; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh18G012000 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh18G012000
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionHeat-inducible transcription repressor
Genome locationCmo_Chr18:11998590..12005788
RNA-Seq ExpressionCmoCh18G012000
SyntenyCmoCh18G012000
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7013167.1 hypothetical protein SDJN02_25923, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]0.0e+0088.84Show/hide
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XP_022945914.1 uncharacterized protein LOC111450016 isoform X1 [Cucurbita moschata]0.0e+0088.29Show/hide
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XP_022945916.1 uncharacterized protein LOC111450016 isoform X2 [Cucurbita moschata]0.0e+0088Show/hide
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XP_022968492.1 uncharacterized protein LOC111467712 isoform X3 [Cucurbita maxima]0.0e+0086.37Show/hide
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        DGIITLETLQINIKEKGVTYIPEHPLKINATSSIST II
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XP_023542261.1 uncharacterized protein LOC111802210 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]0.0e+0086.58Show/hide
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Query:  QKTNASASSGSQLFSLVHFRSYSMSSIPHNTAPPPAPIKSASSKPSFELESWDQFSPQKSSKRKRLGVRDLLSFRGISLEQERFSVCCGLKGIHIPGRRW
        QK+NASASSGSQLFSLVHFRSYSMSSIPHNTAPPPAPIKSASSKPSFELE+WDQFSPQ SSKRKRLGVRDLLSFRGISLEQERFSVCCGLKGIHIPGRRW
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A0A6J1HTM8 uncharacterized protein LOC111467712 isoform X30.0e+0086.37Show/hide
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        IPSQSTTTIKLELLPLTDGIITLETLQINIKEKG
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A0A6J1HZS9 uncharacterized protein LOC111467712 isoform X10.0e+0084.83Show/hide
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        GVARGTFKCCSLSDGSIVVLLHVNVGVDILRDPVLEILQFEKYQERTMSFENQDGLGYSSLDPYGELMKWLLPLDNTIP I+RPLSPP LIPNAGISGTS
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Query:  QKTNASASSGSQLFSLVHFRSYSMSSIPHNTAPPPAPIKSASSKPSFELESWDQFSPQKSSKRKRLGVRDLLSFRGISLEQERFSVCCGLKGIHIPGRRW
        QK+NASASSGSQLFSLVHFRSYSMSSIPHNTAPPPAPIKSASSKPSFELE+WDQFSPQKSSKRKRLGVRDLLSFRGISLEQERFSVCCGLKGIHIPGRRW
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Query:  RRKLEIIHPVEIQSFAADCNTDDLLCVQIKNVSPDHIPDIIIYIDAITIVFEEASKDGLPSSLPIACIEAGNEHSIPNLALRLSSTQKIFYSLNFSCFSY
        RRKLEIIHPVEIQSFAADCNTDDLLCVQIKNVSP HIPDIIIYIDAITIVFEEASKDGLPSSLPIACIEAGNEHS+PNLAL                   
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                          RRNEEHSFIIKPATSMWRNIKACGERNSQSSQLQAGNPTSSLSLTSKSTDQYAIM                           
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Query:  MQSQKELHGEHQNEELNVTFSSTFPESRLFFKQPTSWRPRISSDLMVSVALSGDPLKPNGIGSHLP-----VQASNLTSEDLTMTVLAPSSSSYPSVISL
                         VT    + ESRLFFKQPTSWRPRISSDLMVSVALSGDPLKPNGIGSHLP     +QASNLTSEDLTMTVLAPSSSSYPSVISL
Subjt:  MQSQKELHGEHQNEELNVTFSSTFPESRLFFKQPTSWRPRISSDLMVSVALSGDPLKPNGIGSHLP-----VQASNLTSEDLTMTVLAPSSSSYPSVISL

Query:  NSSSSSPMSRYWVLNE-----------------VAGEKYSTSLERPRSIPVASENQRHNVDFGGRPIPFEELSSPMSDIIPSAGLGCSHLCLQSRIPLGC
        NSSSSSPMSRYWVLNE                 VAGEKYSTSLERPRSIPVASENQR+NVDFGGRPI FEE+SSPMSDIIPSAGLGCSHLCLQSRIPLGC
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Query:  IPSQSTTTIKLELLPLTDGIITLETLQINIKEKGVTYIPEHPLKINATSSISTAII
        IPSQSTTTIKLELLPLTDGIITLETLQINIKEKGVTYIPEHPLKINATSSIST II
Subjt:  IPSQSTTTIKLELLPLTDGIITLETLQINIKEKGVTYIPEHPLKINATSSISTAII

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G17900.1 unknown protein2.1e-22049.32Show/hide
Query:  MNFLLRSTPAVPAERPSVQETPPPVAPYPP----KPAITLESLISEMPFPQYSVADDIDDEVDASAGENGSIAGNKEN---SDCASVGKHSDVSEEEGWI
        MNFLLRS  +    RP V E PP   P PP    KP +TLE LI+E  FPQY     +D+++D     +G + GN E+   S  + + + SDVSEE+GWI
Subjt:  MNFLLRSTPAVPAERPSVQETPPPVAPYPP----KPAITLESLISEMPFPQYSVADDIDDEVDASAGENGSIAGNKEN---SDCASVGKHSDVSEEEGWI

Query:  TIPCKDLPSDWRNASDVHSLRSKDRSFVFPDKRNAVLSVWYFNSALHTGEQICILACLSAYKQDTATITPFKVAAVLSKHGKGHSPKKQNGNMDDGTNST
         IP K++P +W  + D+HSLRS DRSFVFP                  GEQI ILACLS  K DT  ITPFKVA V+S+ G+     KQNG+M DG ++ 
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Query:  NGERRPSPD-QSTIQNGENLSNEKIDSSEDVSASESLLRMEDHRRQTETLLQRFKNSHFFVRIAESSDLLWSKK--IFPDKHSDCE-VVGESTVNSSLNA
        +G+   SPD Q   QNG++   E +DS +D+S  ES+LRMEDH+R+TE LL RF+ SHFFVRIAES + LWSKK  +  D   D E    +S    S   
Subjt:  NGERRPSPD-QSTIQNGENLSNEKIDSSEDVSASESLLRMEDHRRQTETLLQRFKNSHFFVRIAESSDLLWSKK--IFPDKHSDCE-VVGESTVNSSLNA

Query:  DQGNFGSNVSGGVARGTFKCCSLSDGSIVVLLHVNVGVDILRDPVLEILQFEKYQERTMSFENQDGLGYSSLDPYGELMKWLLPLDNTIPSISRPLSPPR
        D+G+F  NVSGGVAR   KCC+L +G IVV L V + VD  ++P++EILQFEK+Q++  + EN         DPYG L+KWL+PLDNTI    R L PP 
Subjt:  DQGNFGSNVSGGVARGTFKCCSLSDGSIVVLLHVNVGVDILRDPVLEILQFEKYQERTMSFENQDGLGYSSLDPYGELMKWLLPLDNTIPSISRPLSPPR

Query:  LIPNAGISGTSQKTNASASSGSQLFSLVHFRSYSMSSIPHNTAPPPAPIKSASSKPSFELESWDQFSPQKSSKRKRLGVRDLLSFRGISLEQERFSVCCG
        + P+  IS T+ K   S++SGSQLFS  HFRSYSMS++P NTAP   PIK+ SSKPSF++E WD +S Q     ++ G  +LLSFRG++LE++RFSV CG
Subjt:  LIPNAGISGTSQKTNASASSGSQLFSLVHFRSYSMSSIPHNTAPPPAPIKSASSKPSFELESWDQFSPQKSSKRKRLGVRDLLSFRGISLEQERFSVCCG

Query:  LKGIHIPGRRWRRKLEIIHPVEIQSFAADCNTDDLLCVQIKNVSPDHIPDIIIYIDAITIVFEEASKDGLPSSLPIACIEAGNEHSIPNLALRLSSTQKI
        L+GI IPGRRWRRKLEII P+EI SFAADCNTDDLLCVQIKNV+P H PDI+IYIDAITIVFEEA K+  PSS+PIACIEAGNEHS+PNL L        
Subjt:  LKGIHIPGRRWRRKLEIIHPVEIQSFAADCNTDDLLCVQIKNVSPDHIPDIIIYIDAITIVFEEASKDGLPSSLPIACIEAGNEHSIPNLALRLSSTQKI

Query:  FYSLNFSCFSYFLSFSLSPVKKSAELLCGRRNEEHSFIIKPATSMWRNIKACGERNS-QSSQLQAGNPTSSLSLTSKSTDQYAIMLHVSLVDIVEKIISH
                                     R+ EEHSFI+KPA S+  N+K    RN  +SS L           +  S DQYA+M               
Subjt:  FYSLNFSCFSYFLSFSLSPVKKSAELLCGRRNEEHSFIIKPATSMWRNIKACGERNS-QSSQLQAGNPTSSLSLTSKSTDQYAIMLHVSLVDIVEKIISH

Query:  KKQLKFKGTLDGMQSQKELHGEHQNEELNVTFSSTFPESRLFFKQPTSWRPRISSDLMVSVA--LSGDPLKPNGIGSHLPV-----QASNLTSEDLTMTV
                                     V+    + ESRLFFKQ T WRPR+S DLM+SVA  +SG+P  P+G  S LPV     QASNLTSEDL++TV
Subjt:  KKQLKFKGTLDGMQSQKELHGEHQNEELNVTFSSTFPESRLFFKQPTSWRPRISSDLMVSVA--LSGDPLKPNGIGSHLPV-----QASNLTSEDLTMTV

Query:  LAPSS-SSYPSVISLNSSSSSPMSRYWVLNE----VAGEKYSTSLERPRSIPVASENQRHNVDFGGRPIPFEELSSPMSDIIPSAGLGCSHLCLQSRIPL
        LAP+S +S P+V+SLNS+ ++P+S +   ++    V  EK +T++ + +S+P      R   +  G        SS  SD++P +GLGC+HL LQSR+PL
Subjt:  LAPSS-SSYPSVISLNSSSSSPMSRYWVLNE----VAGEKYSTSLERPRSIPVASENQRHNVDFGGRPIPFEELSSPMSDIIPSAGLGCSHLCLQSRIPL

Query:  GCIPSQSTTTIKLELLPLTDGIITLETLQINIKEKGVTYIPEHPLKINATSSISTAI
        GC+PS+ST TIKLELLPLTDGIITL+TLQI+ KEKG  YIPE  LKINATSSIS+ I
Subjt:  GCIPSQSTTTIKLELLPLTDGIITLETLQINIKEKGVTYIPEHPLKINATSSISTAI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCCTAGTGATTGGAGAAATGCATCAGATGTACATTCGTTGCGCAGTAAGGACAGATCTTTTGTCTTCCCAGATAAGAGAAATGCTGTGTTATCTGTATGGTACTTTAACT
CTGCCCTTCATACAGGTGAACAAATATGTATCTTGGCATGCTTATCTGCTTATAAACAAGATACAGCAACTATTACTCCTTTTAAAGTTGCAGCAGTTTTGAGTAAACAT
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AATTCTAGCTTAAATGCTGATCAAGGAAATTTTGGTTCCAATGTCTCTGGTGGCGTTGCAAGAGGTACCTTTAAGTGCTGCTCTCTTTCTGATGGAAGCATAGTGGTGCT
TTTACATGTGAATGTTGGTGTTGACATATTGAGAGATCCAGTATTGGAAATTCTTCAATTTGAGAAGTACCAAGAGCGGACAATGTCATTTGAGAATCAGGATGGCTTAG
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CTTGAAATTATTCATCCTGTTGAAATCCAGTCTTTTGCTGCTGATTGCAATACGGATGACCTTTTGTGTGTTCAAATTAAGAATGTGTCTCCAGATCATATACCAGATAT
CATAATATATATTGATGCTATTACAATTGTTTTTGAAGAGGCATCAAAGGATGGACTTCCCTCATCATTACCAATTGCTTGCATAGAAGCAGGGAATGAACACAGCATAC
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AATTGGTTCTCACCTTCCTGTTCAGGCGTCAAATTTAACATCCGAAGATCTGACCATGACGGTTCTTGCTCCATCTTCATCCTCTTATCCATCCGTCATTTCATTGAATT
CCTCATCATCATCACCTATGAGTCGATACTGGGTTTTAAATGAAGTTGCTGGTGAGAAGTATAGTACATCACTGGAAAGGCCGAGATCAATCCCTGTTGCATCTGAGAAT
CAAAGACACAATGTTGATTTTGGAGGCCGGCCAATTCCTTTTGAAGAACTATCTTCTCCCATGTCAGATATCATCCCAAGTGCTGGTTTAGGTTGCTCGCATTTGTGCCT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CTTACCCGCCAAAACCAGCAATAACTTTGGAGAGTCTGATTTCTGAAATGCCATTTCCGCAATATTCTGTAGCTGATGATATTGACGATGAGGTCGATGCATCTGCCGGT
GAAAATGGAAGTATTGCTGGTAATAAGGAGAACAGCGACTGTGCTAGTGTAGGGAAGCACTCTGATGTTTCCGAGGAAGAAGGGTGGATTACCATTCCATGCAAGGATCT
TCCTAGTGATTGGAGAAATGCATCAGATGTACATTCGTTGCGCAGTAAGGACAGATCTTTTGTCTTCCCAGATAAGAGAAATGCTGTGTTATCTGTATGGTACTTTAACT
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AATTCTAGCTTAAATGCTGATCAAGGAAATTTTGGTTCCAATGTCTCTGGTGGCGTTGCAAGAGGTACCTTTAAGTGCTGCTCTCTTTCTGATGGAAGCATAGTGGTGCT
TTTACATGTGAATGTTGGTGTTGACATATTGAGAGATCCAGTATTGGAAATTCTTCAATTTGAGAAGTACCAAGAGCGGACAATGTCATTTGAGAATCAGGATGGCTTAG
GTTATTCAAGTCTGGATCCATATGGAGAATTGATGAAATGGTTGCTTCCTCTGGATAACACCATTCCATCTATTTCCCGCCCTCTATCTCCTCCCCGTTTAATTCCCAAT
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GAGCTTCTCTGTGGCAGGAGAAACGAAGAGCACTCTTTTATTATCAAACCAGCAACTTCTATGTGGAGGAATATAAAGGCTTGTGGAGAAAGAAATTCTCAATCATCCCA
ATTGCAGGCTGGAAATCCGACATCAAGTTTGTCCCTTACCTCCAAGAGTACTGATCAATATGCAATTATGCTGCACGTCTCTCTTGTTGATATTGTGGAAAAAATTATAT
CGCACAAAAAACAACTCAAATTTAAGGGAACTTTGGATGGAATGCAATCACAAAAAGAATTGCACGGGGAGCACCAAAATGAAGAACTGAACGTAACATTTTCAAGTACC
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AATTGGTTCTCACCTTCCTGTTCAGGCGTCAAATTTAACATCCGAAGATCTGACCATGACGGTTCTTGCTCCATCTTCATCCTCTTATCCATCCGTCATTTCATTGAATT
CCTCATCATCATCACCTATGAGTCGATACTGGGTTTTAAATGAAGTTGCTGGTGAGAAGTATAGTACATCACTGGAAAGGCCGAGATCAATCCCTGTTGCATCTGAGAAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ELLCGRRNEEHSFIIKPATSMWRNIKACGERNSQSSQLQAGNPTSSLSLTSKSTDQYAIMLHVSLVDIVEKIISHKKQLKFKGTLDGMQSQKELHGEHQNEELNVTFSST
FPESRLFFKQPTSWRPRISSDLMVSVALSGDPLKPNGIGSHLPVQASNLTSEDLTMTVLAPSSSSYPSVISLNSSSSSPMSRYWVLNEVAGEKYSTSLERPRSIPVASEN
QRHNVDFGGRPIPFEELSSPMSDIIPSAGLGCSHLCLQSRIPLGCIPSQSTTTIKLELLPLTDGIITLETLQINIKEKGVTYIPEHPLKINATSSISTAII