; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh17G002570 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh17G002570
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionTVP38/TMEM64 family membrane protein slr0305-like
Genome locationCmo_Chr17:1521744..1524604
RNA-Seq ExpressionCmoCh17G002570
SyntenyCmoCh17G002570
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033425.1 TVP38/TMEM64 family membrane protein slr0305-like [Cucumis melo var. makuwa]3.7e-2681.01Show/hide
Query:  KKEGSVPQAFSDIDLHAALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQ-DDRK
        +KEG+VP+ FSDIDLHA +LAYC+TRVAKAALEKALAENGD VDYLGLS +LP+  ESPVDLN PLIIKIDSPQ DDRK
Subjt:  KKEGSVPQAFSDIDLHAALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQ-DDRK

KAG6575014.1 hypothetical protein SDJN03_25653, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.1e-2398.36Show/hide
Query:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR
        +ALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR
Subjt:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR

KAG7013587.1 hypothetical protein SDJN02_23754, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-2296.72Show/hide
Query:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR
        +ALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAE+PVDLNLPLIIKIDSPQDDR
Subjt:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR

XP_022958994.1 uncharacterized protein LOC111460118 [Cucurbita moschata]5.1e-2398.36Show/hide
Query:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR
        +ALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR
Subjt:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR

XP_023006221.1 uncharacterized protein LOC111499017 [Cucurbita maxima]1.1e-2296.72Show/hide
Query:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR
        +A+LAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR
Subjt:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KC10 Uncharacterized protein5.3e-1881.67Show/hide
Query:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDD
        + +LAYC+TRVAKAALEKALAENGD VDYLGLS +LP+  ESPVDLN PLIIKIDSPQDD
Subjt:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDD

A0A1S3C8Q0 TVP38/TMEM64 family membrane protein slr0305-like6.9e-1880.95Show/hide
Query:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQ-DDRK
        + +LAYC+TRVAKAALEKALAENGD VDYLGLS +LP+  ESPVDLN PLIIKIDSPQ DDRK
Subjt:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQ-DDRK

A0A5A7SW85 TVP38/TMEM64 family membrane protein slr0305-like1.8e-2681.01Show/hide
Query:  KKEGSVPQAFSDIDLHAALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQ-DDRK
        +KEG+VP+ FSDIDLHA +LAYC+TRVAKAALEKALAENGD VDYLGLS +LP+  ESPVDLN PLIIKIDSPQ DDRK
Subjt:  KKEGSVPQAFSDIDLHAALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQ-DDRK

A0A6J1H6Q0 uncharacterized protein LOC1114601182.5e-2398.36Show/hide
Query:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR
        +ALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR
Subjt:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR

A0A6J1KX66 uncharacterized protein LOC1114990175.5e-2396.72Show/hide
Query:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR
        +A+LAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR
Subjt:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03260.1 SNARE associated Golgi protein family3.5e-0652.63Show/hide
Query:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPR--LPVAAESPVDLNLPLIIKID
        A +L  CITRVAK++L+KALAENG  +D         LP+ AE P DL  PL+I+ID
Subjt:  AALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPR--LPVAAESPVDLNLPLIIKID

AT5G19070.1 SNARE associated Golgi protein family5.4e-0748.39Show/hide
Query:  AALLAYCITRVAKAALEKALAEN-GDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDS--PQD
        + +L  C+T+VAK AL KALAE+ GD  + +   P L V  ++  DLN PL+IKID+  PQD
Subjt:  AALLAYCITRVAKAALEKALAEN-GDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDS--PQD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTCAGGTGGAGGAAGATGACATTGAGCTTGACTCAACTAAAGTTAAAAAAGAGGGGAGCGTACCCCAAGCCTTTTCTGACATTGATTTGCATGCAGCGCTTCTGGC
GTACTGCATCACCAGAGTTGCTAAGGCTGCTTTGGAAAAAGCTTTGGCCGAGAATGGAGATGCTGTTGATTATTTGGGTCTCTCCCCGCGTCTACCCGTCGCAGCTGAAT
CACCTGTTGATCTTAACCTGCCCCTCATAATCAAGATTGACTCTCCTCAAGATGATCGTAAAGCGACCCTATATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTTCAGGTGGAGGAAGATGACATTGAGCTTGACTCAACTAAAGTTAAAAAAGAGGGGAGCGTACCCCAAGCCTTTTCTGACATTGATTTGCATGCAGCGCTTCTGGC
GTACTGCATCACCAGAGTTGCTAAGGCTGCTTTGGAAAAAGCTTTGGCCGAGAATGGAGATGCTGTTGATTATTTGGGTCTCTCCCCGCGTCTACCCGTCGCAGCTGAAT
CACCTGTTGATCTTAACCTGCCCCTCATAATCAAGATTGACTCTCCTCAAGATGATCGTAAAGCGACCCTATATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLQVEEDDIELDSTKVKKEGSVPQAFSDIDLHAALLAYCITRVAKAALEKALAENGDAVDYLGLSPRLPVAAESPVDLNLPLIIKIDSPQDDRKATLY