; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh19G004500 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh19G004500
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionNAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic
Genome locationCmo_Chr19:5474948..5475622
RNA-Seq ExpressionCmoCh19G004500
SyntenyCmoCh19G004500
Gene Ontology termsGO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0009579 - thylakoid (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ABE01285.1 NADH dehydrogenase subunit F, partial [Gustavia longifolia]6.9e-0561.22Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLLNLFNF
        +VAKSAQFPLH          VWLP+AMEGPTPISALIHA  ++   NF
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLLNLFNF

AEP25195.1 NADH dehydrogenase, partial [Physena madagascariensis]5.3e-0565.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        +VAKSAQFPLHL          WLPNAMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

AWI69859.1 NADH dehydrogenase subunit 5, partial [Malouetia tamaquarina]6.9e-0565.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        +VAKSAQFPLH          VWLPNAMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

CDO67393.1 NADH dehydrogenase subunit 5, partial [Aristida migiurtina]6.9e-0565.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        +VAKSAQFPLH          VWLPNAMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

YP_009568915.1 NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 5 [Physena sessiliflora]5.3e-0565.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        +VAKSAQFPLHL          WLPNAMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0X9R2B1 NADH dehydrogenase subunit 53.3e-0561.22Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLLNLFNF
        +VAKSAQFPLH          VWLP+AMEGPTPISALIHA  ++   NF
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLLNLFNF

A0A411JV13 NAD(P)H dehydrogenase subunit 52.5e-0565.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        +VAKSAQFPLHL          WLPNAMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

A0A411JV15 NAD(P)H dehydrogenase subunit 52.5e-0565.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        +VAKSAQFPLHL          WLPNAMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

A4K3K3 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic (Fragment)3.3e-0561.22Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLLNLFNF
        +VAKSAQFPLH          VWLP+AMEGPTPISALIHA  ++   NF
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLLNLFNF

G4WNX6 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic (Fragment)2.5e-0565.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        +VAKSAQFPLHL          WLPNAMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B5LMS9 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic1.5e-0765.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        SVAKSAQFPLH          VWLP+AMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

P15958 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic1.5e-0765.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        SVAKSAQFPLH          VWLP+AMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

Q2PMM9 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic1.5e-0765.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        SVAKSAQFPLH          VWLP+AMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

Q32905 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic (Fragment)1.5e-0765.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        SVAKSAQFPLH          VWLP+AMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

Q9BBP6 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic1.5e-0765.91Show/hide
Query:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        SVAKSAQFPLH          VWLP+AMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  SVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG01010.1 NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 protein4.2e-0862.79Show/hide
Query:  VAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL
        +AKSAQFPLH          VWLP+AMEGPTPISALIHA  ++
Subjt:  VAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGCCGGGAAAAGATCACAGGCAGGTGTCTGTTGCTAAATCTGCTCAATTTCCTCTTCATTTGCTAAATCTGCTCAATTTTCCTCTTCTTGTATGGTTACCTAATGC
TATGGAGGGTCCTACCCCAATTTCGGCTCTTATACATGCTATGCAATTGCTAAATCTGTTCAATTTCTTCTTCATGTATGGTTACCTGATGCTATGGAGGGTCCTACTCC
GATTTCGGCTCTTATACATGCTGCTACAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGCCGGGAAAAGATCACAGGCAGGTGTCTGTTGCTAAATCTGCTCAATTTCCTCTTCATTTGCTAAATCTGCTCAATTTTCCTCTTCTTGTATGGTTACCTAATGC
TATGGAGGGTCCTACCCCAATTTCGGCTCTTATACATGCTATGCAATTGCTAAATCTGTTCAATTTCTTCTTCATGTATGGTTACCTGATGCTATGGAGGGTCCTACTCC
GATTTCGGCTCTTATACATGCTGCTACAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGPGKDHRQVSVAKSAQFPLHLLNLLNFPLLVWLPNAMEGPTPISALIHAMQLLNLFNFFFMYGYLMLWRVLLRFRLLYMLLQ