; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh17G008600 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh17G008600
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionPPPDE domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr17:7923294..7925897
RNA-Seq ExpressionCmoCh17G008600
SyntenyCmoCh17G008600
Gene Ontology termsGO:0016579 - protein deubiquitination (biological process)
GO:0101005 - ubiquitinyl hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008580 - PPPDE peptidase domain
IPR042266 - PPPDE peptidase domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014173.1 DeSI-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.3e-11885.82Show/hide
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XP_023549100.1 deSI-like protein At4g17486 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.9e-12198.66Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GQ68 deSI-like protein At4g17486 isoform X15.6e-124100Show/hide
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A0A6J1GRX9 deSI-like protein At4g17486 isoform X23.7e-11595.98Show/hide
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A0A6J1H916 deSI-like protein At4g174866.2e-10787.56Show/hide
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A0A6J1JMF4 deSI-like protein At4g17486 isoform X23.2e-11193.27Show/hide
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A0A6J1JRC0 deSI-like protein At4g17486 isoform X14.9e-12097.31Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3QRX8 Deubiquitinase DESI21.5e-2537.06Show/hide
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H2KZK4 Desumoylating isopeptidase 1 homolog1.8e-2635.52Show/hide
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        V LNVYD+  +N YA   G+G+FHSG++V GVEYA+G H    +G+FE  P+      + F+F+++++VG+T+   +++R L+  L + ++G+ Y+LI++
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        NCNHF      +LTG  IP W+NRLA     I FL  C+ P  + +  +   +  E K  ++++ +E T +      +DS ++
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Q5PQ09 Deubiquitinase DESI24.0e-2635.75Show/hide
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        P+ LNVYD+  IN Y    G+GVFHSG+QV+G E+A+G H    +G+FE  P       D F+F++ + +G TD    ++  +++EL + YKGNAY+L+ 
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        KNCNHF +     L G  IP WVNRLA     + FL +C+         ++         ++ E + EL  E  +  ++ +++S ++  R GR
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Q93VG8 DeSI-like protein At4g174861.6e-4652.82Show/hide
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        PVYLNVYDLT +N Y YWFG+G+FHSG++ H +EY +GAHE  T+G++E  P+ C GF FR++VL+G T M  ++ R+ M++L++ Y G+ Y+LI KNCN
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        HF  + C++LTG  IP W+NRLAR+G  CNC+LP +   T +
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Q9D291 Deubiquitinase DESI21.5e-2536.04Show/hide
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        G +  V LNVYD+  +N Y    G+GVFHSG++V+G E+A+G H    +GIFE  P       + F+F++ V++G TD    ++  +++EL + YKGNAY
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        +L+ KNCNHF +     L G  IP W+NRLA     I FL +C+         ++         V+ E + EL  E+    +S + +S ++  R GR
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G47740.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein2.2e-5661.9Show/hide
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        G  PVYLNVYDLT INGY YW GLG+FHSGV+VHGVEYAFGAH+ +T+G+FE  P+QC GF+F+K++ +G T++ PT+VR  M+++A SY GN Y+LI K
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        NCNHFC D C KLTG  IP WVNRLA+IG +C+C+LP +   T + H
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AT1G80690.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein8.4e-7264.22Show/hide
Query:  GSVPVYLNVYDLTAINGYAYWFGLGVFHSGVQVHGVEYAFGAHERSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMDELAQSYKGNAYNLITK
        G+VPVYLNVYDLT INGYAYW GLGV+HSGV+VHG+EYA+GAHE  +TGIFEG PKQC+GF FRK++L+GKTD+ P EVRA M++LA +YKG++YNLITK
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Query:  NCNHFCNDACVKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTFNSTRIRHHNRIEDKVVTMET-KKELTTESTK------TPSSDSTSSPSSAVR-RGRTRTR
        NCNHFC++ C+KLTGN IP+WVNRLARIGF+CNCVLP T N+TR  ++   +DK    E  KK+LT+ S++      TPSS S+SSPS  VR R R R  
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        RA  P SPL   +L SSS
Subjt:  RAPPPCSPLPSHSLSSSS

AT2G25190.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein3.0e-6155.07Show/hide
Query:  MLLFKKPIE-ERTGGSVPVYLNVYDLTAINGYAYWFGLGVFHSGVQVHGVEYAFGAHERSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMDEL
        ML FK  ++ ++  GSVPVYLNVYDLT +N Y YW GLGVFHSGV+VHGVEYAFGAHE S+TGIFE  PK+C GF FRK++LVGKTD+   EVR  M++L
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Query:  AQSYKGNAYNLITKNCNHFCNDACVKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTFNSTRIRHHNRIEDKVVTMETKKELTTESTKTP---SSDSTSSPSSA
        A+ Y+GN Y+LIT+NCNHFCN+ C+KL   SIP WVNRLAR+G LCNCVLP   N  ++R   R+    ++   KK+L   S   P   SS S+S+P + 
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Query:  VRRGRTRTRRAPPPCSPLPSHSLSSSS
          R   R + +       PS S SSSS
Subjt:  VRRGRTRTRRAPPPCSPLPSHSLSSSS

AT4G31980.1 unknown protein5.3e-5851.64Show/hide
Query:  ERTGGSVPVYLNVYDLTAINGYAYWFGLGVFHSGVQVHGVEYAFGAHERSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMDELAQSYKGNAYN
        ++  G+VPVYLNVYDLT +N Y YW G+G++HSG++VHGVEY +GAHE+S++GIFE  PK+C GF FRK++LVG+T+MK  EVR+ M++L++ Y+GN Y+
Subjt:  ERTGGSVPVYLNVYDLTAINGYAYWFGLGVFHSGVQVHGVEYAFGAHERSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMDELAQSYKGNAYN

Query:  LITKNCNHFCNDACVKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTFNSTRIRHHNRIEDKVVTME-TKKELTTESTKTPSSDSTSSPSSAVRRGRTRTRR--
        LIT+NCNHFCN   +KLT  SIP+WVNRLAR+GFLCNCVLP   N T+++   +    ++  E TKK+   +  +   S   SS SS  R   T T    
Subjt:  LITKNCNHFCNDACVKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTFNSTRIRHHNRIEDKVVTME-TKKELTTESTKTPSSDSTSSPSSAVRRGRTRTRR--

Query:  ---APPPCSPLPS
             PP S  PS
Subjt:  ---APPPCSPLPS

AT5G25170.1 PPPDE putative thiol peptidase family protein1.4e-6660.59Show/hide
Query:  GSVPVYLNVYDLTAINGYAYWFGLGVFHSGVQVHGVEYAFGAHERSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMDELAQSYKGNAYNLITK
        GSVPVYLNVYDLT INGYAYW GLG++HSGV+VHGVEY FGAH+ STTGIFE  PKQC GF FRK++L+G+TD+ P  VR  M++LA+ Y GN+Y+LITK
Subjt:  GSVPVYLNVYDLTAINGYAYWFGLGVFHSGVQVHGVEYAFGAHERSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMDELAQSYKGNAYNLITK

Query:  NCNHFCNDACVKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTFNSTRIRHHNRIEDKVVTMETKKELTTESTKTPSSDSTSSPSSAVRRGRTRTRRAPPPCSP
        NCNHFCND CV+LT  SIP+WVNRLAR G  CNCVLP   N T++R     E+K+  +E KK+L + S++ P   S SS  S  R  R   RR   P SP
Subjt:  NCNHFCNDACVKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTFNSTRIRHHNRIEDKVVTMETKKELTTESTKTPSSDSTSSPSSAVRRGRTRTRRAPPPCSP

Query:  LPS
          S
Subjt:  LPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGTTGTTGTTTAAGAAACCAATCGAAGAACGCACCGGAGGATCCGTGCCGGTGTATCTGAATGTCTACGATCTAACCGCGATCAATGGCTACGCTTACTGGTTTGG
CCTCGGCGTTTTCCATTCCGGAGTTCAAGTTCATGGTGTGGAATACGCATTTGGAGCTCACGAGCGCTCAACAACGGGAATTTTTGAAGGAGTGCCGAAGCAATGCGACG
GATTTCGATTTAGGAAGACAGTTTTGGTAGGCAAAACAGATATGAAACCAACAGAGGTGAGAGCTTTAATGGATGAACTTGCCCAATCCTACAAGGGAAATGCTTACAAT
TTGATCACCAAAAACTGCAACCATTTTTGCAATGATGCTTGTGTTAAACTCACAGGGAATTCCATCCCAAACTGGGTTAATCGCCTTGCTAGAATTGGCTTTCTTTGCAA
TTGTGTTCTACCAGTGACCTTCAATTCCACCAGAATCCGTCACCACAACAGAATAGAAGACAAGGTTGTAACCATGGAAACAAAGAAGGAATTAACAACTGAATCAACAA
AAACTCCCAGTTCTGATTCTACTTCATCTCCTTCCTCGGCCGTTCGCCGAGGAAGAACTCGGACGAGACGAGCTCCTCCTCCGTGTTCTCCATTGCCTTCTCATTCTTTA
TCCTCGTCTTCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGTTAGTGATCAGGTTATATAAACTTAGCCAGCACGAGAAAATTAGGGAGCCAGCTAGAAAGCTCTCAGTGGCATTTATGTAATTGGAGCCAAAAACCGAGCCCGATGGT
ATACCATCACCAAACTAGGATCGTCCACGGTCCAGATCATTTCTATGGTGTTCAACAACGAGTCGCCGCCGGTGACGCCCGTTAGAATTAGAAACTAAGAAACAATAGTT
TCCGTTCTTCTCCGCAGATTTTGAATTTCAAATTTTCCGTTTCTTGAGGTCGTCACTCTACGTTTTATCGGTTCCGTTTTTTGAGAGTTCTTGGCCATGAATTGAGACGG
AATGATGTTGTTGTTTAAGAAACCAATCGAAGAACGCACCGGAGGATCCGTGCCGGTGTATCTGAATGTCTACGATCTAACCGCGATCAATGGCTACGCTTACTGGTTTG
GCCTCGGCGTTTTCCATTCCGGAGTTCAAGTTCATGGTGTGGAATACGCATTTGGAGCTCACGAGCGCTCAACAACGGGAATTTTTGAAGGAGTGCCGAAGCAATGCGAC
GGATTTCGATTTAGGAAGACAGTTTTGGTAGGCAAAACAGATATGAAACCAACAGAGGTGAGAGCTTTAATGGATGAACTTGCCCAATCCTACAAGGGAAATGCTTACAA
TTTGATCACCAAAAACTGCAACCATTTTTGCAATGATGCTTGTGTTAAACTCACAGGGAATTCCATCCCAAACTGGGTTAATCGCCTTGCTAGAATTGGCTTTCTTTGCA
ATTGTGTTCTACCAGTGACCTTCAATTCCACCAGAATCCGTCACCACAACAGAATAGAAGACAAGGTTGTAACCATGGAAACAAAGAAGGAATTAACAACTGAATCAACA
AAAACTCCCAGTTCTGATTCTACTTCATCTCCTTCCTCGGCCGTTCGCCGAGGAAGAACTCGGACGAGACGAGCTCCTCCTCCGTGTTCTCCATTGCCTTCTCATTCTTT
ATCCTCGTCTTCATGAGGAACAGACATGATTGGAACCTCAGCAGCTCCATTGGAAGTGCCGGAAGAAGGTGAGACAGTCGCAATTCTTAGCTTTTCCTCTATAATATTCT
TCTTCATGATCTTGGAAGATCAAATTCAAATCAGAAGCCATTGATTTGTATGCTTTCAATTCCCTTCATTTGCCTCTGAATTGTTTTCTTGTATTATTTCTACTTCTTGT
AAAAGTTAATATCATTGTGAAGTTAAAATCACAATTCATATTCTCATAATTTAAACAAAGTGTGGACTTTTTGTTGCTTGAAATTTAAGTAATCACAATCTTCTTGTCAA
AGTGAAGAAAAAATCACTTGAGATGACTGGACAAGAAGTTACAATCATAGGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMLLFKKPIEERTGGSVPVYLNVYDLTAINGYAYWFGLGVFHSGVQVHGVEYAFGAHERSTTGIFEGVPKQCDGFRFRKTVLVGKTDMKPTEVRALMDELAQSYKGNAYN
LITKNCNHFCNDACVKLTGNSIPNWVNRLARIGFLCNCVLPVTFNSTRIRHHNRIEDKVVTMETKKELTTESTKTPSSDSTSSPSSAVRRGRTRTRRAPPPCSPLPSHSL
SSSS