; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh17G013580 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh17G013580
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionsmall acidic protein-like isoform X2
Genome locationCmo_Chr17:10568259..10569436
RNA-Seq ExpressionCmoCh17G013580
SyntenyCmoCh17G013580
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036020 - WW domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576106.1 hypothetical protein SDJN03_26745, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-10498.98Show/hide
Query:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDP
        MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRL+SAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDP
Subjt:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDP

Query:  RTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
        RTAEAHSRDLYSEDDD+NDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
Subjt:  RTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP

XP_004140554.1 uncharacterized protein LOC101221916 [Cucumis sativus]5.8e-8786.14Show/hide
Query:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAP-SAGVRR-----SSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM
        MKSPDMAAVTDSLEQSFR FSLNHRL SAAP SAGVRR     SSSSSSS DE HLPL+QH+RFDT LELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM
Subjt:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAP-SAGVRR-----SSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM

Query:  RVTEDPRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNG
        +V EDPRTA AHSRDLY EDDD  D DESSSD GSEESCSSSSYG SRQQYP    EDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRS++SNG
Subjt:  RVTEDPRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNG

Query:  FP
        FP
Subjt:  FP

XP_022953156.1 uncharacterized protein LOC111455780 [Cucurbita moschata]6.2e-105100Show/hide
Query:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDP
        MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDP
Subjt:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDP

Query:  RTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
        RTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
Subjt:  RTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP

XP_022991817.1 uncharacterized protein LOC111488350 [Cucurbita maxima]6.0e-10095.94Show/hide
Query:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPL-NQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTED
        MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRL+S APSAGVRRSSSSSSSADERHLPL + HHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTED
Subjt:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPL-NQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTED

Query:  PRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
        PRTAEAH RDLYSEDDD+NDADESSSDD SEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
Subjt:  PRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP

XP_023547639.1 uncharacterized protein LOC111806522 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.0e-9997.38Show/hide
Query:  MAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDPRTAEA
        MAAVTDSLEQSFRTFSLNHRL+SA PSAGVRRSSSSSSSAD+RHL LNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDPRTAEA
Subjt:  MAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDPRTAEA

Query:  HSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
        HSRDLYSEDDD+NDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
Subjt:  HSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF89 Uncharacterized protein2.8e-8786.14Show/hide
Query:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAP-SAGVRR-----SSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM
        MKSPDMAAVTDSLEQSFR FSLNHRL SAAP SAGVRR     SSSSSSS DE HLPL+QH+RFDT LELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM
Subjt:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAP-SAGVRR-----SSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM

Query:  RVTEDPRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNG
        +V EDPRTA AHSRDLY EDDD  D DESSSD GSEESCSSSSYG SRQQYP    EDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRS++SNG
Subjt:  RVTEDPRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNG

Query:  FP
        FP
Subjt:  FP

A0A1S4E3A8 uncharacterized protein LOC1034988821.9e-8385.86Show/hide
Query:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAP-SAGVRR-----SSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM
        MKSPDMAAVTDSLEQSFR FSLNHRL SAAP SAGVRR     SSSSSSS DE HLPL+QH+RFDT LELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM
Subjt:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAP-SAGVRR-----SSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM

Query:  RVTEDPRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDS
        +V EDPRTA AHSRDLYSEDD E D DESSSD GSEESCSSSSYG SRQQYP    EDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRS+++
Subjt:  RVTEDPRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDS

A0A5A7TA84 Uncharacterized protein1.1e-8686.63Show/hide
Query:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAP-SAGVRR-----SSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM
        MKSPDMAAVTDSLEQSFR FSLNHRL SAAP SAGVRR     SSSSSSS DE HLPL+QH+RFDT LELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM
Subjt:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAP-SAGVRR-----SSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGM

Query:  RVTEDPRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNG
        +V EDPRTA AHSRDLYSEDD E D DESSSD GSEESCSSSSYG SRQQYP    EDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRS++SNG
Subjt:  RVTEDPRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNG

Query:  FP
        FP
Subjt:  FP

A0A6J1GM82 uncharacterized protein LOC1114557803.0e-105100Show/hide
Query:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDP
        MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDP
Subjt:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDP

Query:  RTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
        RTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
Subjt:  RTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP

A0A6J1JMX9 uncharacterized protein LOC1114883502.9e-10095.94Show/hide
Query:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPL-NQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTED
        MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRL+S APSAGVRRSSSSSSSADERHLPL + HHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTED
Subjt:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPL-NQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTED

Query:  PRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
        PRTAEAH RDLYSEDDD+NDADESSSDD SEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP
Subjt:  PRTAEAHSRDLYSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28070.1 unknown protein1.3e-2844.44Show/hide
Query:  MAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDPRTAEA
        MA +T+ LE+S +  SL  R          R S        + H+P++     D  LEL+SH S+P   EQCLDLKTGE+YYR+  +GMRV EDPR  ++
Subjt:  MAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDPRTAEA

Query:  HSRDLYSEDDDEN------DADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDR
         SR  Y++            ++E SS   SEES S SS  +SR+ +   ++EDVLVVAGCK C MYFMVPK  +DCPKC +++L+HFD+
Subjt:  HSRDLYSEDDDEN------DADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDR

AT2G33510.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WW/Rsp5/WWP (InterPro:IPR001202)1.0e-3648.5Show/hide
Query:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDP
        MK+P+M  +T+SLE+S    SLN R        G  RSSS     +E   P++     D TLELNSH+SLP  WEQCLDLKTGE+YY N + GMRV EDP
Subjt:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDP

Query:  R---TAEAHSRDLY----SEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSN
        R    A+  S D Y    SE+D      E SS + S  S  +       ++    +EEDVLVVAGCK CFMYFMVPK VEDCPKC +++L+HFDR   ++
Subjt:  R---TAEAHSRDLY----SEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSN

AT2G33510.2 unknown protein1.0e-3345.12Show/hide
Query:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLK---------------TGEV
        MK+P+M  +T+SLE+S    SLN R        G  RSSS     +E   P++     D TLELNSH+SLP  WEQCLDLK               TGE+
Subjt:  MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLK---------------TGEV

Query:  YYRNCRTGMRVTEDPR---TAEAHSRDLY----SEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKC
        YY N + GMRV EDPR    A+  S D Y    SE+D      E SS + S  S  +       ++    +EEDVLVVAGCK CFMYFMVPK VEDCPKC
Subjt:  YYRNCRTGMRVTEDPR---TAEAHSRDLY----SEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKC

Query:  SSSRLVHFDRSEDSN
         +++L+HFDR   ++
Subjt:  SSSRLVHFDRSEDSN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAATCTCCCGATATGGCGGCGGTTACTGATTCCCTCGAGCAGTCTTTCCGTACCTTCTCCCTCAACCACCGTCTGCTCTCAGCTGCCCCCTCAGCCGGTGTTCGTAG
GTCGTCGTCTTCTTCTTCTTCCGCCGACGAACGTCATCTTCCTCTTAATCAACATCATCGCTTCGACACAACCTTGGAGCTCAACTCTCACATCTCTCTCCCTCCTTTCT
GGGAACAATGCCTCGATTTGAAGACTGGGGAAGTCTACTATAGAAATTGCCGGACCGGAATGAGAGTAACGGAAGATCCGAGGACAGCGGAAGCACACAGCCGAGATTTA
TACTCGGAAGATGACGACGAGAACGATGCGGATGAGAGCTCGTCGGACGACGGCAGCGAGGAGTCGTGTTCTTCGTCGTCGTACGGTGCTAGTAGGCAGCAATACCCGCC
GGGAAAGGAGGAGGACGTGCTAGTGGTTGCCGGATGCAAGAGATGCTTCATGTACTTCATGGTGCCGAAACAGGTCGAAGATTGCCCCAAATGCAGCAGCAGTCGTCTTG
TTCATTTCGATCGCTCCGAGGACAGTAATGGCTTCCCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAATCTCCCGATATGGCGGCGGTTACTGATTCCCTCGAGCAGTCTTTCCGTACCTTCTCCCTCAACCACCGTCTGCTCTCAGCTGCCCCCTCAGCCGGTGTTCGTAG
GTCGTCGTCTTCTTCTTCTTCCGCCGACGAACGTCATCTTCCTCTTAATCAACATCATCGCTTCGACACAACCTTGGAGCTCAACTCTCACATCTCTCTCCCTCCTTTCT
GGGAACAATGCCTCGATTTGAAGACTGGGGAAGTCTACTATAGAAATTGCCGGACCGGAATGAGAGTAACGGAAGATCCGAGGACAGCGGAAGCACACAGCCGAGATTTA
TACTCGGAAGATGACGACGAGAACGATGCGGATGAGAGCTCGTCGGACGACGGCAGCGAGGAGTCGTGTTCTTCGTCGTCGTACGGTGCTAGTAGGCAGCAATACCCGCC
GGGAAAGGAGGAGGACGTGCTAGTGGTTGCCGGATGCAAGAGATGCTTCATGTACTTCATGGTGCCGAAACAGGTCGAAGATTGCCCCAAATGCAGCAGCAGTCGTCTTG
TTCATTTCGATCGCTCCGAGGACAGTAATGGCTTCCCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKSPDMAAVTDSLEQSFRTFSLNHRLLSAAPSAGVRRSSSSSSSADERHLPLNQHHRFDTTLELNSHISLPPFWEQCLDLKTGEVYYRNCRTGMRVTEDPRTAEAHSRDL
YSEDDDENDADESSSDDGSEESCSSSSYGASRQQYPPGKEEDVLVVAGCKRCFMYFMVPKQVEDCPKCSSSRLVHFDRSEDSNGFP