; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh15G004360 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh15G004360
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionChlorophyll A-B binding protein
Genome locationCmo_Chr15:1971872..1972423
RNA-Seq ExpressionCmoCh15G004360
SyntenyCmoCh15G004360
Gene Ontology termsGO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578732.1 hypothetical protein SDJN03_23180, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-9099.45Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE
        MAAIPSSSLQFPNSLALA NSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE

Query:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
        AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
Subjt:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS

XP_022938525.1 uncharacterized protein LOC111444734 [Cucurbita moschata]2.1e-91100Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE
        MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE

Query:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
        AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
Subjt:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS

XP_022992796.1 uncharacterized protein LOC111489022 [Cucurbita maxima]2.7e-8696.72Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE
        MAAIPSSSLQFPNSLALA NSKPHKPK+LTFV RAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGS TAAASSVYLPPVPLKE
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE

Query:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
        AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGL ALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQ YFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
Subjt:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS

XP_023550096.1 uncharacterized protein LOC111808391 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.8e-8898.36Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE
        MAAIPSSSLQFPNSLA A NSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGS TAAASSVYLPPVPLKE
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE

Query:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
        AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
Subjt:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS

XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]6.2e-7588.11Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLA--RLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L     P KPK LTFVTRAADPESPAADSE  SDGDDFEDRLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS+KGS TAA SSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLA--RLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+SALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAA AALYIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS45 Uncharacterized protein5.2e-7586.56Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSE-PRSDGDDFEDRLA--RLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL L  NSKP KPK LTF+TRAADPESPA DSE P SDGDDFEDRLA  R++ R GTGKKAEIRKARKS++GSTT AASSVYLPPV 
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSE-PRSDGDDFEDRLA--RLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
        LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+SALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAA AA+YIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS

A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein3.3e-7485.48Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSE-PRSDGDDFEDRLA--RLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL L  NSK HKP+ LTF+TRAADPES  +DSE P SDGDDFEDRLA  R + R GTGKKAEIRKARKS+KGSTT AASSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSE-PRSDGDDFEDRLA--RLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
        LKE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+SALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAA AA+YIKYEKEKVSVWP+DEIKS
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS

A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC1110061196.7e-7583.87Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLA--RLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTT-AAASSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL    NSKPHK K LTFVTRAADPE+PAAD EP SDGDDFE+RLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLA--RLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTT-AAASSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILG+SALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAA AA+Y+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS

A0A6J1FK14 uncharacterized protein LOC1114447341.0e-91100Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE
        MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE

Query:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
        AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
Subjt:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS

A0A6J1JUJ1 uncharacterized protein LOC1114890221.3e-8696.72Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE
        MAAIPSSSLQFPNSLALA NSKPHKPK+LTFV RAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGS TAAASSVYLPPVPLKE
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKE

Query:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
        AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGL ALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQ YFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS
Subjt:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12345.1 unknown protein6.7e-4361.07Show/hide
Query:  TRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLA--RLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSA
        T    P+     SE  +D D FE RL+  RL+ R GTGKKAE+RK++K   GS  +  + +YLPPV LKEAVSGGLKVE GFSP+SERING IA LGL+A
Subjt:  TRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLA--RLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGLSA

Query:  LVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQD
        L+LVELATGK V+NYHTP+++ +Q+YFVAA +A+++K EKEKVSVWP+D
Subjt:  LVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCAATTCCATCTTCCTCACTGCAATTCCCAAACTCCCTCGCACTCGCTTTCAATTCCAAGCCTCACAAGCCGAAGTCTCTCACCTTCGTAACCAGAGCAGCAGA
TCCGGAATCTCCTGCCGCCGATTCGGAACCTAGATCGGACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTGGCCCGACTCCAACTCCGACGCGGAACGGGAAAGAAGGCAGAGATTC
GTAAGGCTCGGAAGTCCAGGAAAGGATCAACCACCGCCGCCGCCTCGTCAGTGTATCTCCCGCCAGTGCCGCTGAAGGAAGCGGTTTCCGGCGGACTTAAGGTAGAATTC
GGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGATCAATGGATGGATTGCGATACTCGGATTATCGGCACTGGTTCTAGTGGAATTAGCCACTGGAAAAGGCGTCATCAATTACCACAC
GCCAGCGATTATACTAATTCAAGTATACTTCGTAGCGGCGGCGGCTGCTCTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCAAGATGAAATCAAAAGTT
AA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCAATTCCATCTTCCTCACTGCAATTCCCAAACTCCCTCGCACTCGCTTTCAATTCCAAGCCTCACAAGCCGAAGTCTCTCACCTTCGTAACCAGAGCAGCAGA
TCCGGAATCTCCTGCCGCCGATTCGGAACCTAGATCGGACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTGGCCCGACTCCAACTCCGACGCGGAACGGGAAAGAAGGCAGAGATTC
GTAAGGCTCGGAAGTCCAGGAAAGGATCAACCACCGCCGCCGCCTCGTCAGTGTATCTCCCGCCAGTGCCGCTGAAGGAAGCGGTTTCCGGCGGACTTAAGGTAGAATTC
GGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGATCAATGGATGGATTGCGATACTCGGATTATCGGCACTGGTTCTAGTGGAATTAGCCACTGGAAAAGGCGTCATCAATTACCACAC
GCCAGCGATTATACTAATTCAAGTATACTTCGTAGCGGCGGCGGCTGCTCTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCAAGATGAAATCAAAAGTT
AA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIPSSSLQFPNSLALAFNSKPHKPKSLTFVTRAADPESPAADSEPRSDGDDFEDRLARLQLRRGTGKKAEIRKARKSRKGSTTAAASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVEF
GFSPYSERINGWIAILGLSALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAAAALYIKYEKEKVSVWPQDEIKS