| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_022924566.1 serine/arginine-rich splicing factor RS31-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 8.5e-165 | 99.66 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
+GFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Query: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Subjt: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Query: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
Subjt: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
|
|
| XP_022924569.1 serine/arginine-rich splicing factor RS31-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 9.0e-175 | 100 | Show/hide |
Query: MQRLYSYMCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
MQRLYSYMCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
Subjt: MQRLYSYMCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
Query: VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
Subjt: VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
Query: PYERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGS
PYERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGS
Subjt: PYERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGS
Query: VRSRSPIRRSRT
VRSRSPIRRSRT
Subjt: VRSRSPIRRSRT
|
|
| XP_022924570.1 serine/arginine-rich splicing factor RS31A-like isoform X3 [Cucurbita moschata] | 8.5e-165 | 99.66 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
+GFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Query: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Subjt: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Query: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
Subjt: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
|
|
| XP_022979301.1 serine/arginine-rich splicing factor RS31A-like isoform X1 [Cucurbita maxima] | 8.5e-157 | 94.61 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
+GFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Query: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Subjt: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Query: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
P++GRNRSPEVGRNRSPE GRNRSP++GRNRSP+ GRNRSP++G NRSP++GRNRSPE GRNRSPE GRNRSPE GRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
Subjt: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
|
|
| XP_022979304.1 serine/arginine-rich splicing factor RS31A-like isoform X2 [Cucurbita maxima] | 7.7e-166 | 94.87 | Show/hide |
Query: MQRLYSYMCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
MQRLYSYMCIS PIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
Subjt: MQRLYSYMCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
Query: VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
Subjt: VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
Query: PYERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGS
PYERRRSPDYGRNRSP++GRNRSPEVGRNRSPE GRNRSP++GRNRSP+ GRNRSP++G NRSP++GRNRSPE GRNRSPE GRNRSPE GRNRSPEYGS
Subjt: PYERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGS
Query: VRSRSPIRRSRT
VRSRSPIRRSRT
Subjt: VRSRSPIRRSRT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1E9I9 serine/arginine-rich splicing factor RS31-like isoform X2 | 4.4e-175 | 100 | Show/hide |
Query: MQRLYSYMCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
MQRLYSYMCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
Subjt: MQRLYSYMCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
Query: VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
Subjt: VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
Query: PYERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGS
PYERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGS
Subjt: PYERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGS
Query: VRSRSPIRRSRT
VRSRSPIRRSRT
Subjt: VRSRSPIRRSRT
|
|
| A0A6J1ECU9 serine/arginine-rich splicing factor RS31-like isoform X1 | 4.1e-165 | 99.66 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
+GFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Query: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Subjt: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Query: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
Subjt: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
|
|
| A0A6J1EFE5 serine/arginine-rich splicing factor RS31A-like isoform X3 | 4.1e-165 | 99.66 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
+GFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Query: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Subjt: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Query: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
Subjt: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
|
|
| A0A6J1IQE3 serine/arginine-rich splicing factor RS31A-like isoform X1 | 4.1e-157 | 94.61 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
+GFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Query: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Subjt: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRNRS
Query: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
P++GRNRSPEVGRNRSPE GRNRSP++GRNRSP+ GRNRSP++G NRSP++GRNRSPE GRNRSPE GRNRSPE GRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
Subjt: PDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRSRT
|
|
| A0A6J1IWA9 serine/arginine-rich splicing factor RS31A-like isoform X2 | 3.7e-166 | 94.87 | Show/hide |
Query: MQRLYSYMCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
MQRLYSYMCIS PIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
Subjt: MQRLYSYMCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGK
Query: VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
Subjt: VLNVRIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG
Query: PYERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGS
PYERRRSPDYGRNRSP++GRNRSPEVGRNRSPE GRNRSP++GRNRSP+ GRNRSP++G NRSP++GRNRSPE GRNRSPE GRNRSPE GRNRSPEYGS
Subjt: PYERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGS
Query: VRSRSPIRRSRT
VRSRSPIRRSRT
Subjt: VRSRSPIRRSRT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P92964 Serine/arginine-rich splicing factor RS31 | 4.3e-79 | 71.62 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
+G+AFVYFE+ERDAED+IR LDN PFGY++RRLSVEWA+GERGR R +K+ +N +PTKTLFVINFDPIRT+ DIE+HFEPYGKV NVRIRRNF+FVQF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Query: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDD-SPRRA---AYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGP--YERRRSPD
ETQE+ATKALE T SKILDRVVSVEYAL+DD ER D SPRR+ Y R Y R PSP RRPSPDYGRARSP YDRY GP YERRRSPD
Subjt: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDD-SPRRA---AYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGP--YERRRSPD
Query: YGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRS
YGR RS DYGR RSP R RS
Subjt: YGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRS
|
|
| P92965 Serine/arginine-rich splicing factor RS40 | 4.4e-55 | 48.11 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERG---RSRDGS-KSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFA
AGFAFVY E+ERDAED+IR+LD FG RRL VEW + ERG RS GS +S ++ RP+KTLFVINFD TR RD+E+HFEPYGK++NVRIRRNFA
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERG---RSRDGS-KSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFA
Query: FVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSP--AYDRYNGPYERRRSPD
F+Q+E QE+AT+AL+ ++ SK++D+V+SVEYA++DD RG+ + RR RRSPSP R SPDYGR SP AY + R SPD
Subjt: FVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSP--AYDRYNGPYERRRSPD
Query: YGRNRSPD-YGRNR--SPEVGRNR----SPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNR-SPDYG--SNRSP--DYGRNRSPEVGRNR---SPEVGRNRSPEVGRNR
YGR RSP Y ++R SPE GR+R SP + +RSP+ R R SP++ SP G SP R R SPE G+ SP R
Subjt: YGRNRSPD-YGRNR--SPEVGRNR----SPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNR-SPDYG--SNRSP--DYGRNRSPEVGRNR---SPEVGRNRSPEVGRNR
Query: SPEYGSVRSRSPIRRSRT
+ G + SP+++SR+
Subjt: SPEYGSVRSRSPIRRSRT
|
|
| P92966 Serine/arginine-rich splicing factor RS41 | 3.0e-56 | 46.97 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGER---GRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAF
AGFAFVY E+ERDAED+IR+LD +G RRL VEW + +R GRS +S + RP+KTLFVINFD TR RD+ERHFEPYGK++NVRIRRNFAF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGER---GRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAF
Query: VQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGR
+Q+E QE+AT+AL+ T+ SK++D+V+SVEYA++DD RG+ Y RR RRSPSP R SPDYGR SP + R SPDYGR
Subjt: VQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGR
Query: NR-----------SPDYGRN-------RSPEVG--RNRSPEVGRNRS---PDYGRNRS----PDYGRNRS----PDYGSNRSPDYGRNR-SPEVGRNRSP
R SPDY R+ SPE G RNRSP GR S P Y + R P Y + R P Y R R++ SPE G+ SP
Subjt: NR-----------SPDYGRN-------RSPEVG--RNRSPEVGRNRS---PDYGRNRS----PDYGRNRS----PDYGSNRSPDYGRNR-SPEVGRNRSP
Query: EVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRS
G+ E GR G + SPIR S
Subjt: EVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIRRS
|
|
| Q5UPJ3 Uncharacterized protein L116 | 6.2e-09 | 48.57 | Show/hide |
Query: RRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRS
R RSP+ R RSP+ R RSPE R RSPE R RSP+ R RSP+ RSPD RS N+S E RS E R RSPE RSPE RS
Subjt: RRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSPDYGRNRSPDYGSNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRS
Query: RSPIR
R R
Subjt: RSPIR
|
|
| Q9ZPX8 Serine/arginine-rich splicing factor RS31A | 3.4e-76 | 67.23 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWAR---GERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAF
+G+AFVYFE+ERDAED+IR DN FGY RR+LSVEWA+ GERG+ RDG K+++NQRPTKTLFVINFDPIRTR RD+ERHFEPYGKVLNVR+RRNFAF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWAR---GERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAF
Query: VQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG--PYERRRSPDY
VQF TQE+ATKAL+ TH SK+LD+VVSVEYALR+ GER D Y S R RRSPSPVY RRPSPDY R RSP YDRY G PYERR+SPDY
Subjt: VQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG--PYERRRSPDY
Query: GRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSP
GR RS DYGR R+ RSP Y R+RSP
Subjt: GRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT2G46610.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.4e-77 | 67.23 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWAR---GERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAF
+G+AFVYFE+ERDAED+IR DN FGY RR+LSVEWA+ GERG+ RDG K+++NQRPTKTLFVINFDPIRTR RD+ERHFEPYGKVLNVR+RRNFAF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWAR---GERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAF
Query: VQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG--PYERRRSPDY
VQF TQE+ATKAL+ TH SK+LD+VVSVEYALR+ GER D Y S R RRSPSPVY RRPSPDY R RSP YDRY G PYERR+SPDY
Subjt: VQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG--PYERRRSPDY
Query: GRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSP
GR RS DYGR R+ RSP Y R+RSP
Subjt: GRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSP
|
|
| AT2G46610.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.9e-78 | 66.67 | Show/hide |
Query: MCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWAR---GERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNV
M S I AG+AFVYFE+ERDAED+IR DN FGY RR+LSVEWA+ GERG+ RDG K+++NQRPTKTLFVINFDPIRTR RD+ERHFEPYGKVLNV
Subjt: MCISPPIFAGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWAR---GERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNV
Query: RIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG--PY
R+RRNFAFVQF TQE+ATKAL+ TH SK+LD+VVSVEYALR+ GER D Y S R RRSPSPVY RRPSPDY R RSP YDRY G PY
Subjt: RIRRNFAFVQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNG--PY
Query: ERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSP
ERR+SPDYGR RS DYGR R+ RSP Y R+RSP
Subjt: ERRRSPDYGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRSPEVGRNRSPDYGRNRSP
|
|
| AT3G61860.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.1e-80 | 71.62 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
+G+AFVYFE+ERDAED+IR LDN PFGY++RRLSVEWA+GERGR R +K+ +N +PTKTLFVINFDPIRT+ DIE+HFEPYGKV NVRIRRNF+FVQF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGERGRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFVQF
Query: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDD-SPRRA---AYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGP--YERRRSPD
ETQE+ATKALE T SKILDRVVSVEYAL+DD ER D SPRR+ Y R Y R PSP RRPSPDYGRARSP YDRY GP YERRRSPD
Subjt: ETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDD-SPRRA---AYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGP--YERRRSPD
Query: YGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRS
YGR RS DYGR RSP R RS
Subjt: YGRNRSPDYGRNRSPEVGRNRS
|
|
| AT5G52040.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.3e-58 | 46.65 | Show/hide |
Query: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGER---GRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAF
AGFAFVY E+ERDAED+IR+LD +G RRL VEW + +R GRS +S + RP+KTLFVINFD TR RD+ERHFEPYGK++NVRIRRNFAF
Subjt: AGFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGER---GRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAF
Query: VQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGR
+Q+E QE+AT+AL+ T+ SK++D+V+SVEYA++DD RG+ Y RR RRSPSP R SPDYGR SP + R SPDYGR
Subjt: VQFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGR
Query: NR-----------SPDYGRN-------RSPEVG--RNRSPEVGRNRS---PDYGRNRS----PDYGRNRS----PDYGSNRSPDYGRNR-SPEVGRNRSP
R SPDY R+ SPE G RNRSP GR S P Y + R P Y + R P Y R R++ SPE G+ SP
Subjt: NR-----------SPDYGRN-------RSPEVG--RNRSPEVGRNRS---PDYGRNRS----PDYGRNRS----PDYGSNRSPDYGRNR-SPEVGRNRSP
Query: EVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIR
G+ E GR +R SP R
Subjt: EVGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIR
|
|
| AT5G52040.4 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.3e-57 | 46.48 | Show/hide |
Query: GFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGER---GRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFV
GFAFVY E+ERDAED+IR+LD +G RRL VEW + +R GRS +S + RP+KTLFVINFD TR RD+ERHFEPYGK++NVRIRRNFAF+
Subjt: GFAFVYFEEERDAEDSIRSLDNMPFGYDRRRLSVEWARGER---GRSRDGSKSMANQRPTKTLFVINFDPIRTRVRDIERHFEPYGKVLNVRIRRNFAFV
Query: QFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRN
Q+E QE+AT+AL+ T+ SK++D+V+SVEYA++DD RG+ Y RR RRSPSP R SPDYGR SP + R SPDYGR
Subjt: QFETQEEATKALECTHMSKILDRVVSVEYALRDDGERGDHYDDSPRRAAYGRLGDSPYRRSPSPVYHRRPSPDYGRARSPAYDRYNGPYERRRSPDYGRN
Query: R-----------SPDYGRN-------RSPEVG--RNRSPEVGRNRS---PDYGRNRS----PDYGRNRS----PDYGSNRSPDYGRNR-SPEVGRNRSPE
R SPDY R+ SPE G RNRSP GR S P Y + R P Y + R P Y R R++ SPE G+ SP
Subjt: R-----------SPDYGRN-------RSPEVG--RNRSPEVGRNRS---PDYGRNRS----PDYGRNRS----PDYGSNRSPDYGRNR-SPEVGRNRSPE
Query: VGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIR
G+ E GR +R SP R
Subjt: VGRNRSPEVGRNRSPEYGSVRSRSPIR
|
|
