; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh16G004540 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh16G004540
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUBP1-associated protein 2C-like
Genome locationCmo_Chr16:2182911..2184334
RNA-Seq ExpressionCmoCh16G004540
SyntenyCmoCh16G004540
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7015043.1 UBP1-associated protein 2C, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.6e-22499.05Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
        KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGM MAPPSAIPGSGGQ+GGPGGMGSYGGFSGGPQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG

Query:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
        AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHY S
Subjt:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS

Query:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSP
        MSSASGHPNHHHQQAGASP+P
Subjt:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSP

XP_004137219.1 UBP1-associated protein 2C [Cucumis sativus]1.5e-21591.97Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSS+ SFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH+DVLDAVR IADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFS+YGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDK TGKSKGYGFVTFKHVDG++LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG+SGQ+SNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
        KCRGYALFVYKK EGAQAALVDPIKTIDGRQLSCK+ANDGKKGKPGGG DG QT GAGQGN+HGDGMPMAPPSA+PGSGGQYGGPGGMGSYGGFS G QG
Subjt:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG

Query:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
        AQPL HHPLNSSMGPG+SSVG QA SS GSSGGYGGGPYGGGYGGPG SIYGGMGSVGGGLG SGGGLGGAGG SSLYRL QSSVGMPSGGYPDSGHY S
Subjt:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS

Query:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        MSSASGHPN HHQ AG SP+PRVPPGG+YPN+PPYY
Subjt:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

XP_022922628.1 UBP1-associated protein 2C-like [Cucurbita moschata]2.3e-237100Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
        KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG

Query:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
        AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
Subjt:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS

Query:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
Subjt:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

XP_022984465.1 UBP1-associated protein 2C-like [Cucurbita maxima]6.0e-23398.62Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
        KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIK IDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG

Query:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
        AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAG VSSLYRLSQSSVG+PSGGYPDSGHY S
Subjt:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS

Query:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        MSSASGHPNHHHQQAGASP+PRVPPGGLYPN+PPYY
Subjt:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

XP_023553445.1 UBP1-associated protein 2C-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.9e-23599.54Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
        KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG

Query:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
        AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHY S
Subjt:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS

Query:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        MSSASGHPNHHHQQAGASP+PRVPPGGLYPNMPPYY
Subjt:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KYY6 Uncharacterized protein7.1e-21691.97Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSS+ SFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH+DVLDAVR IADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFS+YGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDK TGKSKGYGFVTFKHVDG++LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG+SGQ+SNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
        KCRGYALFVYKK EGAQAALVDPIKTIDGRQLSCK+ANDGKKGKPGGG DG QT GAGQGN+HGDGMPMAPPSA+PGSGGQYGGPGGMGSYGGFS G QG
Subjt:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG

Query:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
        AQPL HHPLNSSMGPG+SSVG QA SS GSSGGYGGGPYGGGYGGPG SIYGGMGSVGGGLG SGGGLGGAGG SSLYRL QSSVGMPSGGYPDSGHY S
Subjt:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS

Query:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        MSSASGHPN HHQ AG SP+PRVPPGG+YPN+PPYY
Subjt:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

A0A1S3BT99 UBP1-associated protein 2C3.0e-21491.28Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSS++SFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH+DVL+AVR IADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFS+YGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDK TGKSKGYGFVTFKHVDG++LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG+SGQ+SNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
        KCRGYALFVYKK EGAQAALVDPIKTIDGRQLSCK+ANDGKKGKPGGG DG QT GAGQGN+HGDGMPMAPPSA+PGSG QYGGPGGMGSY GFS G QG
Subjt:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG

Query:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
        AQPL HHPLNSSMGPG+SSVG QA SS GSSGGYGGGPYGGGYGGPG SIYGGMGSVGGGLG SGGGLGGAGG SSLYRL QSSVGMPSGGYPDSGHY S
Subjt:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS

Query:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        MSSASGHPN HHQ AG SP+PRVPPGG+YPN+PPYY
Subjt:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

A0A5D3D7P8 UBP1-associated protein 2C3.0e-21491.28Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSS++SFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH+DVL+AVR IADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFS+YGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDK TGKSKGYGFVTFKHVDG++LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG+SGQ+SNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
        KCRGYALFVYKK EGAQAALVDPIKTIDGRQLSCK+ANDGKKGKPGGG DG QT GAGQGN+HGDGMPMAPPSA+PGSG QYGGPGGMGSY GFS G QG
Subjt:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG

Query:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
        AQPL HHPLNSSMGPG+SSVG QA SS GSSGGYGGGPYGGGYGGPG SIYGGMGSVGGGLG SGGGLGGAGG SSLYRL QSSVGMPSGGYPDSGHY S
Subjt:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS

Query:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        MSSASGHPN HHQ AG SP+PRVPPGG+YPN+PPYY
Subjt:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

A0A6J1E3Y4 UBP1-associated protein 2C-like1.1e-237100Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
        KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG

Query:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
        AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
Subjt:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS

Query:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
Subjt:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

A0A6J1JAL1 UBP1-associated protein 2C-like2.9e-23398.62Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAV

Query:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
        KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIK IDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQG

Query:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS
        AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAG VSSLYRLSQSSVG+PSGGYPDSGHY S
Subjt:  AQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSS

Query:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        MSSASGHPNHHHQQAGASP+PRVPPGGLYPN+PPYY
Subjt:  MSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80678 UBP1-associated protein 2B2.1e-3934.46Show/hide
Query:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSIL
        E    +++ F+ DQL+ +L++A  RH DV + +R +AD D+  RK+F+ GL  DT  + L   F  YGE+E+   ++DKV+G+SKGYGF+ FK   G+  
Subjt:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSIL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------VSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQA
        ALK+P K I  R+T  QLA++G           Q  N  ++  RKIYV+NV  D+   KLL  FS +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ 
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------VSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQA

Query:  ALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSSMGPGIS
        AL +P KT +G  L C  ANDG K                + + H                  YG PGG G +   +G  Q  Q         +  P I 
Subjt:  ALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSSMGPGIS

Query:  SVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGG-------GLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGH
           +  L+SQG+  G          G  G++  G +G +  G G+          G G   G    Y+  Q   G    G   +G+
Subjt:  SVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGG-------GLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGH

Q13151 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A01.5e-2132.25Show/hide
Query:  KLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVP
        KLFI GL+  TS  GLR  F A+G L + VV+++  T +S+ +GFVT+ +V+ +  A+      +DG  TV    AV     +   A   ++K++V  + 
Subjt:  KLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVP

Query:  MDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNL-HGDGMPM
         D+    L+ HFS +G +E+  +  DKQ+GK RG+    ++  + A  A V     I G ++  K A   +    GGG  G +++  G+G    G G   
Subjt:  MDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNL-HGDGMPM

Query:  APPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGS-----SIYGGMGSVGGGLGSS
                +G   GG GG  SYGG+ GG  G                    G  A    G    YGG  YG G+GG GS     S YG M S GGG    
Subjt:  APPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGS-----SIYGGMGSVGGGLGSS

Query:  GGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSSMS
        GGG    GG        +S+ G   GGY   G Y   S
Subjt:  GGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSSMS

Q9LES2 UBP1-associated protein 2A3.0e-3834.64Show/hide
Query:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSIL
        E  + +++ F+ +Q++ +L++A  +HVDV + +R +AD D   RK+F+ GL  DT TE L   F  YGE+E+   + DK++GKSKGYGF+ +K   G+  
Subjt:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSIL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKK
        ALK+P K I  R+T  QL              AAV    Q SN ++ + +KIYV+NV  ++   KLL  FS +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ LFVYK 
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKK

Query:  AEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSS
        +E A+ AL +P KT +G  L C+ A DG   KPG            Q   H +      P         YG PGG G     +G P G        +N +
Subjt:  AEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSS

Query:  MGPGIS--------------SVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGG---GYG----GPGSSI-YGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSG
        +G  ++              ++G   L S G++ G   G   G   GYG     PG+   YG    + GG  +   G GG          S+   G+   
Subjt:  MGPGIS--------------SVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGG---GYG----GPGSSI-YGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSG

Query:  GYPDSGH
        G P  GH
Subjt:  GYPDSGH

Q9LJ04 RNA-binding protein P3.7e-4438.56Show/hide
Query:  DENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGK
        D  G    +   +    +  + +++ F  DQL+++L  A   H DVL AV   AD D + RK+F+ GL  D + E L   FSAYGE+E+  V+ D+ TGK
Subjt:  DENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGK

Query:  SKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG---VSGQSSNAA----------------DLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEE
         KGYGF+ F    G+  AL+EP K I  R T  QLA+VG     G ++N A                + + RKI+V+NV  D+   KLL  FS YGEIEE
Subjt:  SKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG---VSGQSSNAA----------------DLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEE

Query:  GPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGS
        GPLG DK TGK +G+ALFVYK  + A+ AL +P K  +G  L C+ A DG K   GGG           G L+G               G  GG  G G 
Subjt:  GPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGS

Query:  YGGFSGGPQGAQPLGH---HPLNS-------SMGPGISSVGSQA----LSSQGSSGG----YGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVG-GGLGSSGGGLGGA
        YG  S    GA   GH    P++S       + GPG++    QA    L+SQG   G     G G  G G   PG+S   G+GS G  G+  +GG LGG 
Subjt:  YGGFSGGPQGAQPLGH---HPLNS-------SMGPGISSVGSQA----LSSQGSSGG----YGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVG-GGLGSSGGGLGGA

Query:  GG
        GG
Subjt:  GG

Q9LKA4 UBP1-associated protein 2C4.0e-12359.33Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSF-----SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE
        MD+ KKR++DENG   + +       +R++P+DARKII+RFT DQL+D+LQ+A+ RH DVL++VR  AD D+SQRKLFIRGL+ DT+TEGLRSLFS+YG+
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSF-----SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE

Query:  LEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VI+DKVTGKSKGYGFVTF HVDG++LALKEPSK IDGRVTVTQLAA G  G  S  AD+S+RKIYVANVP DMPAD+LL HF  YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKK-GKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGF
        DK TGK RG+ALFVYK AEGAQAAL DP+K IDG+ L+CK A DGKK GKP  G    Q  G+G G++HG+GM M  P+      G YG  GG+ +YGG+
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKK-GKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGF

Query:  SGGPQGAQPLGH-HPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGP-GSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMP-SGG
        SGGP    P  H +  +SSMG G              S GYGG  + GGYGGP G+ +YGG+          GGG GG G  S  YR+  SS  MP  GG
Subjt:  SGGPQGAQPLGH-HPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGP-GSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMP-SGG

Query:  YPDSGHYSSMSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        YP+SGHY  +SS++G+P  HHQ  G SP PRVP GG+YPN PP Y
Subjt:  YPDSGHYSSMSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41060.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.5e-4034.46Show/hide
Query:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSIL
        E    +++ F+ DQL+ +L++A  RH DV + +R +AD D+  RK+F+ GL  DT  + L   F  YGE+E+   ++DKV+G+SKGYGF+ FK   G+  
Subjt:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSIL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------VSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQA
        ALK+P K I  R+T  QLA++G           Q  N  ++  RKIYV+NV  D+   KLL  FS +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ 
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------VSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQA

Query:  ALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSSMGPGIS
        AL +P KT +G  L C  ANDG K                + + H                  YG PGG G +   +G  Q  Q         +  P I 
Subjt:  ALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSSMGPGIS

Query:  SVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGG-------GLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGH
           +  L+SQG+  G          G  G++  G +G +  G G+          G G   G    Y+  Q   G    G   +G+
Subjt:  SVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGG-------GLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGH

AT2G41060.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.5e-4034.46Show/hide
Query:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSIL
        E    +++ F+ DQL+ +L++A  RH DV + +R +AD D+  RK+F+ GL  DT  + L   F  YGE+E+   ++DKV+G+SKGYGF+ FK   G+  
Subjt:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSIL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------VSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQA
        ALK+P K I  R+T  QLA++G           Q  N  ++  RKIYV+NV  D+   KLL  FS +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ 
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------VSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQA

Query:  ALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSSMGPGIS
        AL +P KT +G  L C  ANDG K                + + H                  YG PGG G +   +G  Q  Q         +  P I 
Subjt:  ALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSSMGPGIS

Query:  SVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGG-------GLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGH
           +  L+SQG+  G          G  G++  G +G +  G G+          G G   G    Y+  Q   G    G   +G+
Subjt:  SVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGG-------GLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGH

AT3G15010.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein2.8e-12459.33Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSF-----SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE
        MD+ KKR++DENG   + +       +R++P+DARKII+RFT DQL+D+LQ+A+ RH DVL++VR  AD D+SQRKLFIRGL+ DT+TEGLRSLFS+YG+
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSF-----SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE

Query:  LEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VI+DKVTGKSKGYGFVTF HVDG++LALKEPSK IDGRVTVTQLAA G  G  S  AD+S+RKIYVANVP DMPAD+LL HF  YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKK-GKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGF
        DK TGK RG+ALFVYK AEGAQAAL DP+K IDG+ L+CK A DGKK GKP  G    Q  G+G G++HG+GM M  P+      G YG  GG+ +YGG+
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKK-GKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGF

Query:  SGGPQGAQPLGH-HPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGP-GSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMP-SGG
        SGGP    P  H +  +SSMG G              S GYGG  + GGYGGP G+ +YGG+          GGG GG G  S  YR+  SS  MP  GG
Subjt:  SGGPQGAQPLGH-HPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGP-GSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMP-SGG

Query:  YPDSGHYSSMSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        YP+SGHY  +SS++G+P  HHQ  G SP PRVP GG+YPN PP Y
Subjt:  YPDSGHYSSMSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

AT3G15010.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein2.8e-12459.33Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSF-----SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE
        MD+ KKR++DENG   + +       +R++P+DARKII+RFT DQL+D+LQ+A+ RH DVL++VR  AD D+SQRKLFIRGL+ DT+TEGLRSLFS+YG+
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDHSF-----SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGE

Query:  LEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VI+DKVTGKSKGYGFVTF HVDG++LALKEPSK IDGRVTVTQLAA G  G  S  AD+S+RKIYVANVP DMPAD+LL HF  YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKK-GKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGF
        DK TGK RG+ALFVYK AEGAQAAL DP+K IDG+ L+CK A DGKK GKP  G    Q  G+G G++HG+GM M  P+      G YG  GG+ +YGG+
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKK-GKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGF

Query:  SGGPQGAQPLGH-HPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGP-GSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMP-SGG
        SGGP    P  H +  +SSMG G              S GYGG  + GGYGGP G+ +YGG+          GGG GG G  S  YR+  SS  MP  GG
Subjt:  SGGPQGAQPLGH-HPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGGGYGGP-GSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMP-SGG

Query:  YPDSGHYSSMSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY
        YP+SGHY  +SS++G+P  HHQ  G SP PRVP GG+YPN PP Y
Subjt:  YPDSGHYSSMSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY

AT3G56860.3 UBP1-associated protein 2A2.2e-3934.64Show/hide
Query:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSIL
        E  + +++ F+ +Q++ +L++A  +HVDV + +R +AD D   RK+F+ GL  DT TE L   F  YGE+E+   + DK++GKSKGYGF+ +K   G+  
Subjt:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKSKGYGFVTFKHVDGSIL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKK
        ALK+P K I  R+T  QL              AAV    Q SN ++ + +KIYV+NV  ++   KLL  FS +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ LFVYK 
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKK

Query:  AEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSS
        +E A+ AL +P KT +G  L C+ A DG   KPG            Q   H +      P         YG PGG G     +G P G        +N +
Subjt:  AEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSS

Query:  MGPGIS--------------SVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGG---GYG----GPGSSI-YGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSG
        +G  ++              ++G   L S G++ G   G   G   GYG     PG+   YG    + GG  +   G GG          S+   G+   
Subjt:  MGPGIS--------------SVGSQALSSQGSSGGYGGGPYGG---GYG----GPGSSI-YGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSG

Query:  GYPDSGH
        G P  GH
Subjt:  GYPDSGH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACGTCACCAAGAAGCGGAGGATGGACGAAAATGGCGTCGACTCCTCCGACCATTCTTTCTCTAGAATTACTCCTGAAGACGCTCGCAAGATCATTGATCGTTTCAC
TCCGGACCAGCTTATCGATATTTTACAAGATGCAGTTTCGCGTCACGTGGATGTTCTTGATGCAGTACGGTGTATTGCAGACCGTGATGTCTCCCAGCGGAAGCTGTTTA
TTCGGGGTCTTAGTTGCGATACTAGTACAGAAGGTTTGCGTTCTCTCTTTTCCGCTTATGGCGAGCTTGAAGAAGCTGTTGTTATTATTGACAAGGTGACTGGGAAATCG
AAAGGTTATGGCTTTGTGACTTTTAAGCATGTTGATGGTTCTATACTGGCTTTGAAAGAACCGAGCAAGACAATTGATGGCCGCGTTACGGTGACGCAATTGGCTGCAGT
GGGAGTTTCTGGGCAGAGTTCGAACGCTGCAGACTTGTCGTTGAGGAAAATTTATGTGGCGAATGTTCCAATGGATATGCCGGCCGATAAACTGTTGGCACACTTTTCGC
TGTATGGAGAAATTGAGGAGGGACCGCTAGGCTTCGATAAGCAGACGGGTAAGTGTAGAGGCTATGCTTTGTTTGTGTACAAAAAGGCAGAGGGTGCTCAAGCAGCTCTG
GTTGATCCAATCAAGACGATTGATGGAAGGCAGTTGAGTTGTAAATACGCTAACGATGGGAAAAAAGGGAAACCTGGCGGTGGGACGGATGGAATTCAAACGACGGGAGC
GGGTCAAGGAAACTTGCATGGAGATGGTATGCCTATGGCTCCTCCATCAGCAATCCCCGGTTCGGGCGGACAATATGGTGGTCCCGGTGGCATGGGATCGTATGGAGGCT
TTTCTGGTGGCCCTCAAGGGGCGCAGCCACTTGGTCACCATCCGCTCAACTCTTCAATGGGGCCAGGAATATCCTCTGTCGGTAGTCAGGCTCTATCTTCGCAGGGCAGC
TCCGGCGGATATGGTGGCGGTCCATATGGTGGTGGGTACGGCGGGCCCGGTTCCTCAATATATGGCGGTATGGGAAGTGTAGGTGGGGGCTTGGGTAGTTCTGGAGGTGG
ATTGGGCGGAGCTGGGGGTGTTTCATCACTATATAGGTTATCACAGAGTTCGGTTGGAATGCCTTCTGGTGGTTATCCGGATAGTGGGCATTATAGTAGCATGTCATCAG
CATCCGGGCACCCAAATCACCACCATCAACAGGCAGGAGCATCACCATCACCACGTGTTCCACCTGGAGGATTGTATCCCAATATGCCACCATATTACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTCATCGCTCCAACACTCGGATTAGGGCTTTTAGCTTCACCCTCTTCTTCTTCTTCCTCCTCTACTTTTACTCTACACCTCCAGGGACCTCCTTTCTCCGTCTCATTTAC
GCCATGGACGTCACCAAGAAGCGGAGGATGGACGAAAATGGCGTCGACTCCTCCGACCATTCTTTCTCTAGAATTACTCCTGAAGACGCTCGCAAGATCATTGATCGTTT
CACTCCGGACCAGCTTATCGATATTTTACAAGATGCAGTTTCGCGTCACGTGGATGTTCTTGATGCAGTACGGTGTATTGCAGACCGTGATGTCTCCCAGCGGAAGCTGT
TTATTCGGGGTCTTAGTTGCGATACTAGTACAGAAGGTTTGCGTTCTCTCTTTTCCGCTTATGGCGAGCTTGAAGAAGCTGTTGTTATTATTGACAAGGTGACTGGGAAA
TCGAAAGGTTATGGCTTTGTGACTTTTAAGCATGTTGATGGTTCTATACTGGCTTTGAAAGAACCGAGCAAGACAATTGATGGCCGCGTTACGGTGACGCAATTGGCTGC
AGTGGGAGTTTCTGGGCAGAGTTCGAACGCTGCAGACTTGTCGTTGAGGAAAATTTATGTGGCGAATGTTCCAATGGATATGCCGGCCGATAAACTGTTGGCACACTTTT
CGCTGTATGGAGAAATTGAGGAGGGACCGCTAGGCTTCGATAAGCAGACGGGTAAGTGTAGAGGCTATGCTTTGTTTGTGTACAAAAAGGCAGAGGGTGCTCAAGCAGCT
CTGGTTGATCCAATCAAGACGATTGATGGAAGGCAGTTGAGTTGTAAATACGCTAACGATGGGAAAAAAGGGAAACCTGGCGGTGGGACGGATGGAATTCAAACGACGGG
AGCGGGTCAAGGAAACTTGCATGGAGATGGTATGCCTATGGCTCCTCCATCAGCAATCCCCGGTTCGGGCGGACAATATGGTGGTCCCGGTGGCATGGGATCGTATGGAG
GCTTTTCTGGTGGCCCTCAAGGGGCGCAGCCACTTGGTCACCATCCGCTCAACTCTTCAATGGGGCCAGGAATATCCTCTGTCGGTAGTCAGGCTCTATCTTCGCAGGGC
AGCTCCGGCGGATATGGTGGCGGTCCATATGGTGGTGGGTACGGCGGGCCCGGTTCCTCAATATATGGCGGTATGGGAAGTGTAGGTGGGGGCTTGGGTAGTTCTGGAGG
TGGATTGGGCGGAGCTGGGGGTGTTTCATCACTATATAGGTTATCACAGAGTTCGGTTGGAATGCCTTCTGGTGGTTATCCGGATAGTGGGCATTATAGTAGCATGTCAT
CAGCATCCGGGCACCCAAATCACCACCATCAACAGGCAGGAGCATCACCATCACCACGTGTTCCACCTGGAGGATTGTATCCCAATATGCCACCATATTACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDVTKKRRMDENGVDSSDHSFSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHVDVLDAVRCIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSAYGELEEAVVIIDKVTGKS
KGYGFVTFKHVDGSILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGVSGQSSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAAL
VDPIKTIDGRQLSCKYANDGKKGKPGGGTDGIQTTGAGQGNLHGDGMPMAPPSAIPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSGGPQGAQPLGHHPLNSSMGPGISSVGSQALSSQGS
SGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGSSGGGLGGAGGVSSLYRLSQSSVGMPSGGYPDSGHYSSMSSASGHPNHHHQQAGASPSPRVPPGGLYPNMPPYY