; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh15G013990 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh15G013990
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCmo_Chr15:9521889..9522110
RNA-Seq ExpressionCmoCh15G013990
SyntenyCmoCh15G013990
Gene Ontology termsGO:0016874 - ligase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7017064.1 hypothetical protein SDJN02_22176, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.6e-2496.05Show/hide
Query:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANN---SSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
        MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANN   SSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
Subjt:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANN---SSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
XP_022159655.1 uncharacterized protein LOC111025999 [Momordica charantia]4.6e-1384.91Show/hide
Query:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSS
        MMLVSV+AE+LEEYTVLL EVLRQLF+SAPFPRRVRFLILHNLP  NNS+SS+
Subjt:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSS
XP_022928978.1 uncharacterized protein LOC111435715 [Cucurbita moschata]6.2e-26100Show/hide
Query:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
        MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
Subjt:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
XP_022970120.1 uncharacterized protein LOC111469109 [Cucurbita maxima]7.1e-2291.78Show/hide
Query:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
        MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANN      SSSSSSALIHSNRPSGAVA
Subjt:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
XP_023520510.1 uncharacterized protein LOC111783933 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.2e-2293.15Show/hide
Query:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
        MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANN    SSSSSSSSALI+SNRPSGAVA
Subjt:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KM75 Uncharacterized protein9.4e-1280.39Show/hide
Query:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSS
        MMLVSVLAEILEEYTV+L++VLRQLF+SAPFP RVRFLILHNLPFA+  ++
Subjt:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSS
A0A1S3AUP0 uncharacterized protein LOC1034828832.5e-1279.63Show/hide
Query:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSS
        MMLVSVLAEILEEYTV+L++VLRQLF+SAPFPRRVRFLILHNLPFA+  ++ S+
Subjt:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSS
A0A6J1DZC9 uncharacterized protein LOC1110259992.2e-1384.91Show/hide
Query:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSS
        MMLVSV+AE+LEEYTVLL EVLRQLF+SAPFPRRVRFLILHNLP  NNS+SS+
Subjt:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSS
A0A6J1EQP1 uncharacterized protein LOC1114357153.0e-26100Show/hide
Query:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
        MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
Subjt:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
A0A6J1I1Z0 uncharacterized protein LOC1114691093.4e-2291.78Show/hide
Query:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
        MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANN      SSSSSSALIHSNRPSGAVA
Subjt:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G33055.1 unknown protein6.2e-0850.98Show/hide
Query:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSS
        M+LV+++AE+++EYTV+L  V+  LF  APFPRR+R  IL++LPF ++++S
Subjt:  MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSS

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGCTCGTGTCGGTACTAGCGGAGATTCTGGAGGAGTACACGGTGTTGCTTACGGAGGTGCTCCGGCAGCTCTTCCATTCCGCGCCATTTCCTCGCCGAGTC
CGATTTCTCATCCTTCACAATCTTCCTTTCGCCAACAACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTGCCCTAATTCACTCCAATCGACCTAGCGGC
GCAGTTGCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGCTCGTGTCGGTACTAGCGGAGATTCTGGAGGAGTACACGGTGTTGCTTACGGAGGTGCTCCGGCAGCTCTTCCATTCCGCGCCATTTCCTCGCCGAGTC
CGATTTCTCATCCTTCACAATCTTCCTTTCGCCAACAACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTGCCCTAATTCACTCCAATCGACCTAGCGGC
GCAGTTGCTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMLVSVLAEILEEYTVLLTEVLRQLFHSAPFPRRVRFLILHNLPFANNSSSSSSSSSSSSALIHSNRPSGAVA