; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh18G013070 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh18G013070
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationCmo_Chr18:12512257..12514655
RNA-Seq ExpressionCmoCh18G013070
SyntenyCmoCh18G013070
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR044646 - Pentatricopeptide repeat-containing protein EMB1417-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6574206.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.1e-17698.19Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        MAHSLVPASLSSAL SNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALA DGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQPSMAIVT LGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEED+ITSQDSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD

Query:  EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        EMSE P EALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

KAG7013270.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.7e-17798.8Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALA DGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQPSMAIVT LGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEED+ITSQDSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD

Query:  EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        EMSEDP EALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

XP_022945794.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 [Cucurbita moschata]9.9e-180100Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD

Query:  EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

XP_022968275.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 [Cucurbita maxima]5.8e-17296.71Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS--SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS  SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS--SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI

Query:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
        AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALA DGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
Subjt:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE

Query:  IFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLE
        IFADMEELGVQPSMAIVT LG+VFQKLGMLDK EKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKE SSTEELLEEDE TSQDSSLE
Subjt:  IFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLE

Query:  DDEMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        DDEMSED DE LEDESM+LKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  DDEMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

XP_023541679.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21190 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.7e-17697.9Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLI--ASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLI  ASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLI--ASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI

Query:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
        AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALA DGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
Subjt:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE

Query:  IFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLE
        IFADMEELGVQPSMAIVT LGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSG+ DKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLE
Subjt:  IFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLE

Query:  DDEMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        DDEMSEDPDEALEDESM+LKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  DDEMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q9 Uncharacterized protein1.3e-14584.38Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        M HSL  A+LSS LAS RM TL+Y+FPV SK IESV FS   SSSVVCAAKGPRPRYPRVWKT+KRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLE QREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALA DGRLDEAEELWNKLFSQHLES+PRIFFHKMISLYY++ MHDKLFE+F
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQP+MAIVTK+GNVFQ+LGMLDKY+KL KKYPPPKWEYRYI+GKRVKIRAK L ENG+SNNG  E  K EHSST   ++E EITS+DSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD

Query:  E-MSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        E MSEDPDE LEDE M  K S FEHDFMG GQL
Subjt:  E-MSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

A0A5D3DHA7 Pentatricopeptide repeat-containing protein1.8e-14282.58Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        M H L  A+L+S  AS RM TL+Y+FPV SK IESV FS   SSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLE QREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNAL  DGRLDEAEELWNKLFSQ+LESMPRIFFHKMISLYY+R MHDKLFE+F
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQP+MAIVTK+GN+FQ+LGMLDKYEKL KKYPPPKWEYRYI+GKRVKIR K L ENG+S NG  E +K EHSST   L+E EITS+DSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD

Query:  -EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
         E+ +DPDE LEDE M  K S FEHDFMG GQL
Subjt:  -EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

A0A6J1CI57 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g211906.6e-14583.43Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        MAHS V ASLSS+ ASNRM TLIYSFPVISK IESVKFS  ASS+VVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALA DGRLDEAEELWNKLFSQ+LESMPR+FFHKMISLYY++ MHDKLFE+F
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQP+  IVT +GNVFQ+LGM DKYEKLKKKYPP KWEYRY++GKRV+IRAK L+E G+SNNGS ELD+K+ SS  +LLEE E  S+DSSLED+
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD

Query:  EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        EM EDPDE LEDES  L+   FE++FMG+G+L
Subjt:  EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

A0A6J1G1Y3 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g211904.8e-180100Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAW

Query:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
        ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF
Subjt:  ELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIF

Query:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD
        ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD
Subjt:  ADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDD

Query:  EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  EMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

A0A6J1HWS4 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g211902.8e-17296.71Show/hide
Query:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS--SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
        MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS  SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI
Subjt:  MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIAS--SSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFI

Query:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
        AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALA DGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE
Subjt:  AWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFE

Query:  IFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLE
        IFADMEELGVQPSMAIVT LG+VFQKLGMLDK EKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKE SSTEELLEEDE TSQDSSLE
Subjt:  IFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLE

Query:  DDEMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL
        DDEMSED DE LEDESM+LKESTFEHDFMGFGQL
Subjt:  DDEMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFGQL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2V3H0 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g18975, chloroplastic2.4e-4345.18Show/hide
Query:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY   D+HDK+ E+FADMEEL V P      ++   F++L   +  + + ++Y   +++Y Y  G+RV+++
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR

Q8LG95 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g211903.8e-9765.03Show/hide
Query:  MHTLIYSFPVI---SKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT
        M +L YS P +   ++   +  F+   ++ VVCAA+GPRPR PRVWKTRKRIGTISKAAK++ C+KGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPL+ VKKAL  
Subjt:  MHTLIYSFPVI---SKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT

Query:  LEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIV
        LE ++EWK+IIQ+TKWMLSKGQGRTMG+YF+LLNALA D RLDEAEELWNKLF +HLE  PR FF+KMIS+YY+RDMH KLFE+FADMEELGV+P++AIV
Subjt:  LEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIV

Query:  TKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDDE
        + +G VF KL M DKYEKL KKYPPP+WE+RYI+G+RVK++AK L+E    + G G L   E     E+  E+E     S  E+DE
Subjt:  TKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDDE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G18975.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein1.7e-4445.18Show/hide
Query:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY   D+HDK+ E+FADMEEL V P      ++   F++L   +  + + ++Y   +++Y Y  G+RV+++
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR

AT4G18975.2 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein1.7e-4445.18Show/hide
Query:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY   D+HDK+ E+FADMEEL V P      ++   F++L   +  + + ++Y   +++Y Y  G+RV+++
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR

AT4G18975.3 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein1.7e-4445.18Show/hide
Query:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY   D+HDK+ E+FADMEEL V P      ++   F++L   +  + + ++Y   +++Y Y  G+RV+++
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR

AT4G18975.4 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein1.7e-4445.18Show/hide
Query:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDE
        +WK     G+  KA  LV  + GL N KE VYGAL+ ++AWE+EFP+I   KAL+ L  + +W R+IQL KWMLSKGQG TMG+Y  LL A   D R DE
Subjt:  VWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDE

Query:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR
        AE LWN +   H  S+PR  F +MI+LY   D+HDK+ E+FADMEEL V P      ++   F++L   +  + + ++Y   +++Y Y  G+RV+++
Subjt:  AEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIR

AT4G21190.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein2.7e-9865.03Show/hide
Query:  MHTLIYSFPVI---SKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT
        M +L YS P +   ++   +  F+   ++ VVCAA+GPRPR PRVWKTRKRIGTISKAAK++ C+KGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPL+ VKKAL  
Subjt:  MHTLIYSFPVI---SKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVKKALKT

Query:  LEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIV
        LE ++EWK+IIQ+TKWMLSKGQGRTMG+YF+LLNALA D RLDEAEELWNKLF +HLE  PR FF+KMIS+YY+RDMH KLFE+FADMEELGV+P++AIV
Subjt:  LEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIV

Query:  TKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDDE
        + +G VF KL M DKYEKL KKYPPP+WE+RYI+G+RVK++AK L+E    + G G L   E     E+  E+E     S  E+DE
Subjt:  TKLGNVFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDDE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCACTCTCTTGTTCCAGCATCGCTCTCGTCCGCCTTGGCTTCCAACCGGATGCATACTTTGATTTACTCTTTCCCAGTCATATCCAAAGGGATTGAATCTGTTAA
ATTTTCGTTGATTGCAAGCAGTTCAGTGGTATGTGCTGCAAAAGGTCCACGGCCGAGATATCCTCGGGTCTGGAAAACCAGGAAGAGGATTGGGACCATATCCAAGGCAG
CAAAGCTCGTTGATTGTGTCAAGGGACTGTCTAACGTGAAAGAGGAAGTCTATGGGGCTCTTGATTCCTTCATTGCCTGGGAACTAGAGTTTCCTCTTATTACTGTAAAA
AAGGCCCTGAAGACCTTAGAGATCCAAAGAGAATGGAAGAGGATAATTCAGTTGACGAAATGGATGTTAAGTAAAGGCCAAGGAAGAACAATGGGTAGCTATTTCACATT
ATTAAATGCCTTAGCTGCAGATGGAAGACTTGATGAAGCTGAAGAGCTTTGGAACAAATTATTTTCTCAGCATCTGGAGAGCATGCCTCGCATATTCTTCCATAAAATGA
TATCCCTTTACTATGAACGGGATATGCACGACAAGTTATTTGAGATATTTGCTGATATGGAGGAACTTGGAGTTCAACCAAGTATGGCAATTGTCACTAAGCTCGGAAAT
GTCTTCCAAAAGTTGGGTATGCTAGATAAATATGAAAAGTTGAAGAAGAAATATCCCCCACCGAAATGGGAATATCGTTACATAAGAGGAAAGCGCGTAAAAATACGAGC
AAAGAATCTGCACGAAAATGGTAGTTCCAACAATGGTTCAGGTGAACTCGACAAAAAGGAGCATAGTTCAACAGAAGAACTGTTGGAGGAAGATGAAATAACTTCCCAAG
ATTCGAGTCTTGAAGATGATGAAATGAGTGAAGACCCAGATGAAGCCTTGGAAGATGAAAGTATGATGTTGAAAGAATCCACTTTTGAGCACGATTTCATGGGATTTGGA
CAATTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGAAAAGAAGAAATATGGGAAATTGAAGACATTCTTACACATTTCTTCAATGGCGCACTCTCTTGTTCCAGCATCGCTCTCGTCCGCCTTGGCTTCCAACCGGATGCATA
CTTTGATTTACTCTTTCCCAGTCATATCCAAAGGGATTGAATCTGTTAAATTTTCGTTGATTGCAAGCAGTTCAGTGGTATGTGCTGCAAAAGGTCCACGGCCGAGATAT
CCTCGGGTCTGGAAAACCAGGAAGAGGATTGGGACCATATCCAAGGCAGCAAAGCTCGTTGATTGTGTCAAGGGACTGTCTAACGTGAAAGAGGAAGTCTATGGGGCTCT
TGATTCCTTCATTGCCTGGGAACTAGAGTTTCCTCTTATTACTGTAAAAAAGGCCCTGAAGACCTTAGAGATCCAAAGAGAATGGAAGAGGATAATTCAGTTGACGAAAT
GGATGTTAAGTAAAGGCCAAGGAAGAACAATGGGTAGCTATTTCACATTATTAAATGCCTTAGCTGCAGATGGAAGACTTGATGAAGCTGAAGAGCTTTGGAACAAATTA
TTTTCTCAGCATCTGGAGAGCATGCCTCGCATATTCTTCCATAAAATGATATCCCTTTACTATGAACGGGATATGCACGACAAGTTATTTGAGATATTTGCTGATATGGA
GGAACTTGGAGTTCAACCAAGTATGGCAATTGTCACTAAGCTCGGAAATGTCTTCCAAAAGTTGGGTATGCTAGATAAATATGAAAAGTTGAAGAAGAAATATCCCCCAC
CGAAATGGGAATATCGTTACATAAGAGGAAAGCGCGTAAAAATACGAGCAAAGAATCTGCACGAAAATGGTAGTTCCAACAATGGTTCAGGTGAACTCGACAAAAAGGAG
CATAGTTCAACAGAAGAACTGTTGGAGGAAGATGAAATAACTTCCCAAGATTCGAGTCTTGAAGATGATGAAATGAGTGAAGACCCAGATGAAGCCTTGGAAGATGAAAG
TATGATGTTGAAAGAATCCACTTTTGAGCACGATTTCATGGGATTTGGACAATTGTAAGTTCAAGATATAGATAATGTATTCCCCATTTCAAGTTCGTCAAAATTCTCTC
CCTCAATATATATAGTGTACACTTTTCTCTTCTTTTCTTTCTTTCTGTAATTTTGATCATACGGGATCACCAGTAGCATTGTGATCATAGAGCCAATTCCCTGCCCGACC
TAAAATATACTTTTGTTATTGAGAGTAAATGAAAGAAAAAGAAAATGTTCTTAATAAGTCGTAGAAGACAATTTCATCATCTGAGTGTGAGATAGCTGAATGTGGTGAAC
TAATTGCCTTCAAAAAAGGATAATAAATATGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAHSLVPASLSSALASNRMHTLIYSFPVISKGIESVKFSLIASSSVVCAAKGPRPRYPRVWKTRKRIGTISKAAKLVDCVKGLSNVKEEVYGALDSFIAWELEFPLITVK
KALKTLEIQREWKRIIQLTKWMLSKGQGRTMGSYFTLLNALAADGRLDEAEELWNKLFSQHLESMPRIFFHKMISLYYERDMHDKLFEIFADMEELGVQPSMAIVTKLGN
VFQKLGMLDKYEKLKKKYPPPKWEYRYIRGKRVKIRAKNLHENGSSNNGSGELDKKEHSSTEELLEEDEITSQDSSLEDDEMSEDPDEALEDESMMLKESTFEHDFMGFG
QL