; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh17G010790 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh17G010790
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationCmo_Chr17:8952765..8953121
RNA-Seq ExpressionCmoCh17G010790
SyntenyCmoCh17G010790
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014377.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.6e-5898.31Show/hide
Query:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFST V ATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGCSAIARCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]1.0e-4176.27Show/hide
Query:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MA  +SFLLP   + A LTV STA      K PSWVLD A A CHGSMA+CMM+DIEFQMDSEINRRILAD+NYISYDAL+AN VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]1.9e-4579.66Show/hide
Query:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAK+SFLLPFC I A LTV STAV A +T+ PSWVLD A A CHGSMA+CMMD+IE++M+SEINRRILA  NYISY+AL+AN VPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGCSAI RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]1.8e-59100Show/hide
Query:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGCSAIARCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]5.1e-4680.51Show/hide
Query:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAK+SFLLPF  +AA LTV STAV  T+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMM DIEF+M+S+INRRILAD+NYISYDAL+AN VPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein4.8e-4276.27Show/hide
Query:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MA  +SFLLP   + A LTV STA      K PSWVLD A A CHGSMA+CMM+DIEFQMDSEINRRILAD+NYISYDAL+AN VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like3.1e-4175.42Show/hide
Query:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAK+SFLLP   + A LTV STA +      PSWVL  A A CHGSMA+CM +DIEF+MDSEINRRILAD+NYISYDALRAN VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like3.1e-4175.42Show/hide
Query:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAK+SFLLP   + A LTV STA +      PSWVL  A A CHGSMA+CM +DIEF+MDSEINRRILAD+NYISYDALRAN VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGC+AI+RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 339.4e-4679.66Show/hide
Query:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAK+SFLLPFC I A LTV STAV A +T+ PSWVLD A A CHGSMA+CMMD+IE++M+SEINRRILA  NYISY+AL+AN VPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGCSAI RCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like8.8e-60100Show/hide
Query:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
        MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPG

Query:  AEANPYDRGCSAIARCRS
        AEANPYDRGCSAIARCRS
Subjt:  AEANPYDRGCSAIARCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 338.8e-2555.45Show/hide
Query:  PFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMD--DIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYD
        P   I A LTV     + T+     +V     + C+G++A+C +   + EF+MDSEINRRILA   YISY ALR N VPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY 
Subjt:  PFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMD--DIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYD

Query:  RGCSAIARCR
        RGCSAI RCR
Subjt:  RGCSAIARCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor2.3e-2554.39Show/hide
Query:  SFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLD-RALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEAN
        S L+    I AF   F +  +A  +    WV+  R+   C GS+ +C+ ++ EF++DSE NRRILA   YISY AL+ N VPCSRRGASYYNC+PGA+AN
Subjt:  SFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLD-RALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYDRGCSAIARCRS
        PY RGCSAI RCRS
Subjt:  PYDRGCSAIARCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 235.4e-2258.89Show/hide
Query:  CHGSMADCMMD-------DI---------EFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSAIARCR
        C G++A+C +        D+         EF+MDSEINRRILA   YISY ALR N +PCSRRGASYYNC+ GA+ANPY RGCSAI RCR
Subjt:  CHGSMADCMMD-------DI---------EFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSAIARCR

Q9MA62 Protein RALF-like 222.6e-2453.21Show/hide
Query:  IAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRA-----LATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDR
        + A L +  +AV +T   G S    RA      + C GS+A+C+ ++ E + DS+I+RRILA   YISY A+R N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY R
Subjt:  IAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRA-----LATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDR

Query:  GCSAIARCR
        GCS I RCR
Subjt:  GCSAIARCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 16.8e-2572Show/hide
Query:  CHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSAIARCRS
        CHGS+A+C+  + E +MDSEINRRILA   YISY +L+ N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY RGCS IARCRS
Subjt:  CHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSAIARCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 14.8e-2672Show/hide
Query:  CHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSAIARCRS
        CHGS+A+C+  + E +MDSEINRRILA   YISY +L+ N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY RGCS IARCRS
Subjt:  CHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSAIARCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.0e-1545.19Show/hide
Query:  IAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRR-ILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSA
        I   LT+   A SA  T    W L ++     G + +    ++++ MDSE NRR + A  +YISY ALR N VPCSRRG SYY+C+    ANPY RGCS 
Subjt:  IAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRR-ILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSA

Query:  IARC
        I  C
Subjt:  IARC

AT3G05490.1 ralf-like 221.8e-2553.21Show/hide
Query:  IAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRA-----LATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDR
        + A L +  +AV +T   G S    RA      + C GS+A+C+ ++ E + DS+I+RRILA   YISY A+R N VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY R
Subjt:  IAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRA-----LATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDR

Query:  GCSAIARCR
        GCS I RCR
Subjt:  GCSAIARCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 233.8e-2358.89Show/hide
Query:  CHGSMADCMMD-------DI---------EFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSAIARCR
        C G++A+C +        D+         EF+MDSEINRRILA   YISY ALR N +PCSRRGASYYNC+ GA+ANPY RGCSAI RCR
Subjt:  CHGSMADCMMD-------DI---------EFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGCSAIARCR

AT4G15800.1 ralf-like 336.3e-2655.45Show/hide
Query:  PFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMD--DIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYD
        P   I A LTV     + T+     +V     + C+G++A+C +   + EF+MDSEINRRILA   YISY ALR N VPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY 
Subjt:  PFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMD--DIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYD

Query:  RGCSAIARCR
        RGCSAI RCR
Subjt:  RGCSAIARCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCAAGCTTTCTTTTCTCCTTCCATTTTGCTTCATCGCTGCATTCCTGACCGTCTTCTCCACTGCAGTATCGGCCACCACCACAAAAGGCCCGAGTTGGGTCCT
CGATCGAGCTCTAGCTACCTGTCATGGCTCCATGGCAGACTGCATGATGGACGACATTGAATTTCAGATGGACTCCGAAATCAATAGACGCATATTGGCCGATGTAAACT
ACATAAGCTACGATGCGCTCAGGGCCAACAAGGTGCCATGCTCACGCAGAGGAGCATCTTACTACAATTGCCAGCCAGGTGCTGAGGCTAACCCCTACGACCGTGGCTGC
AGTGCTATTGCTCGTTGCCGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCAAGCTTTCTTTTCTCCTTCCATTTTGCTTCATCGCTGCATTCCTGACCGTCTTCTCCACTGCAGTATCGGCCACCACCACAAAAGGCCCGAGTTGGGTCCT
CGATCGAGCTCTAGCTACCTGTCATGGCTCCATGGCAGACTGCATGATGGACGACATTGAATTTCAGATGGACTCCGAAATCAATAGACGCATATTGGCCGATGTAAACT
ACATAAGCTACGATGCGCTCAGGGCCAACAAGGTGCCATGCTCACGCAGAGGAGCATCTTACTACAATTGCCAGCCAGGTGCTGAGGCTAACCCCTACGACCGTGGCTGC
AGTGCTATTGCTCGTTGCCGAAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAKLSFLLPFCFIAAFLTVFSTAVSATTTKGPSWVLDRALATCHGSMADCMMDDIEFQMDSEINRRILADVNYISYDALRANKVPCSRRGASYYNCQPGAEANPYDRGC
SAIARCRS