; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh18G012980 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh18G012980
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionbeta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic-like
Genome locationCmo_Chr18:12476386..12479058
RNA-Seq ExpressionCmoCh18G012980
SyntenyCmoCh18G012980
Gene Ontology termsGO:0008610 - lipid biosynthetic process (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005506 - iron ion binding (molecular function)
GO:0016491 - oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006694 - Fatty acid hydroxylase
IPR045019 - Beta-carotene hydroxylase-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6574199.1 Beta-carotene 3-hydroxylase 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.5e-17498.71Show/hide
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KAG7013258.1 Beta-carotene 3-hydroxylase 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.3e-17599.03Show/hide
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XP_022944865.1 beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.3e-176100Show/hide
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XP_022968455.1 beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita maxima]2.4e-17298.06Show/hide
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XP_023541483.1 beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.9e-17397.74Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L606 Fatty acid hydroxylase domain-containing protein4.0e-16089.35Show/hide
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A0A6J1FZ94 beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic-like isoform X16.1e-177100Show/hide
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A0A6J1HX82 beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic-like isoform X21.2e-17298.06Show/hide
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A0A6J1J1S8 beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic-like2.8e-15889.35Show/hide
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G1FQR0 Chloroplast beta-carotene hydroxylase1.2e-17298.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B3SGL0 Beta-carotene 3-hydroxylase, chloroplastic3.1e-11771.52Show/hide
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        K+
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O49814 Beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic3.4e-12475.34Show/hide
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        S  LGPK            P P TP ++P + F  N     + RR+   TVC ++ED    ++ E   ++    I  QI +  +AEKLARKKSERFTYLV
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O49815 Beta-carotene hydroxylase 1, chloroplastic7.8e-11371.73Show/hide
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        P LF S +  N     + RRK  L  C +++D           S+ E + DE ++     +  +  +AEK ARKKSERFTYLVAAVMSS GITSMAV++V
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Query:  YYRFHWQMEGGEIPFSEMFGTFALSVGAAVGMEFWARWAHRALWHASLWHMHESHHKPREGPFELNDVFAITNAVPAIALLSYGFFHKGLVPGLCFGAGL
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        GITVFGMAYMFVHDGLVHKRFPVGPIANVPYF++VAAAHQLHHS+KF+GVPYGLFLGPKELEEVG L+ELEKE+NRR KS+ +
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Q9LTG0 Beta-carotene 3-hydroxylase 2, chloroplastic5.6e-11168.52Show/hide
Query:  MAAGLSAV-LGPKPFHVFLTSSNLSPKPRTPFLFPSSVFRNSRIQWKMRRKTLLTVCVLVEDQSSSSEVENLADEKLPIIVPQ----IPSPHVAEKLARK
        MAAGLS + +  KP +    S+N    P +  +FP S+  N       RR+ +LTVC +VE++  SS ++   D+  P         + +  + +K  +K
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Query:  KSERFTYLVAAVMSSFGITSMAVMAVYYRFHWQMEGGEIPFSEMFGTFALSVGAAVGMEFWARWAHRALWHASLWHMHESHHKPREGPFELNDVFAITNA
        KSERFTYL+AAVMSSFGITSMA+MAVYYRF WQM+GGE+   EMFGTFALSVGAAVGMEFWARWAHRALWH SLW+MHESHHKPREG FELNDVFAITNA
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        VPAI LL YGF +KGLVPGLCFGAGLGIT+FGMAYMFVHDGLVHKRFPVGPIANVPY RKVAAAHQLHH++KF GVPYGLFLGPKE+EEVGG +ELEKEI
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Query:  NRRTK
        +RR K
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Q9SZZ8 Beta-carotene 3-hydroxylase 1, chloroplastic1.6e-11369.3Show/hide
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        MAAGLS  +  KP H   +SS+   + R     P S+   S     +R K   +VC +VE++  +S +EN  DE+         I  +  +  +AEKL R
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        KKSER TYL+AA++SSFGITSMAVMAVYYRF WQMEGGEI   EMFGTFALSVGAAVGMEFWARWAHRALWHASLW+MHESHHKPREGPFELNDVFAI N
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        A PAI LLSYGFF+KGLVPGLCFGAGLGITVFG+AYMFVHDGLVHKRFPVGPIA+VPY RKVAAAHQLHH++KFNGVPYGLFLGPKELEEVGG +EL+KE
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Query:  INRRTKSTAKKPINGS
        I+RR KS  K   +GS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G25700.1 beta-hydroxylase 11.1e-11469.3Show/hide
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        MAAGLS  +  KP H   +SS+   + R     P S+   S     +R K   +VC +VE++  +S +EN  DE+         I  +  +  +AEKL R
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        KKSER TYL+AA++SSFGITSMAVMAVYYRF WQMEGGEI   EMFGTFALSVGAAVGMEFWARWAHRALWHASLW+MHESHHKPREGPFELNDVFAI N
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        A PAI LLSYGFF+KGLVPGLCFGAGLGITVFG+AYMFVHDGLVHKRFPVGPIA+VPY RKVAAAHQLHH++KFNGVPYGLFLGPKELEEVGG +EL+KE
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Query:  INRRTKSTAKKPINGS
        I+RR KS  K   +GS
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AT4G25700.2 beta-hydroxylase 11.6e-6864Show/hide
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        MAAGLS  +  KP H   +SS+   + R     P S+   S     +R K   +VC +VE++  +S +EN  DE+         I  +  +  +AEKL R
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        KKSER TYL+AA++SSFGITSMAVMAVYYRF WQMEGGEI   EMFGTFALSVGAAVGMEFWARWAHRALWHASLW+MHESHHKPREGPFELNDVFAI N
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        A PAI LLSYGFF+KGLVPGLCFGA
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AT5G52570.1 beta-carotene hydroxylase 24.0e-11268.52Show/hide
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        MAAGLS + +  KP +    S+N    P +  +FP S+  N       RR+ +LTVC +VE++  SS ++   D+  P         + +  + +K  +K
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        KSERFTYL+AAVMSSFGITSMA+MAVYYRF WQM+GGE+   EMFGTFALSVGAAVGMEFWARWAHRALWH SLW+MHESHHKPREG FELNDVFAITNA
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        VPAI LL YGF +KGLVPGLCFGAGLGIT+FGMAYMFVHDGLVHKRFPVGPIANVPY RKVAAAHQLHH++KF GVPYGLFLGPKE+EEVGG +ELEKEI
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Query:  NRRTK
        +RR K
Subjt:  NRRTK

AT5G52570.2 beta-carotene hydroxylase 25.8e-6348.2Show/hide
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        MAAGLS + +  KP +    S+N    P +  +FP S+  N       RR+ +LTVC +VE++  SS ++   D+  P         + +  + +K  +K
Subjt:  MAAGLSAV-LGPKPFHVFLTSSNLSPKPRTPFLFPSSVFRNSRIQWKMRRKTLLTVCVLVEDQSSSSEVENLADEKLPIIVPQ----IPSPHVAEKLARK

Query:  KSERFTYLVAAVMSSFGITSMAVMAVYYRFHWQMEGGEIPFSEMFGTFALSVGAAVGMEFWARWAHRALWHASLWHMHESHHKPREGPFELNDVFAITNA
        KSERFTYL+AAVMSSFGITSMA+MAVYYRF WQM+GGE+   EMFGTFALSVGA                                              
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Query:  VPAIALLSYGFFHKGLVPGLCFGAGLGITVFGMAYMFVHDGLVHKRFPVGPIANVPYFRKVAAAHQLHHSEKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLQELEKEI
                               AGLGIT+FGMAYMFVHDGLVHKRFPVGPIANVPY RKVAAAHQLHH++KF GVPYGLFLGPKE+EEVGG +ELEKEI
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Query:  NRRTK
        +RR K
Subjt:  NRRTK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCGGCCTCTCCGCCGTCTTAGGGCCCAAACCATTCCATGTCTTCCTTACTTCCTCCAATCTCTCCCCTAAACCTCGAACTCCGTTTCTGTTTCCATCTTCGGT
CTTCCGGAACAGTAGAATCCAATGGAAGATGCGGAGAAAAACGCTGCTCACCGTCTGCGTCCTCGTTGAGGATCAGAGTAGTTCCAGCGAGGTGGAAAATCTCGCAGATG
AAAAATTACCGATTATAGTCCCTCAGATCCCATCGCCTCATGTTGCAGAGAAATTAGCGAGGAAGAAATCGGAGCGCTTCACTTATCTTGTTGCTGCAGTTATGTCTAGT
TTTGGAATTACTTCCATGGCTGTCATGGCAGTTTACTACCGATTTCACTGGCAAATGGAGGGCGGAGAGATTCCTTTCTCTGAAATGTTTGGTACATTTGCTCTCTCCGT
TGGTGCCGCAGTCGGCATGGAGTTTTGGGCAAGATGGGCACATAGGGCTCTCTGGCACGCTTCCTTGTGGCATATGCACGAGTCTCACCACAAACCAAGAGAAGGACCGT
TCGAATTGAACGATGTTTTCGCCATAACCAACGCCGTGCCCGCCATAGCTCTCCTCTCTTACGGCTTCTTCCATAAAGGCCTCGTCCCTGGTCTCTGCTTCGGCGCAGGC
CTTGGAATTACTGTGTTTGGGATGGCCTACATGTTCGTCCACGACGGTCTCGTTCACAAAAGATTCCCTGTGGGTCCCATTGCCAACGTGCCCTACTTCAGAAAGGTCGC
TGCTGCTCACCAGCTTCATCATTCGGAAAAGTTCAACGGTGTTCCGTACGGGCTGTTTTTGGGTCCAAAGGAATTAGAGGAAGTGGGAGGCCTACAAGAATTGGAGAAGG
AAATCAACAGAAGAACAAAATCAACGGCCAAAAAACCAATCAACGGTTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGCCGAGTATTTGACTCCACTACTTCAAACCGATAAGAACTTGTGGTCTCTGTTCCTTCAACCTCCATTTTTAGCTCTCTCTCTCGCCGCTGTCGTTCTCTCCGAGAAG
CTTCCCCTTCTTCCACCGTATTTTCACCTTTATCTCTCCCATGGCGGCCGGCCTCTCCGCCGTCTTAGGGCCCAAACCATTCCATGTCTTCCTTACTTCCTCCAATCTCT
CCCCTAAACCTCGAACTCCGTTTCTGTTTCCATCTTCGGTCTTCCGGAACAGTAGAATCCAATGGAAGATGCGGAGAAAAACGCTGCTCACCGTCTGCGTCCTCGTTGAG
GATCAGAGTAGTTCCAGCGAGGTGGAAAATCTCGCAGATGAAAAATTACCGATTATAGTCCCTCAGATCCCATCGCCTCATGTTGCAGAGAAATTAGCGAGGAAGAAATC
GGAGCGCTTCACTTATCTTGTTGCTGCAGTTATGTCTAGTTTTGGAATTACTTCCATGGCTGTCATGGCAGTTTACTACCGATTTCACTGGCAAATGGAGGGCGGAGAGA
TTCCTTTCTCTGAAATGTTTGGTACATTTGCTCTCTCCGTTGGTGCCGCAGTCGGCATGGAGTTTTGGGCAAGATGGGCACATAGGGCTCTCTGGCACGCTTCCTTGTGG
CATATGCACGAGTCTCACCACAAACCAAGAGAAGGACCGTTCGAATTGAACGATGTTTTCGCCATAACCAACGCCGTGCCCGCCATAGCTCTCCTCTCTTACGGCTTCTT
CCATAAAGGCCTCGTCCCTGGTCTCTGCTTCGGCGCAGGCCTTGGAATTACTGTGTTTGGGATGGCCTACATGTTCGTCCACGACGGTCTCGTTCACAAAAGATTCCCTG
TGGGTCCCATTGCCAACGTGCCCTACTTCAGAAAGGTCGCTGCTGCTCACCAGCTTCATCATTCGGAAAAGTTCAACGGTGTTCCGTACGGGCTGTTTTTGGGTCCAAAG
GAATTAGAGGAAGTGGGAGGCCTACAAGAATTGGAGAAGGAAATCAACAGAAGAACAAAATCAACGGCCAAAAAACCAATCAACGGTTCTTGATTAACCAGTCACCAGAG
GGCCCCACTGTTGATGTTAAGTAAAAATGAAAAGGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAGAAACCCTCCCCTGGCAGTAACTTTGATAATTAAAAA
GTGAAAGTTTAGATCACTGCCTCCTTTTTTCCCCCAATTTTTTTTACTGTACGAGGCAAAAGGATGGAATAATGAGATGGTAAATTTGGTAGGAAGGATTGGCTTTTACC
CAGGACTTACCCTCTACTTTTTTACTCTCTAATGCGACGGTGAAAAAAACAAATCAGCCAAAAGTAAATAACTCACCCGTAACATTGTGTAATTTTGGATATTTCATAAT
TTAGTAAAGTATGTAAATATTCGAGCCGGTTAAATGTCAAAGCGATCACTAATCGAATAAATAATTTTTAAATGAAAATATACAATAAAATATAAATGAATGGAATCATT
TTTAGAAGAATCAAATGGATTAAACCAACATTTTAAAAGTTAATTCTAAAAAAAGTAATTGGTTTTGTTGAATTAAAAAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAGLSAVLGPKPFHVFLTSSNLSPKPRTPFLFPSSVFRNSRIQWKMRRKTLLTVCVLVEDQSSSSEVENLADEKLPIIVPQIPSPHVAEKLARKKSERFTYLVAAVMSS
FGITSMAVMAVYYRFHWQMEGGEIPFSEMFGTFALSVGAAVGMEFWARWAHRALWHASLWHMHESHHKPREGPFELNDVFAITNAVPAIALLSYGFFHKGLVPGLCFGAG
LGITVFGMAYMFVHDGLVHKRFPVGPIANVPYFRKVAAAHQLHHSEKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLQELEKEINRRTKSTAKKPINGS