; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh15G012500 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh15G012500
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionAgamous-like MADS-box protein
Genome locationCmo_Chr15:8582334..8586940
RNA-Seq ExpressionCmoCh15G012500
SyntenyCmoCh15G012500
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016937.1 Agamous-like MADS-box protein AGL19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.5e-10499.07Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AT26 agamous-like MADS-box protein AGL195.3e-8785.45Show/hide
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A0A6J1E382 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X21.1e-10399.07Show/hide
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A0A6J1E6F6 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X13.9e-106100Show/hide
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A0A6J1I258 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X11.1e-10398.14Show/hide
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A0A6J1I349 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X22.9e-10197.21Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64645 MADS-box protein SOC11.4e-5257.62Show/hide
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O82743 Agamous-like MADS-box protein AGL194.6e-5661.79Show/hide
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Q38838 Agamous-like MADS-box protein AGL144.8e-5360.28Show/hide
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Q9FIS1 MADS-box protein AGL422.9e-5058.85Show/hide
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        MVRGK EMK+IENATSRQVTFSKRRNGLLKKA+ELSVLCDA+++LIIFS RG+LYEFS+  M KTI+RY+  TKD  +SN+ +   LQ  K+  S  IT 
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        K+E LE  KRKLLG G+ SCS++ELQ+++ QL+RSL K+R RK Q+ KE++ KLK +EK LLEEN  L  K      +   T Q+ E  K  D+ ++VET
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Q9XJ60 MADS-box transcription factor 501.0e-5055.66Show/hide
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         MDVETELFIGLP R  ++ G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45660.1 AGAMOUS-like 209.9e-5457.62Show/hide
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        VET+LFIGLP
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AT4G11880.1 AGAMOUS-like 143.4e-5460.28Show/hide
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        +V T+LFIG PE R
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AT4G22950.1 AGAMOUS-like 193.3e-5761.79Show/hide
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