNKMI-
                     GE ATARAA+AA TIM LS  +T S+EEVAS+   +RFFQL++ K R++   LV+RAER G+KAI LT DTPRLGRRE+DI+N+   
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             +KN EGL    ++    S L +Y    +D ++ W+D+ WL++IT LPIL+KG+LT EDA  A++AG  GIIVSNHGARQLD+ PAT+S LEE   
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Query:  VVDAVKGKVAVLLDGGVRRGTDVFKAVALGAQAVLIGRPVLFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEISMALSGCPCIKDITRSHVRTPYD
        VV A +G++ V LDGGVRRGTDVFKA+ALGA  + IGRPV+F LAA+GE GVR VL+ML++E E++MALSGC  +K+I+R+H+ T +D
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AT4G18360.1 Aldolase-type TIM barrel family protein4.0e-10953.35Show/hide
Query:  EPVNVNDFKELARNALPKIYYDYYAGGAEDEHTLRENIQAFHRITIRPRVLVDVSQIDMSTTILGYPISAPILLAPTSAHKLAIPEGYPFWYLAYLRTDF
        E  NV +++++A+  LPK+ YDYYA GAED+ TL+EN  AF RI  RPR+L+DVS+ID+STT+LG+ IS PI++APT+  K+A P+              
Subjt:  EPVNVNDFKELARNALPKIYYDYYAGGAEDEHTLRENIQAFHRITIRPRVLVDVSQIDMSTTILGYPISAPILLAPTSAHKLAIPEGYPFWYLAYLRTDF

Query:  HATFFLDDICDLSGELATARAAAAANTIMILSYSSTCSMEEVASSCNAVRFFQLHISKRRDISALLVQRAERFGYKAIVLTADTPRLGRREADIRNKMI-
                     GELATARA +AA TIM LS  +TCS+EEVAS+   +RFFQL++ K R++   LV+RAE  G+KAI LT DTPRLGRRE+DI+N+   
Subjt:  HATFFLDDICDLSGELATARAAAAANTIMILSYSSTCSMEEVASSCNAVRFFQLHISKRRDISALLVQRAERFGYKAIVLTADTPRLGRREADIRNKMI-

Query:  --GFPVKNLEGLMSIDVESDQGSKLEAYYNELLDASIRWEDIGWLRSITNLPILIKGILTHEDATKAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEGMQ
          G  +KN EGL    ++    S L +Y    +D S+ W+DI WL+SIT+LPIL+KG++T EDA  AVE G  GIIVSNHGARQLD+ PAT+  LEE   
Subjt:  --GFPVKNLEGLMSIDVESDQGSKLEAYYNELLDASIRWEDIGWLRSITNLPILIKGILTHEDATKAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEGMQ

Query:  VVDAVKGKVAVLLDGGVRRGTDVFKAVALGAQAVLIGRPVLFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEISMALSGCPCIKDITRSHVRTPYD
        VV AV+G++ V LDGGVRRGTDVFKA+ALGA  V +GRP LF LAA GE GVR +L+ML++E E++MALSGC  +++I+R+H++T +D
Subjt:  VVDAVKGKVAVLLDGGVRRGTDVFKAVALGAQAVLIGRPVLFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEISMALSGCPCIKDITRSHVRTPYD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TAGAGAGAACATACAAGCTTTCCATAGAATCACGATTCGGCCTCGAGTTCTGGTGGATGTGAGCCAAATTGATATGTCAACAACCATATTGGGCTATCCCATCTCTGCAC
CTATCCTCCTTGCTCCCACTTCTGCACATAAGTTGGCTATCCCTGAAGGTTACCCCTTTTGGTATCTTGCTTACTTGAGAACTGATTTTCATGCCACTTTTTTTCTTGAT
GATATCTGTGATCTTTCAGGAGAATTAGCCACGGCCAGGGCAGCTGCTGCTGCAAACACTATAATGATTCTGTCTTACTCTTCCACCTGTTCAATGGAGGAAGTTGCCTC
TAGCTGCAATGCTGTCCGTTTCTTTCAATTACATATTTCCAAACGGCGCGATATCTCGGCGCTGCTAGTACAGAGAGCTGAGAGATTTGGATACAAGGCAATTGTCCTGA
CTGCTGATACTCCTCGACTTGGAAGAAGGGAGGCTGACATAAGGAACAAGATGATTGGCTTTCCAGTGAAGAATCTTGAAGGCCTCATGTCTATTGACGTTGAATCTGAC
CAAGGTTCAAAGTTAGAAGCTTATTACAACGAGTTGTTGGATGCATCTATACGTTGGGAAGATATAGGGTGGTTAAGATCAATCACTAATCTGCCAATTCTGATAAAGGG
GATTCTCACTCATGAAGATGCAACTAAAGCAGTGGAAGCTGGTGTTGATGGAATTATTGTCTCCAATCATGGAGCTCGTCAACTAGACTTTGCTCCTGCCACTGTTTCTG
TCCTTGAAGAGGGCATGCAGGTTGTTGATGCTGTGAAGGGTAAAGTTGCTGTGCTCTTAGATGGAGGTGTGCGGCGAGGTACAGATGTGTTTAAGGCAGTAGCCCTTGGT
GCCCAGGCAGTGCTCATAGGGAGACCAGTTTTATTTGGACTGGCAGCAAAGGGAGAAGGAGGAGTAAGAACAGTGCTGGAGATGCTGAAGAATGAGTTAGAGATTAGTAT
GGCACTTTCTGGGTGCCCATGCATCAAGGACATTACTAGAAGCCATGTTAGGACACCGTACGATAAGCTGCCTTCAATGCTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TAGAGAGAACATACAAGCTTTCCATAGAATCACGATTCGGCCTCGAGTTCTGGTGGATGTGAGCCAAATTGATATGTCAACAACCATATTGGGCTATCCCATCTCTGCAC
CTATCCTCCTTGCTCCCACTTCTGCACATAAGTTGGCTATCCCTGAAGGTTACCCCTTTTGGTATCTTGCTTACTTGAGAACTGATTTTCATGCCACTTTTTTTCTTGAT
GATATCTGTGATCTTTCAGGAGAATTAGCCACGGCCAGGGCAGCTGCTGCTGCAAACACTATAATGATTCTGTCTTACTCTTCCACCTGTTCAATGGAGGAAGTTGCCTC
TAGCTGCAATGCTGTCCGTTTCTTTCAATTACATATTTCCAAACGGCGCGATATCTCGGCGCTGCTAGTACAGAGAGCTGAGAGATTTGGATACAAGGCAATTGTCCTGA
CTGCTGATACTCCTCGACTTGGAAGAAGGGAGGCTGACATAAGGAACAAGATGATTGGCTTTCCAGTGAAGAATCTTGAAGGCCTCATGTCTATTGACGTTGAATCTGAC
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GATTCTCACTCATGAAGATGCAACTAAAGCAGTGGAAGCTGGTGTTGATGGAATTATTGTCTCCAATCATGGAGCTCGTCAACTAGACTTTGCTCCTGCCACTGTTTCTG
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GCCCAGGCAGTGCTCATAGGGAGACCAGTTTTATTTGGACTGGCAGCAAAGGGAGAAGGAGGAGTAAGAACAGTGCTGGAGATGCTGAAGAATGAGTTAGAGATTAGTAT
GGCACTTTCTGGGTGCCCATGCATCAAGGACATTACTAGAAGCCATGTTAGGACACCGTACGATAAGCTGCCTTCAATGCTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSEPVNVNDFKELARNALPKIYYDYYAGGAEDEHTLRENIQAFHRITIRPRVLVDVSQIDMSTTILGYPISAPILLAPTSAHKLAIPEGYPFWYLAYLRTDFHATFFLD
DICDLSGELATARAAAAANTIMILSYSSTCSMEEVASSCNAVRFFQLHISKRRDISALLVQRAERFGYKAIVLTADTPRLGRREADIRNKMIGFPVKNLEGLMSIDVESD
QGSKLEAYYNELLDASIRWEDIGWLRSITNLPILIKGILTHEDATKAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEGMQVVDAVKGKVAVLLDGGVRRGTDVFKAVALG
AQAVLIGRPVLFGLAAKGEGGVRTVLEMLKNELEISMALSGCPCIKDITRSHVRTPYDKLPSML