; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh17G007410 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh17G007410
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1677)
Genome locationCmo_Chr17:7361273..7361860
RNA-Seq ExpressionCmoCh17G007410
SyntenyCmoCh17G007410
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012876 - Protein of unknown function DUF1677, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646534.1 hypothetical protein Csa_016674 [Cucumis sativus]9.2e-9392.31Show/hide
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XP_011659684.1 uncharacterized protein LOC105436220 [Cucumis sativus]9.2e-9392.31Show/hide
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XP_022953378.1 uncharacterized protein LOC111455946 [Cucurbita moschata]1.7e-102100Show/hide
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XP_022992409.1 uncharacterized protein LOC111488724 [Cucurbita maxima]7.8e-10097.95Show/hide
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XP_038898439.1 uncharacterized protein LOC120086077 [Benincasa hispida]4.1e-9392.82Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K9S5 Uncharacterized protein4.5e-9392.31Show/hide
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A0A1S3CGX8 uncharacterized protein LOC1035007868.4e-9291.28Show/hide
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A0A5D3BVT1 Uncharacterized protein2.2e-9291.79Show/hide
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A0A6J1GN68 uncharacterized protein LOC1114559468.1e-103100Show/hide
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A0A6J1JXG9 uncharacterized protein LOC1114887243.8e-10097.95Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G79770.1 Protein of unknown function (DUF1677)5.0e-3647.4Show/hide
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        MA +G     S +  K   P++   +L R++SDIS++  +E       ++  L  I E+E A+CECCGM EE T EYI+R+R+KF GK ICGLCSEAV+ 
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        E +K      E AL  HMSAC RFNKLGR YP LFQA+AMR+ML++S        R +S+ P         K  I+R+SSCIPAI  T DLN
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AT2G25780.1 Protein of unknown function (DUF1677)3.1e-1431.2Show/hide
Query:  NALQRTISDISMELGKELAITSDTKQDALPPISEIEDARCECCGMSEEYTQEYIDRMRDKFLGKLICGLCSEAVEGEVEKH---GGSKEAALNAHMSACA
        N L++  SD+S+E  + ++   + +Q+      E+   +C+CCG+ EE T +YI ++R+ + G  +CGLC E V   + K        + A + H   C 
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Query:  RFNKLGRAYPVLFQAEAMREMLKKS
         FN   R  P L    +MRE+ K+S
Subjt:  RFNKLGRAYPVLFQAEAMREMLKKS

AT3G22540.1 Protein of unknown function (DUF1677)2.8e-1543.82Show/hide
Query:  EIEDARCECCGMSEEYTQEYIDRMRDKFLGKLICGLCSEAVEGEVEKHG-GSKEAALNAHMSACARFNKLGRAYPVLFQAEAMREMLKK
        EIE  RCECCG+ E+ TQ+YI  ++  F  K +CGLCSEAV  EV +    + + A+ AH+S C +F K     P +  A+ MR+ML++
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AT4G14819.1 Protein of unknown function (DUF1677)6.1e-1843.81Show/hide
Query:  EIEDARCECCGMSEEYTQEYIDRMRDKFLGKLICGLCSEAVEGEVEKHGGSKEAALNAHMSACARFNKLGRAYPVLFQAEAMREMLKKSRMDGRGGLRAK
        EIE   CECCG+ E+ TQ YI +++  F GK +CGLCSEAV  E  +   + E A+NAHMS C +FN    A P    A+ MR+ML++         R+ 
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Query:  SLSPR
         LSP+
Subjt:  SLSPR

AT5G25840.1 Protein of unknown function (DUF1677)5.7e-4052.3Show/hide
Query:  LQRTISDISMELGKELAITSDTKQDA-------LPPISEIEDARCECCGMSEEYTQEYIDRMRDKFLGKLICGLCSEAVEGEVEKHGGS-------KEAA
        LQRTISDIS ++  +  +T +    A       L  ISE+EDA+CECCGMSEE T EYI R+R KF GKLICGLC +AVEGE+EK   S       +E A
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Query:  LNAHMSACARFNKLGRAYPVLFQAEAMREMLKKSRMDGRGGLRAKSLSPRDKAAAAQKKGGIARSSSCIPAIIR
        +  HMSAC+RFN+LGR+YPVL+QAEA++EMLKK         R+K +      A   +KGG+ARSSSC+PA+ +
Subjt:  LNAHMSACARFNKLGRAYPVLFQAEAMREMLKKSRMDGRGGLRAKSLSPRDKAAAAQKKGGIARSSSCIPAIIR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACCTCATGGAGAAGCTATTCCAAGGAGCAACAACTTCTCCAAGGCACCAAGGCTTTCATCCAATGCCCTCCAAAGAACAATCTCAGACATATCCATGGAGTTGGG
GAAGGAGTTGGCTATAACATCGGATACCAAACAAGACGCGCTTCCACCGATATCTGAGATCGAGGATGCGCGGTGTGAGTGTTGTGGGATGAGTGAGGAGTACACTCAAG
AGTACATCGATCGGATGCGAGACAAGTTCCTTGGGAAGTTGATATGCGGGCTATGCTCTGAGGCCGTGGAAGGAGAGGTGGAGAAGCATGGAGGGAGCAAAGAGGCGGCG
TTGAACGCTCATATGAGCGCCTGCGCAAGGTTCAACAAATTGGGGAGGGCTTATCCGGTGTTGTTTCAGGCTGAGGCAATGAGAGAGATGTTGAAGAAGAGTAGGATGGA
TGGGAGAGGTGGTCTTAGAGCTAAGTCTTTGAGTCCTAGAGACAAAGCTGCAGCAGCCCAAAAGAAAGGTGGGATTGCAAGGAGTTCAAGTTGCATTCCAGCCATCATAA
GAACAGAGGATCTTAACAACCTCAAGCTACAAAACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPHGEAIPRSNNFSKAPRLSSNALQRTISDISMELGKELAITSDTKQDALPPISEIEDARCECCGMSEEYTQEYIDRMRDKFLGKLICGLCSEAVEGEVEKHGGSKEAA
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