; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh16G013330 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh16G013330
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionDirigent protein
Genome locationCmo_Chr16:9423735..9424304
RNA-Seq ExpressionCmoCh16G013330
SyntenyCmoCh16G013330
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0048046 - apoplast (cellular component)
GO:0004659 - prenyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004265 - Dirigent protein
IPR044859 - Allene oxide cyclase/Dirigent protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6577817.1 Dirigent protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.6e-9797.88Show/hide
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KAG7015856.1 Dirigent protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.6e-9797.88Show/hide
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XP_022923245.1 dirigent protein 19-like [Cucurbita moschata]2.0e-100100Show/hide
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XP_023007642.1 dirigent protein 19-like [Cucurbita maxima]3.1e-9396.22Show/hide
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XP_023551883.1 dirigent protein 11-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-9493.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2N9EIH7 Dirigent protein7.0e-6770.88Show/hide
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        + +   +L +LLS  A +  +  HH H H     L+SLHFSLFQHETINKTGY IV GVAGP  SQTTTPFGT+F F DP+T   +R+SKLVG +EGTSI
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        TSSLDGLRS+SIAKI+LRL+NH GS+SIVGGTHN+KPS+HP+VGGTGDFLFVQGYVTSSPVDL G+TVVYK+EFH+YWPPYA
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A0A5D3CJJ8 Dirigent protein9.4e-8083.42Show/hide
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        SL+LSS+FTL   SLLS  ++  E  A      HH HRHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGV GPGVSQTTTPFGTMF FHDPLTT  DR SKLVGTS
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        EGTSITSS DGL+S+SIAKISLRLR+HTGSLSIVGGTHNVKPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPVDL+GITVVYKLEFH+YWPPYA
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A0A6J1EB83 Dirigent protein9.6e-101100Show/hide
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A0A6J1KZ97 Dirigent protein1.5e-9396.22Show/hide
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A0A7N2R780 Dirigent protein7.0e-6772.16Show/hide
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        + T++L +LLS  A +  +  HH H   L+SLHFSLFQHETIN+TGY IV GVAGPGVSQTTTPFGT+F F DP+T   +R SKLVG +EGTSITS LDG
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        LRS+SIAKI+LRL+NH+GS+SIVGGTHN+KPS+HP+VGGTGDFLFVQGYVTSSPV+L G+TV YK+EFH+YWPPYA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
I1JNN8 Pterocarpan synthase 11.7e-0629.49Show/hide
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        L LS LF+L+ ++  SS     P            LHF  F H+ +      +V      G ++   PFGT+    DPLT  P++ SKLVG ++G   + 
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        S + +  + +  ++    +  GS   V G + +         IVGGTG F F +GY
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Q67YM6 Dirigent protein 117.8e-0724.72Show/hide
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        LI S++  L ++   S P +   P   + P + L  LHF  + H+ I+      +     PG + + T FG + +   P+T  P+ +SK VG ++G   +
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Query:  SSLDGLRSLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPVDLIGITVVYKLEFHIY
        + +       +           GS + + G + +  +    PI+GGTGDF F +GY       ++ I  V  +E++++
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Q9C523 Dirigent protein 192.7e-0729.38Show/hide
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        S  L S  TL L  +  +    E N  HH    L   HF ++ H+ +       V  +  P      T FG M +  +PLT  P  +SK+VG ++G    
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Query:  SSLDGLRSLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSS
        +S + +  L     ++    + GS   V G ++V  K    P++GG+G F F +GYV +S
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Q9FIG6 Dirigent protein 11.7e-0623.86Show/hide
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        +LSS+  L+L+  +++ +   P   + P +     H   + H+ I+      V        +     FG + +  DPLT  PD +SK VG ++G   +++
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        +  +    +           GS   V G +++  K    PI+GGTG F F +GY       ++G+  V  +E++++
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Q9FIG7 Dirigent protein 26.0e-0723.76Show/hide
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        L+L  L T++L S+  + + A    +P   + P +     H   + H+ I+      V        + +   FG + +  DPLT  PD +SK VG ++G 
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Query:  SITSSLDGLRSLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPVDLIGITVVYKLEFHIY
           +++  +    +  ++       GS   + G + +  K    PI+GGTG F F +GY  +    ++G+  V  +E++++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22900.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein5.5e-0824.72Show/hide
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        LI S++  L ++   S P +   P   + P + L  LHF  + H+ I+      +     PG + + T FG + +   P+T  P+ +SK VG ++G   +
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        + +       +           GS + + G + +  +    PI+GGTGDF F +GY       ++ I  V  +E++++
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AT1G58170.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein1.9e-0829.38Show/hide
Query:  SLILSSLFTLILSSLLSSPALAEPNAAHHPHRHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGVAGPGVSQTTTPFGTMFVFHDPLTTAPDRASKLVGTSEGTSIT
        S  L S  TL L  +  +    E N  HH    L   HF ++ H+ +       V  +  P      T FG M +  +PLT  P  +SK+VG ++G    
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Query:  SSLDGLRSLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSS
        +S + +  L     ++    + GS   V G ++V  K    P++GG+G F F +GYV +S
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AT5G42500.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein4.2e-0823.76Show/hide
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        L+L  L T++L S+  + + A    +P   + P +     H   + H+ I+      V        + +   FG + +  DPLT  PD +SK VG ++G 
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Query:  SITSSLDGLRSLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPVDLIGITVVYKLEFHIY
           +++  +    +  ++       GS   + G + +  K    PI+GGTG F F +GY  +    ++G+  V  +E++++
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AT5G42510.1 Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein1.2e-0723.86Show/hide
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        +LSS+  L+L+  +++ +   P   + P +     H   + H+ I+      V        +     FG + +  DPLT  PD +SK VG ++G   +++
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Query:  LDGLRSLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNV--KPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPVDLIGITVVYKLEFHIY
        +  +    +           GS   V G +++  K    PI+GGTG F F +GY       ++G+  V  +E++++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCCACCGCCACCACCACCCTCTCTCATTCTCTCTTCCCTTTTCACTCTAATTCTCTCCTCCCTCTTATCTTCGCCGGCGCTGGCCGAGCCCAACGCCGCCCACCA
TCCCCACCGCCACCTCCGGTCACTCCACTTCTCCCTCTTCCAGCACGAAACAATCAACAAAACCGGCTACTTCATCGTGCCGGGGGTGGCTGGCCCAGGAGTGAGCCAAA
CCACCACCCCATTTGGCACCATGTTTGTATTTCACGACCCTTTGACCACAGCGCCCGACCGAGCATCGAAGCTGGTCGGCACGTCGGAGGGAACCTCCATAACCTCTAGC
CTCGATGGCTTGCGAAGCCTTAGCATAGCGAAGATCAGCTTGCGTTTGAGGAACCATACCGGTTCGCTCTCCATCGTGGGTGGGACCCATAATGTTAAACCGTCGAACCA
CCCCATTGTCGGAGGGACCGGAGATTTCTTGTTCGTACAAGGCTACGTGACGTCATCTCCGGTGGATCTGATCGGAATCACGGTGGTTTACAAGTTGGAATTTCATATTT
ACTGGCCGCCCTACGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGCCACCGCCACCACCACCCTCTCTCATTCTCTCTTCCCTTTTCACTCTAATTCTCTCCTCCCTCTTATCTTCGCCGGCGCTGGCCGAGCCCAACGCCGCCCACCA
TCCCCACCGCCACCTCCGGTCACTCCACTTCTCCCTCTTCCAGCACGAAACAATCAACAAAACCGGCTACTTCATCGTGCCGGGGGTGGCTGGCCCAGGAGTGAGCCAAA
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ACTGGCCGCCCTACGCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPPPPPPSLILSSLFTLILSSLLSSPALAEPNAAHHPHRHLRSLHFSLFQHETINKTGYFIVPGVAGPGVSQTTTPFGTMFVFHDPLTTAPDRASKLVGTSEGTSITSS
LDGLRSLSIAKISLRLRNHTGSLSIVGGTHNVKPSNHPIVGGTGDFLFVQGYVTSSPVDLIGITVVYKLEFHIYWPPYA