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CmoCh15G004440 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh15G004440
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr15:2017329..2022583
RNA-Seq ExpressionCmoCh15G004440
SyntenyCmoCh15G004440
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578743.1 LOB domain-containing protein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.2e-5698.28Show/hide
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KAG7016272.1 LOB domain-containing protein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.2e-5698.28Show/hide
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XP_022939142.1 LOB domain-containing protein 1-like [Cucurbita moschata]3.0e-58100Show/hide
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XP_022993359.1 LOB domain-containing protein 1-like [Cucurbita maxima]5.7e-4995.24Show/hide
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XP_023551518.1 LOB domain-containing protein 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.6e-5198.1Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KU20 LOB domain-containing protein1.8e-4888.07Show/hide
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A0A6J1FFZ7 LOB domain-containing protein 1-like1.5e-58100Show/hide
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A0A6J1JZZ3 LOB domain-containing protein 1-like2.8e-4995.24Show/hide
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A0A7J9KLE0 LOB domain-containing protein1.7e-4680.7Show/hide
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W9RZL7 LOB domain-containing protein1.7e-4683.04Show/hide
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        PPPPPP  VVLSPCAACKILRRRCVDKCVLAPYFPPTEPLKF   HR+FGA N+IKFLQE+PE+QRADA SS+VYEANARIRDPVYGC G+I QLQ QVS
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        ELQ QLA A+AE
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LBW3 LOB domain-containing protein 124.7e-3871.29Show/hide
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Q9LQR0 LOB domain-containing protein 12.4e-4271.93Show/hide
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        S PPP     VVLSPCAACKILRRRC ++CVLAPYFPPT+P KF   HR+FGA N+IKFLQELPE+QR DA +S+VYEA ARIRDPVYGC G+I+ LQ Q
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        VSELQ QLA A+ E
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Q9SA51 LOB domain-containing protein 39.2e-3466.99Show/hide
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        +SPCA CK+LRR+CV D CV APYFP  EP KFA VH+IFGA NV K LQEL EN R+DA  S+VYEANARI+DPVYGC G+I  L  Q+  LQ QLA A
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Q9SHE9 LOB domain-containing protein 47.5e-3669.31Show/hide
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        SPCAACK+LRRRC   CV +PYFP  EP KFA VHR+FGA NV K LQELP +QR DA SS+VYEANAR+RDPVYGC G+I  LQ Q+  LQ QLA+A+A
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Q9SK08 LOB domain-containing protein 119.8e-4471.43Show/hide
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        SPPPPP P       VVLSPCAACKILRRRC DKCVLAPYFPPT+P KF   HR+FGA N+IKFLQELPE+QR DA +S+VYEA AR+RDPVYGC G+I+
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         LQ QVSELQ QLA  + E
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07900.1 LOB domain-containing protein 11.7e-4371.93Show/hide
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        S PPP     VVLSPCAACKILRRRC ++CVLAPYFPPT+P KF   HR+FGA N+IKFLQELPE+QR DA +S+VYEA ARIRDPVYGC G+I+ LQ Q
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AT1G16530.1 ASYMMETRIC LEAVES 2-like 96.5e-3566.99Show/hide
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AT1G31320.1 LOB domain-containing protein 45.3e-3769.31Show/hide
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AT2G28500.1 LOB domain-containing protein 117.0e-4571.43Show/hide
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        SPPPPP P       VVLSPCAACKILRRRC DKCVLAPYFPPT+P KF   HR+FGA N+IKFLQELPE+QR DA +S+VYEA AR+RDPVYGC G+I+
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AT2G30130.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein3.3e-3971.29Show/hide
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        SPCA+CK+LRRRC   C+ APYFPP +P KFA VH++FGA NV K LQELP +QRADA +SLV+EANAR+RDPVYGC G+I  LQNQVS+LQ+QLAVA+A
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        E
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGATGGTGGTTCTCAGCCCTTGCGCCGCCTGTAAGATCCTCCGCCGGAGATGCGTCGATAAGTGTGTTTTAGCG
CCTTATTTTCCTCCGACTGAGCCACTCAAGTTCGCCGCCGTGCATAGAATATTTGGAGCCGGCAACGTAATCAAGTTTCTGCAGGAACTTCCAGAGAACCAGAGA
GCGGATGCTACAAGCAGTTTAGTATATGAAGCCAACGCTAGGATTCGAGACCCCGTCTATGGTTGCACTGGTTCAATTTTTCAGCTGCAAAATCAAGTGAGCGAG
CTCCAAGTGCAACTAGCCGTGGCTAAGGCTGAGGATAATTTTCATGTATTTACGTTCGGAGTCGTGGACAATCTGTTAGTCCGATTCCGATTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAGTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGATGGTGGTTCTCAGCCCTTGCGCCGCCTGTAAGATCCTCCGCCGGAGATGCGTCGATAAGTGTGTTTTAGCG
CCTTATTTTCCTCCGACTGAGCCACTCAAGTTCGCCGCCGTGCATAGAATATTTGGAGCCGGCAACGTAATCAAGTTTCTGCAGGAACTTCCAGAGAACCAGAGA
GCGGATGCTACAAGCAGTTTAGTATATGAAGCCAACGCTAGGATTCGAGACCCCGTCTATGGTTGCACTGGTTCAATTTTTCAGCTGCAAAATCAAGTGAGCGAG
CTCCAAGTGCAACTAGCCGTGGCTAAGGCTGAGGATAATTTTCATGTATTTACGTTCGGAGTCGTGGACAATCTGTTAGTCCGATTCCGATTATGAGGAGACCTA
AACATAGATTCTTCATCCTCGTTGAATTTCATATACATTCCCCCAATCTTAATATTTAGATTACTCCATTCTTCTTCACAAATAGCAAGAAGCTTTAGCTCCATT
CAAATTCTTGAAGGATACATTCTTAACAAAACTGATATACTCTTTAATTGTACACATTCTACGAGTTTATCCACTCCTTATTAGAAGACTAGAGGAATGGGAGCT
GGACGTAAGTTGAAGTCCCACCGTAGAAGGCAGAGATGGGCAGATAAGTCATATAAGAAATCCCATCTTGGTAATGAGTGGAAAAAGCCTTTTGCAGGGTCATCT
CATGCGAAAGGAATTGTGCTCGAAAAGATTGGAATTGAAGCCAAGCAGCCAAATTCTGCTATTAGAAAATGTGCTCGTGTTCAACTGATTAAAAACGGGAAGAAG
ATTGCTGCTTTTGTACCTAACGATGGCTGCCTCAATTACATTGAGGAAAATGACGAAGTGTTGATTGCGGGATTTGGACGTAAGGGTCATGCTGTGGGAGATATT
CCTGGTGTTAGGTTCAAAGTTGTGAAAGTTTCTGGGGTTTCACTTTTGGCTCTCTTCAAGGAGAAGAAAGAGAAGCCGAGGTCCTAGAAACGCCTTCGCTAATCA
CTGGTTTTTGTGTACTCTTAATTTAATTTAAATTCAAATCATCCATCAAATTTTGATACACTCTTAATTTTTTAATTTGAACGCTTATGCATGACAGTGTACAGG
GGGTTGATTAGAATCATCTCGACGATGCTATTGATTCTTCTTCAAACAGCTTCAATGGACAATAACAAAATGTGATAAAAATTGATTGAAATCAACTTCAATGAT
GTATAACTAACTATCTTGATTTAATTCAGTTCACGCGGTTGTTTAGGCGAATGGAGTTAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQSPPPPPPPLMVVLSPCAACKILRRRCVDKCVLAPYFPPTEPLKFAAVHRIFGAGNVIKFLQELPENQRADATSSLVYEANARIRDPVYGCTGSIFQLQNQVSE
LQVQLAVAKAEDNFHVFTFGVVDNLLVRFRL