; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh14G018870 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh14G018870
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic
Genome locationCmo_Chr14:14119056..14121650
RNA-Seq ExpressionCmoCh14G018870
SyntenyCmoCh14G018870
Gene Ontology termsGO:1901259 - chloroplast rRNA processing (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6582419.1 hypothetical protein SDJN03_22421, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-15099.29Show/hide
Query:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG
        MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG
Subjt:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG

Query:  STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL
        STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL
Subjt:  STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL

Query:  AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAEGSQTQGQILN
        AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAEGSQ QGQ+LN
Subjt:  AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAEGSQTQGQILN

KAG7018818.1 hypothetical protein SDJN02_20691, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.3e-14299.62Show/hide
Query:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG
        MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISAT VQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG
Subjt:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG

Query:  STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL
        STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL
Subjt:  STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL

Query:  AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVL
        AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVL
Subjt:  AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVL

XP_022924562.1 uncharacterized protein LOC111432007 [Cucurbita moschata]1.3e-143100Show/hide
Query:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG
        MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG
Subjt:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG

Query:  STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL
        STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL
Subjt:  STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL

Query:  AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV
        AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV
Subjt:  AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV

XP_022979333.1 putative G3BP-like protein [Cucurbita maxima]5.7e-13694.83Show/hide
Query:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEG-----AEKEGGEAVDGGS
        MPAAATGVSFFTTPIRGSRS  WLSDSPLATPSTQVLP+LSRPLAVKSAPLRAFSER RPAT+ISA SVQGEAALTVG EEG     AEK GGEAVDGGS
Subjt:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEG-----AEKEGGEAVDGGS

Query:  PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKL
        PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSI+DCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKL
Subjt:  PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKL

Query:  FVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV
        FVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV
Subjt:  FVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV

XP_023526652.1 uncharacterized protein LOC111790085 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.2e-13997.74Show/hide
Query:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG
        MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLL RPLAVKSAPLRAFSER R AT+ISATSVQGEAALTVGVEEGAEK GGEAVDGGSPVESG
Subjt:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG

Query:  STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL
        STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSI+DCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL
Subjt:  STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL

Query:  AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV
        AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV
Subjt:  AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L496 Uncharacterized protein1.1e-11379.56Show/hide
Query:  AAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGST
        AAATG SFF T +RGSRS  WLSDS LATPSTQVLP+LSR LA++S  LRA SE+ RP  IISA  VQGE A+TVGVEEG E+E    V+GGSPVESGST
Subjt:  AAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGST

Query:  KLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAW
        KLYFGNLPYSVDS QLAAIVQDYG+AELIEVLYDR+TGKSRGFAFVTM+SI+DCNKVIENL+G+ YMGRILRVNFSDKPKPKE L+PETEYKLFV NL+W
Subjt:  KLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAW

Query:  SVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAEGSQTQG
        SVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIY+GETG+SRGYGFVSYSTKSEMETAL  +N+   EGRV+ VSLAEG Q  G
Subjt:  SVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAEGSQTQG

A0A1S4DSH7 LOW QUALITY PROTEIN: putative G3BP-like protein1.6e-11281.82Show/hide
Query:  AAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGST
        AAATG SFFTTP+RGSRS  W SDS LATPSTQVLP+LSR L ++S PLRA SER RP  IISA  VQGE A+ VGVEEG E+E   AV+GGSPVESGST
Subjt:  AAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGST

Query:  KLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAW
        KLYFGNLPYSVDS QLAAIVQD+GVAELIEVLYDR+TGKSRGFAFVTM+SI+DCNKVIENL+G  YMGRILRVNFSDKPKPKE L+PETEYKLFV NL+W
Subjt:  KLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAW

Query:  SVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV
        SVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTKSEMETAL ALN+   EGRV+ V
Subjt:  SVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV

A0A5D3CZH4 Putative G3BP-like protein2.3e-11182.63Show/hide
Query:  AAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGST
        AAATG SFFTTP+RGSRS  W SDS LATPSTQVLP+LSR L ++S PLRA SER RP  IISA  VQGE A+TVGVEEG E+E   AV+GGSPVESGST
Subjt:  AAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGST

Query:  KLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAW
        KLYFGNLPYSVDS QLAAIVQD+GVAELIEVLYDR+TGKSRGFAFVTM+SI+DCNKVIENL+G  YMGRILRVNFSDKPKPKE L+PETEYKLFV NL+W
Subjt:  KLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAW

Query:  SVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEG
        SVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTKSEMETAL ALN+ V  G
Subjt:  SVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEG

A0A6J1E9A5 uncharacterized protein LOC1114320076.1e-144100Show/hide
Query:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG
        MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG
Subjt:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESG

Query:  STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL
        STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL
Subjt:  STKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNL

Query:  AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV
        AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV
Subjt:  AWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV

A0A6J1IVW4 putative G3BP-like protein2.8e-13694.83Show/hide
Query:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEG-----AEKEGGEAVDGGS
        MPAAATGVSFFTTPIRGSRS  WLSDSPLATPSTQVLP+LSRPLAVKSAPLRAFSER RPAT+ISA SVQGEAALTVG EEG     AEK GGEAVDGGS
Subjt:  MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEG-----AEKEGGEAVDGGS

Query:  PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKL
        PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSI+DCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKL
Subjt:  PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKL

Query:  FVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV
        FVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV
Subjt:  FVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19683 31 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic2.0e-3543.02Show/hide
Query:  KLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFS----DKPKPKEHLFPETEYKLFVR
        KL+ GNLPY VDS  LA + +  GV E+ EV+Y+RDT +SRGF FVTM+++++  K +E  N     GR+L VN +    ++P+     F E  Y+++V 
Subjt:  KLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFS----DKPKPKEHLFPETEYKLFVR

Query:  NLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAE
        N+ W +    L Q F E+G VV ARV+Y+ ETGRSRG+GFV+ ++++EM  A+  L+    +GR + V++AE
Subjt:  NLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAE

P28644 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic6.9e-3641.87Show/hide
Query:  EAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGR
        E A++ G E     EGG     G        KL+ GNLPY VDS +LA I    GV E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTM+++++  K +E LNG    GR
Subjt:  EAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGR

Query:  ILRVNFSDKPKPKEHLFPETEY----KLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVS
         L VN    P+      P  ++    +++V NL W V +  L Q F E+G VV ARV+ + ETGRSRG+GFV+ S++SE+  A+ AL+    +GR + V+
Subjt:  ILRVNFSDKPKPKEHLFPETEY----KLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVS

Query:  LAE
        +AE
Subjt:  LAE

P82277 30S ribosomal protein 2, chloroplastic5.0e-3438.46Show/hide
Query:  EKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKP--
        E+    +    S    G+ +LY GN+P ++++ +L  IV+++G  E+ EV+YD+ +G+SR F FVTM +++D N VIE LN     GR ++VN ++KP  
Subjt:  EKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKP--

Query:  -------KPKEHLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLA
               + ++  F E+ YK+++ NLA +VT+E L   F E G V+GA+V     T +S G+GFVS+S++ E+E A+ ALN++V EG+ + V+ A
Subjt:  -------KPKEHLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLA

Q8VYM4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic5.0e-3438.59Show/hide
Query:  PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKP----------KPKE
        P    + ++Y GN+P +V + QL  +V+++G  E ++V+YD+ +G+SR F F TM S++D N V+E LNG T  GR ++VN ++KP          + ++
Subjt:  PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKP----------KPKE

Query:  HLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLA
          F ++ YK++V NLA +VT E L   F E G VV A+V     T +S G+GFV++S++ ++E A+VALN+++ EG+ + V+ A
Subjt:  HLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLA

Q9FGS0 RNA-binding protein CP31B, chloroplastic1.0e-3438.96Show/hide
Query:  LLSRP----LAVKSAPLRAFSERCRPATIISATS-----VQGE----AALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDY
        L SRP    L++KS  LR  S      T +S TS      +GE       +V V+E  E E G     G P      KL+ GNLPY VDS  LA + +  
Subjt:  LLSRP----LAVKSAPLRAFSERCRPATIISATS-----VQGE----AALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDY

Query:  GVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFS----DKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVG
        G  E+ EV+Y+RDT +SRGF FVTM+++++  K +E  N     GR L VN +     +P+ +  ++ +  ++++V NL W V S  L + F E+G VV 
Subjt:  GVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFS----DKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVG

Query:  ARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAE
        ARV+ + ETGRSRG+GFV  S ++E+  A+ AL+    EGR + V++AE
Subjt:  ARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein7.3e-6556.22Show/hide
Query:  RPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGK
        +PL + S   R+ S R R   ++S T       +TV +EE  + +G  AV    P  + +TKLYFGNLPY+VDS  LA I+QD+   EL+EVLY+RDTG+
Subjt:  RPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGK

Query:  SRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKP-KEHLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVS
        SRGFAFVTM++++DCN +I+NL+G  Y+GR L+VNF+DKPKP KE L+PETE+KLFV NL+W+VTSESL  AF+E G+VVGARV+++G+TGRSRGYGFV 
Subjt:  SRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKP-KEHLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVS

Query:  YSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAEGSQ
        YS+K+EMETAL +L+    EGR + V+LA+G +
Subjt:  YSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAEGSQ

AT3G52150.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein3.5e-3538.59Show/hide
Query:  PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKP----------KPKE
        P    + ++Y GN+P +V + QL  +V+++G  E ++V+YD+ +G+SR F F TM S++D N V+E LNG T  GR ++VN ++KP          + ++
Subjt:  PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKP----------KPKE

Query:  HLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLA
          F ++ YK++V NLA +VT E L   F E G VV A+V     T +S G+GFV++S++ ++E A+VALN+++ EG+ + V+ A
Subjt:  HLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLA

AT3G52150.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein3.5e-3538.59Show/hide
Query:  PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKP----------KPKE
        P    + ++Y GN+P +V + QL  +V+++G  E ++V+YD+ +G+SR F F TM S++D N V+E LNG T  GR ++VN ++KP          + ++
Subjt:  PVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKP----------KPKE

Query:  HLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLA
          F ++ YK++V NLA +VT E L   F E G VV A+V     T +S G+GFV++S++ ++E A+VALN+++ EG+ + V+ A
Subjt:  HLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLA

AT4G24770.1 31-kDa RNA binding protein1.3e-3440.72Show/hide
Query:  EGAEKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFS--
        EG   EG  +     P  S   KL+ GNL Y V+S  LA + +  G  E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTM+S+D+    +E  N     GR+L VN +  
Subjt:  EGAEKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFS--

Query:  --DKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAE
           +P+    ++ E  ++++V NL W V +  L Q F E+G VV ARV+Y+ ETGRSRG+GFV+ S   E+  A+ AL+    EGR + V++AE
Subjt:  --DKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAE

AT5G50250.1 chloroplast RNA-binding protein 31B7.1e-3638.96Show/hide
Query:  LLSRP----LAVKSAPLRAFSERCRPATIISATS-----VQGE----AALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDY
        L SRP    L++KS  LR  S      T +S TS      +GE       +V V+E  E E G     G P      KL+ GNLPY VDS  LA + +  
Subjt:  LLSRP----LAVKSAPLRAFSERCRPATIISATS-----VQGE----AALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSPQLAAIVQDY

Query:  GVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFS----DKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVG
        G  E+ EV+Y+RDT +SRGF FVTM+++++  K +E  N     GR L VN +     +P+ +  ++ +  ++++V NL W V S  L + F E+G VV 
Subjt:  GVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFS----DKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVVG

Query:  ARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAE
        ARV+ + ETGRSRG+GFV  S ++E+  A+ AL+    EGR + V++AE
Subjt:  ARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCCGCCGCCGCTACCGGAGTCTCCTTCTTCACCACTCCCATAAGGGGTTCACGGTCCAATCCCTGGCTCTCCGATTCTCCCCTTGCAACCCCATCTACCCAGGTGTT
GCCCTTACTGTCCCGCCCTCTGGCCGTTAAATCGGCTCCGCTTAGAGCTTTCTCAGAGAGGTGTCGCCCGGCTACGATCATCTCGGCCACCTCTGTGCAAGGAGAGGCGG
CTTTGACGGTGGGGGTTGAAGAGGGTGCGGAGAAGGAAGGAGGGGAGGCGGTGGATGGTGGTTCTCCAGTGGAGTCCGGGAGTACTAAGCTGTATTTTGGGAATTTGCCT
TATAGTGTTGATAGTCCCCAGCTTGCGGCTATCGTTCAGGATTATGGGGTCGCCGAGCTTATTGAGGTTCTGTATGACAGGGATACTGGAAAAAGTAGAGGATTCGCATT
TGTAACCATGAACAGTATTGATGATTGCAATAAAGTCATTGAAAATCTGAATGGAGCTACTTATATGGGCAGAATTTTGAGGGTTAATTTCTCAGACAAACCTAAGCCCA
AGGAACATTTGTTTCCAGAAACTGAGTATAAACTCTTTGTTCGAAACTTAGCTTGGTCAGTAACATCAGAAAGTTTGACACAAGCATTTCAAGAATATGGAAATGTGGTA
GGAGCAAGGGTCATCTATAACGGGGAGACTGGAAGGTCACGTGGTTATGGCTTTGTTTCTTACTCAACAAAATCAGAGATGGAAACGGCTCTTGTCGCTCTTAATGACGC
GGTATTTGAAGGCAGGGTATTAAGTGTAAGCTTGGCTGAAGGATCACAAACACAAGGGCAAATATTGAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTACCCATCTCCTCCCTATCCAATTCCACTACAATGCCCGCCGCCGCTACCGGAGTCTCCTTCTTCACCACTCCCATAAGGGGTTCACGGTCCAATCCCTGGCTCTCCGA
TTCTCCCCTTGCAACCCCATCTACCCAGGTGTTGCCCTTACTGTCCCGCCCTCTGGCCGTTAAATCGGCTCCGCTTAGAGCTTTCTCAGAGAGGTGTCGCCCGGCTACGA
TCATCTCGGCCACCTCTGTGCAAGGAGAGGCGGCTTTGACGGTGGGGGTTGAAGAGGGTGCGGAGAAGGAAGGAGGGGAGGCGGTGGATGGTGGTTCTCCAGTGGAGTCC
GGGAGTACTAAGCTGTATTTTGGGAATTTGCCTTATAGTGTTGATAGTCCCCAGCTTGCGGCTATCGTTCAGGATTATGGGGTCGCCGAGCTTATTGAGGTTCTGTATGA
CAGGGATACTGGAAAAAGTAGAGGATTCGCATTTGTAACCATGAACAGTATTGATGATTGCAATAAAGTCATTGAAAATCTGAATGGAGCTACTTATATGGGCAGAATTT
TGAGGGTTAATTTCTCAGACAAACCTAAGCCCAAGGAACATTTGTTTCCAGAAACTGAGTATAAACTCTTTGTTCGAAACTTAGCTTGGTCAGTAACATCAGAAAGTTTG
ACACAAGCATTTCAAGAATATGGAAATGTGGTAGGAGCAAGGGTCATCTATAACGGGGAGACTGGAAGGTCACGTGGTTATGGCTTTGTTTCTTACTCAACAAAATCAGA
GATGGAAACGGCTCTTGTCGCTCTTAATGACGCGGTATTTGAAGGCAGGGTATTAAGTGTAAGCTTGGCTGAAGGATCACAAACACAAGGGCAAATATTGAACTGATTTA
TTGCATGTCAGCATACAATGACTGGACAAACCTGGAGTGACGGAATCTTGTCTCTTCTTTCTTTTTGTATGTACCCCATCTCTTCATTCTTGTGGTAGATAGATATCATA
TCGGTCCTGATTCAAACAAATGGTCACAACACTGAAATTCATAAATGGTTGTATCATGACTGGAAAGGAAAGAGGAAAGAATTTCTACCTTTCTCTTGCAGCTCGAGTGA
CCGAAATTTCTTTCTCGTTTGTTCATTTTGTTCGTATAGTCATAACTCAGTCCTATACCTTACAAGAGATTAGTCATATGATTGAATTGCAACAACTTGGTCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPAAATGVSFFTTPIRGSRSNPWLSDSPLATPSTQVLPLLSRPLAVKSAPLRAFSERCRPATIISATSVQGEAALTVGVEEGAEKEGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLP
YSVDSPQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRDTGKSRGFAFVTMNSIDDCNKVIENLNGATYMGRILRVNFSDKPKPKEHLFPETEYKLFVRNLAWSVTSESLTQAFQEYGNVV
GARVIYNGETGRSRGYGFVSYSTKSEMETALVALNDAVFEGRVLSVSLAEGSQTQGQILN