; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh15G006100 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh15G006100
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionSASA domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr15:2959193..2961930
RNA-Seq ExpressionCmoCh15G006100
SyntenyCmoCh15G006100
Gene Ontology termsGO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578894.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-15098.86Show/hide
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KAG7016422.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.5e-15199.24Show/hide
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XP_022939276.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]9.1e-152100Show/hide
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XP_022993914.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita maxima]2.9e-15098.48Show/hide
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XP_023550941.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-15098.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K9J9 SASA domain-containing protein2.7e-11779.23Show/hide
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        PCAIGGSHL+EWVKGTNRY  LVER++ SE++GG V+G  WYQGESDAAVEEEA  YEREL+KFF DLRAD NHP+LPIILVK+VTHDFF+SP+  FKEE
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        V NA EAVT +LPN+ MVDG +AVGNFD+GLNED+GHLNVKSEV LGKMFAHS+YSNFAH
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A0A1S3B3Y0 probable carbohydrate esterase At4g342155.4e-11879.62Show/hide
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        PCAIGGSHL+EWVKGT+RY  LVER++ SE+ GGKVKGF WYQGESDAAVEEEA  YEREL+KFF DLRAD NHPDLPII+VKIVTHDFF+SP+  FKEE
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        V  A EAVT  LPN+ MVDG +AVGNFD+GLNED+GHLNVKSEV LGKMFAHS+YSNFAH
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A0A5D3CGI9 Putative carbohydrate esterase5.4e-11879.62Show/hide
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        A TSP NIFILAGQSNMAGRGGVS+DPTT+K VWDGYIP E Q N SIFR  ADMVWE+A EPLHWDIDVVKTNG+GPGMPFANELLA  G   G IGLV
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        V  A EAVT  LPN+ MVDG +AVGNFD+GLNED+GHLNVKSEV LGKMFAHS+YSNFAH
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A0A6J1FFF9 probable carbohydrate esterase At4g342154.4e-152100Show/hide
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A0A6J1K1G7 probable carbohydrate esterase At4g342151.4e-15098.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342153.8e-5244.09Show/hide
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        P  IFIL+GQSNMAGRGGV KD   ++ VWD  +PPE  PN SI R +AD+ WE+A EPLH DID  K  GVGPGM FAN +  +       IGLVPCA 
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        GG+ ++EW +G++ Y ++V+R + S + GG++K   WYQGESD     +A+SY   + +   +LR D+N P LPII V I +   +I       ++V  A
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Query:  QEAVTQKLPNIRMVDGRVAVGNFDEGLNEDRGHLNVKSEVNLGKMFAHSYYSNF
        Q  +  KL N+  VD +         L  D  HL  +++V LG   A +Y SNF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)9.3e-5445.02Show/hide
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        T   +IFILAGQSNMAGRGGV  D  T+  VWDG IPPE + N SI R T+ + W++A+EPLH DID+ KTNGVGPGMPFAN ++ +     G +GLVPC
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Query:  AIGGSHLREWVKGTNRYTKLVERMK--RSEEHGGKVKGFFWYQGESDAAVEEEAKSYERELSKFFTDLRADMNHPDLPIILVKIVTHDFFISPDFEFKEE
        +IGG+ L +W KG   Y + V+R K   +   GG  +   WYQGESD     +A  Y++ L KFF+DLR D+ HP+LPII V + T      P   + + 
Subjt:  AIGGSHLREWVKGTNRYTKLVERMK--RSEEHGGKVKGFFWYQGESDAAVEEEAKSYERELSKFFTDLRADMNHPDLPIILVKIVTHDFFISPDFEFKEE

Query:  VWNAQEAVTQKLPNIRMVDGRVAVGNFDEGLNEDRGHLNVKSEVNLGKMFAHSYY--------SNFAHFIS
        V  AQ  +   L N+  VD R         L  D  HL   S+V LG M A S+         S + HF S
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AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)2.7e-5344.09Show/hide
Query:  PANIFILAGQSNMAGRGGVSKDPTTDKNVWDGYIPPESQPNQSIFRFTADMVWEQAREPLHWDIDVVKTNGVGPGMPFANELLAKAGPSIGTIGLVPCAI
        P  IFIL+GQSNMAGRGGV KD   ++ VWD  +PPE  PN SI R +AD+ WE+A EPLH DID  K  GVGPGM FAN +  +       IGLVPCA 
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Query:  GGSHLREWVKGTNRYTKLVERMKRSEEHGGKVKGFFWYQGESDAAVEEEAKSYERELSKFFTDLRADMNHPDLPIILVKIVTHDFFISPDFEFKEEVWNA
        GG+ ++EW +G++ Y ++V+R + S + GG++K   WYQGESD     +A+SY   + +   +LR D+N P LPII V I +   +I       ++V  A
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Query:  QEAVTQKLPNIRMVDGRVAVGNFDEGLNEDRGHLNVKSEVNLGKMFAHSYYSNF
        Q  +  KL N+  VD +         L  D  HL  +++V LG   A +Y SNF
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AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)2.7e-5344.09Show/hide
Query:  PANIFILAGQSNMAGRGGVSKDPTTDKNVWDGYIPPESQPNQSIFRFTADMVWEQAREPLHWDIDVVKTNGVGPGMPFANELLAKAGPSIGTIGLVPCAI
        P  IFIL+GQSNMAGRGGV KD   ++ VWD  +PPE  PN SI R +AD+ WE+A EPLH DID  K  GVGPGM FAN +  +       IGLVPCA 
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Query:  GGSHLREWVKGTNRYTKLVERMKRSEEHGGKVKGFFWYQGESDAAVEEEAKSYERELSKFFTDLRADMNHPDLPIILVKIVTHDFFISPDFEFKEEVWNA
        GG+ ++EW +G++ Y ++V+R + S + GG++K   WYQGESD     +A+SY   + +   +LR D+N P LPII V I +   +I       ++V  A
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Query:  QEAVTQKLPNIRMVDGRVAVGNFDEGLNEDRGHLNVKSEVNLGKMFAHSYYSNF
        Q  +  KL N+  VD +         L  D  HL  +++V LG   A +Y SNF
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCTACTTCTCCGGCCAACATTTTCATACTTGCAGGGCAGAGCAACATGGCAGGCCGAGGCGGCGTCTCCAAAGACCCAACCACAGACAAAAACGTGTGGGATGG
TTATATCCCCCCAGAATCTCAACCCAACCAATCCATCTTTCGGTTCACTGCTGATATGGTATGGGAGCAAGCCCGTGAGCCACTCCATTGGGACATAGACGTTGTAAAGA
CCAATGGGGTTGGACCCGGCATGCCTTTTGCCAATGAGCTTTTGGCCAAAGCAGGCCCGAGCATTGGCACCATCGGTCTGGTTCCATGTGCCATTGGAGGATCTCACTTG
AGAGAATGGGTTAAAGGGACTAATAGGTACACCAAATTGGTTGAACGGATGAAACGTTCGGAAGAACATGGGGGGAAAGTTAAGGGATTCTTTTGGTATCAAGGAGAGTC
CGATGCGGCGGTGGAAGAAGAAGCTAAGTCGTACGAGAGAGAGCTGAGCAAATTCTTCACGGACTTGCGTGCGGACATGAACCATCCAGATCTACCCATCATCCTGGTGA
AGATAGTGACCCATGATTTCTTCATAAGCCCAGATTTTGAGTTCAAAGAAGAGGTATGGAATGCTCAGGAGGCAGTCACGCAGAAGCTGCCAAACATAAGAATGGTGGAC
GGTAGGGTGGCGGTGGGGAACTTTGATGAAGGGCTTAACGAAGACAGAGGTCATCTCAACGTTAAATCTGAAGTGAATTTGGGCAAAATGTTTGCTCATTCCTATTATTC
AAACTTCGCTCACTTCATTTCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCCTGTCCAGCTTCAAAGTAGAAGATGAGCATCGCTAACATGGCGATCCTAGCATGCTTGATCTCAGCCAACTTCAATCTCTCCAATTTGTCCGTGTCCGGAATGTAAA
CCCCATCTTTAATAGTTCCGGCAAATCCCAACGGATCGAAGAATTTTCCGCCGGGATAACCCTGTTCTCCCGTTGCGTTTGCGAAGTTCTCTGCCGTCCTCGACCATGGC
GTCGCCCATTCCACCGATTGAGACTCTGGGTTGAAGAAATCCACCCACCGCTTGCTCTCCACCCATCCCATTAGTAGAAGCTGGGTTCCGAGAAGTGATCCGAAGGAGAA
TGGAGCAATTGCGCCTGGATCGGCTCCGGCTTCGAACCATGGGATCCCACTCCAGGCTTGGCCTACGAAGATTCCGACCACCGCTGCCATTGCCCACCGGCCGTGGATCA
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AGGTGTTCGATGAAATGCCTCAATCAGCTTTTAGACAGTAACTAAAAAAAGTGCAACTAGAAGAAAGTAAGCGAGAGACATACGAGCCATCTAGCCATTCTGGGTCGACT
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