; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh16G011040 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh16G011040
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionPectin lyase-like superfamily protein
Genome locationCmo_Chr16:7792297..7794199
RNA-Seq ExpressionCmoCh16G011040
SyntenyCmoCh16G011040
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0004650 - polygalacturonase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000743 - Glycoside hydrolase, family 28
IPR006626 - Parallel beta-helix repeat
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022923223.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita moschata]1.1e-13573.94Show/hide
Query:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----
        MGMNMK +TLS      VSIG  QSSDGVFDVTTYGA  NADITQ       DACAS IQ KLIIPK+TYTLGVIT+LGPCKSPIDIV+QGTIMAP    
Subjt:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----

Query:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
                   + + +GGGVFD QGQKAW SNDCHKNP CARIP                      LKF F KDSIV DITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
Subjt:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF

Query:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS
        + VTI APG SINSDGIHMGRC GVN+INSVIGTGDDCISLGDGS++VTVTNVTCGPGH ISVGSLG+YLVEE VAGLYVKNC LIGTTNGLRIKT P S
Subjt:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS

Query:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        P TG+VTDMHYEDI LV+VQNPII+DQEYCPYNKCN+KIPSKIKISKVSFKNI
Subjt:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

XP_022965071.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita maxima]1.0e-13674.5Show/hide
Query:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----
        MGMNMK +TLS      VSI   QSSDGVFDVTTYGA  NADITQ       DACAS IQ KLIIPK+TY LGVITLLGPCKSPIDIV+QGTIMAP    
Subjt:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----

Query:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
                   + + +GGGVFD QGQKAWE NDCHKNP CARIP                      LKF F KDSIV DITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
Subjt:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF

Query:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS
        + VTI APGTSINSDGIHMGRC GVN+INSVIGTGDDCISLGDGS+EVT+TNVTCGPGH ISVGSLG+YLVEE VAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKT P S
Subjt:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS

Query:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        P TG+VTDMHYEDI+LV+VQNPIILDQEYCPYNKCN+KIPSKIKISKVSFKNI
Subjt:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

XP_022965192.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita maxima]2.2e-13674.22Show/hide
Query:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----
        MGMNM+ +TLS      VSI   QSSDGVFDVTTYGA  NADITQ       DACAS IQ KLIIPK+TY LGVITLLGPCKSPIDIV+QGTIMAP    
Subjt:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----

Query:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
                   + + +GGGVFD QGQKAWE NDCHKNP CARIP                      LKF F KDSIV DITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
Subjt:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF

Query:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS
        + VTI APGTSINSDGIHMGRC GVN+INSVIGTGDDCISLGDGS+EVT+TNVTCGPGH ISVGSLG+YLVEE VAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKT P S
Subjt:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS

Query:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        P TG+VTDMHYEDI+LV+VQNPIILDQEYCPYNKCN+KIPSKIKISKVSFKNI
Subjt:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

XP_023007604.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita maxima]2.0e-13774.79Show/hide
Query:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----
        MGMNMK +TLS      VSI   QSSDGVFDVTTYGA  NADITQ       DACAS IQ KLIIPK+TYTLGVITLLGPCKSPIDIV+QGTIMAP    
Subjt:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----

Query:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
                   + + +GGGVFD QGQKAWE NDCHKNP CARIP                      LKF F KDSIV DITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
Subjt:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF

Query:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS
        + VTI APGTSINSDGIHMGRC GVN+INSVIGTGDDCISLGDGS+EVT+TNVTCGPGH ISVGSLG+YLVEE VAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKT P S
Subjt:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS

Query:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        P TG+VTDMHYEDI+LV+VQNPIILDQEYCPYNKCN+KIPSKIKISKVSFKNI
Subjt:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

XP_023553131.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.9e-13473.37Show/hide
Query:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----
        MGMNMK +TLS      VSI  VQSSDGVFDVTTYGA  NADITQ       DACAS IQ KLIIPK+TYTLGVIT+LGPC+SPIDIV+QGTIMAP    
Subjt:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----

Query:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
                   + + +GGGVFD QGQKAW SNDCHKNP CARIP                      LKF F KDSIV DITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
Subjt:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF

Query:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS
        + VTI APG SINSDGIHMGRC  VN+INSVIGTGDDCISLGDGS++VTVTNVTCGPGH ISVGSLG+YLVEE VAGLYVKNC LIGTTNGLRIKT P S
Subjt:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS

Query:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        P TG+VTDMHYEDI LV+VQNPII+DQEYCPYNKCN+KIPSKIKISKVSFKNI
Subjt:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DUC6 exopolygalacturonase-like6.2e-10857.95Show/hide
Query:  MGMNMKWMTLS-----VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADIT-------QDACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP-----
        MGM +  + LS     VS  K QSSDG+FDVT +GA  NADI+       ++ACAS IQ K+IIPK  Y LG I L GPCKSPI++ +QGTI AP     
Subjt:  MGMNMKWMTLS-----VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADIT-------QDACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP-----

Query:  ---------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFN
                   +  SGGG FD QG+ AWE NDC KNP C R+P                      L+F F  +SIVSDITSKDSKNFHV ILGC NLTF 
Subjt:  ---------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFN

Query:  RVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSP
         V + APG SIN+DGIH+GR  G+N++++ IGTGDDCISLGDGSK+VT+TNVTCGPGH ISVGSLGRY  EE V G+   NCT++ T+NG+RIKT P SP
Subjt:  RVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSP

Query:  DTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
          GT +DMH+ED+I+VNV NPI++DQEYCPYN+CNKK PSK+KISKVSFKN+
Subjt:  DTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

A0A6J1F4L3 exopolygalacturonase-like5.3e-13673.94Show/hide
Query:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----
        MGMNMK +TLS      VSIG  QSSDGVFDVTTYGA  NADITQ       DACAS IQ KLIIPK+TYTLGVIT+LGPCKSPIDIV+QGTIMAP    
Subjt:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----

Query:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
                   + + +GGGVFD QGQKAW SNDCHKNP CARIP                      LKF F KDSIV DITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
Subjt:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF

Query:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS
        + VTI APG SINSDGIHMGRC GVN+INSVIGTGDDCISLGDGS++VTVTNVTCGPGH ISVGSLG+YLVEE VAGLYVKNC LIGTTNGLRIKT P S
Subjt:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS

Query:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        P TG+VTDMHYEDI LV+VQNPII+DQEYCPYNKCN+KIPSKIKISKVSFKNI
Subjt:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

A0A6J1HJP4 exopolygalacturonase-like1.1e-13674.22Show/hide
Query:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----
        MGMNM+ +TLS      VSI   QSSDGVFDVTTYGA  NADITQ       DACAS IQ KLIIPK+TY LGVITLLGPCKSPIDIV+QGTIMAP    
Subjt:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----

Query:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
                   + + +GGGVFD QGQKAWE NDCHKNP CARIP                      LKF F KDSIV DITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
Subjt:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF

Query:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS
        + VTI APGTSINSDGIHMGRC GVN+INSVIGTGDDCISLGDGS+EVT+TNVTCGPGH ISVGSLG+YLVEE VAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKT P S
Subjt:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS

Query:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        P TG+VTDMHYEDI+LV+VQNPIILDQEYCPYNKCN+KIPSKIKISKVSFKNI
Subjt:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

A0A6J1HKP9 exopolygalacturonase-like4.8e-13774.5Show/hide
Query:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----
        MGMNMK +TLS      VSI   QSSDGVFDVTTYGA  NADITQ       DACAS IQ KLIIPK+TY LGVITLLGPCKSPIDIV+QGTIMAP    
Subjt:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----

Query:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
                   + + +GGGVFD QGQKAWE NDCHKNP CARIP                      LKF F KDSIV DITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
Subjt:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF

Query:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS
        + VTI APGTSINSDGIHMGRC GVN+INSVIGTGDDCISLGDGS+EVT+TNVTCGPGH ISVGSLG+YLVEE VAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKT P S
Subjt:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS

Query:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        P TG+VTDMHYEDI+LV+VQNPIILDQEYCPYNKCN+KIPSKIKISKVSFKNI
Subjt:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

A0A6J1L5F4 exopolygalacturonase-like9.7e-13874.79Show/hide
Query:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----
        MGMNMK +TLS      VSI   QSSDGVFDVTTYGA  NADITQ       DACAS IQ KLIIPK+TYTLGVITLLGPCKSPIDIV+QGTIMAP    
Subjt:  MGMNMKWMTLS------VSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----

Query:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
                   + + +GGGVFD QGQKAWE NDCHKNP CARIP                      LKF F KDSIV DITSKDSKNFHVNILGCKNLTF
Subjt:  ----------RRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTF

Query:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS
        + VTI APGTSINSDGIHMGRC GVN+INSVIGTGDDCISLGDGS+EVT+TNVTCGPGH ISVGSLG+YLVEE VAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKT P S
Subjt:  NRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTS

Query:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        P TG+VTDMHYEDI+LV+VQNPIILDQEYCPYNKCN+KIPSKIKISKVSFKNI
Subjt:  PDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P24548 Exopolygalacturonase (Fragment)2.3e-8350.16Show/hide
Query:  QDACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRRYNR-----------------SGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKL
        ++ACAS     +++PK  + +G+ITL GPCKS I + +QGT+ AP   ++                  GGGVFD QG+ AW  NDCHKN    +  ++ L
Subjt:  QDACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRRYNR-----------------SGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKL

Query:  TIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEV
         +Y                      +SI+ D+T+ DSKNFHVN++GCKNLTF R  I+A  TSIN+DGIH+GR  GVN+IN+ I TGDDCISLGDGSK +
Subjt:  TIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEV

Query:  TVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKV
         +TN+TCGPGH ISVGSLGRY  EESV G+YVKNCT+ G+ NG+RIKT P S + G  ++MH++DI + +V  PI++DQ YCPYN+C  ++PS +K+SK+
Subjt:  TVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKV

Query:  SFKNI
        SFKNI
Subjt:  SFKNI

P35337 Polygalacturonase1.1e-7442.44Show/hide
Query:  DVTTYGATLNADIT-------QDACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----------------RRYNRSGGGVFDRQGQKA
        +V T G   N+DIT         AC +    +++IPK  + LG   + GPCKSPI+  +QG +                     +  +GGG FD +G  A
Subjt:  DVTTYGATLNADIT-------QDACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAP----------------RRYNRSGGGVFDRQGQKA

Query:  WESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVI
        W++N+CHK   C ++P                      ++F F  ++ + D+TS D+KNFH N++  KN+TF+ + I AP  S N+DGIH+GRC GV ++
Subjt:  WESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVI

Query:  NSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQE
        N+ I TGDDCIS+GDG K + +  V CGPGH ISVGSLGRY  E+ V  + VKNCTL GT+NGLRIKT P++  T T   +H+EDIIL  V NPI++DQE
Subjt:  NSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQE

Query:  YCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNIIEVWSNLTLISPTLDMKGH
        YCP+N+CNK  PS IK+  ++F+NI     N   +   L  KGH
Subjt:  YCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNIIEVWSNLTLISPTLDMKGH

Q05967 Polygalacturonase7.8e-7644.74Show/hide
Query:  QSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPR-----------------RYNRSGGGV
        +S  GVFD+T YGA  NADI++       +AC S     ++IPK T+T+  + L GPCKSP+++ +Q T+ AP                  ++  SGGG+
Subjt:  QSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPR-----------------RYNRSGGGV

Query:  FDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMG
         D Q   AWE   C ++  C ++P                      L F    +S + DIT+ DSK+FHVN+  CKNLTF R  ++AP  S N+DGIH+ 
Subjt:  FDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMG

Query:  RCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQ
        R   VN+ +S   TGDDCIS+GD ++++ +T VTCGPGH ISVGSLG    E+ V G++V+NCT   T NG+RIKT P S   G V D+H+EDII+ NV 
Subjt:  RCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQ

Query:  NPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        NP+++DQ YCP+NKCNK +PS++KISKVSF+NI
Subjt:  NPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

Q40312 Polygalacturonase1.2e-7948.05Show/hide
Query:  SSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPR------------------RYNRSGGGV
        +  GV D++ +G   N+DI Q       +ACAS    K++IP  TY L  I L GPCK+PI++ + GTI AP                       SG GV
Subjt:  SSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPR------------------RYNRSGGGV

Query:  FDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMG
        FD QG         +K    A   + K +  K +  F           F F  +SIV  +TSKDSKNFHV + GCKN+TF+  TITAPG S N+DGIHMG
Subjt:  FDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMG

Query:  RCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQ
        +   V ++N+ IGTGDDC+S+GDGSK++TV  V CGPGH +SVGSLG++  EE+V G+ VKNCTL  T NG+RIKT P +P T TV+D+H+EDI + NV+
Subjt:  RCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQ

Query:  NPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        NP+I+DQEY P+N+C+KK PSKIK+SK+SFKN+
Subjt:  NPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

Q6H9K0 Exopolygalacturonase (Fragment)3.2e-7746.57Show/hide
Query:  VQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCK-SPIDIVMQGTIMAPRRYNR-----------------SGG
        VQSS  VF+V  YGA    DI+Q        ACAS     ++IPK  Y +G + + GPCK S I   + G + AP   ++                 SG 
Subjt:  VQSSDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCK-SPIDIVMQGTIMAPRRYNR-----------------SGG

Query:  GVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIH
        G  D QGQ AW  N+C KNPNC                    H     L+F F K ++V DITS +SK FH+N+L C+++TF  VT+TAPGTSIN+DGIH
Subjt:  GVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIH

Query:  MGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVN
        +G   GV + N+ I TGDDCIS+G GS+ VT+T V CGPGH IS+GSLGRY  E+ V G+ VK CT  GT NG+R+KT P SP  G  TD+ ++D+ + N
Subjt:  MGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVN

Query:  VQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        VQNP+ILDQEYCPY +C+++ PS+IK+S ++F NI
Subjt:  VQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G07820.1 Pectin lyase-like superfamily protein2.9e-7846.15Show/hide
Query:  DVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRR----------------YNRSGGGVFDRQGQKA
        +V T G++  +DITQ        AC S    K++IPK  + LG I + GPCK+PI++ +QGT+ A                   +  +GGG FD +G  A
Subjt:  DVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRR----------------YNRSGGGVFDRQGQKA

Query:  WESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVI
        W  N+CHK   C ++P                      ++F F  +S + DI+S D+KNFH+N+LG KN+T N + I AP  S N+DGIH+GR  GV ++
Subjt:  WESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVI

Query:  NSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQE
        NS I TGDDCIS+GDG K + V  VTCGPGH ISVGSLGRY  E+ V+G+ V NCTL  T NGLRIKT P++  + T +D+H+EDIIL +V NPI++DQE
Subjt:  NSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQE

Query:  YCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        YCP+N+CNK+  S IK+  +SFKNI
Subjt:  YCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

AT3G07830.1 Pectin lyase-like superfamily protein3.6e-7644.24Show/hide
Query:  SDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRR----------------YNRSGGGVFDR
        S    +V    ++  +DITQ        AC S   RK++IPK  + LG I + GPCKSP++I + GT++A                   +  +GGG FD 
Subjt:  SDGVFDVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRR----------------YNRSGGGVFDR

Query:  QGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCV
        +G  AW  N+CHK   C ++P                      ++F F  ++ + DI+S D+KNFH+N++G KN+TF+ V I AP  S N+DGIH+GR V
Subjt:  QGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCV

Query:  GVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPI
        GV++INS I TGDDC+S+GDG   + V NV CGPGH ISVGSLGRY  E+ V+G+ V NCTL  T NGLRIKT P++  + T +++H+E+IIL NV NPI
Subjt:  GVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPI

Query:  ILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        ++DQEYCP+N+CNK+  S IK++ +SF+ I
Subjt:  ILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

AT3G07840.1 Pectin lyase-like superfamily protein5.0e-7845.23Show/hide
Query:  DVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRR----------------YNRSGGGVFDRQGQKA
        +V   G +  +DITQ        AC +    K++I K  + LG I + GPCK+P++I +QGT+ A  +                +  +GGG+FD +G  A
Subjt:  DVTTYGATLNADITQ-------DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRR----------------YNRSGGGVFDRQGQKA

Query:  WESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVI
        W  N+CHK   C ++P                      ++F F +++ + DI+S D+KNFH+N+LG KN+TF+ V + AP  S N+DGIH+GR  GV ++
Subjt:  WESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVI

Query:  NSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQE
        NS I TGDDCIS+GDG K + V NV CGPGH ISVGSLGRY+ E+ V G+ V NCTL GT NGLRIKT P++    T + +H+E+IIL NV NPI++DQE
Subjt:  NSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQE

Query:  YCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        YCP+N+CNK+ PS IK+  +SFKNI
Subjt:  YCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

AT3G14040.1 Pectin lyase-like superfamily protein7.3e-6138.6Show/hide
Query:  VQSSDGVFDVTTYGATLNADITQDACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRRYN-------------------RSGGGVFDRQ
        V++S    D  T  +   A   ++ACA+     + +PK  Y +  +   GPCK P+ + + G   AP                            +FD Q
Subjt:  VQSSDGVFDVTTYGATLNADITQDACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRRYN-------------------RSGGGVFDRQ

Query:  GQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVG
        G  AW++NDC K   C  +P                      ++F    +S ++ ITS +SK FH+NIL CKN+T   + I AP  S+N+DGIH+GR  G
Subjt:  GQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVG

Query:  VNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPII
        VN+I + I TGDDC+S+GDG++ + V NV CGPGH IS+GSLGRY  E+ V G+ V+ C +  T NG+RIKT P SP  G  +++ +EDI + NV  P++
Subjt:  VNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPII

Query:  LDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI
        +DQEYCPY  C   +PSK+K+S V+ KNI
Subjt:  LDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNI

AT5G48140.1 Pectin lyase-like superfamily protein3.3e-7747.02Show/hide
Query:  DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRRYN---------------RSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIY
        +AC    +  ++IPK  Y LG I ++GPCK+PI I + GT+ A    N                +GGGVFD +G  AW  N+CHK  NC ++P       
Subjt:  DACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRRYN---------------RSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKNPNCARIPTLKLTIY

Query:  KFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVT
                       ++F F  D+ +  ITS D+K+FH+N++G KN+TF  V I AP  S N+DGIH+GR  G+ +INS I TGDDC+S+GDG K + V 
Subjt:  KFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKEVTVT

Query:  NVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFK
         VTCGPGH IS+GSLGRY  EE+V+G+ + NCTL  T NGLRIKT P++  T T +D+H+E+I+L NV NPI++DQEYCP+N+CNK+ PS IK++ +SFK
Subjt:  NVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFK

Query:  NI
         I
Subjt:  NI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTATGAACATGAAGTGGATGACTCTATCCGTTTCTATAGGAAAAGTTCAATCAAGTGACGGAGTGTTTGACGTGACAACGTACGGTGCTACGCTTAATGCTGATAT
AACTCAAGACGCTTGTGCTTCACTAATACAACGTAAATTAATTATTCCAAAACAGACTTACACTTTAGGTGTAATCACATTGCTTGGTCCATGCAAGAGTCCAATTGATA
TTGTCATGCAAGGAACAATAATGGCGCCCCGTAGATATAACAGGTCAGGTGGCGGAGTTTTTGATAGACAAGGACAAAAAGCTTGGGAAAGTAACGATTGTCATAAAAAC
CCTAATTGTGCAAGAATTCCAACGCTTAAATTAACAATTTACAAGTTTTACTTTATATTTATACTTATGCATGATTGTTTTCGTTGTTTGAAGTTCATCTTTGAAAAAGA
TTCAATTGTGAGTGACATAACGTCAAAAGATAGCAAGAATTTTCATGTCAATATCCTAGGTTGTAAGAACCTTACTTTCAACCGTGTGACTATAACTGCACCGGGAACTA
GTATTAATAGTGATGGAATTCACATGGGTCGTTGTGTTGGAGTTAATGTCATCAATTCAGTTATAGGTACTGGTGATGATTGTATCTCACTCGGAGATGGAAGCAAAGAG
GTAACAGTTACGAACGTGACGTGTGGACCTGGACATCACATAAGTGTAGGAAGTCTGGGAAGATATCTTGTTGAAGAATCCGTTGCCGGGCTTTATGTCAAAAATTGTAC
ATTAATTGGTACAACAAATGGCCTAAGAATCAAAACATGTCCGACTTCTCCAGATACTGGAACGGTTACTGATATGCATTATGAAGATATAATTTTGGTTAACGTCCAAA
ATCCAATTATTTTGGATCAAGAATACTGTCCATACAACAAATGTAACAAGAAGATTCCATCAAAAATTAAGATAAGTAAGGTGAGTTTCAAGAATATCATAGAGGTATGG
AGTAATCTAACATTGATATCACCTACACTGGACATGAAGGGCCATTGTGTAGTGCTAATTATCCATGTGAAGGTATGGAGTTATCTAACATTGATATCACCTACACTGGA
CATGAAGGGCCAGTTGAATCTTTTCTTTTACGCCCTAGAGAATAAATTTGGAGTGAACAAAGGGTTCTCCTTTGTTGCTCCTTTGTTATCTCATACTATCCTCCATAAAC
TTAAAATCCATAATCTCAATTGCTATGGGAATACCGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTATGAACATGAAGTGGATGACTCTATCCGTTTCTATAGGAAAAGTTCAATCAAGTGACGGAGTGTTTGACGTGACAACGTACGGTGCTACGCTTAATGCTGATAT
AACTCAAGACGCTTGTGCTTCACTAATACAACGTAAATTAATTATTCCAAAACAGACTTACACTTTAGGTGTAATCACATTGCTTGGTCCATGCAAGAGTCCAATTGATA
TTGTCATGCAAGGAACAATAATGGCGCCCCGTAGATATAACAGGTCAGGTGGCGGAGTTTTTGATAGACAAGGACAAAAAGCTTGGGAAAGTAACGATTGTCATAAAAAC
CCTAATTGTGCAAGAATTCCAACGCTTAAATTAACAATTTACAAGTTTTACTTTATATTTATACTTATGCATGATTGTTTTCGTTGTTTGAAGTTCATCTTTGAAAAAGA
TTCAATTGTGAGTGACATAACGTCAAAAGATAGCAAGAATTTTCATGTCAATATCCTAGGTTGTAAGAACCTTACTTTCAACCGTGTGACTATAACTGCACCGGGAACTA
GTATTAATAGTGATGGAATTCACATGGGTCGTTGTGTTGGAGTTAATGTCATCAATTCAGTTATAGGTACTGGTGATGATTGTATCTCACTCGGAGATGGAAGCAAAGAG
GTAACAGTTACGAACGTGACGTGTGGACCTGGACATCACATAAGTGTAGGAAGTCTGGGAAGATATCTTGTTGAAGAATCCGTTGCCGGGCTTTATGTCAAAAATTGTAC
ATTAATTGGTACAACAAATGGCCTAAGAATCAAAACATGTCCGACTTCTCCAGATACTGGAACGGTTACTGATATGCATTATGAAGATATAATTTTGGTTAACGTCCAAA
ATCCAATTATTTTGGATCAAGAATACTGTCCATACAACAAATGTAACAAGAAGATTCCATCAAAAATTAAGATAAGTAAGGTGAGTTTCAAGAATATCATAGAGGTATGG
AGTAATCTAACATTGATATCACCTACACTGGACATGAAGGGCCATTGTGTAGTGCTAATTATCCATGTGAAGGTATGGAGTTATCTAACATTGATATCACCTACACTGGA
CATGAAGGGCCAGTTGAATCTTTTCTTTTACGCCCTAGAGAATAAATTTGGAGTGAACAAAGGGTTCTCCTTTGTTGCTCCTTTGTTATCTCATACTATCCTCCATAAAC
TTAAAATCCATAATCTCAATTGCTATGGGAATACCGTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGMNMKWMTLSVSIGKVQSSDGVFDVTTYGATLNADITQDACASLIQRKLIIPKQTYTLGVITLLGPCKSPIDIVMQGTIMAPRRYNRSGGGVFDRQGQKAWESNDCHKN
PNCARIPTLKLTIYKFYFIFILMHDCFRCLKFIFEKDSIVSDITSKDSKNFHVNILGCKNLTFNRVTITAPGTSINSDGIHMGRCVGVNVINSVIGTGDDCISLGDGSKE
VTVTNVTCGPGHHISVGSLGRYLVEESVAGLYVKNCTLIGTTNGLRIKTCPTSPDTGTVTDMHYEDIILVNVQNPIILDQEYCPYNKCNKKIPSKIKISKVSFKNIIEVW
SNLTLISPTLDMKGHCVVLIIHVKVWSYLTLISPTLDMKGQLNLFFYALENKFGVNKGFSFVAPLLSHTILHKLKIHNLNCYGNTV