; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh15G002870 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh15G002870
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionmini zinc finger protein 2-like
Genome locationCmo_Chr15:1354802..1355092
RNA-Seq ExpressionCmoCh15G002870
SyntenyCmoCh15G002870
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016139.1 Zinc-finger homeodomain protein 9, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.4e-41100Show/hide
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]4.8e-4292.71Show/hide
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XP_022939280.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita moschata]7.1e-46100Show/hide
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XP_022993699.1 mini zinc finger protein 2 [Cucurbita maxima]2.7e-4598.96Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]6.2e-4290.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor1.1e-3991.3Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 22.3e-4292.71Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 22.3e-4292.71Show/hide
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A0A6J1FM92 mini zinc finger protein 2-like3.4e-46100Show/hide
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A0A6J1K0U7 mini zinc finger protein 21.3e-4598.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 15.7e-2271.43Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 31.8e-2362.77Show/hide
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        M+KRQVV+++ +     T +SS    +VRY ECQKNHAA++GGYAVDGCREFMASG +    ALTCAACGCHR+FHRR+V TEVV  C  SP N
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Q2RB28 Mini zinc finger protein 15.7e-2271.43Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 11.2e-2456.86Show/hide
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 25.9e-3579.38Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger1.3e-2462.77Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 18.7e-2656.86Show/hide
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AT2G18350.1 homeobox protein 245.1e-1871.15Show/hide
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        RY ECQKNHAAS GG+ VDGC EFM+SG+EGT  +L CAAC CHRSFHR+++
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AT3G28917.1 mini zinc finger 24.2e-3679.38Show/hide
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AT3G50890.1 homeobox protein 283.0e-1869.09Show/hide
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        +  +Y ECQKNHAAS GG+ VDGC EFMA G+EGT  AL CAAC CHRSFHR++V
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AACCACGCTGCGAGTGTCGGAGGGTACGCCGTCGATGGGTGTCGAGAATTCATGGCAAGCGGCGATGAAGGTACGACTTCTGCACTGACTTGCGCTGCCTGCGGT
TGCCACCGGAGTTTCCATAGAAGGCAAGTTGGAACGGAGGTAGTCAGTGATTGCTCGTCGTCTCCCTCAAACGAAACTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGAAAGCGTCAAGTGGTGCTCAGAAGATCAGAAGAACCCTCGAGAGACACTGAGGCTTCCTCTTTCACAGTAAGGAGTGTTAGATATGGGGAGTGCCAAAAG
AACCACGCTGCGAGTGTCGGAGGGTACGCCGTCGATGGGTGTCGAGAATTCATGGCAAGCGGCGATGAAGGTACGACTTCTGCACTGACTTGCGCTGCCTGCGGT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRKRQVVLRRSEEPSRDTEASSFTVRSVRYGECQKNHAASVGGYAVDGCREFMASGDEGTTSALTCAACGCHRSFHRRQVGTEVVSDCSSSPSNET