; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh19G002110 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh19G002110
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionNAC domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr19:1410004..1410660
RNA-Seq ExpressionCmoCh19G002110
SyntenyCmoCh19G002110
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003441 - NAC domain
IPR036093 - NAC domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571618.1 hypothetical protein SDJN03_28346, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.0e-7193.01Show/hide
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KAG6571619.1 NAC domain-containing protein 30, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-5279.85Show/hide
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XP_022963930.1 uncharacterized protein LOC111464082 [Cucurbita moschata]1.3e-5078.36Show/hide
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XP_023511529.1 uncharacterized protein LOC111776332 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.0e-5787.02Show/hide
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XP_023511533.1 NAC domain-containing protein 30-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.2e-5278.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3CNQ3 NAC domain-containing protein 83-like1.0e-2960Show/hide
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        ER KRKL +  ELQ+ +KKR+T P+
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A0A6J1HH13 NAC domain-containing protein 30-like1.1e-3468.6Show/hide
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        LYFF KLK  TNNS  L AHIN K+GLAN TWSGEN    IFATKTDK II Y K FRY+N QL EHHGEWIMHE     DSI Q  DSNY+LCR  KNE
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A0A6J1HJD2 uncharacterized protein LOC1114640826.1e-5178.36Show/hide
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A0A6J1HSR6 NAC domain-containing protein 72-like9.5e-3667.48Show/hide
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A0A6J1HXC3 NAC transcription factor 25-like9.2e-4771.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAAATCTGGCTACGTTTTGGACTCATCGACGCAAACATCTCTATTTCTTCATCAAACTCAAGTGCCTGACCAATAACTCCGAACATCTGTGGGCCCATATCAACAG
CAAGATTGGCTTGGCCAATGATACATGGAGTGGCGAGAACCTGGTCAAACCAATTTTTGCTACCAAGACCGATAAACAAATAATCAGCTATCGCAAGTGCTTCAGGTACA
AGAATGTCCAATTGTCGGAGCATCATGGCGAATGGATTATGCATGAAGATTCGATACACCAAATTGAAGATTCGAATTACATTTTATGTCGACTTAGCAAGAATGAAAGA
CTTAAAAGAAAATTAGGAAAAAATCTTGAGCTACAGCGACATAGCAAGAAAAGAATAACGGGGCCTAGATCGACCATTGAACAAGACACTATGTCTGACAATGCAAACGT
GACCATATTTTCCATGGCTCCATTTCTCCATAAAGATAACAGTCCGAGACTGCACCTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAAAATCTGGCTACGTTTTGGACTCATCGACGCAAACATCTCTATTTCTTCATCAAACTCAAGTGCCTGACCAATAACTCCGAACATCTGTGGGCCCATATCAACAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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