; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh18G011360 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh18G011360
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptiont-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr18:11656051..11659982
RNA-Seq ExpressionCmoCh18G011360
SyntenyCmoCh18G011360
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0061025 - membrane fusion (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain
IPR044766 - NPSN/SNAP25-like, N-terminal SNARE domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6574050.1 SNAP25-likeous protein SNAP33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-16599.06Show/hide
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KAG7013111.1 SNAP25-likeous protein SNAP33 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-16498.74Show/hide
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XP_022945438.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucurbita moschata]8.3e-168100Show/hide
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XP_022968314.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucurbita maxima]6.8e-16297.15Show/hide
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XP_023542548.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-16699.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BF13 putative SNAP25 homologous protein SNAP305.0e-13484.23Show/hide
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A0A6J1G0W1 putative SNAP25 homologous protein SNAP304.0e-168100Show/hide
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A0A6J1H000 putative SNAP25 homologous protein SNAP305.9e-13583.54Show/hide
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A0A6J1HWW0 putative SNAP25 homologous protein SNAP303.3e-16297.15Show/hide
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A0A6J1J9F6 putative SNAP25 homologous protein SNAP302.8e-13784.81Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P36977 Synaptosomal-associated protein 25-A1.8e-1630Show/hide
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Q5TZ66 Synaptosomal-associated protein 25-A2.6e-1529.9Show/hide
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Q9LMG8 Putative SNAP25 homologous protein SNAP306.3e-8658.41Show/hide
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Q9S7P9 SNAP25 homologous protein SNAP332.7e-8961.2Show/hide
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        YKN+FRDSGG ENQSVQELE YAVYKAEETT SV  CLK+AEDIRSDATRTL MLH QGEQI RTH  A ++D DLS+GEKLL +LGGMFSK WKPKKT+
Subjt:  YKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTK

Query:  EITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKK-QSATRTPPSESSGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDE
         I GP++T D+S  R  N+ E+REKLGL++  + QS TR P  ES+ A Q+VE EK KQDD LSDLS+ILG+LKNMAVDMGSE+++QNK LDHL DDVDE
Subjt:  EITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKK-QSATRTPPSESSGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDE

Query:  LNSRVKGANQRARRLLG
        LN RV+ +NQR RRLLG
Subjt:  LNSRVKGANQRARRLLG

Q9SD96 SNAP25 homologous protein SNAP291.4e-5651.94Show/hide
Query:  SISANPFDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNGYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQ
        S S NPFDDDDDD               K   K  TSS          + SGG ENQ+VQELE+YAVY +EETT +V  CLK+AE+IR DA++TL ML++
Subjt:  SISANPFDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNGYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQ

Query:  QGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTKEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESSGAMQKVEDEKEK
        QG+QI RTH+   D+D  LS+GEK+L  LGG+FS+ WKPKK++ ITGP+IT  +S  R   + + REKLGL+   K  +   P  E+  A QK   +  K
Subjt:  QGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTKEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESSGAMQKVEDEKEK

Query:  QDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL
        QD+AL+DLS +LG+LKNMAVDMG+ ++RQ   LDHL D+ DELN RVK +NQRAR LL
Subjt:  QDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13890.1 soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein 304.5e-8758.41Show/hide
Query:  MFSFMKSPVKVSKQNSVDTGLAGSGTNPFDSDTEPETNQTLNPARRTSSEPALVIPNSISANPFDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNG
        MF F KSP                G N   +++      T+   RRTSSEP L+ P+      FDDDD                                
Subjt:  MFSFMKSPVKVSKQNSVDTGLAGSGTNPFDSDTEPETNQTLNPARRTSSEPALVIPNSISANPFDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNG

Query:  YKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTK
        YKN F DSGG ++Q+ +ELE YAVYKAEETT  VNNCLKIAEDIRSD  RTL+MLHQQGEQI RTH MA DMDKDLS+GEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTK
Subjt:  YKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTK

Query:  EITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESSGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDEL
         ITGP+IT D  S ++EN+KEEREKLGL   K +S+++    + + A+QKVE EK KQDD LSDLS+ILGDLK+MAVDMGSE+D+QNKALDHL DDVDEL
Subjt:  EITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESSGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDEL

Query:  NSRVKGANQRARRLL
        NSRV+GANQRAR LL
Subjt:  NSRVKGANQRARRLL

AT3G45280.1 syntaxin of plants 729.6e-0538.36Show/hide
Query:  ESSGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL
        ESS   Q+ E  ++KQD+ L  +S  L  LKN+A DM  ELD+Q   ++ +   VD   S +K  N R ++ L
Subjt:  ESSGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL

AT5G07880.1 synaptosomal-associated protein SNAP25-like 299.8e-5851.94Show/hide
Query:  SISANPFDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNGYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQ
        S S NPFDDDDDD               K   K  TSS          + SGG ENQ+VQELE+YAVY +EETT +V  CLK+AE+IR DA++TL ML++
Subjt:  SISANPFDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNGYKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQ

Query:  QGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTKEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESSGAMQKVEDEKEK
        QG+QI RTH+   D+D  LS+GEK+L  LGG+FS+ WKPKK++ ITGP+IT  +S  R   + + REKLGL+   K  +   P  E+  A QK   +  K
Subjt:  QGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTKEITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESSGAMQKVEDEKEK

Query:  QDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL
        QD+AL+DLS +LG+LKNMAVDMG+ ++RQ   LDHL D+ DELN RVK +NQRAR LL
Subjt:  QDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLL

AT5G61210.1 soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein 331.9e-9061.2Show/hide
Query:  MFSFMKSPVKVSKQNSVDTGLAGSGTNPFDSDTEPETNQTLNPARRTSSEPALVIPNSISANPFDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNG
        MF   KSP  + K NSVD  L  S  NPFDSD E +   TLNP++RT+SEP+L    +   NPF       G   ++G ++SS      K +  S SK  
Subjt:  MFSFMKSPVKVSKQNSVDTGLAGSGTNPFDSDTEPETNQTLNPARRTSSEPALVIPNSISANPFDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNG

Query:  YKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTK
        YKN+FRDSGG ENQSVQELE YAVYKAEETT SV  CLK+AEDIRSDATRTL MLH QGEQI RTH  A ++D DLS+GEKLL +LGGMFSK WKPKKT+
Subjt:  YKNDFRDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTK

Query:  EITGPLITADNSSGRTENNKEEREKLGLSTGKK-QSATRTPPSESSGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDE
         I GP++T D+S  R  N+ E+REKLGL++  + QS TR P  ES+ A Q+VE EK KQDD LSDLS+ILG+LKNMAVDMGSE+++QNK LDHL DDVDE
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Query:  LNSRVKGANQRARRLLG
        LN RV+ +NQR RRLLG
Subjt:  LNSRVKGANQRARRLLG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTAGTTTCATGAAATCCCCCGTGAAAGTTTCTAAGCAGAATTCTGTTGATACTGGATTAGCCGGATCCGGTACTAATCCTTTTGATTCAGATACTGAACCTGAAAC
CAACCAAACTCTTAATCCTGCAAGAAGAACTTCTTCCGAGCCTGCGCTTGTTATACCGAACTCCATTTCCGCCAATCCTTTTGATGATGATGATGATGATGATGGTTTTG
TTGGAAGAAGAGGTACTGCAACTTCTTCAGCCTCTAAAAACGGATACAAAAATGCAACTTCTTCAGCCTCTAAAAATGGATACAAAAATGATTTTCGCGACTCGGGAGGA
TTTGAGAACCAGAGTGTGCAGGAATTGGAGAACTATGCCGTATATAAAGCTGAGGAGACCACAAATTCTGTTAATAACTGCCTGAAGATCGCTGAGGACATAAGGAGTGA
TGCTACCAGGACCCTTGACATGTTGCATCAGCAAGGTGAGCAAATTGAGAGGACCCACAGGATGGCTGCTGATATGGATAAAGATCTAAGTAAGGGAGAGAAACTTCTGA
ATAATCTTGGAGGCATGTTTTCTAAGCCATGGAAGCCAAAGAAAACCAAAGAAATTACAGGCCCTCTCATAACAGCAGATAATTCATCTGGGAGAACTGAAAACAACAAG
GAGGAAAGGGAAAAACTGGGTTTATCTACAGGTAAAAAGCAGTCGGCTACTCGAACACCGCCTTCTGAATCATCTGGCGCAATGCAAAAAGTCGAGGATGAGAAGGAAAA
GCAAGATGATGCACTCTCAGATTTAAGTAATATCTTGGGTGATCTGAAGAATATGGCTGTGGACATGGGAAGCGAGCTTGACAGGCAAAACAAAGCTTTGGATCATCTAA
GCGACGATGTCGACGAGCTGAATTCTAGAGTGAAAGGTGCCAATCAACGAGCTCGCCGTTTGCTTGGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTTTGTAGCGAGTGGGAGCGTCCAGTTTTCTGCTTTTCCGCGTCGCCTCCCATCGATCTGTTTCGCGATTTTCAATTCTATCTGTGTTAAAGGATTGAACGCACTGAAA
ATCCTCAAGAACACGACCTATTATTTCACTTTCATTTCAATTTTTCTTCCTGCTTCGATTTTTCAGGTATCGTTCTCTCTCACTTTCCCCTTCTCGATTGTGTTCGTTGG
GGGTTCTATTTCCAGTTCATGAATTTGGTACCAGCTATATTCACCAGATCCCTTGTTTTAGAGCCGCTTAGCTAATAGTTCATTAAAATTCAAGTCTCTTTGTACAGCCA
GGATGTTTAGTTTCATGAAATCCCCCGTGAAAGTTTCTAAGCAGAATTCTGTTGATACTGGATTAGCCGGATCCGGTACTAATCCTTTTGATTCAGATACTGAACCTGAA
ACCAACCAAACTCTTAATCCTGCAAGAAGAACTTCTTCCGAGCCTGCGCTTGTTATACCGAACTCCATTTCCGCCAATCCTTTTGATGATGATGATGATGATGATGGTTT
TGTTGGAAGAAGAGGTACTGCAACTTCTTCAGCCTCTAAAAACGGATACAAAAATGCAACTTCTTCAGCCTCTAAAAATGGATACAAAAATGATTTTCGCGACTCGGGAG
GATTTGAGAACCAGAGTGTGCAGGAATTGGAGAACTATGCCGTATATAAAGCTGAGGAGACCACAAATTCTGTTAATAACTGCCTGAAGATCGCTGAGGACATAAGGAGT
GATGCTACCAGGACCCTTGACATGTTGCATCAGCAAGGTGAGCAAATTGAGAGGACCCACAGGATGGCTGCTGATATGGATAAAGATCTAAGTAAGGGAGAGAAACTTCT
GAATAATCTTGGAGGCATGTTTTCTAAGCCATGGAAGCCAAAGAAAACCAAAGAAATTACAGGCCCTCTCATAACAGCAGATAATTCATCTGGGAGAACTGAAAACAACA
AGGAGGAAAGGGAAAAACTGGGTTTATCTACAGGTAAAAAGCAGTCGGCTACTCGAACACCGCCTTCTGAATCATCTGGCGCAATGCAAAAAGTCGAGGATGAGAAGGAA
AAGCAAGATGATGCACTCTCAGATTTAAGTAATATCTTGGGTGATCTGAAGAATATGGCTGTGGACATGGGAAGCGAGCTTGACAGGCAAAACAAAGCTTTGGATCATCT
AAGCGACGATGTCGACGAGCTGAATTCTAGAGTGAAAGGTGCCAATCAACGAGCTCGCCGTTTGCTTGGGTAGTAAAATCAGACACTCTAATTCTTCCCTTCTCTTTGTT
TCTAGCTGGAATCATTTCGTTCAAACATTCTTTAATTGTTGGTGTACTTCTGTTCTTTTCTCATGTGATTTTTTAGTTCATAATAAGTACATTGCTTCTATTATTTCAAG
GAAAAAGCCTGTTCCTTCATCTTGTTGAAGATAGATAGCAGCCATGAATTTAGACAATAAGAGTTAGATACCATTTTCCTTTCTTTTTTACGTGAACTGTCTAAAAATGG
AAGATAAAAAAACTACAGTAAAAAAGATAAAAAGGTAAGATAAACTCAGAAGGGGCTTTTACATACATTATGTTTCCATAGATTCAGACAGTACACAGCCTATACAGCAA
AATTACATTAATTCCATAAACAGTAAAAGACATATGAAAGTTCCATAGTACCCCTCCAAAGAAAGAAAACCTCATGAATCCTGCCATGTCGGCAATCTGTACCTTATACC
TCCAAAATTAATGAAACTCATGGGTTTCTTTTGAATCTTACCTCCGGACCCGACCACCTATGAACTTGTCTTCTTTTTCTTTAATACTAAAAAAAGGAGCCCAAATCTTA
AAAGTAAATACCTTGTCATTTCCATGCTTGTTTTTGCCACTTTTCCACATCAAAATGAACTCGAACACACCAAAACTCGGAACACTTGGACGCAAAAACAAGAATGGAAA
TAGCAACAATAACCTGAACGAACCAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAACAAGACAATACGACATTGAACAAAAACTCGTCCACTAATTAGCATAGTCTTCTTCTGACTTCG
TCGATCACGTACGAGGATTATATATTCTTCTTGATTCTTAACTAATAGGACTCAAGAAGAAAAGGGTGGATGATATATGTTGTACTGGAATAGCGAGAAAACTGAGAAGA
GAAATGGCTGTCTTGGTAAAGAAAGATTCTTTTTGCTCTTTCTTTGCTCTCTCTTTCTCTCTTGTTTCAGTTGTGAAGAGGGTTTGGCCCGGATGGCACGAGTCTATTCT
CGACGCCATATCGAGGGTCAATTTGATTGTGTGTCAGCAATGGCAGCGGCAGCGGTGGAAGGTAGACAGGGAGGCGATGTTGGTAAACTCTATGAAGGTGAATACACAAA
GAACGTGAGTTTTCGCGAGTAAGAGCATCACAAGGATGAAGCTGTTGTTTGTGGCGAGGCGGGTGGTGGCGAGGGATGATCGGAGATGCTTCTGGCACGGAGGTGGAAGG
TGGATGATTGGAGAGTCTAGTGGCCGTGGAAGACGAGACGAAGAGGAATAAAACTATCAAGATCATCATGATGAGCTGCCCATTGGTGGCAAAAGATGAAGAGGGGGAAA
GAGAGGCTTTCATTTTGAGTTTCAGATACAGAGAGATAAGGACGGGGGGAAGAAAGGAGATGAAGAAAGGAGAAGAGATGGTGAAAGTGAAAGGGAAGAAGTTTAAATGC
AGAGCAAGAGACTCATGAGGGGGGGAAATATTATTATGGCCTTGTTGACAGAAGGGACTGGCTTGAGGGACCTGTCCATTGGCCAAGGGTATAGTTGGCAATCATTTTCA
CTCTTCATTCAATTTTTTGCTCTCACTTTCATCATGTACGTTAAACATCATCGGTTGATCATTCGCATCTTTAATTCAACGGTTCAGATCATCTTTATTTTTTCAATATT
T
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFSFMKSPVKVSKQNSVDTGLAGSGTNPFDSDTEPETNQTLNPARRTSSEPALVIPNSISANPFDDDDDDDGFVGRRGTATSSASKNGYKNATSSASKNGYKNDFRDSGG
FENQSVQELENYAVYKAEETTNSVNNCLKIAEDIRSDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKPWKPKKTKEITGPLITADNSSGRTENNK
EEREKLGLSTGKKQSATRTPPSESSGAMQKVEDEKEKQDDALSDLSNILGDLKNMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARRLLG