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CmoCh17G004610 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh17G004610
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionNADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
Genome locationCmo_Chr17:3244058..3254149
RNA-Seq ExpressionCmoCh17G004610
SyntenyCmoCh17G004610
Gene Ontology termsGO:0042773 - ATP synthesis coupled electron transport (biological process)
GO:0005743 - mitochondrial inner membrane (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0009579 - thylakoid (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0070469 - respirasome (cellular component)
GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001750 - NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter, membrane subunit


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AEH04462.1 NADH dehydrogenase subunit 5, partial [Byrsonima crassifolia]1.2e-6790.38Show/hide
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KJB09767.1 hypothetical protein B456_001G163400 [Gossypium raimondii]2.6e-6789.74Show/hide
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YP_010048787.1 NADH dehydrogenase subunit 5 [Aquilaria sinensis]1.2e-6790.38Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2R2Z7J0 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 55.7e-6890.38Show/hide
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A0A6M2ED53 Uncharacterized protein5.7e-6890.38Show/hide
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A0A7T0KB29 NADH dehydrogenase subunit 45.7e-6890.38Show/hide
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F8TCB7 NADH dehydrogenase subunit 5 (Fragment)5.7e-6890.38Show/hide
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F8TCC3 NADH dehydrogenase subunit 5 (Fragment)4.4e-6890.38Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P10330 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 53.4e-7089.74Show/hide
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P26849 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 52.2e-6483.33Show/hide
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P29388 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 51.1e-6888.46Show/hide
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P50366 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 56.8e-4253.85Show/hide
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        LG++   FT++YS RLLF  FL  TN+++  I   HDVP+ M IPL LL   S+F+
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Q37680 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 51.1e-6888.46Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG01010.1 NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 protein1.1e-1035.29Show/hide
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         S  F+    S + L T++Y FR+  LTF    N++
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ATMG00060.1 NADH dehydrogenase subunit 5C7.9e-7088.46Show/hide
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ATMG00513.1 NADH dehydrogenase 5A7.9e-7088.46Show/hide
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ATMG00665.1 NADH dehydrogenase 5B7.9e-7088.46Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TAACTGGATTTTATTCCAAAGATGTGATCTTAGAGCTCACTTACACTAAGTATACCATCAGTGGGAACTTTTCTTTCCGGTTGGGAAGTGTCTCTGTCCTTTTCACCTCT
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CCTTCTGGTTCTCGAGAGTCTCTTTGTAATCTCAGACCAGGGGAAGGAAGGAGCGAAGCAAGCAAACAAGAAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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