; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh15G003630 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh15G003630
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionsirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like
Genome locationCmo_Chr15:1692834..1695080
RNA-Seq ExpressionCmoCh15G003630
SyntenyCmoCh15G003630
Gene Ontology termsGO:0006979 - response to oxidative stress (biological process)
GO:0019354 - siroheme biosynthetic process (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0042802 - identical protein binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051266 - sirohydrochlorin ferrochelatase activity (molecular function)
GO:0051536 - iron-sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002762 - Sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578662.1 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.7e-11198.55Show/hide
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KAG7016202.1 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.8e-11097.58Show/hide
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XP_022939639.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]1.1e-112100Show/hide
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XP_022993758.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]4.7e-11198.07Show/hide
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XP_023551685.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.2e-11299.52Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KP17 Uncharacterized protein8.1e-9383.09Show/hide
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A0A1S3C8S9 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic1.9e-9484.06Show/hide
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A0A5D3BY55 Sirohydrochlorin ferrochelatase1.9e-9484.06Show/hide
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A0A6J1FHT5 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like5.4e-113100Show/hide
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A0A6J1K384 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like2.3e-11198.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A6UWT5 Sirohydrochlorin cobaltochelatase3.4e-1128.26Show/hide
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P61817 Sirohydrochlorin ferrochelatase1.7e-1534.48Show/hide
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P61819 Sirohydrochlorin cobaltochelatase1.0e-1228.06Show/hide
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                        G+  +   P+G  ++++D+V DR
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Q58380 Sirohydrochlorin cobaltochelatase1.0e-1230.43Show/hide
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                        +  I   P+G  +++VD++ DR
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Q84JH7 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic4.2e-6276.92Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G50170.1 sirohydrochlorin ferrochelatase B3.0e-6376.92Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGTCGGACGGTCCTCTACATTAAGGAATTTCTCCTCGCGGTTCCGCATGAGTGTGGATAATGGAGGCGCTGATCGGATTGGTGCTGGAGATGCCGTGATCATTGTCGACC
ATGGCTCTCGCCGCCGGGAATCTAATCTCATGCTGAATGAATTCGTTGCTATGTTTAGGGATAAAACTGGTTACCCTATTGTGGAACCTGCTCACATGGAGTTGGCTGAA
CCGTCGATAAGAGACTCATTTGCATCGTGTGTCGAACAGGGGGCCAAACGAATCGTTGTAAGCCCATTCTTTCTCTTCCCCGGTCGACATTGGCAACAGGACATTCCTTC
CTTAACAGCTGAAGCAGCAAAGGATCACCCGGGAATATCGTATATAATAACTGCTCCTCTCGGTCTTCATGAACAGCTTGTGGATGTCGTGAATGATCGAATAAGTCACT
GTTTAAGCCATGCTGCTGGAGTTGTAGAGGAATGTGAAGTCTGTGCAGGAACAGGCAAATGCAAATTTAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATGAATCGTTTCTACAAAAGAAGAATATATACTTTTCTCTCTCTAAACGACATCGTTTTCCAGGTCAATCGTTCCAGACAGGCTGCCTCTGCAAAGGATCGGAACCCAT
GACATCGTTATCCATCCCTTCTCAAATTACAGTGAAGAGTCCTTCAGCAGGGGAAACTAGAAAAACGTATACAATCTGCGCATCTCAGAAATCTTCAATTCTGATCGGAG
TCGGACGGTCCTCTACATTAAGGAATTTCTCCTCGCGGTTCCGCATGAGTGTGGATAATGGAGGCGCTGATCGGATTGGTGCTGGAGATGCCGTGATCATTGTCGACCAT
GGCTCTCGCCGCCGGGAATCTAATCTCATGCTGAATGAATTCGTTGCTATGTTTAGGGATAAAACTGGTTACCCTATTGTGGAACCTGCTCACATGGAGTTGGCTGAACC
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TAACAGCTGAAGCAGCAAAGGATCACCCGGGAATATCGTATATAATAACTGCTCCTCTCGGTCTTCATGAACAGCTTGTGGATGTCGTGAATGATCGAATAAGTCACTGT
TTAAGCCATGCTGCTGGAGTTGTAGAGGAATGTGAAGTCTGTGCAGGAACAGGCAAATGCAAATTTAATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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