; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh18G006730 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh18G006730
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationCmo_Chr18:8576324..8580793
RNA-Seq ExpressionCmoCh18G006730
SyntenyCmoCh18G006730
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573630.1 hypothetical protein SDJN03_27517, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.2e-11998.31Show/hide
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XP_022967102.1 uncharacterized protein LOC111466606 [Cucurbita maxima]7.7e-12097.5Show/hide
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XP_023522766.1 uncharacterized protein LOC111786770 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-11998.33Show/hide
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XP_038894579.1 uncharacterized protein LOC120083099 [Benincasa hispida]1.5e-10789.17Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT40 Uncharacterized protein4.0e-10687.5Show/hide
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A0A1S4E4F1 uncharacterized protein LOC1034998844.9e-10486.67Show/hide
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A0A5A7SY45 Senescence regulator4.9e-10486.67Show/hide
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A0A6J1G2B0 uncharacterized protein LOC1114500333.8e-125100Show/hide
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A0A6J1HPU4 uncharacterized protein LOC1114666063.7e-12097.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G11700.1 Protein of unknown function, DUF5841.8e-1047.62Show/hide
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        SAPVNVP  SK     +V+   E D ++ +E  G M+PPHE +A+S  +    S    SV EG GRTLKGR+LR+VR+A+W +T
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AT1G61930.1 Protein of unknown function, DUF5841.6e-1144.71Show/hide
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        SAPVNVP  SK     +V+   E+D +D ++ +  M+PPHE +A+S A+          SV +G GRTLKGR+LR+VR+A+W +T
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AT3G15040.1 Protein of unknown function, DUF5843.9e-3750.61Show/hide
Query:  LSFSSPSPRPSNPTSANALDNDDNNSELNEDDVFWTGDFAADSAHHTHSTPSSSSSSTPRHH--IHHLQHHK-GFPQSETFGILAALPENEASSSLRNSS
        L FSSP        S+ A  +D  + ELNEDD+     FA D +H       S  SS  +       LQ  K G    E  GILAALPE+  SSS   S 
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Query:  YFYHK----------ASVSSSSSS-------SPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPIS--SSLKY-QSAPVNVPMMSKAAVQRHQ------EIDVDDVDESDG
         F+HK          ++ SSSSSS       S SS+R IPT PKPP ERLP   S     KY QSAPV VP++S A + RH+      ++  DD +E +G
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Query:  EMLPPHEIVARSLAQSPLLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        EMLPPHEIVARSLAQS LLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAV+RRT
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AT4G04630.1 Protein of unknown function, DUF5843.9e-1340.67Show/hide
Query:  ILAALPENEASSSLRN--SSYFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISSSLKYQSAPVNVPMMSKA---------AVQRHQEIDVDDVDE
        + + L E E SS       S+F    S SSSSSSSP + R    +             S +K  SAP+NVP  SK          +   H     DD ++
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Query:  SDGEMLPPHEIVARSLAQSPLLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
         DG M+PPHE VAR LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL +VRNAV  +T
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AT4G21970.1 Protein of unknown function, DUF5847.4e-1240.28Show/hide
Query:  ENEASSSLRNSSYFYHKASVSSS----SSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISSSLKYQSAPVNVPMMSKAAVQRHQEID-------VDDVDESDGEML
        E E  S LR S     +  +S S    S+SS SS+R IP   +         +S   K  SAP+N+P  SK      +          +DD DE  G M+
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Query:  PPHEIVARSLAQSPLLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        PPHE+VA+ LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL + RNAV  RT
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCTCACCCCTCCTTCCTCCCGTTTCCGCCACCGGAAATCCCCCTCCTCCGAGCGCTTCCTTCTCTCCTTCTCTTCTCCCTCCCCCCGACCTTCTAACCCTACCTC
CGCCAACGCCCTCGACAACGACGACAACAACAGCGAGCTCAACGAGGACGACGTCTTCTGGACTGGCGATTTCGCCGCCGATTCCGCCCACCATACCCACTCCACTCCCT
CCTCCTCCTCCTCCTCCACTCCTCGCCACCATATTCATCACCTCCAGCATCACAAGGGCTTCCCCCAGTCTGAGACCTTCGGTATTCTCGCTGCCCTCCCTGAGAACGAG
GCCTCCTCCAGCCTTCGCAACTCCTCGTATTTCTACCACAAGGCCTCCGTCTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCCCCTTCCTCTTCTCGGATGATTCCGACTATCCCTAAACC
TCCTCTCGAGCGGTTGCCCTTGCCGATTTCTTCATCGTTGAAGTACCAGTCCGCTCCGGTCAATGTGCCAATGATGTCCAAGGCGGCGGTTCAGAGACACCAAGAGATAG
ATGTGGATGATGTTGATGAAAGTGATGGGGAGATGTTGCCGCCTCATGAAATTGTCGCCAGAAGTTTGGCTCAATCGCCATTGTTGTCTTGCTCGGTACTCGAGGGTGCG
GGAAGGACGTTAAAGGGCAGGGATCTTCGCCAGGTTCGAAATGCTGTTTGGAGACGAACAGACAGACAACTTTCCTTCTCTATGAAGCAGCAGTTACTTCAGAATGACAG
TTACAGATTCCACTGGAAGCACGGGAAGAAAGAGGATCGTTATTGTTTGTCGATGTTTTTTGCATCTGAGAAGCGACACTATCAAATTCAGGAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ASSSLRNSSYFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISSSLKYQSAPVNVPMMSKAAVQRHQEIDVDDVDESDGEMLPPHEIVARSLAQSPLLSCSVLEGA
GRTLKGRDLRQVRNAVWRRTDRQLSFSMKQQLLQNDSYRFHWKHGKKEDRYCLSMFFASEKRHYQIQE