; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh18G012840 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh18G012840
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCmo_Chr18:12417135..12420938
RNA-Seq ExpressionCmoCh18G012840
SyntenyCmoCh18G012840
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6574190.1 Silicon efflux transporter LSI3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.7e-0789.47Show/hide
Query:  KDFVTSSSLLSFLKFKLKLQQTMKDQVIILKEVKMPIL
        +DFVTSSSLLSFLKFKLKLQQTMKDQVIILKEVK  +L
Subjt:  KDFVTSSSLLSFLKFKLKLQQTMKDQVIILKEVKMPIL
KAG7013247.1 hypothetical protein SDJN02_26005, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.5e-3082.11Show/hide
Query:  KDFVTSSSLLSFLKFKLKLQQT---------------MKDQVIILKEVKMPILENTTGHRSGSLDTQSQIYQLADGVKANYGMKGIMYLSDALEV
        +DFVTSSSLLSFLKFKLKLQQT               MKDQVIILKEVKMPILENTTGHRSGSLDTQSQIYQ ADGVKANYGMKGIMYLSDALEV
Subjt:  KDFVTSSSLLSFLKFKLKLQQT---------------MKDQVIILKEVKMPILENTTGHRSGSLDTQSQIYQLADGVKANYGMKGIMYLSDALEV
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
No hits found
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTAGGTTTCCAATATTTAAGGATTTTGTTACTAGTTCCTCATTATTGAGCTTCCTCAAATTCAAGCTGAAGTTGCAACAAACGATGAAGGATCAAGTGATAATTCT
GAAAGAAGTGAAAATGCCTATATTAGAAAATACGACCGGTCACAGAAGTGGTAGCTTGGATACTCAGTCACAGATTTACCAGCTTGCCGATGGGGTAAAAGCTAATTATG
GCATGAAGGGTATCATGTACTTGTCGGATGCTTTGGAAGTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATTAGGTTTCCAATATTTAAGGATTTTGTTACTAGTTCCTCATTATTGAGCTTCCTCAAATTCAAGCTGAAGTTGCAACAAACGATGAAGGATCAAGTGATAATTCT
GAAAGAAGTGAAAATGCCTATATTAGAAAATACGACCGGTCACAGAAGTGGTAGCTTGGATACTCAGTCACAGATTTACCAGCTTGCCGATGGGGTAAAAGCTAATTATG
GCATGAAGGGTATCATGTACTTGTCGGATGCTTTGGAAGTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIRFPIFKDFVTSSSLLSFLKFKLKLQQTMKDQVIILKEVKMPILENTTGHRSGSLDTQSQIYQLADGVKANYGMKGIMYLSDALEV