; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh19G002790 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh19G002790
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionTropomyosin-like
Genome locationCmo_Chr19:2044811..2049278
RNA-Seq ExpressionCmoCh19G002790
SyntenyCmoCh19G002790
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022963475.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 [Cucurbita moschata]4.1e-69100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
XP_022963476.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X2 [Cucurbita moschata]3.0e-67100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
XP_022967634.1 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X1 [Cucurbita maxima]7.8e-6898.65Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
XP_022967635.1 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X2 [Cucurbita maxima]1.9e-6699.31Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
XP_038886855.1 uncharacterized protein LOC120077075 isoform X1 [Benincasa hispida]1.5e-6695.27Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVTRELENTTKVFQLHMDELR KQEEI+KRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K2J2 Uncharacterized protein4.6e-6693.24Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEM SNL+SLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGG+E
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
A0A6J1HG82 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X21.4e-67100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
A0A6J1HI40 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X12.0e-69100Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
A0A6J1HV17 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X29.3e-6799.31Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLG
A0A6J1HXA5 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X13.8e-6898.65Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64180.1 unknown protein1.1e-5476.51Show/hide
Query:  MEDKGKGTD-RWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV
        ME++  G+D RW G++ NITEMASNL+SLQK+L+KKAV+V+++TF+RASL SEQARTIKVLEQRV+TLERELDAAITAAAHARSEKRQAE++QKAAE   
Subjt:  MEDKGKGTD-RWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV

Query:  QEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE
        Q+VT+ELENTTKVF+LHM+ELR  QE+I+KRD +IKLLEAIIQTLGGKE
Subjt:  QEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCCGTAGCCAATATCACGGAGATGGCCTCCAACCTGGAATCACTCCAGAAGATTTTAGTAAAGAAAGCCGT
CTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGAACAGGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGAGAACTTGATGCTG
CTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCACAAAAAGCTGCTGAACTACATGTGCAGGAGGTCACTAGAGAGCTCGAGAACACGACA
AAGGTATTTCAACTGCACATGGATGAATTGCGTGCAAAGCAAGAGGAAATCAACAAGCGTGATAAGGATATCAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAAACTCTCGGTGGTAA
AGAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCGCGGAAACATCGAATGCAACGGATGATCGGGTGAGTTCTTAGCTCCCTCGCTAAGTCTCTACACAGATCATGAAGTTGAACAATAATTGAATTGCGAATTCGCAAAA
GTGCAATCGTCGAGGAAGGTTTGGATCATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCCGTAGCCAATATCACGGAGATGGCCTCCAACCTGGAATCACT
CCAGAAGATTTTAGTAAAGAAAGCCGTCTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGAACAGGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTG
AGACTTTGGAAAGAGAACTTGATGCTGCTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCACAAAAAGCTGCTGAACTACATGTGCAGGAG
GTCACTAGAGAGCTCGAGAACACGACAAAGGTATTTCAACTGCACATGGATGAATTGCGTGCAAAGCAAGAGGAAATCAACAAGCGTGATAAGGATATCAAGCTCTTGGA
AGCAATAATTCAAACTCTCGGTGGTAAAGAATAATATTTGATGGGCGATTAGGCGATTAGCGTAACGATCGAAGAAGTATAAGTAGGTTCTGTTGTTTTCTTGAGTCCAG
TTTGGTTTCTTAGATCTTCTGAAAGCAAAATGTTCTGTCAAATTCAGTGTTGTATGGATAATGTGGCTTTTGAAATTGTGTGGATACGATCATGTATGGATAGAACTTCA
TCATTCTCTTACTTTCATCTTTTTTACTACTCTGTGTCAATATTAGCACTCAAGTAGACACATCTAAGTAAGGTCGTAACAGTCGAAGCCCAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDKGKGTDRWSGAVANITEMASNLESLQKILVKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQEVTRELENTT
KVFQLHMDELRAKQEEINKRDKDIKLLEAIIQTLGGKE