; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh19G006800 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh19G006800
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionNADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial-like
Genome locationCmo_Chr19:7220019..7223458
RNA-Seq ExpressionCmoCh19G006800
SyntenyCmoCh19G006800
Gene Ontology termsGO:0006120 - mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone (biological process)
GO:0032981 - mitochondrial respiratory chain complex I assembly (biological process)
GO:0005747 - mitochondrial respiratory chain complex I (cellular component)
GO:0003954 - NADH dehydrogenase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR010226 - NADH-quinone oxidoreductase, chain I
IPR017896 - 4Fe-4S ferredoxin-type, iron-sulphur binding domain
IPR017900 - 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572037.1 hypothetical protein SDJN03_28765, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-11999.55Show/hide
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KAG7011706.1 hypothetical protein SDJN02_26612 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.5e-11897.79Show/hide
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XP_022972525.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial-like [Cucurbita maxima]8.5e-11999.1Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C2E8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial5.6e-11695.95Show/hide
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A0A6J1F0I7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial1.7e-11797.75Show/hide
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A0A6J1GJX8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial-like1.7e-120100Show/hide
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A0A6J1I8H7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial1.7e-11797.75Show/hide
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A0A6J1I8W0 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial-like4.1e-11999.1Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O21233 NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 84.0e-7985.71Show/hide
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P80269 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial1.6e-10786.03Show/hide
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Q42599 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial5.1e-10685.59Show/hide
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Q9FX83 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-B, mitochondrial2.3e-10686.04Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16700.1 Alpha-helical ferredoxin1.6e-10786.04Show/hide
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AT1G79010.1 Alpha-helical ferredoxin3.6e-10785.59Show/hide
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ATCG01090.1 NADPH dehydrogenases1.9e-1535.54Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TATCGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GAACATAATTCTTGCTGCTTACTAAGATCCAAGTTTGGGAATTTTCTTGGTGCGTTCTGTTTTTCTTCCTAATAAAAATGGGATCGTTATGGTTTCTCATGCAGTTGCAA
TGTAGCTAAAATATGAAAAATGTCATCAATATATCCTCAATGTTCTTCAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAILARKSLLALRARQLAISGQALQGSRFHDLRSSAHLYSTKREDEEREQLAKEMSKDWSSIFERSINTLFLTEMVRGLMLTLKYFFEKKVTINYPFEKGPLSPRFRGE
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