; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh17G003380 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh17G003380
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionprotein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 4-like
Genome locationCmo_Chr17:2042008..2044662
RNA-Seq ExpressionCmoCh17G003380
SyntenyCmoCh17G003380
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008598 - Drought induced 19 protein type, zinc-binding domain
IPR027935 - Protein dehydration-induced 19, C-terminal
IPR033347 - Protein DEHYDRATION-INDUCED 19


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7013662.1 Protein DEHYDRATION-INDUCED 19-like 7 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.3e-9489.62Show/hide
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XP_023549083.1 protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 4-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-9488.58Show/hide
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XP_023549084.1 protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 4-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-9288.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1H3I7 protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 4-like isoform X11.4e-9589.5Show/hide
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A0A6J1H6W7 protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 4-like isoform X27.5e-9489.04Show/hide
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A0A6J1KM74 protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 4-like3.9e-8280Show/hide
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A0A6J1L119 protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 4-like isoform X27.8e-9186.3Show/hide
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A0A6J1L3U6 protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 4-like isoform X11.4e-9286.76Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q39083 Protein DEHYDRATION-INDUCED 193.2e-2541.29Show/hide
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        RSRS +  G  E   +++ + EF CPFCAE +DI+GL CH+D+EH +E KNA     S     +    +T ++     +QR+R+ RK G+N T S LRKE
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        LREG+L+ LLG +    S  +S  PDPLL SF S       P R QS  +   T +    K    +  V     S KD +ER  K EFVQ LL S I DE
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        +
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Q5W794 Protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 21.8e-2337.99Show/hide
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        D+W      SSS     RR ++R  +Y G         EE+E       + CPFC EDFD V   CHVD+EH VE K+      +T    +    LT  +
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             +QR+RR+RKI  GS+   S LRK+LR+G+L+S LGGS + S P +  PDP L S   +LP       + S SS       + P    +ER+  S 
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           S KD+KERAQ+ +FV+GL++STI ++
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Q84J70 Protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 35.6e-2235.68Show/hide
Query:  MEADSWNAPFQLSSSRRYR----SRSGVYQGDHEEIEEENSRTEFLCPFCAEDFDIVGLYCHVDEEHPVEVKNAHKYGRSTTSCDNYSTSLTKNY-----
        M++DSW+     S++RRY+    SRS  + G  E   EE  R EF CPFC++ FDIV L CH+DE+HP+E KN      +     +    +T  +     
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Query:  VQRQRRLRKIGSNLTFSKLRKELREGNLRSLLGGS----LHSAPTSTEPDPLLFSFTSNLPT--FRKPARVQSQSS-AEVTTSQENPKAHSERSSVSRLA
        + R+R+ R+ GS  T S LR+E  +GN +SL GGS      S+ ++   DPLL SF S +    F   + + +++   + TT Q  P+ +++++S+S   
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           +D K++ ++ EFV+ LL STILD+
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Q8VXU6 Protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 42.3e-3144.44Show/hide
Query:  SSSRRYRSRSGVY-QGDHEEIE-EENSRTEFLCPFCAEDFDIVGLYCHVDEEHPVEVKNA-----------HKYGRSTTSCDNYSTSLTKNYVQRQRRLR
        SSSRR +SRS +Y  G +E++E E++ + EF+CPFCAEDFDIVGL CH+DEEHPVE KN               G  TT   N+        VQR+RRLR
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        + G + T+  L+KELRE NL+SLLGG S  ++ T+ + DPLL SF  N P+  + A   ++S+  VT      K  S + S+ R    A  + +++E+A+
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        K EFV+GLL+ST+L++
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Q9FJ17 Protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 71.6e-2941.59Show/hide
Query:  MEADSW-NAPFQLS---SSRRYRSRSGVYQGDHEEIEEENSRTEFLCPFCAEDFDIVGLYCHVDEEHPVEVKNA-----------HKYGRSTTSCDNYST
        M+++SW N P   S   SSRRY+SRS +Y GD E   E++ + EF+CPFCA++FDIVGL CH+D  HPVE KN               G  TT   N   
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Query:  SLTKNYVQRQRRLRKIGSNLTFSKLRKELREGNLRSLLGGSLHSAPTSTEPDPLLFSFTSNLPTFRKPARVQSQSSAEVTTSQENPKAHSERSSVSRLAA
              VQR+RRLRK G + T+  L+KELRE NL+SL G S     ++ + DPLL SF      F+ P+ +       V  +Q +PK  + +S + + + 
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        SN+D+ E+A+K +FV+GLL ST+L++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56280.1 drought-induced 196.6e-2640.59Show/hide
Query:  RSRSGVYQGDHEEIEEENSRTEFLCPFCAEDFDIVGLYCHVDEEHPVEVKNA------HKYGRSTTSCDNYSTSLTKNYVQRQRRLRKIGSNLTFSKLRK
        RSRS +  G  E   +++ + EF CPFCAE +DI+GL CH+D+EH +E KNA       K G    +   ++       + R+R+ RK G+N T S LRK
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Query:  ELREGNLRSLLGGSLH--SAPTSTEPDPLLFSFTSNLPTFRKPARVQSQSSAEVTTSQENPKAHSERSSVSRLAASNKDEKERAQKCEFVQGLLMSTILD
        ELREG+L+ LLG +    S  +S  PDPLL SF S       P R QS  +   T +    K    +  V     S KD +ER  K EFVQ LL S I D
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Query:  EL
        E+
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AT1G56280.2 drought-induced 191.1e-2540.82Show/hide
Query:  RSRSGVYQGDHEEIEEENSRTEFLCPFCAEDFDIVGLYCHVDEEHPVEVKNAHKYGRSTTSCDNYSTSLTKNYVQRQRRLRKIGSNLTFSKLRKELREGN
        RSRS +  G  E   +++ + EF CPFCAE +DI+GL CH+D+EH +E KN           D    +  +  + R+R+ RK G+N T S LRKELREG+
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Query:  LRSLLGGSLH--SAPTSTEPDPLLFSFTSNLPTFRKPARVQSQSSAEVTTSQENPKAHSERSSVSRLAASNKDEKERAQKCEFVQGLLMSTILDEL
        L+ LLG +    S  +S  PDPLL SF S       P R QS  +   T +    K    +  V     S KD +ER  K EFVQ LL S I DE+
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AT3G06760.1 Drought-responsive family protein1.6e-3244.44Show/hide
Query:  SSSRRYRSRSGVY-QGDHEEIE-EENSRTEFLCPFCAEDFDIVGLYCHVDEEHPVEVKNA-----------HKYGRSTTSCDNYSTSLTKNYVQRQRRLR
        SSSRR +SRS +Y  G +E++E E++ + EF+CPFCAEDFDIVGL CH+DEEHPVE KN               G  TT   N+        VQR+RRLR
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        + G + T+  L+KELRE NL+SLLGG S  ++ T+ + DPLL SF  N P+  + A   ++S+  VT      K  S + S+ R    A  + +++E+A+
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Query:  KCEFVQGLLMSTILDE
        K EFV+GLL+ST+L++
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AT3G06760.2 Drought-responsive family protein1.2e-3042.73Show/hide
Query:  SSSRRYRSRSGVY-QGDHEEIE-EENSRTEFLCPFCAEDFDIVGLYCHVDEEHPVEVKNA--HKYGRSTTSCDNY-----STSL--------TKNYVQRQ
        SSSRR +SRS +Y  G +E++E E++ + EF+CPFCAEDFDIVGL CH+DEEHPVE KN     +      C N+      ++L        +  Y  R 
Subjt:  SSSRRYRSRSGVY-QGDHEEIE-EENSRTEFLCPFCAEDFDIVGLYCHVDEEHPVEVKNA--HKYGRSTTSCDNY-----STSL--------TKNYVQRQ

Query:  RRLRKIGSNLTFSKLRKELREGNLRSLLGG-SLHSAPTSTEPDPLLFSFTSNLPTFRKPARVQSQSSAEVTTSQENPKAHSERSSVSR---LAASNKDEK
        RRLR+ G + T+  L+KELRE NL+SLLGG S  ++ T+ + DPLL SF  N P+  + A   ++S+  VT      K  S + S+ R    A  + +++
Subjt:  RRLRKIGSNLTFSKLRKELREGNLRSLLGG-SLHSAPTSTEPDPLLFSFTSNLPTFRKPARVQSQSSAEVTTSQENPKAHSERSSVSR---LAASNKDEK

Query:  ERAQKCEFVQGLLMSTILDE
        E+A+K EFV+GLL+ST+L++
Subjt:  ERAQKCEFVQGLLMSTILDE

AT5G49230.1 Drought-responsive family protein1.2e-3041.59Show/hide
Query:  MEADSW-NAPFQLS---SSRRYRSRSGVYQGDHEEIEEENSRTEFLCPFCAEDFDIVGLYCHVDEEHPVEVKNA-----------HKYGRSTTSCDNYST
        M+++SW N P   S   SSRRY+SRS +Y GD E   E++ + EF+CPFCA++FDIVGL CH+D  HPVE KN               G  TT   N   
Subjt:  MEADSW-NAPFQLS---SSRRYRSRSGVYQGDHEEIEEENSRTEFLCPFCAEDFDIVGLYCHVDEEHPVEVKNA-----------HKYGRSTTSCDNYST

Query:  SLTKNYVQRQRRLRKIGSNLTFSKLRKELREGNLRSLLGGSLHSAPTSTEPDPLLFSFTSNLPTFRKPARVQSQSSAEVTTSQENPKAHSERSSVSRLAA
              VQR+RRLRK G + T+  L+KELRE NL+SL G S     ++ + DPLL SF      F+ P+ +       V  +Q +PK  + +S + + + 
Subjt:  SLTKNYVQRQRRLRKIGSNLTFSKLRKELREGNLRSLLGGSLHSAPTSTEPDPLLFSFTSNLPTFRKPARVQSQSSAEVTTSQENPKAHSERSSVSRLAA

Query:  SNKDEKERAQKCEFVQGLLMSTILDE
        SN+D+ E+A+K +FV+GLL ST+L++
Subjt:  SNKDEKERAQKCEFVQGLLMSTILDE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGCCGATTCCTGGAATGCTCCTTTTCAACTTTCATCGTCTCGACGCTACCGATCTCGTTCCGGTGTGTACCAAGGAGATCACGAAGAAATTGAAGAGGAAAATTC
GAGGACTGAGTTTTTGTGCCCGTTTTGCGCCGAGGATTTTGATATCGTAGGTCTTTATTGTCACGTCGATGAGGAGCATCCGGTGGAAGTCAAGAACGCGCATAAATATG
GCCGATCTACAACTTCCTGTGATAATTATTCCACTTCCTTGACTAAAAATTACGTGCAGCGACAGCGAAGATTGCGAAAAATTGGGTCCAATTTGACATTTTCAAAGCTG
AGAAAAGAGCTTAGGGAAGGAAACTTGAGATCCCTTCTTGGTGGTTCTTTACACTCTGCCCCCACAAGTACTGAGCCTGATCCCTTGTTGTTTTCTTTTACTTCTAATCT
GCCTACATTCAGAAAACCTGCTAGAGTGCAGTCTCAGTCGTCAGCCGAAGTAACTACATCACAGGAAAATCCCAAGGCTCATTCAGAGAGGAGCAGTGTCTCAAGGTTGG
CGGCTTCAAATAAGGATGAAAAGGAGAGGGCTCAGAAATGTGAGTTTGTACAAGGGCTGTTGATGTCTACTATTCTTGATGAGTTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAAGTCGCATTGTAGCCAGAGGGTCGGTAGAGAGTCTTTTGGTGCTCTCTCCGTCGCGTAATTTCTGTGTCTTTTCCTCGCTGCAGTTTTTCCATCTCTGTAAGGTCTA
GTTCTCAGTTTGATTTTGGATTCCATTTCGCGATCTTCGATAGCGATAGCGATCGCGATCGTGATTTTAATTGTTGTAAGAATTCGTGAAAAGATTTAGAGTTCAATCGA
TGGAGGCCGATTCCTGGAATGCTCCTTTTCAACTTTCATCGTCTCGACGCTACCGATCTCGTTCCGGTGTGTACCAAGGAGATCACGAAGAAATTGAAGAGGAAAATTCG
AGGACTGAGTTTTTGTGCCCGTTTTGCGCCGAGGATTTTGATATCGTAGGTCTTTATTGTCACGTCGATGAGGAGCATCCGGTGGAAGTCAAGAACGCGCATAAATATGG
CCGATCTACAACTTCCTGTGATAATTATTCCACTTCCTTGACTAAAAATTACGTGCAGCGACAGCGAAGATTGCGAAAAATTGGGTCCAATTTGACATTTTCAAAGCTGA
GAAAAGAGCTTAGGGAAGGAAACTTGAGATCCCTTCTTGGTGGTTCTTTACACTCTGCCCCCACAAGTACTGAGCCTGATCCCTTGTTGTTTTCTTTTACTTCTAATCTG
CCTACATTCAGAAAACCTGCTAGAGTGCAGTCTCAGTCGTCAGCCGAAGTAACTACATCACAGGAAAATCCCAAGGCTCATTCAGAGAGGAGCAGTGTCTCAAGGTTGGC
GGCTTCAAATAAGGATGAAAAGGAGAGGGCTCAGAAATGTGAGTTTGTACAAGGGCTGTTGATGTCTACTATTCTTGATGAGTTATGATTGGATATAGGTTCGTCGGAAG
AAGAGACCATGCCAGTTATAGTATGGAACCACAAGCGTAGGTTATATCGGGATGGATTGATCTGATTTGGATATTGCAGCAGGTGGCAATAGTTATTAGGTAAACTATGC
AATGTTCTATTATCCATAAGTATATATGTGCATAAATGCAAAGATGGAAGCTCTTGTTTTTATCAACATTTAGTAATATGATATGATAATGATGCTACTCTTACTCATAG
ATTGATTCTGTTCCTCATCCTCTTGAACTTATAAGCTTACTTGGGAAAATAATGTTGATTCCAAGCTGTTTTAAGTTGCCTCTAGACTTTGCTTCAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEADSWNAPFQLSSSRRYRSRSGVYQGDHEEIEEENSRTEFLCPFCAEDFDIVGLYCHVDEEHPVEVKNAHKYGRSTTSCDNYSTSLTKNYVQRQRRLRKIGSNLTFSKL
RKELREGNLRSLLGGSLHSAPTSTEPDPLLFSFTSNLPTFRKPARVQSQSSAEVTTSQENPKAHSERSSVSRLAASNKDEKERAQKCEFVQGLLMSTILDEL