; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh16G011070 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh16G011070
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionexopolygalacturonase-like
Genome locationCmo_Chr16:7820567..7822520
RNA-Seq ExpressionCmoCh16G011070
SyntenyCmoCh16G011070
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0004650 - polygalacturonase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000743 - Glycoside hydrolase, family 28
IPR006626 - Parallel beta-helix repeat
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022923223.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita moschata]2.2e-17282.03Show/hide
Query:  MGIVQSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYV
        +G  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQ         ILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKS IDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYV
Subjt:  MGIVQSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYV

Query:  DKISLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINS
        DKISLTGGGVFDGQGQKAWASND HKNPKCARIPM                               NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDG++IINS
Subjt:  DKISLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINS

Query:  VIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII------
        VIGTGDDCISLGD SRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEE VAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWP SPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII      
Subjt:  VIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII------

Query:  --------IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS
                IPSKIKISKVSFKNIRGS+G AVAVKLLCSADYPCEDVQLS+IDITYTGREGP+VSECSNVKPVV GIQKPLICPS
Subjt:  --------IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS

XP_022965071.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita maxima]8.0e-16780Show/hide
Query:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
        QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQ         IL+KAWKDACASPIQSKLIIPKETY LGVIT+LGPCKS IDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
Subjt:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS

Query:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT
        LTGGGVFDGQGQKAW  ND HKNPKCARIPM                               NLTFDHVTINAPG SINSDGIHMGRCDG++IINSVIGT
Subjt:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT

Query:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------
        GDDCISLGD SR+VT+TNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEE VAGLYVKNC LIGTTNGLRIKTWP SPATGSVTDMHYEDI LVDVQNPII          
Subjt:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------

Query:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS
            IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDV LS+IDITYTGREGP+VSECSNVKPVV GIQKP+ICPS
Subjt:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS

XP_022965192.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita maxima]8.0e-16780Show/hide
Query:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
        QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQ         IL+KAWKDACASPIQSKLIIPKETY LGVIT+LGPCKS IDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
Subjt:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS

Query:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT
        LTGGGVFDGQGQKAW  ND HKNPKCARIPM                               NLTFDHVTINAPG SINSDGIHMGRCDG++IINSVIGT
Subjt:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT

Query:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------
        GDDCISLGD SR+VT+TNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEE VAGLYVKNC LIGTTNGLRIKTWP SPATGSVTDMHYEDI LVDVQNPII          
Subjt:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------

Query:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS
            IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDV LS+IDITYTGREGP+VSECSNVKPVV GIQKP+ICPS
Subjt:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS

XP_023007604.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita maxima]1.6e-16780.26Show/hide
Query:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
        QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQ         IL+KAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVIT+LGPCKS IDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
Subjt:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS

Query:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT
        LTGGGVFDGQGQKAW  ND HKNPKCARIPM                               NLTFDHVTINAPG SINSDGIHMGRCDG++IINSVIGT
Subjt:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT

Query:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------
        GDDCISLGD SR+VT+TNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEE VAGLYVKNC LIGTTNGLRIKTWP SPATGSVTDMHYEDI LVDVQNPII          
Subjt:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------

Query:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS
            IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDV LS+IDITYTGREGP+VSECSNVKPVV GIQKP+ICPS
Subjt:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS

XP_023553131.1 exopolygalacturonase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.6e-16981.36Show/hide
Query:  VQSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKI
        VQSSDGVFDVTTYGAKPNADITQ         ILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPC+S IDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKI
Subjt:  VQSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKI

Query:  SLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIG
        SLTGGGVFDGQGQKAWASND HKNPKCARIPM                               NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCD ++IINSVIG
Subjt:  SLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIG

Query:  TGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII---------
        TGDDCISLGD SRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEE VAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWP SPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII         
Subjt:  TGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII---------

Query:  -----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS
             IPSKIKISKVSFKNIRGS+G AVAVKLLCSA YPCEDVQLS+IDITYTG +GP+VSECSNVKPVV GIQKPLICPS
Subjt:  -----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DUC6 exopolygalacturonase-like5.0e-12256.05Show/hide
Query:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
        QSSDG+FDVT +GA PNADI++          L  AWK+ACASPIQSK+IIPK  Y LG I + GPCKS I++ +QGTI AP+D+TG+GW+QF+Y+D  +
Subjt:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS

Query:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT
        L+GGG FDGQG+ AW  ND  KNPKC R+PM                               NLTF HV +NAPG+SIN+DGIH+GR  GI+I+++ IGT
Subjt:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT

Query:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII---------
        GDDCISLGD S+QVT+TNVTCGPGHGISVGSLG+Y  EE V G+   NC ++ T+NG+RIKTWP SP  G+ +DMH+ED+ +V+V NPI+I         
Subjt:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII---------

Query:  -----PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS
             PSK+KISKVSFKN+RGS+ NA+AVKL+CSA+ PCEDV++++ID+TY G EGPI S+C NVKP++ G Q P  C S
Subjt:  -----PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS

A0A6J1F4L3 exopolygalacturonase-like1.1e-17282.03Show/hide
Query:  MGIVQSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYV
        +G  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQ         ILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKS IDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYV
Subjt:  MGIVQSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYV

Query:  DKISLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINS
        DKISLTGGGVFDGQGQKAWASND HKNPKCARIPM                               NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDG++IINS
Subjt:  DKISLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINS

Query:  VIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII------
        VIGTGDDCISLGD SRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEE VAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWP SPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII      
Subjt:  VIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII------

Query:  --------IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS
                IPSKIKISKVSFKNIRGS+G AVAVKLLCSADYPCEDVQLS+IDITYTGREGP+VSECSNVKPVV GIQKPLICPS
Subjt:  --------IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS

A0A6J1HJP4 exopolygalacturonase-like3.9e-16780Show/hide
Query:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
        QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQ         IL+KAWKDACASPIQSKLIIPKETY LGVIT+LGPCKS IDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
Subjt:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS

Query:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT
        LTGGGVFDGQGQKAW  ND HKNPKCARIPM                               NLTFDHVTINAPG SINSDGIHMGRCDG++IINSVIGT
Subjt:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT

Query:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------
        GDDCISLGD SR+VT+TNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEE VAGLYVKNC LIGTTNGLRIKTWP SPATGSVTDMHYEDI LVDVQNPII          
Subjt:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------

Query:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS
            IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDV LS+IDITYTGREGP+VSECSNVKPVV GIQKP+ICPS
Subjt:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS

A0A6J1HKP9 exopolygalacturonase-like3.9e-16780Show/hide
Query:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
        QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQ         IL+KAWKDACASPIQSKLIIPKETY LGVIT+LGPCKS IDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
Subjt:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS

Query:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT
        LTGGGVFDGQGQKAW  ND HKNPKCARIPM                               NLTFDHVTINAPG SINSDGIHMGRCDG++IINSVIGT
Subjt:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT

Query:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------
        GDDCISLGD SR+VT+TNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEE VAGLYVKNC LIGTTNGLRIKTWP SPATGSVTDMHYEDI LVDVQNPII          
Subjt:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------

Query:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS
            IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDV LS+IDITYTGREGP+VSECSNVKPVV GIQKP+ICPS
Subjt:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS

A0A6J1L5F4 exopolygalacturonase-like7.8e-16880.26Show/hide
Query:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
        QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQ         IL+KAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVIT+LGPCKS IDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS
Subjt:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKIS

Query:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT
        LTGGGVFDGQGQKAW  ND HKNPKCARIPM                               NLTFDHVTINAPG SINSDGIHMGRCDG++IINSVIGT
Subjt:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT

Query:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------
        GDDCISLGD SR+VT+TNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEE VAGLYVKNC LIGTTNGLRIKTWP SPATGSVTDMHYEDI LVDVQNPII          
Subjt:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPII----------

Query:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS
            IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDV LS+IDITYTGREGP+VSECSNVKPVV GIQKP+ICPS
Subjt:  ----IPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P24548 Exopolygalacturonase (Fragment)4.4e-9148Show/hide
Query:  LEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVD---ITGDGWIQFRYVDKISLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKN-PKCAR
        L  AWK+ACAS   S +++PK  + +G+IT+ GPCKSSI + +QGT+ AP D   I G GWI    +D +++ GGGVFDGQG+ AW  ND HKN P C  
Subjt:  LEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVD---ITGDGWIQFRYVDKISLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKN-PKCAR

Query:  IPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGIS
        + M                               NLTF+   I+A   SIN+DGIH+GR DG++IIN+ I TGDDCISLGD S+ + +TN+TCGPGHGIS
Subjt:  IPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGIS

Query:  VGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVA
        VGSLG+Y  EE V G+YVKNC + G+ NG+RIKTWP S   G  ++MH++DIT+  V  PI+I              PS +K+SK+SFKNI+G++    A
Subjt:  VGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVA

Query:  VKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC
        VKL+CS  +PC  V+L++ID+TY+G+ GP  S C N+KP + G Q P IC
Subjt:  VKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC

P35337 Polygalacturonase8.2e-8242.09Show/hide
Query:  DVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDIT--GDGWIQFRYVDKISLTGGG
        +V T G  PN+DIT           + KA+  AC +P  S+++IPK  + LG   M GPCKS I+  +QG +      T   D W+ F  ++   L GGG
Subjt:  DVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDIT--GDGWIQFRYVDKISLTGGG

Query:  VFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCI
         FDG+G  AW +N+ HK  +C ++P+                               N+TFD++ I AP  S N+DGIH+GRC+G+ I+N+ I TGDDCI
Subjt:  VFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCI

Query:  SLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------
        S+GD  + + +  V CGPGHGISVGSLG+Y  E+ V  + VKNC L GT+NGLRIKTWP +  T +   +H+EDI L  V NPI+I              
Subjt:  SLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------

Query:  PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC
        PS IK+  ++F+NIRG++ N  AVKLLCS  +PCE+V++ +I+I YTG +GP   EC+NV P ++G Q P  C
Subjt:  PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC

Q05967 Polygalacturonase1.3e-7941.21Show/hide
Query:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVD---ITGDGWIQFRYVD
        +S  GVFD+T YGA  NADI++   N         A+K+AC S   S ++IPK T+T+  + + GPCKS +++ +Q T+ AP D   +    W+    +D
Subjt:  QSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVD---ITGDGWIQFRYVD

Query:  KISLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPMNLTFD------------------HVTIN-------------APGNSINSDGIHMGRCDGISIINSV
        + +++GGG+ DGQ   AW   +  ++ KC ++P NL+F+                  HV +N             AP NS N+DGIH+ R   ++I +S 
Subjt:  KISLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPMNLTFD------------------HVTIN-------------APGNSINSDGIHMGRCDGISIINSV

Query:  IGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII------
          TGDDCIS+GD + Q+ +T VTCGPGHGISVGSLG    E+ V G++V+NC    T NG+RIKTWP S   G V D+H+EDI + +V NP++I      
Subjt:  IGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII------

Query:  --------PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC
                PS++KISKVSF+NI+G++    AV LL S   PCE +++ +IDITY+G+EGP  S C N+KP + G Q P +C
Subjt:  --------PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC

Q40312 Polygalacturonase9.4e-8643.92Show/hide
Query:  SSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVD---ITG-DGWIQFRYVD
        +  GV D++ +G KPN+DI Q  T+         AW +ACAS   +K++IP  TY L  I + GPCK+ I++ V GTI AP D   I G + W +F Y+D
Subjt:  SSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVD---ITG-DGWIQFRYVD

Query:  KISLTGGGVFDGQG---------QKAWASNDFH----------------------KNPKCARIPM----NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISI
         ++L+G GVFDGQG           AW+  + +                      K+ K   + +    N+TFD  TI APG+S N+DGIHMG+   + I
Subjt:  KISLTGGGVFDGQG---------QKAWASNDFH----------------------KNPKCARIPM----NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISI

Query:  INSVIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--
        +N+ IGTGDDC+S+GD S+Q+TV  V CGPGHG+SVGSLG++  EE V G+ VKNC L  T NG+RIKTWP +P T +V+D+H+EDIT+ +V+NP+II  
Subjt:  INSVIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--

Query:  ------------PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIG
                    PSKIK+SK+SFKN++G++G A  V L+CS+  PC+ V+L+N+D+ + G   P  ++C+NVKP+V G
Subjt:  ------------PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIG

Q6H9K0 Exopolygalacturonase (Fragment)9.4e-8643.98Show/hide
Query:  VQSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCK-SSIDIVVQGTIMAPVD---ITGDGWIQFRY
        VQSS  VF+V  YGAK   DI+Q          + KAWK ACAS   S ++IPK  Y +G + M GPCK S I   + G + AP D      DGW+ F  
Subjt:  VQSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCK-SSIDIVVQGTIMAPVD---ITGDGWIQFRY

Query:  VDKISLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPMNL-------------------------------TFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIIN
        +D ++++G G  DGQGQ AWA N+  KNP C    MNL                               TF HVT+ APG SIN+DGIH+G   G++I N
Subjt:  VDKISLTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPMNL-------------------------------TFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIIN

Query:  SVIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII----
        + I TGDDCIS+G  S+ VT+T V CGPGHGIS+GSLG+Y  E+ V G+ VK C   GT NG+R+KTWP SP  G+ TD+ ++D+T+ +VQNP+I+    
Subjt:  SVIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII----

Query:  ----------PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLI
                  PS+IK+S ++F NIRG++   VAV + CS   PC ++++  I+++Y G  GP  S CSNVKP   G Q P I
Subjt:  ----------PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G07820.1 Pectin lyase-like superfamily protein6.9e-8443.97Show/hide
Query:  DVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVD-ITG-DGWIQFRYVDKISLTGGG
        +V T G+   +DITQ          L KA+  AC S   SK++IPK  + LG I M GPCK+ I++ +QGT+ A  + I G + W+ F  +D   L GGG
Subjt:  DVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVD-ITG-DGWIQFRYVDKISLTGGG

Query:  VFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCI
         FDG+G  AW  N+ HK  +C ++P+                               N+T +++ I AP +S N+DGIH+GR DG+ I+NS I TGDDCI
Subjt:  VFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCI

Query:  SLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------
        S+GD  + + V  VTCGPGHGISVGSLG+Y  E+ V+G+ V NC L  T NGLRIKTWP +  + + +D+H+EDI L DV NPI+I              
Subjt:  SLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------

Query:  PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC
         S IK+  +SFKNIRG++GN  AVKLLCS  YPC++V++ +IDI Y G +GP    CSNV P ++G Q P  C
Subjt:  PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC

AT3G07830.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.9e-8143.12Show/hide
Query:  SDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVD-ITG-DGWIQFRYVDKIS
        S    +V    + P +DITQ          L +A+  AC SP   K++IPK  + LG I M GPCKS ++I + GT++A  + I G + W+ F+ +D   
Subjt:  SDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVD-ITG-DGWIQFRYVDKIS

Query:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT
        L GGG FDG+G  AW  N+ HK  +C ++P+                               N+TFD+V I AP  S N+DGIH+GR  G+SIINS I T
Subjt:  LTGGGVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGT

Query:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII---------
        GDDC+S+GD    + V NV CGPGHGISVGSLG+Y  E+ V+G+ V NC L  T NGLRIKTWP +  + + +++H+E+I L +V NPI+I         
Subjt:  GDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII---------

Query:  -----PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC
              S IK++ +SF+ IRG++GN  AVKLLCS  YPCE+VQ+ +I+I YTG +GP    CSNV+P ++G Q P  C
Subjt:  -----PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC

AT3G07840.1 Pectin lyase-like superfamily protein3.8e-8242.9Show/hide
Query:  DVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAP-VDITG-DGWIQFRYVDKISLTGGG
        +V   G  P +DITQ          L KA+  AC +P  SK++I K  + LG I M GPCK+ ++I +QGT+ A    I G + W+ F  ++   L GGG
Subjt:  DVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAP-VDITG-DGWIQFRYVDKISLTGGG

Query:  VFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCI
        +FDG+G  AW  N+ HK  +C ++P+                               N+TFD+V + AP  S N+DGIH+GR +G+ I+NS I TGDDCI
Subjt:  VFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCI

Query:  SLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------
        S+GD  + + V NV CGPGHGISVGSLG+Y+ E+ V G+ V NC L GT NGLRIKTWP +    + + +H+E+I L +V NPI+I              
Subjt:  SLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------

Query:  PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC
        PS IK+  +SFKNIRG++GN  AVKLLCS  +PC +V++ NI++ Y G +GP    CSNV P ++G Q P  C
Subjt:  PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLIC

AT3G14040.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.1e-7039.15Show/hide
Query:  AWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGD----GWIQFRYVDKISLTGG-GVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIP
        AWK+ACA+   S + +PK  Y +  +   GPCK  + + + G   AP  +       GWI F  +   +L G   +FDGQG  AW +ND  K  KC  +P
Subjt:  AWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGD----GWIQFRYVDKISLTGG-GVFDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIP

Query:  MNLTFDHVT-------------------------------INAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVG
        +N+ F  +T                               I+AP  S+N+DGIH+GR +G+++I + I TGDDC+S+GD +  + V NV CGPGHGIS+G
Subjt:  MNLTFDHVT-------------------------------INAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVG

Query:  SLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVK
        SLG+Y  E+ V G+ V+ C +  T NG+RIKTWP SP  G  +++ +EDIT+ +V  P++I              PSK+K+S V+ KNI+G++   VAVK
Subjt:  SLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------PSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVK

Query:  LLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPSQRKQG
        L+CS   PC ++ LS+I++ + G+EGP VS CSN+KP++ G   P  C    K G
Subjt:  LLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPSQRKQG

AT5G48140.1 Pectin lyase-like superfamily protein2.8e-8544.26Show/hide
Query:  PNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITG-DGWIQFRYVDKISLTGGGVFDGQGQKA
        P +DIT         + L KA+ +AC  P +S ++IPK  Y LG I M+GPCK+ I I + GT+ A  +  G + W+ FR ++   L GGGVFDG+G  A
Subjt:  PNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITG-DGWIQFRYVDKISLTGGGVFDGQGQKA

Query:  WASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCISLGDRSRQV
        W  N+ HK   C ++P+                               N+TF+ V I AP  S N+DGIH+GR DGI IINS I TGDDC+S+GD  + +
Subjt:  WASNDFHKNPKCARIPM-------------------------------NLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCISLGDRSRQV

Query:  TVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------PSKIKISKV
         V  VTCGPGHGIS+GSLG+Y  EE V+G+ + NC L  T NGLRIKTWP +  T + +D+H+E+I L +V NPI+I              PS IK++ +
Subjt:  TVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVKNCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIII--------------PSKIKISKV

Query:  SFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS
        SFK IRG++GN  AVKLLCS  YPC++V++ +++I YTG +GP   +CSNV P ++G Q P  C S
Subjt:  SFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIGIQKPLICPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAATAGTTCAATCAAGTGATGGAGTTTTTGACGTAACAACATACGGTGCTAAGCCTAATGCTGATATAACTCAGATAAAAACTAATATCAAATATATCGATATTCT
AGAAAAGGCATGGAAGGACGCTTGTGCTTCACCGATTCAAAGTAAATTAATTATTCCAAAAGAGACTTACACGTTAGGTGTAATCACAATGCTTGGTCCTTGCAAGAGTT
CAATTGATATTGTCGTGCAAGGAACAATAATGGCACCTGTAGATATAACAGGTGATGGTTGGATTCAGTTCAGATATGTCGACAAAATTTCATTAACAGGTGGCGGAGTT
TTTGATGGACAAGGACAAAAAGCTTGGGCAAGTAACGATTTTCATAAAAACCCCAAGTGTGCAAGAATTCCAATGAATCTTACTTTCGACCACGTGACTATAAATGCACC
GGGGAATAGTATTAATAGTGATGGAATTCACATGGGTCGTTGTGATGGAATTAGTATCATCAATTCAGTTATTGGTACTGGTGATGATTGTATCTCACTCGGAGATAGAA
GCAGACAGGTAACAGTTACGAACGTGACGTGTGGACCTGGACACGGCATAAGCGTAGGAAGTCTAGGACAATATCTTGTTGAAGAACTGGTTGCTGGGCTTTATGTCAAA
AATTGTAAATTAATTGGTACAACAAATGGCCTAAGGATCAAAACATGGCCGGTTTCTCCGGCTACTGGATCGGTTACTGATATGCACTATGAAGATATAACTTTGGTTGA
CGTCCAAAATCCAATTATTATTCCGTCGAAAATCAAGATAAGTAAGGTGAGTTTCAAGAATATTAGAGGTAGTGCTGGTAATGCAGTTGCTGTGAAGCTTTTGTGTAGTG
CTGATTATCCATGTGAAGATGTGCAGTTATCTAACATTGATATCACTTATACTGGACGTGAAGGTCCAATTGTATCTGAATGTTCGAATGTGAAACCGGTTGTTATTGGG
ATACAAAAACCTCTTATTTGTCCTTCGCAGCGGAAACAGGGATTGGGCGTTCGCCGCCACGGAAAGTCGGGCCCGCCGGACGGAAACCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAATAGTTCAATCAAGTGATGGAGTTTTTGACGTAACAACATACGGTGCTAAGCCTAATGCTGATATAACTCAGATAAAAACTAATATCAAATATATCGATATTCT
AGAAAAGGCATGGAAGGACGCTTGTGCTTCACCGATTCAAAGTAAATTAATTATTCCAAAAGAGACTTACACGTTAGGTGTAATCACAATGCTTGGTCCTTGCAAGAGTT
CAATTGATATTGTCGTGCAAGGAACAATAATGGCACCTGTAGATATAACAGGTGATGGTTGGATTCAGTTCAGATATGTCGACAAAATTTCATTAACAGGTGGCGGAGTT
TTTGATGGACAAGGACAAAAAGCTTGGGCAAGTAACGATTTTCATAAAAACCCCAAGTGTGCAAGAATTCCAATGAATCTTACTTTCGACCACGTGACTATAAATGCACC
GGGGAATAGTATTAATAGTGATGGAATTCACATGGGTCGTTGTGATGGAATTAGTATCATCAATTCAGTTATTGGTACTGGTGATGATTGTATCTCACTCGGAGATAGAA
GCAGACAGGTAACAGTTACGAACGTGACGTGTGGACCTGGACACGGCATAAGCGTAGGAAGTCTAGGACAATATCTTGTTGAAGAACTGGTTGCTGGGCTTTATGTCAAA
AATTGTAAATTAATTGGTACAACAAATGGCCTAAGGATCAAAACATGGCCGGTTTCTCCGGCTACTGGATCGGTTACTGATATGCACTATGAAGATATAACTTTGGTTGA
CGTCCAAAATCCAATTATTATTCCGTCGAAAATCAAGATAAGTAAGGTGAGTTTCAAGAATATTAGAGGTAGTGCTGGTAATGCAGTTGCTGTGAAGCTTTTGTGTAGTG
CTGATTATCCATGTGAAGATGTGCAGTTATCTAACATTGATATCACTTATACTGGACGTGAAGGTCCAATTGTATCTGAATGTTCGAATGTGAAACCGGTTGTTATTGGG
ATACAAAAACCTCTTATTTGTCCTTCGCAGCGGAAACAGGGATTGGGCGTTCGCCGCCACGGAAAGTCGGGCCCGCCGGACGGAAACCCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGIVQSSDGVFDVTTYGAKPNADITQIKTNIKYIDILEKAWKDACASPIQSKLIIPKETYTLGVITMLGPCKSSIDIVVQGTIMAPVDITGDGWIQFRYVDKISLTGGGV
FDGQGQKAWASNDFHKNPKCARIPMNLTFDHVTINAPGNSINSDGIHMGRCDGISIINSVIGTGDDCISLGDRSRQVTVTNVTCGPGHGISVGSLGQYLVEELVAGLYVK
NCKLIGTTNGLRIKTWPVSPATGSVTDMHYEDITLVDVQNPIIIPSKIKISKVSFKNIRGSAGNAVAVKLLCSADYPCEDVQLSNIDITYTGREGPIVSECSNVKPVVIG
IQKPLICPSQRKQGLGVRRHGKSGPPDGNP