CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh16G004090
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Protein TIC 214
Genome location	Cmo_Chr16:1882961..1883318
RNA-Seq Expression	CmoCh16G004090
Synteny	CmoCh16G004090
Gene Ontology terms	GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR008896 - Protein TIC214

Homology

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GenBank top hits

e value

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YP_009751879.1 Ycf1 protein [Indofevillea khasiana]

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YP_009752373.1 Ycf1 protein [Bryonia marmorata]

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YP_009752639.1 Ycf1 protein [Trichosanthes homophylla]

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YP_009752977.1 Ycf1 protein [Momordica sessilifolia]

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YP_009753666.1 Ycf1 protein [Trichosanthes wallichiana]

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A0A6H0ERF2 Protein TIC 214

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A0A6H0ESD4 Protein TIC 214

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A0A6H0ETK3 Protein TIC 214

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A0A6H0EWP9 Protein TIC 214

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A0A6H0EXF7 Protein TIC 214

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SwissProt top hits

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A0A393 Protein TIC 214

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A6MM95 Protein TIC 214

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A6MN03 Protein TIC 214

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Q09FQ2 Protein TIC 214

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Arabidopsis top hits

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AT2G07739.1 Ycf1 protein

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80.88

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ATCG01000.1 Ycf1 protein

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ATCG01130.1 Ycf1 protein

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ATMG00370.1 Ycf1 protein

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82.35

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Sequences

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CDS sequence

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ATGAAGATAATCAATTCGGTCGTTGTGGGCCCTCTTATCTCTTCCTTCTCCGAGCTCGGGTTATGGAAGAAGGAACCGGTCATTGTGGTCGGACTCTATTATGGATTTCT
GACCACATTTTCGATAGGGCCCTCTTATCTCTTCCTTTTTCGAGCTCGAGTTATGAAAGAAGGAACTGAAAAGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTAATACGGGACAGT
TCTTGATATTCATATTGATCTATTATGCACCTCTACATCTAGCATTGGGTAGATGTTATATTGATCTATTATGCACCTCTGCATCTAGCATTGGGTAG

mRNA sequence

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Protein sequence

Show/hide protein sequence

MKIINSVVVGPLISSFSELGLWKKEPVIVVGLYYGFLTTFSIGPSYLFLFRARVMKEGTEKKVSATTGFNTGQFLIFILIYYAPLHLALGRCYIDLLCTSASSIG

CmoCh16G004090 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome