; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh16G011480 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh16G011480
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionDUF2052 domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr16:8193903..8196087
RNA-Seq ExpressionCmoCh16G011480
SyntenyCmoCh16G011480
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR018613 - Ccdc97-like
IPR040233 - Domain of unknown function DUF2052


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596899.1 hypothetical protein SDJN03_10079, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-2855.4Show/hide
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KAG7015691.1 hypothetical protein SDJN02_23328, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-3566.91Show/hide
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KAG7030174.1 hypothetical protein SDJN02_08521, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-2855.4Show/hide
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XP_022155554.1 coiled-coil domain-containing protein 97 [Momordica charantia]1.2e-3051.69Show/hide
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XP_022935567.1 coiled-coil domain-containing protein 97 [Cucurbita moschata]1.1e-2855.4Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5C7 Uncharacterized protein2.1e-2856.12Show/hide
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A0A5A7TDJ3 YTH domain-containing protein 13.5e-2856.12Show/hide
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A0A5D3CJT9 Coiled-coil domain-containing protein 973.5e-2856.12Show/hide
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         REPFLHHEY+GKFQDP+   G  R     +E +M R E
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A0A6J1DQL7 coiled-coil domain-containing protein 975.8e-3151.69Show/hide
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A0A6J1F5X8 coiled-coil domain-containing protein 975.4e-2955.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q96F63 Coiled-coil domain-containing protein 979.9e-0446.15Show/hide
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Q9DBT3 Coiled-coil domain-containing protein 979.9e-0446.15Show/hide
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        ++NRR A L +LI  G+YFS++ MR R P L+ +Y+G++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G47090.1 unknown protein9.8e-2358.43Show/hide
Query:  ERLSLQLISIELHEFDALKDDHEIN----------SPISDELHFRSVIVKNRRRAYLNKLICDGQYFSEDAMRGREPFLHHEYLGKFQD
        ER   +L+  EL EFDA+K D+E++          SP S+E+  RSV V+NRR AYLNKL+ +GQYFSEDAMR REP+LHHEY+GKFQD
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACGGCGACGATGGAGCCGACGGAGAAAGCGGCCACGGGATTGAATTGCGAAGCCATGGATTGCTTGTCGGAAAGGCTTTCGTTGCAGTTGATATCCATTGAGCT
CCATGAGTTTGATGCTCTTAAGGATGATCATGAGATCAATAGTCCGATATCAGATGAACTACACTTTAGGTCAGTTATTGTGAAGAATAGGAGACGAGCATATCTGAATA
AACTGATATGTGATGGCCAGTACTTCTCGGAGGATGCAATGAGGGGGAGAGAGCCTTTTTTGCATCATGAATACTTAGGGAAGTTTCAGGATCCAAATCACGAAACTGGA
AAGATACGAGATGATGCAAGTGCGAACGAGCTGATGATGATCCGTGATGAGATGATGAATGCAACTAAAAGACTCGGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACGGCGACGATGGAGCCGACGGAGAAAGCGGCCACGGGATTGAATTGCGAAGCCATGGATTGCTTGTCGGAAAGGCTTTCGTTGCAGTTGATATCCATTGAGCT
CCATGAGTTTGATGCTCTTAAGGATGATCATGAGATCAATAGTCCGATATCAGATGAACTACACTTTAGGTCAGTTATTGTGAAGAATAGGAGACGAGCATATCTGAATA
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AAGATACGAGATGATGCAAGTGCGAACGAGCTGATGATGATCCGTGATGAGATGATGAATGCAACTAAAAGACTCGGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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KIRDDASANELMMIRDEMMNATKRLG