; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh17G006100 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh17G006100
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionFMN-binding split barrel
Genome locationCmo_Chr17:6464585..6469980
RNA-Seq ExpressionCmoCh17G006100
SyntenyCmoCh17G006100
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012349 - FMN-binding split barrel
IPR037119 - Haem oxygenase HugZ-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575391.1 F-box/kelch-repeat protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.6e-20799.73Show/hide
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KAG7013929.1 hypothetical protein SDJN02_24098 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.4e-21199.73Show/hide
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XP_022954153.1 uncharacterized protein LOC111456501 [Cucurbita moschata]2.0e-212100Show/hide
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XP_022992307.1 uncharacterized protein LOC111488659 [Cucurbita maxima]6.0e-20999.2Show/hide
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XP_023549204.1 uncharacterized protein LOC111807632 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.3e-21099.2Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAK0 Uncharacterized protein3.0e-19089.97Show/hide
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A0A1S3CGC6 uncharacterized protein LOC1035006161.4e-19291.03Show/hide
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A0A5A7UTT3 Uncharacterized protein9.7e-18991.15Show/hide
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A0A6J1GQB1 uncharacterized protein LOC1114565019.7e-213100Show/hide
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A0A6J1JPF6 uncharacterized protein LOC1114886592.9e-20999.2Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G51560.1 Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein1.9e-14470.49Show/hide
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        P A + S  W   +  K+   LRI + +  G LR  AL    E +  S+  N FGL   +  S P+++     S EK++   + V+ SL  P G GTRAG
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        LS+E+E+DDAA+ISIDSKGIDIRVRQGAQF +QR++FE  H VETLEEAK AL K+I KG + N Q
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AT3G03890.1 FMN binding6.1e-1828.5Show/hide
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        +C ++S    + +GYP GS+VDFA D+ G PI + S LA+HT++LLA+P+C++++        +  R+T+ GD   + E  Q      Y+AKH +     
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        +G+F + R++    + ++ G  T          +EY+A + D IA     Q  K + +  +K  +E   A         V+ A ++ +DS G +++   Q
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        G  F ++
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AT3G03890.2 FMN binding6.1e-1828.5Show/hide
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        G  F ++
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AT3G21140.1 Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein2.0e-13871.43Show/hide
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        F N   +T F  LR+++ ++  GLR    L  E       +N FG F  +  S  +++L  + SN + ++  + V+ASL  P  G G RAGLFRTPISGG
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        VQ+ATSAH LPRPALAVRNL+EQARFAHLCTVMS+MHHRR+GYPFGSLVDFA D MGHPIF FSPLAIHTRNLL +PRC++VVQIPGWSGLSNARVT+FG
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        D+YPL ED+QEWAHKQYIAKH  GPS+QWGNF+YFRMQ+ISDIYFIGGFGTVAWVDVKEYE LQPDKIAVDGGE++LKELNA+FSKPL+ELLS ESEVDD
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Query:  AALISIDSKGIDIRVRQGAQFNVQRISFEGGHAVETLEEAKVALRKLINK
        AALISIDSKGID+RVRQGAQFN+QR++FE GH VETLEEAK AL K++ K
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TATCTGGTTTTTATTGCATAAGTTAATGTGACATCGCAAGAAGCGTGTTGAAAATGACTCAATAAATGTTCTGCAACAACTATTCGATGGCTCTTGATGCCATTTAATTT
GTATTAGATTAGTGAAATTTAATATCATTATCTAAGTATTTACTTTCTTTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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