; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh16G004910 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh16G004910
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 1-like
Genome locationCmo_Chr16:2370768..2370986
RNA-Seq ExpressionCmoCh16G004910
SyntenyCmoCh16G004910
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039608 - VQ motif-containing protein 1/10


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063001.1 VQ motif-containing protein 1-like [Cucumis melo var. makuwa]5.6e-1977.33Show/hide
Query:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA----EENRHGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE
        A +STRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD V     E  R    ARNSS LRDSSFKEFQRVLREMPR+ E
Subjt:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA----EENRHGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE

KAG6577059.1 VQ motif-containing protein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-2897.14Show/hide
Query:  MAAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRV
        MAAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSS LRDSSFKEFQRVLREMPR+
Subjt:  MAAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRV

KGN53544.1 hypothetical protein Csa_014778 [Cucumis sativus]1.1e-1981.33Show/hide
Query:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD---PVAEENRHGDG-ARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE
        A +STRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD    VAEE R   G ARNSS LRDSSFKEFQRVLREMPR+ E
Subjt:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD---PVAEENRHGDG-ARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE

XP_022142787.1 VQ motif-containing protein 10-like [Momordica charantia]9.8e-1676.06Show/hide
Query:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDP--VAEENRH--GDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPR
        A STRVVIIDTKYV TDAKSFKTVVQKLTGKDP   AEE+R   G G+ +SS  RDSSFKEFQRVLREM +
Subjt:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDP--VAEENRH--GDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPR

XP_038889427.1 VQ motif-containing protein 1-like [Benincasa hispida]1.4e-2286.11Show/hide
Query:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-EENRHGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE
        AA+STRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD VA EENRH  G RNS  LRDSSFKEFQRVLREMPR+ E
Subjt:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-EENRHGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXJ0 VQ domain-containing protein5.4e-2081.33Show/hide
Query:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD---PVAEENRHGDG-ARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE
        A +STRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD    VAEE R   G ARNSS LRDSSFKEFQRVLREMPR+ E
Subjt:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD---PVAEENRHGDG-ARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE

A0A0L9UJH2 VQ domain-containing protein5.4e-1261.11Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----PVAEENRHGDGARNSSFL-RDSSFKEFQRVLREMPRVGE
        +VVII+T+YV+TDA SFK+VVQKLTGKD     P A+ NRH  G    SFL RD SFKEF R+LREMP + +
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----PVAEENRHGDGARNSSFL-RDSSFKEFQRVLREMPRVGE

A0A5A7VBD1 VQ motif-containing protein 1-like2.7e-1977.33Show/hide
Query:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA----EENRHGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE
        A +STRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD V     E  R    ARNSS LRDSSFKEFQRVLREMPR+ E
Subjt:  AAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA----EENRHGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE

A0A6J1CNV7 VQ motif-containing protein 10-like4.8e-1676.06Show/hide
Query:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDP--VAEENRH--GDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPR
        A STRVVIIDTKYV TDAKSFKTVVQKLTGKDP   AEE+R   G G+ +SS  RDSSFKEFQRVLREM +
Subjt:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDP--VAEENRH--GDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPR

A0A6J1FVF7 VQ motif-containing protein 11.4e-1571.01Show/hide
Query:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSF-LRDSSFKEFQRVLREMPRV
        A+STRVVIIDTKYV TDAKSFKTVVQKLTGKDP  EENR   G  +S   + DSSFK+FQ  LREMP +
Subjt:  AYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSF-LRDSSFKEFQRVLREMPRV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1G3U8 VQ motif-containing protein 16.6e-0745Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-----EENRHGDGARNSS---------FLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE
        +VV I+T+YVQTDA+SFKT+VQ+LTGK+ V      E +  G G ++SS           R     EF    REMP VGE
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-----EENRHGDGARNSS---------FLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE

Q8VYI5 VQ motif-containing protein 101.1e-0436.26Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----------------------PVAEENR--HGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE
        +VV I+T+YV+TDA+SFKTVVQ+LTGK+                        + E+ R  HG G       R  +  EF R+ +EMP + E
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----------------------PVAEENR--HGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17147.1 VQ motif-containing protein4.7e-0845Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-----EENRHGDGARNSS---------FLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE
        +VV I+T+YVQTDA+SFKT+VQ+LTGK+ V      E +  G G ++SS           R     EF    REMP VGE
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA-----EENRHGDGARNSS---------FLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE

AT1G78410.1 VQ motif-containing protein7.5e-0636.26Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----------------------PVAEENR--HGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE
        +VV I+T+YV+TDA+SFKTVVQ+LTGK+                        + E+ R  HG G       R  +  EF R+ +EMP + E
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD-----------------------PVAEENR--HGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCTTATTCGACTCGGGTTGTGATCATCGACACCAAGTATGTGCAAACGGATGCCAAGAGCTTCAAGACGGTGGTGCAGAAGCTGACGGGGAAGGACCCGGTGGC
GGAGGAGAATCGACATGGTGACGGTGCCCGGAACTCGAGTTTTTTGAGAGATTCGTCGTTCAAGGAGTTCCAAAGAGTGCTGCGAGAGATGCCAAGAGTTGGTGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAGCTTATTCGACTCGGGTTGTGATCATCGACACCAAGTATGTGCAAACGGATGCCAAGAGCTTCAAGACGGTGGTGCAGAAGCTGACGGGGAAGGACCCGGTGGC
GGAGGAGAATCGACATGGTGACGGTGCCCGGAACTCGAGTTTTTTGAGAGATTCGTCGTTCAAGGAGTTCCAAAGAGTGCTGCGAGAGATGCCAAGAGTTGGTGAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAYSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAEENRHGDGARNSSFLRDSSFKEFQRVLREMPRVGE