; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh19G006600 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh19G006600
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationCmo_Chr19:7096803..7100615
RNA-Seq ExpressionCmoCh19G006600
SyntenyCmoCh19G006600
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.5e-9393.33Show/hide
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XP_022972363.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita maxima]3.7e-9799.42Show/hide
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XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]4.3e-9396.53Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like7.1e-9497.11Show/hide
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A0A6J1EZ82 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.0e-9295.38Show/hide
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A0A6J1GLY2 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like6.2e-98100Show/hide
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A0A6J1I9Q6 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.8e-9799.42Show/hide
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A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.0e-9295.38Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.9e-6064.16Show/hide
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Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.2e-6064.16Show/hide
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Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.2e-6064.16Show/hide
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Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.1e-8284.48Show/hide
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Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like3.0e-8183.33Show/hide
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        MI LFKVKEKQRE +++ NG+     KKQSAGELRL KDISELNLPK+C ISFPNGK+DLMNFEVTI+PDEGYYL G F+FSFQVS +YPHE PKVKCKT
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G16740.1 ubiquitin-conjugating enzyme 291.2e-2438.24Show/hide
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        R+ K++ EL   P   C + P G +D+ +++ TI  P+E  Y GG FL +    P YP +PPKV  +TKV+HPNI+  GN+CL+IL++ W P L I+ ++
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          +  L T PN +DPL  + A + + +   +E+  R
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AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein2.1e-8283.33Show/hide
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AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 111.5e-2439.71Show/hide
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          +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
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AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 11.5e-8384.48Show/hide
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AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 11.5e-8384.48Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGATGACGCCGGTCCGCAGTCGAAGCTCGAAAGCGAAGGGATCCGAATTTGGCCCTGCGGAACGAACAATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGA
GATTGCACGGAATGCCAATGGAAAACCTCCTGGCAAGAAGCAAAGTGCAGGAGAATTGCGTCTTCAAAAAGATATCAGTGAATTGAACCTACCAAAAACGTGTTGTATAT
CGTTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCAGCCTGATGAAGGATATTATCTAGGCGGCACGTTTCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTG
TACCCTCACGAGCCACCAAAAGTTAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACTTGGAAGGAAATGTTTGTCTCAACATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGT
TCTGAATATCAACACTATCATATACGGATTATTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGACCCCCTCAACCACGATGCTGCAGCTGTTTTAAGGGATAACCCGAAGA
CGTTCGAATCCAACGTGAGAAGAGCAATGGCTGGGGGATATTATTGGTTTCCATGGAAGTTGGACTGGAAACTGAAACACTTATCTCTGTCAAAGAAGCGCGATGGAGCG
GTTGTCGACATTCCTTCATTGACCGACTTTTCGACCCTTTTAGCTCCCATGGTGGCAGGCAGCCGTTGTCATGGGAGTGAAGAAACAATGAAGACGTTGAGACTTATGAT
TGATGTATTGAGATCGATGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TGATGTATTGAGATCGATGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YPHEPPKVKCKTKVYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKTFESNVRRAMAGGYYWFPWKLDWKLKHLSLSKKRDGA
VVDIPSLTDFSTLLAPMVAGSRCHGSEETMKTLRLMIDVLRSM