; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh14G015870 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh14G015870
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCmo_Chr14:12612936..12613851
RNA-Seq ExpressionCmoCh14G015870
SyntenyCmoCh14G015870
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7018537.1 putative GTP diphosphokinase CRSH, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.6e-3698.7Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACN
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTT ATACN
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACN
XP_008439007.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103483930 isoform X3 [Cucumis melo]2.4e-3191.46Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD-KANSTTTAATA-CNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQ+PRDPKKS SDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD KANS  T ATA CNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD-KANSTTTAATA-CNVSS
XP_022138108.1 uncharacterized protein LOC111009357 [Momordica charantia]4.9e-3290Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQ PRDPKKS SDSEQEKRVDVR+LQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANS   A  ACNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACNVSS
XP_022980000.1 uncharacterized protein LOC111479526 [Cucurbita maxima]1.3e-37100Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACNVSS
XP_038898749.1 uncharacterized protein LOC120086267 [Benincasa hispida]3.2e-3190.12Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAAT-ACNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQ+ RDPKKS SDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANS  TA T  CNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAAT-ACNVSS
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5H1 Uncharacterized protein2.9e-3090.36Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRD-PKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD-KANSTTTAATA-CNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQ+PRD PKKS SDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD KANS  T ATA CNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRD-PKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD-KANSTTTAATA-CNVSS
A0A1S3AXS6 uncharacterized protein LOC103483930 isoform X31.2e-3191.46Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD-KANSTTTAATA-CNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQ+PRDPKKS SDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD KANS  T ATA CNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD-KANSTTTAATA-CNVSS
A0A5A7U9W0 Uncharacterized protein1.2e-3191.46Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD-KANSTTTAATA-CNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQ+PRDPKKS SDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD KANS  T ATA CNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILD-KANSTTTAATA-CNVSS
A0A6J1CC51 uncharacterized protein LOC1110093572.4e-3290Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQ PRDPKKS SDSEQEKRVDVR+LQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANS   A  ACNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACNVSS
A0A6J1IUX8 uncharacterized protein LOC1114795266.4e-38100Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACNVSS
        MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACNVSS
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACNVSS
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G48330.1 unknown protein1.4e-1656.58Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPK--KSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAAT
        MASWKKTI +PF+KA T FNQ  +  +   + +  E EKR  V+ LQG+VMACGYEDV VMWSILDK+NS+   ++
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPK--KSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAAT
AT3G17580.1 unknown protein3.3e-1856.79Show/hide
Query:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKK-------SPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAAT
        MASWKKTI +PF+KA T FNQ  + PKK       + +  E EKR+ V+ LQGEVMACGY+DV VMWSILDK+NS+   ++
Subjt:  MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKK-------SPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAAT

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTTGGAAGAAAACCATCATTTCTCCCTTTAGAAAGGCTTGCACCATCTTCAACCAGCACCCTCGAGATCCCAAAAAGTCTCCCTCCGATTCAGAACAAGAGAA
GCGAGTAGACGTGAGGAATCTCCAAGGAGAGGTGATGGCATGTGGGTATGAAGACGTGCACGTGATGTGGTCTATTTTAGACAAGGCCAACTCAACTACGACCGCCGCCA
CCGCTTGCAATGTGTCTTCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGTTGCTCATCCTTCGGATCTTGCCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTTTGCTTATAAATTGTTTGCCATTTCACTTCCAACGCCTTTCAG
CCAAACACATTCTCACACCTTCATATTCCCATGGCTTCTTGGAAGAAAACCATCATTTCTCCCTTTAGAAAGGCTTGCACCATCTTCAACCAGCACCCTCGAGATCCCAA
AAAGTCTCCCTCCGATTCAGAACAAGAGAAGCGAGTAGACGTGAGGAATCTCCAAGGAGAGGTGATGGCATGTGGGTATGAAGACGTGCACGTGATGTGGTCTATTTTAG
ACAAGGCCAACTCAACTACGACCGCCGCCACCGCTTGCAATGTGTCTTCTTAACCGTCGTCGAGGCCGCCACCGACACCGACAAGTGGTGGTGGTTGGTTAATTGGTGTA
GATAAAGCATAATACATCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATGTTATTTTGTGAGTTATGATGATTTTGTTTGTGTAGGAAATGAATCCCCATGATTTGAAGGTTTTAATC
ATGGTGAGATTTTAAGTTTTATATTAATTACTTCTTTTTTAAGTCCTAAAAAGCTCTCTTTTTTTCTTATGGGGAATGGAACCTTATCTCTCATCAAACTGCCTCAGATC
TGATTGGTTTGTCATTTTTAGTTTTAATTTATGTGCACCACTTTCCAAGGGCATCAAATTGAGAGACAATGAGAGAAGCTTGGACATTTACAATCTTTTTTTTAGATGAA
ATTATTATATTTTGTTTCTTGTTTAATGATATCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASWKKTIISPFRKACTIFNQHPRDPKKSPSDSEQEKRVDVRNLQGEVMACGYEDVHVMWSILDKANSTTTAATACNVSS