CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh14G015210
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Phosphoribosylformylglycinamidine synthase
Genome location	Cmo_Chr14:12187832..12193552
RNA-Seq Expression	CmoCh14G015210
Synteny	CmoCh14G015210
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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        VAR KATASLNLTDVSDEVSKNGVRVGERLPKWWPPAVPRQITTANRQEYQD+ANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLRQICRTSGVKVSFNTENM DS
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Query:  FYRASVDFVLNIYSRTPVPPNSVLINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSCFLQAWALVMQDRQSEANAELLKICYIIQIFPPEESSP
        FYRASVDFVLNIYSRTPV PNSVLINGEDGPNFVAGLAEDIGIEN+RAARIVSAAVAARMRSCFLQAWALVMQDRQSEANAELLKICYIIQIFPPEESSP
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Query:  EMEMLTLGLKKHLKVEQRETLMNMFIGVCGKDSHRTAAEALGLVLPPNVGN
        EMEMLTLGLKKHLKVEQRETLMNMFIGVCGKDSH+TAAEALGLVLPPNVGN
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G43235.1 unknown protein

6.6e-84

45.55

Show/hide

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        S S + +++  + +D+ +++            L+  + + F+ S  DAF DL+TL++ D  NR + +SC+ ST +F+G +V+L  V  F ++ L+ +GS+
Subjt:  SSSFSSERNFQIAIDIDKVTAEVSFFFYYIYYLSRSKVRRFISSGSDAFDDLRTLVAFDHQNRILTISCRHSTAKFLGQLVLLSIVVHFVVKGLIGIGSS

Query:  FFKKFSSGHTSPVVRRDRSLGGKEVAVGTGS--SVVARGKATASLNLTDVSDEVSKN-GVRVGERLPKWWPPAVPRQ-ITTANRQEYQDEANRLVRALVD
            F S +   VVRRDRSLGGKEV V   +  S     K+  + +    S+   +N  ++    LPKWWP ++  Q     ++++YQ EANR+VRA+VD
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Query:  NRMSGRDFMEDDIVQLRQICRTSGVKVSFNTENMCDSFYRASVDFVLNIYSRTPVPPNSVLINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSC
        NR SG+D  +DDI+QLR++CR SGV+V+F  +N  DSFYR S+DFVLN  SR P   +SV I  ED   F+AGLAE+IG+  + AAR+VSAAVAAR RS 
Subjt:  NRMSGRDFMEDDIVQLRQICRTSGVKVSFNTENMCDSFYRASVDFVLNIYSRTPVPPNSVLINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSC

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        FLQAWAL +Q + SE+ AEL KIC I +IFPP E S EMEM+  GL+K +K+E+R++L+  F+G+ C +DS R+AAEALGLV
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Sequences

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CDS sequence

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AACGGAACTTCCAAATCGCGATTGACATCGACAAAGTCACCGCCGAAGTCTCCTTTTTCTTCTACTACATCTACTATCTTTCCCGTTCCAAAGTTCGCCGGTTTATATCG
TCGGGATCGGACGCTTTTGACGACTTGCGGACATTGGTTGCCTTCGATCATCAGAATCGCATACTGACCATCTCGTGTCGGCATTCCACTGCGAAGTTCCTTGGTCAGTT
GGTGCTATTGAGCATCGTTGTGCACTTTGTAGTTAAGGGCTTGATTGGGATCGGATCTAGTTTTTTCAAGAAATTTAGTTCTGGACATACTTCTCCTGTGGTGAGAAGGG
ACCGGAGCCTCGGTGGAAAAGAGGTGGCTGTTGGTACTGGGAGTAGTGTTGTAGCGCGAGGTAAAGCTACGGCTTCATTGAATCTGACGGATGTTTCAGACGAAGTATCG
AAGAATGGGGTTCGGGTTGGAGAAAGGTTGCCAAAATGGTGGCCTCCAGCAGTTCCCAGACAGATTACCACGGCGAATAGGCAGGAATATCAGGATGAAGCTAACAGATT
AGTCCGAGCCCTCGTGGATAATAGAATGAGTGGGCGGGATTTCATGGAGGATGATATTGTTCAATTGCGTCAAATATGTAGGACATCTGGAGTAAAAGTTTCCTTCAACA
CCGAAAATATGTGTGATTCATTCTATCGAGCATCAGTGGACTTTGTTTTAAATATCTATAGCAGGACTCCAGTGCCCCCTAACTCAGTTCTCATTAATGGCGAGGATGGT
CCAAATTTTGTTGCTGGGCTTGCTGAGGATATTGGCATTGAGAATGTTCGTGCTGCCAGGATAGTTTCTGCTGCTGTTGCTGCAAGAATGCGTTCATGCTTTTTACAGGC
CTGGGCTCTAGTGATGCAAGACAGACAATCTGAAGCAAATGCAGAGTTGTTGAAGATCTGTTACATCATCCAGATATTTCCTCCTGAGGAATCCTCGCCTGAGATGGAGA
TGTTGACTCTAGGCTTGAAGAAACACTTGAAGGTAGAACAGAGAGAAACATTAATGAATATGTTTATTGGCGTTTGTGGTAAAGATAGTCATAGAACTGCTGCAGAAGCT
CTTGGTTTGGTACTTCCTCCAAATGTTGGCAATTGA

mRNA sequence

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TCCTCGCCGAAGCCCCAACGACTCTTCACTACGATCTCCTGCTTCAATGGCCGCCGTCGAACTCGCTGGAAAAATAAGCTCCAAACGATCAGCATCACCCGCACTCCTAG
AGTTCCCTCCTCCTCCTTCTCCTCAGAACGGAACTTCCAAATCGCGATTGACATCGACAAAGTCACCGCCGAAGTCTCCTTTTTCTTCTACTACATCTACTATCTTTCCC
GTTCCAAAGTTCGCCGGTTTATATCGTCGGGATCGGACGCTTTTGACGACTTGCGGACATTGGTTGCCTTCGATCATCAGAATCGCATACTGACCATCTCGTGTCGGCAT
TCCACTGCGAAGTTCCTTGGTCAGTTGGTGCTATTGAGCATCGTTGTGCACTTTGTAGTTAAGGGCTTGATTGGGATCGGATCTAGTTTTTTCAAGAAATTTAGTTCTGG
ACATACTTCTCCTGTGGTGAGAAGGGACCGGAGCCTCGGTGGAAAAGAGGTGGCTGTTGGTACTGGGAGTAGTGTTGTAGCGCGAGGTAAAGCTACGGCTTCATTGAATC
TGACGGATGTTTCAGACGAAGTATCGAAGAATGGGGTTCGGGTTGGAGAAAGGTTGCCAAAATGGTGGCCTCCAGCAGTTCCCAGACAGATTACCACGGCGAATAGGCAG
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ATCTGGAGTAAAAGTTTCCTTCAACACCGAAAATATGTGTGATTCATTCTATCGAGCATCAGTGGACTTTGTTTTAAATATCTATAGCAGGACTCCAGTGCCCCCTAACT
CAGTTCTCATTAATGGCGAGGATGGTCCAAATTTTGTTGCTGGGCTTGCTGAGGATATTGGCATTGAGAATGTTCGTGCTGCCAGGATAGTTTCTGCTGCTGTTGCTGCA
AGAATGCGTTCATGCTTTTTACAGGCCTGGGCTCTAGTGATGCAAGACAGACAATCTGAAGCAAATGCAGAGTTGTTGAAGATCTGTTACATCATCCAGATATTTCCTCC
TGAGGAATCCTCGCCTGAGATGGAGATGTTGACTCTAGGCTTGAAGAAACACTTGAAGGTAGAACAGAGAGAAACATTAATGAATATGTTTATTGGCGTTTGTGGTAAAG
ATAGTCATAGAACTGCTGCAGAAGCTCTTGGTTTGGTACTTCCTCCAAATGTTGGCAATTGATATATAATCAAAGCGTTTGCACCTGGAGAAGTCCATTTCCAAGAGCAG
TATCTTACAAATCATAACCTTTTATTAGTAATTATTGCTATCAAGTTTGGCATTTTCATTAATGGGTTCATCCATCCAATAACTAATTAATGTGTATTATGAATCACGAA
TATCAAGATTATGAATGTTGGTGCTGAAAGTTTTCATTTAATGTTTGATTGCATCAAAACAAAAAGAATATTAAGCGTTCAAACTAACTTCGATAAGTT

Protein sequence

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SGSDAFDDLRTLVAFDHQNRILTISCRHSTAKFLGQLVLLSIVVHFVVKGLIGIGSSFFKKFSSGHTSPVVRRDRSLGGKEVAVGTGSSVVARGKATASLNLTDVSDEVS
KNGVRVGERLPKWWPPAVPRQITTANRQEYQDEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLRQICRTSGVKVSFNTENMCDSFYRASVDFVLNIYSRTPVPPNSVLINGEDG
PNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSCFLQAWALVMQDRQSEANAELLKICYIIQIFPPEESSPEMEMLTLGLKKHLKVEQRETLMNMFIGVCGKDSHRTAAEA
LGLVLPPNVGN

CmoCh14G015210 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome