; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh18G004060 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh18G004060
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionDUF1685 domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr18:2651246..2651899
RNA-Seq ExpressionCmoCh18G004060
SyntenyCmoCh18G004060
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012881 - Protein of unknown function DUF1685


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573322.1 hypothetical protein SDJN03_27209, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-11297.27Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPP---EEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPE
        MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPP   EEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPE
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPP---EEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPE

Query:  NSQRGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGN
        NSQRGNE RPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFT EDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELR PLMKKWRFPGN
Subjt:  NSQRGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGN

Query:  ETDMKDNLKWWAHAVASTVR
        ETDMKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  ETDMKDNLKWWAHAVASTVR

KAG7012491.1 hypothetical protein SDJN02_25243, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-11699.08Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
        MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ

Query:  RGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGNETD
        RGNERRPETELRMKWSES+SLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELR PLMKKWRFPGNETD
Subjt:  RGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGNETD

Query:  MKDNLKWWAHAVASTVR
        MKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  MKDNLKWWAHAVASTVR

XP_022954447.1 uncharacterized protein LOC111456711 [Cucurbita moschata]2.1e-117100Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
        MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ

Query:  RGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGNETD
        RGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGNETD
Subjt:  RGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGNETD

Query:  MKDNLKWWAHAVASTVR
        MKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  MKDNLKWWAHAVASTVR

XP_023542166.1 uncharacterized protein LOC111802131 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-11095.43Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNP--PPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPEN
        MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLK P  PPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYL SKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPEN
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNP--PPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPEN

Query:  SQRGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGNE
        SQRGNERR +TELRM+WSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVF EEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELR PLMKKWRFPGNE
Subjt:  SQRGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGNE

Query:  TDMKDNLKWWAHAVASTVR
        TDMKDNLKWWAHAVAS VR
Subjt:  TDMKDNLKWWAHAVASTVR

XP_038895996.1 uncharacterized protein LOC120084174 [Benincasa hispida]1.2e-6966.53Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPF-VRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGN
        MD EQLLNLF+S WFE EIFN HPF SNPQNPQPEN   + P      +EPF V ++RTRSISE L+SKLSFMSNSNSP+SVLFSPKLQT      +AG 
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPF-VRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGN

Query:  ESPENSQR-GNERRPETE-------LRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRK--------EGEEEMGGEILRPYLSE
        ESPENS++ G ERRP+TE        RM+ SES+SLSELEFEELKGFMD+GFVF+EEDK SSLA IVP LNR  K        E E ++GGEI RPYLSE
Subjt:  ESPENSQR-GNERRPETE-------LRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRK--------EGEEEMGGEILRPYLSE

Query:  AWEAM-----ELRMPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
        AWEAM     EL+ PL  KW+FP N+ DMKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  AWEAM-----ELRMPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV26 Uncharacterized protein3.1e-6360Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGNE
        MD + LLNLF+S WF+R++ NNHPF SNPQ  QP+    +P P    +E   + ++RTRSISE L+SKLSFMSNSNSP+SVL SPKLQT      +AG E
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGNE

Query:  SPENSQRGN-ERRPETELRMKW-------SESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR-------GRKEGEEE---------MGGEI
        SPE S +   ERRP+TE R +        SES+SLSELEFEELKGFMD+GFVF+EEDK SSLA IVP LNR       G KEGEEE         +GGEI
Subjt:  SPENSQRGN-ERRPETELRMKW-------SESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR-------GRKEGEEE---------MGGEI

Query:  LRPYLSEAWEAME--------LRMPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
         RPYLSEAWEA+         L+ PLM KWRFP N+ DMKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  LRPYLSEAWEAME--------LRMPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR

A0A6J1CEZ9 uncharacterized protein LOC1110109014.5e-6260.98Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGNE
        MD+EQ+LNLF+S+WFER IFN     SNP+    E PLKN PPP  E     + +I TRSISE L+SKLSFMSNSNSP+S+LFSPKLQT      +A  E
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------MAGNE

Query:  SPENSQRGNERRPETEL-------------RMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRK----EGEEEMGGEILRPYLSE
        SPEN+++  E RPE E              R +W ESKSLSELEFEELKGFMD+GFVF+EEDKDSSLA I+P LNR +K    E EE   GEI RPYLSE
Subjt:  SPENSQRGNERRPETEL-------------RMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRK----EGEEEMGGEILRPYLSE

Query:  AWEAM----ELRMPLMKKWRFP--GNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
        AWEAM    EL+ P + +W FP  GNE DMKDNLKWWAH VASTVR
Subjt:  AWEAM----ELRMPLMKKWRFP--GNETDMKDNLKWWAHAVASTVR

A0A6J1EH41 uncharacterized protein LOC1114340586.1e-6764.02Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPEN----PLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------M
        MD+EQ+L+LF+S+WFEREIFN HPF +NPQNP+PEN    PLKN PP     EEPFV +I  RSISE L+SKL+FMS+S+SP+SVLFSPKLQT      +
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPEN----PLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------M

Query:  AGNESPENSQRGNERRPETELR------MKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR--GRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAM
        AG E PE S+R   R+   + R      ++ SES+SLSELEFEE+KGFMD+GFVF+E DK SSLAWIVP LNR   R E EEE+GG I RPYLSEAW AM
Subjt:  AGNESPENSQRGNERRPETELR------MKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR--GRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAM

Query:  ----ELRMPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
            EL+  L+ KWR P NE DMKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  ----ELRMPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR

A0A6J1GR10 uncharacterized protein LOC1114567111.0e-117100Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
        MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQ

Query:  RGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGNETD
        RGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGNETD
Subjt:  RGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGNETD

Query:  MKDNLKWWAHAVASTVR
        MKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  MKDNLKWWAHAVASTVR

A0A6J1KR35 uncharacterized protein LOC1114957104.0e-6662.2Show/hide
Query:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPEN----PLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------M
        MD+EQ+LNLF+S WFEREIFN HPF +NPQNP+PEN    PLKN PP     EEPFV +I  RSISE L+SKL+FMS+S+SP+SVLFSPKLQT      +
Subjt:  MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPEN----PLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQT------M

Query:  AGNESPENSQRGNERRPETELR------MKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR---------GRKEGEEEMGGEILRPYL
        AG E PE S+R   R+   + R      ++ SES+SLSELEFEELKGFMD+GFVF+E DK SSLAWIVP LNR           +E EEE+GG I RPYL
Subjt:  AGNESPENSQRGNERRPETELR------MKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNR---------GRKEGEEEMGGEILRPYL

Query:  SEAWEAM----ELRMPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
        SEAW AM    E++  L+ KWR P NE DMKDNLKWWAHAVASTVR
Subjt:  SEAWEAM----ELRMPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42760.1 unknown protein3.3e-2035.85Show/hide
Query:  EQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQP--ENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISE----YLASKLSFMSNSN-----SPNSVL----FSPKLQ
        E+LL LF   W ER IF     + N ++ +   E  +      EE  +   V  +  R++S+      +SK S  S+S+     SP SVL       KLQ
Subjt:  EQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQP--ENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISE----YLASKLSFMSNSN-----SPNSVL----FSPKLQ

Query:  T-MAGNE------------SPENSQRGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEED-KDSSLAWIVPALNR--------GRKEGEEEM
        T ++G E              E  ++  +++ ++ +R +  + KS+S+LE+EELKGFMD+GFVF+E+D KDS L  I+P L R         ++E EEE 
Subjt:  T-MAGNE------------SPENSQRGNERRPETELRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEED-KDSSLAWIVPALNR--------GRKEGEEEM

Query:  -----GGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMK-----KWRFP----GNETDMKDNLKWWAHAVASTVR
             G    RPYLSEAW+    R    +     KWR P     +E D+KDNL+ WAHAVAST+R
Subjt:  -----GGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMK-----KWRFP----GNETDMKDNLKWWAHAVASTVR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCTTGAGCAACTTCTAAATCTCTTCAATTCCGTCTGGTTTGAGCGTGAAATCTTCAACAACCACCCCTTTTCATCTAACCCCCAAAACCCACAACCAGAAAATCC
CTTAAAAAACCCGCCGCCGCCGGAGGAGGAGGAGGAGGAGCCTTTCGTCCGACAGATTCGAACGAGGTCAATAAGCGAATACTTAGCCTCCAAATTGAGCTTTATGTCCA
ATTCCAACTCACCCAATTCAGTTCTGTTTTCGCCAAAGCTTCAAACGATGGCCGGAAACGAGTCGCCGGAGAACAGCCAGAGAGGAAATGAACGGCGGCCGGAAACAGAG
TTGAGAATGAAGTGGTCGGAAAGTAAGAGCTTGTCGGAGCTGGAATTCGAGGAGCTAAAAGGGTTTATGGATATGGGATTTGTTTTCACGGAGGAGGATAAAGATTCTAG
CTTGGCGTGGATTGTTCCGGCATTGAACAGAGGCCGGAAGGAAGGAGAAGAAGAGATGGGTGGGGAAATTTTGAGGCCTTATCTTTCGGAAGCTTGGGAAGCTATGGAGT
TGAGGATGCCATTGATGAAGAAATGGAGGTTTCCTGGTAATGAGACTGATATGAAGGATAATCTCAAATGGTGGGCTCATGCAGTGGCTTCTACTGTTAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACCTTGAGCAACTTCTAAATCTCTTCAATTCCGTCTGGTTTGAGCGTGAAATCTTCAACAACCACCCCTTTTCATCTAACCCCCAAAACCCACAACCAGAAAATCC
CTTAAAAAACCCGCCGCCGCCGGAGGAGGAGGAGGAGGAGCCTTTCGTCCGACAGATTCGAACGAGGTCAATAAGCGAATACTTAGCCTCCAAATTGAGCTTTATGTCCA
ATTCCAACTCACCCAATTCAGTTCTGTTTTCGCCAAAGCTTCAAACGATGGCCGGAAACGAGTCGCCGGAGAACAGCCAGAGAGGAAATGAACGGCGGCCGGAAACAGAG
TTGAGAATGAAGTGGTCGGAAAGTAAGAGCTTGTCGGAGCTGGAATTCGAGGAGCTAAAAGGGTTTATGGATATGGGATTTGTTTTCACGGAGGAGGATAAAGATTCTAG
CTTGGCGTGGATTGTTCCGGCATTGAACAGAGGCCGGAAGGAAGGAGAAGAAGAGATGGGTGGGGAAATTTTGAGGCCTTATCTTTCGGAAGCTTGGGAAGCTATGGAGT
TGAGGATGCCATTGATGAAGAAATGGAGGTTTCCTGGTAATGAGACTGATATGAAGGATAATCTCAAATGGTGGGCTCATGCAGTGGCTTCTACTGTTAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLEQLLNLFNSVWFEREIFNNHPFSSNPQNPQPENPLKNPPPPEEEEEEPFVRQIRTRSISEYLASKLSFMSNSNSPNSVLFSPKLQTMAGNESPENSQRGNERRPETE
LRMKWSESKSLSELEFEELKGFMDMGFVFTEEDKDSSLAWIVPALNRGRKEGEEEMGGEILRPYLSEAWEAMELRMPLMKKWRFPGNETDMKDNLKWWAHAVASTVR