CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh15G005430
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Nuclear pore complex protein NUP1-like
Genome location	Cmo_Chr15:2575826..2584149
RNA-Seq Expression	CmoCh15G005430
Synteny	CmoCh15G005430
Gene Ontology terms	GO:0016973 - poly(A)+ mRNA export from nucleus (biological process) GO:0071763 - nuclear membrane organization (biological process) GO:0005635 - nuclear envelope (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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KAG7016358.1 Nuclear pore complex protein NUP1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_022938794.1 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 [Cucurbita moschata]

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XP_023550414.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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        SSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAA SSSPMLF
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        GSSTTGAASTTSMFSFTSAATAA SQPAFG SNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPF
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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A1S3C4Z3 nuclear pore complex protein NUP1-like

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        RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPV S+ +QEGSPKFP  +Q+GV PHM PTHV+NANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSM   
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                  GNPSKSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRATPSIKNS+ATTD+YRAT +SSSQSAWEQG LL S QGALK
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        RR+SVLDD++GSVGPIRR R KSN LFP GLSLPSSSTSIP SGI SET++HLQSTKVHPFSS  GK  YSSET+RN SK SAES+N  TPSSSFP+IPL
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Query:  RSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSIS
        RSSEMA KILEQLD LTPPKEKSSELKL SVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE+VDSAKYLENVE I+SND  D TS+K DKFE+SS  KS VP+DKSIS
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Query:  TGGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVSAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVS
        T  GVGSSVP+KD  S SG+QVSFVGPS  TKCAFQMS  EDFVDMD+E +SNGPV+ KSFE REKVDDSLV+V KP +TEAITV K + SI+AKPS VS
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Query:  EMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPA
         M KINDQ KSDVP TTEKS IFSFPT S  S+TANV  PES+ RPEK+AS E+PKAA APIFGFGEK PSQK+ +   PTF FG+K TT TNEQNA+P 
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Query:  VTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAK-AGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESMSEKAGDKKSSSAG
        VTSE N  PT  AS PTTFKFGDKA+F IPA+ ATENGN  AGS FKF S LVNEKEGA   GSASVFK+E+SSSS  SFGVPKESMSEKAGD KSSS G
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Query:  LSVGTSGNLLLSSVS---STPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGS-TPSTFPSPSNTFPSNITNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAP
        L  GTSGNL  SS S   STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGSL S TPST P+P+ TF +N+T+QNSSIKPS  AATSNSEPVT+TS   SSPMPSFSAAP
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        IFKFGSSSVPS+     SAPSGVGSVE KTK ETT FGN+SG+ PSDT+A KV STGSSVFQFGAASTTSD+NK P  STFA  ++P+FGAPV  +SSG+
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Query:  ASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLFTSGATFGF-GSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGL
        ASSTQSTP   F SSSTSFGLTGNTGLASG+SL GSSAPASN FTSGATFG   SSSSANNSVSS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STP+GGFSFGL
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Query:  ASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPAFGTSNHGFTFGSTPPA-NNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGF
        +SSS+AS+S+PM+FGSS+TG AS  SMFSFTSAA+A  SQPAFG SN+ FTFGSTPPA NN+ A+MEDSMAEDTVQT    +PMPSFGQQPLTPPPSSGF
Subjt:  ASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPAFGTSNHGFTFGSTPPA-NNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGF

Query:  VFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
        +FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNV  PQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
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A0A6J1FF52 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1

0.0e+00

88.71

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A0A6J1FKS9 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2

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A0A6J1JQT4 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1

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        SPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLF SGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASS PSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSS+
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A0A6J1K059 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2

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86.08

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Subjt:  MATEREGVHYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPIALRNSNGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISRGFHTAFFLLIRLILE

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Query:  EGKVNGVMYACRHKTAYRYTRKQQNSFSFQVSASIFDCLPLHFILPEANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFT
                                                      EANDEMEIKNQEEVAAD PGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFT
Subjt:  EGKVNGVMYACRHKTAYRYTRKQQNSFSFQVSASIFDCLPLHFILPEANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFT

Query:  RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQ
        RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPVISYDIQEGSPKFPAQE VRPHMVP HV+NANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQ
Subjt:  RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQ

Query:  KFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRS
        KFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSIKNSVATTDSYRA+VTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRS
Subjt:  KFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRS

Query:  SVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLRSS
        SVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSET QHLQSTKVHPFSS AGKAPYSSETKRNLSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLRSS
Subjt:  SVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLRSS

Query:  EMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGG
        EMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKK DKFEDSSLLKS+VPSDKSISTGG
Subjt:  EMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTGG

Query:  GVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVSAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMK
        GVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPV+AKSFERREKVDDSLVAVGKPSD EAI VDKPQASIQAKPS VSEMK
Subjt:  GVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVSAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMK

Query:  KINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTS
        KINDQAKSD+PVTTEKSSIFSFPTASPSSTTA VIEPESTTRPEKIA SEVPKAA APIFGFGEK PSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTS
Subjt:  KINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTS

Query:  EGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESMSEKAGDKKSSSAGLSVG
        EGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPAST TENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSASVFKSESSSSS LSFGVPKE MSEKAGDKKSSSAGLSVG
Subjt:  EGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESMSEKAGDKKSSSAGLSVG

Query:  TSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSS
        TSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSS
Subjt:  TSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNITNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSS

Query:  VPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFS
        VPS+SAP+G GSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNK+PEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFS
Subjt:  VPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFS

Query:  SSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSSSPMLF
        SSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLF SGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASS PSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSS+PMLF
Subjt:  SSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSSSPMLF

Query:  GSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPAFGTSNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPF
        GSS+TGAASTTSMFSFTSAATAA SQPAFG SNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAEDTVQTVA PTPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPF
Subjt:  GSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPAFGTSNHGFTFGSTPPANNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPF

Query:  QFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
        QFGGSQQNV TPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
Subjt:  QFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9CAF4 Nuclear pore complex protein NUP1

7.4e-89

31.24

Show/hide

Query:  GRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPIALRNS-------NGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISRGFHTAFFLLIRLILEALAED
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP  ++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RLF S+ RKRL      L                  + L E 
Subjt:  GRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPIALRNS-------NGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISRGFHTAFFLLIRLILEALAED

Query:  GIFKNNFIIILIFSRGSSYSLGVFILFSWWNLDLLFCMNFNYLNVITLRDSMLMNLKYVKVQVSTLTSRITSSLLVMLFCFCCLDVIYVKNIRILEGKVN
        G+ +   +                                                   K  VS L+ +                              N
Subjt:  GIFKNNFIIILIFSRGSSYSLGVFILFSWWNLDLLFCMNFNYLNVITLRDSMLMNLKYVKVQVSTLTSRITSSLLVMLFCFCCLDVIYVKNIRILEGKVN

Query:  GVMYACRHKTAYRYTRKQQNSFSFQVSASIFDCLPLHFILPEANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEID
        G++                                           ME  N    + DPP                    G +DLEKIL+ KTFTR E+D
Subjt:  GVMYACRHKTAYRYTRKQQNSFSFQVSASIFDCLPLHFILPEANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEID

Query:  RLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDT
        RLT LL+S+ AD  +  E ++ E+     V+ +       +     G    +V T   +    DE +ASPA++AKA+MGSRP + TP  +    Q   + 
Subjt:  RLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDT

Query:  FALGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQG---ALKR
            N    P KS T+SLV +  G   +EN FVTPRSRGRSA+YSMAR PYSR +++  I            ++  +S S WE+     S QG    LKR
Subjt:  FALGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQG---ALKR

Query:  RSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLR
        RSSVLD++IGSVGP+RRIR KSN L  + L+LP S + + V   G E + H                          SK SAE      P SSF  +P +
Subjt:  RSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLR

Query:  SSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSIST
        SSEMA KIL+QLDKL   +EK            SP KLSPSML GPAL+SL++V++ K+L N+ + ++N   D + +K++   +S   +    S+K+   
Subjt:  SSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSIST

Query:  GGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSL-----TKCAFQMSVQEDFVDMDDE-EYSNGPVSAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAK
          G   +  SKD     G  V     +SL      K +F+MS  EDF+++DD+   ++ P      +   +V+ S +++           +KP    +A 
Subjt:  GGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSL-----TKCAFQMSVQEDFVDMDDE-EYSNGPVSAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAK

Query:  PSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQ--KDPVFSSPTFTFGNKVTTSTN
        PS          Q  S+  + TE++   +FP  +   +     EP S    + I  +E    ++       +++P +  K P    P  +F    T   N
Subjt:  PSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQ--KDPVFSSPTFTFGNKVTTSTN

Query:  EQNAVPA-VTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEA----GSPFKFASSLVN--EKEGAKAGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESM
        + +   A +  E   +     S         K TF   AS A E+  S A    GS F   ++ V      G+   S S   S S+  S  S G    ++
Subjt:  EQNAVPA-VTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEA----GSPFKFASSLVN--EKEGAKAGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESM

Query:  SEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTP--TPSLFSFSSPTT--NSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNIT---------NQNSSIKPSLNAATSN
           A    SSS    + TS +    S S++P  + S F F  P    ++  ++ S G         + TF +  T         +Q++ I     +A + 
Subjt:  SEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTP--TPSLFSFSSPTT--NSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNIT---------NQNSSIKPSLNAATSN

Query:  SEP------VTTTSLSTSSPMPSFSAAP------IFKFGSSSVPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSA---AKVFSTGSSVFQFGAAST
        S P       +    ST +P  + ++AP      IF   SSS P +   S + +    T    + FG  S    S  S+       STGSSVF F A S+
Subjt:  SEP------VTTTSLSTSSPMPSFSAAP------IFKFGSSSVPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSA---AKVFSTGSSVFQFGAAST

Query:  TSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSS-SSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAG
         S ++ Q + S          G       SG  +STQS P    SS S+ SFGL+GN+ LAS +S  G S     +FTS +T      SS N+S SS + 
Subjt:  TSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSS-SSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAG

Query:  TSSSFF--NWQA-----SSAPSFSSGF--GSTPTGGFSFGLASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPA-----------FGTSNH
         SS  F  +WQA     +S P FSS F   STPT  FSFG +S++  SS++  +FG+ST    S + +F F S     P QP            FG S  
Subjt:  TSSSFF--NWQA-----SSAPSFSSGF--GSTPTGGFSFGLASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPA-----------FGTSNH

Query:  GFTFGSTPPA----NNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLT-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNAS
        GF FG+        NN   +MEDSMAEDT Q   +    P FGQ  ++ P P+  F  G+    P  ANPFQFGG Q    T QN +PFQAS SL+F   
Subjt:  GFTFGSTPPA----NNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLT-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNAS

Query:  AGGSFSLGA-GGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
         GGSFSLG+ GGGDKS R+  K K  +RKK
Subjt:  AGGSFSLGA-GGGDKSNRKFVKVKSKSRKK

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G10650.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1)

5.3e-90

31.24

Show/hide

Query:  GRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPIALRNS-------NGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISRGFHTAFFLLIRLILEALAED
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP  ++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RLF S+ RKRL      L                  + L E 
Subjt:  GRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPIALRNS-------NGKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISRGFHTAFFLLIRLILEALAED

Query:  GIFKNNFIIILIFSRGSSYSLGVFILFSWWNLDLLFCMNFNYLNVITLRDSMLMNLKYVKVQVSTLTSRITSSLLVMLFCFCCLDVIYVKNIRILEGKVN
        G+ +   +                                                   K  VS L+ +                              N
Subjt:  GIFKNNFIIILIFSRGSSYSLGVFILFSWWNLDLLFCMNFNYLNVITLRDSMLMNLKYVKVQVSTLTSRITSSLLVMLFCFCCLDVIYVKNIRILEGKVN

Query:  GVMYACRHKTAYRYTRKQQNSFSFQVSASIFDCLPLHFILPEANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEID
        G++                                           ME  N    + DPP                    G +DLEKIL+ KTFTR E+D
Subjt:  GVMYACRHKTAYRYTRKQQNSFSFQVSASIFDCLPLHFILPEANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEID

Query:  RLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDT
        RLT LL+S+ AD  +  E ++ E+     V+ +       +     G    +V T   +    DE +ASPA++AKA+MGSRP + TP  +    Q   + 
Subjt:  RLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDT

Query:  FALGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQG---ALKR
            N    P KS T+SLV +  G   +EN FVTPRSRGRSA+YSMAR PYSR +++  I            ++  +S S WE+     S QG    LKR
Subjt:  FALGN----PSKSSTLSLVPRSPGNFDVENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQG---ALKR

Query:  RSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLR
        RSSVLD++IGSVGP+RRIR KSN L  + L+LP S + + V   G E + H                          SK SAE      P SSF  +P +
Subjt:  RSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLR

Query:  SSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSIST
        SSEMA KIL+QLDKL   +EK            SP KLSPSML GPAL+SL++V++ K+L N+ + ++N   D + +K++   +S   +    S+K+   
Subjt:  SSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSIST

Query:  GGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSL-----TKCAFQMSVQEDFVDMDDE-EYSNGPVSAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAK
          G   +  SKD     G  V     +SL      K +F+MS  EDF+++DD+   ++ P      +   +V+ S +++           +KP    +A 
Subjt:  GGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSL-----TKCAFQMSVQEDFVDMDDE-EYSNGPVSAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAK

Query:  PSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQ--KDPVFSSPTFTFGNKVTTSTN
        PS          Q  S+  + TE++   +FP  +   +     EP S    + I  +E    ++       +++P +  K P    P  +F    T   N
Subjt:  PSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQ--KDPVFSSPTFTFGNKVTTSTN

Query:  EQNAVPA-VTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEA----GSPFKFASSLVN--EKEGAKAGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESM
        + +   A +  E   +     S         K TF   AS A E+  S A    GS F   ++ V      G+   S S   S S+  S  S G    ++
Subjt:  EQNAVPA-VTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEA----GSPFKFASSLVN--EKEGAKAGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESM

Query:  SEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTP--TPSLFSFSSPTT--NSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNIT---------NQNSSIKPSLNAATSN
           A    SSS    + TS +    S S++P  + S F F  P    ++  ++ S G         + TF +  T         +Q++ I     +A + 
Subjt:  SEKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTP--TPSLFSFSSPTT--NSNLINGSLGSTPSTFPSPSNTFPSNIT---------NQNSSIKPSLNAATSN

Query:  SEP------VTTTSLSTSSPMPSFSAAP------IFKFGSSSVPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSA---AKVFSTGSSVFQFGAAST
        S P       +    ST +P  + ++AP      IF   SSS P +   S + +    T    + FG  S    S  S+       STGSSVF F A S+
Subjt:  SEP------VTTTSLSTSSPMPSFSAAP------IFKFGSSSVPSSSAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSA---AKVFSTGSSVFQFGAAST

Query:  TSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSS-SSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAG
         S ++ Q + S          G       SG  +STQS P    SS S+ SFGL+GN+ LAS +S  G S     +FTS +T      SS N+S SS + 
Subjt:  TSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSS-SSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLFTSGATFGFGSSSSANNSVSSGAG

Query:  TSSSFF--NWQA-----SSAPSFSSGF--GSTPTGGFSFGLASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPA-----------FGTSNH
         SS  F  +WQA     +S P FSS F   STPT  FSFG +S++  SS++  +FG+ST    S + +F F S     P QP            FG S  
Subjt:  TSSSFF--NWQA-----SSAPSFSSGF--GSTPTGGFSFGLASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPA-----------FGTSNH

Query:  GFTFGSTPPA----NNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLT-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNAS
        GF FG+        NN   +MEDSMAEDT Q   +    P FGQ  ++ P P+  F  G+    P  ANPFQFGG Q    T QN +PFQAS SL+F   
Subjt:  GFTFGSTPPA----NNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLT-PPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNAS

Query:  AGGSFSLGA-GGGDKSNRKFVKVKSKSRKK
         GGSFSLG+ GGGDKS R+  K K  +RKK
Subjt:  AGGSFSLGA-GGGDKSNRKFVKVKSKSRKK

AT5G20200.1 nucleoporin-related

2.0e-04

24.82

Show/hide

Query:  PEANDE--MEIKNQEEVAA----DPPGTQEGTNNDFVPSINS------NNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSST
        P+ ND     I N+ E A+     P GT      +F  S         N+   +S+LE++++ KTF++ EIDRL E++ SR  D+P              
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Query:  PVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHM---------------------VPTHVLNA------NVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQK--FGD
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Show/hide protein sequence

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CmoCh15G005430 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome