; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh17G010670 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh17G010670
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionuniversal stress protein A-like protein isoform X1
Genome locationCmo_Chr17:8894812..8896297
RNA-Seq ExpressionCmoCh17G010670
SyntenyCmoCh17G010670
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR014729 - Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575831.1 Universal stress protein A-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.2e-6087.41Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAK-------
        MAVEAAKPVMVIGIDDSEHA AALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAK       
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAK-------

Query:  -------SSLNLGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY
               S LNLGLNGYEL MILKCDPIVFD EFEVEEGDARY
Subjt:  -------SSLNLGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY

KAG7014366.1 hypothetical protein SDJN02_24543, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.2e-6087.41Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAK-------
        MAVEAAKPVMVIGIDDSEHA AALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAK       
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAK-------

Query:  -------SSLNLGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY
               S LNLGLNGYEL MILKCDPIVFD EFEVEEGDARY
Subjt:  -------SSLNLGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY

XP_022953724.1 uncharacterized protein LOC111456170 [Cucurbita moschata]1.2e-4782.58Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN
        MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR   SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKS   
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN

Query:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY
                         VFDAEFEVEEGDARY
Subjt:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY

XP_022991249.1 uncharacterized protein LOC111487962 [Cucurbita maxima]5.2e-4680.3Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN
        MAVEAAKPVMVIGIDDSEHA +ALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR   SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKS   
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN

Query:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY
                         VFD EFEVEEGDARY
Subjt:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY

XP_023522510.1 uncharacterized protein LOC111786496 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.4e-4579.55Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN
        MAVEAAKPVMVIGIDDSEHA AALEWTLDK FSRT RLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR   SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKS   
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN

Query:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY
                         VFD EFEVEEGDARY
Subjt:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAW4 Usp domain-containing protein6.8e-3657.59Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN
        MA  A+KPVMVIG+DDSE A AALEWTLD+FFS+T+ L PFKLVVVHVKPSPDVFVG SG G    S+ETYQA D DLKRKA RTI+ AREICA+KS   
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN

Query:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARYGFDGKCERLLRTSSTLQCHDCEDEGA
                         V D EFEVEEGDARY     CE  ++  +++      D GA
Subjt:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARYGFDGKCERLLRTSSTLQCHDCEDEGA

A0A1S3BR75 universal stress protein in QAH/OAS sulfhydrylase 3'region-like isoform X44.3e-3867.44Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLNLGL
        MA  A+KPVMVIG+DDSE A A LEWTLD+FFS+T+R+ PFKLVVVHVKPSPDVFVG SG GRSVETYQA D DLKRKAARTI++AREIC++KS      
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLNLGL

Query:  NGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY
                      V D EFEVEEGDARY
Subjt:  NGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY

A0A1S3BSX6 universal stress protein in QAH/OAS sulfhydrylase 3'region-like isoform X31.8e-3665.91Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN
        MA  A+KPVMVIG+DDSE A A LEWTLD+FFS+T+R+ PFKLVVVHVKPSPDVFVG SG GR   SVETYQA D DLKRKAARTI++AREIC++KS   
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN

Query:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY
                         V D EFEVEEGDARY
Subjt:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY

A0A6J1GQH8 uncharacterized protein LOC1114561705.9e-4882.58Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN
        MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR   SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKS   
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN

Query:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY
                         VFDAEFEVEEGDARY
Subjt:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY

A0A6J1JUA8 uncharacterized protein LOC1114879622.5e-4680.3Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN
        MAVEAAKPVMVIGIDDSEHA +ALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR   SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKS   
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGR---SVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLN

Query:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY
                         VFD EFEVEEGDARY
Subjt:  LGLNGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDARY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09740.1 Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein9.5e-0634.95Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVS-------GP-GRSVETY-QALDDDLKRKAARTIELAREICA
        M V  +   +V+ +D SE +  AL W LD     +        VV+HV+PSP V  GVS       GP G  V  +  A++   KR     +E A +ICA
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVS-------GP-GRSVETY-QALDDDLKRKAARTIELAREICA

Query:  AKS
         KS
Subjt:  AKS

AT2G47710.1 Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein1.3e-1842.19Show/hide
Query:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLNLGL
        MA    K VMV+G+DDSE +  ALEWTLD+FF+      PFKL +VH KP+    VG++GPG + E    +D DLK  AA+ +E A+ IC ++S      
Subjt:  MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLNLGL

Query:  NGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDAR
                      V  A  EV EGDAR
Subjt:  NGYELTMILKCDPIVFDAEFEVEEGDAR

AT5G49050.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown1.0e-1241.86Show/hide
Query:  VMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKS
        V+V+G+DDS H++ ALE  LD FF        FKLVV+H +P+   F+GV+GPG +V+    +++DL + A    +   E+C+AKS
Subjt:  VMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGTAGAGGCAGCGAAGCCAGTGATGGTGATCGGAATCGACGACAGCGAACACGCATTTGCCGCTCTGGAGTGGACATTGGACAAATTTTTTTCTCGAACAGTACG
ATTACAACCGTTTAAGCTCGTCGTTGTTCATGTCAAACCATCTCCCGACGTCTTCGTCGGCGTCTCCGGACCAGGAAGATCGGTTGAAACCTACCAAGCTCTGGATGATG
ATTTGAAGAGAAAAGCTGCGAGAACTATCGAACTTGCCAGAGAAATTTGCGCTGCGAAATCGTCTTTGAATCTCGGATTAAATGGATACGAACTTACGATGATTCTCAAA
TGCGATCCAATTGTTTTTGATGCTGAATTCGAGGTTGAAGAAGGAGATGCAAGATATGGCTTTGATGGGAAGTGTGAGCGACTATTGCGCACATCAAGCACCTTGCAGTG
TCATGATTGTGAAGATGAAGGAGCGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACCAGTTCACCAATCCCAAAAACAGGCGGCGTTCTGGAATCGTCTGGCGGCGATGGCGGTAGAGGCAGCGAAGCCAGTGATGGTGATCGGAATCGACGACAGCGAACAC
GCATTTGCCGCTCTGGAGTGGACATTGGACAAATTTTTTTCTCGAACAGTACGATTACAACCGTTTAAGCTCGTCGTTGTTCATGTCAAACCATCTCCCGACGTCTTCGT
CGGCGTCTCCGGACCAGGAAGATCGGTTGAAACCTACCAAGCTCTGGATGATGATTTGAAGAGAAAAGCTGCGAGAACTATCGAACTTGCCAGAGAAATTTGCGCTGCGA
AATCGTCTTTGAATCTCGGATTAAATGGATACGAACTTACGATGATTCTCAAATGCGATCCAATTGTTTTTGATGCTGAATTCGAGGTTGAAGAAGGAGATGCAAGATAT
GGCTTTGATGGGAAGTGTGAGCGACTATTGCGCACATCAAGCACCTTGCAGTGTCATGATTGTGAAGATGAAGGAGCGTAGTGACAAAAACAGTGCTTAAATAACTCAAA
ATCTGTATTTCTGTTTGTATTTCTAATCTTGTTGTATTTTTAAGACGGGATACTTAAAAATTATTAATTTTTTTAATTTTCTTTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAVEAAKPVMVIGIDDSEHAFAALEWTLDKFFSRTVRLQPFKLVVVHVKPSPDVFVGVSGPGRSVETYQALDDDLKRKAARTIELAREICAAKSSLNLGLNGYELTMILK
CDPIVFDAEFEVEEGDARYGFDGKCERLLRTSSTLQCHDCEDEGA