; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh19G007900 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh19G007900
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionexpansin-like A3
Genome locationCmo_Chr19:7916194..7917769
RNA-Seq ExpressionCmoCh19G007900
SyntenyCmoCh19G007900
Gene Ontology termsGO:0019953 - sexual reproduction (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR007112 - Expansin/pollen allergen, DPBB domain
IPR007117 - Expansin, cellulose-binding-like domain
IPR007118 - Expansin/Lol pI
IPR009009 - RlpA-like protein, double-psi beta-barrel domain
IPR036749 - Expansin, cellulose-binding-like domain superfamily
IPR036908 - RlpA-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BHX1 expansin-like A22.5e-12379.85Show/hide
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A0A515EIT6 Expansin A8-like protein1.2e-12279.48Show/hide
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A0A5A7TAM6 Expansin-like A21.8e-12181.01Show/hide
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A0A6J1GMD1 expansin-like A31.6e-154100Show/hide
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A0A6J1I1Z2 expansin-like A36.6e-14894.68Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10S70 Expansin-like A16.5e-6044.19Show/hide
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        LS  A++AMA       L  L  VDVEYKR+PC Y++++L VRV+E S+ P  L +  +YQGGQT+I  +++A+VGS +W+ M R +G  W       G 
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        LQ+++VV   Y+ + ++     LP  W+ GE+YDTGVQI DI  E C P  C    WK
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Q7XCL0 Expansin-like A25.0e-6045.25Show/hide
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        +LFF+V    +S  + CDRCV +SK  +      +  G+CGYG LA   + G++A   P+L+R G GCGACFQVRCK+ + CSTAG KVV TD+    NR
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           G LQ ++VV   Y+ + ++     LP  W  G +YD GVQI D+  E C P  C    WK
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Q9LZT4 Expansin-like A14.1e-7051.39Show/hide
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        ++ FL SS+   CDRC+H+SK AY+   + +  GAC YG +A     G++A  +PS+Y+ GAGCGACFQVRCKN + CST GT V+ TD N  N+ D VL
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        S  A+ AMA  +    K+LL  G VD+EY+R+PC Y NKN+ VRVEE S+KP YL +KL+YQGGQTE+  I+IA+VGS  NW  M R++GA+W T+KV  
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        GA+Q + VV   Y+ + I W+   LP +W+ G++YD GVQI DI  E C P
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Q9LZT5 Expansin-like A34.8e-7150.19Show/hide
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        Y+ ++ FL SS+   CDRC+H+SK +Y+   + +  GAC YGP+A     G++A  +PS+Y+ GAGCGACFQVRCKN + C++ GT V+ TD N  N+ D
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Q9SVE5 Expansin-like A21.2e-6950.39Show/hide
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        + AMA  +    ++LL  G VD+EY+R+PC Y NK + VRVEE S+ P YLA+KL+YQGGQTE+  I IA+VGS +W  M R++GA+W T+KV  GALQ 
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        + VV + Y+ + + W+   LP +W+ G+ YD GVQI DI  E C P  C D  W
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G45960.1 expansin-like A31.3e-5852.63Show/hide
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        G++A  +PS+Y+ GAGCGACFQVRCKN + C++ GT V+ TD N  N+ D VLS  A+ AMA  +    K LL  G VDVEY+R+PC Y  +NL VRVEE
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Query:  WSQKPYYLALKLVYQGGQTEIKGIEIAEVGSDNWESMKRNYGAIWDTNKVLEGALQLKIVVASRYNNENIYWATYDLPDDWKNGEMYDTGVQIDDIVNEK
         S+KP YLA+KL+YQGGQTE+ GI+IA VGS  W  M R++GA+W T+KV  GALQ K  V   Y+ + + W+   LP +W +G +YD GVQI DI  E 
Subjt:  WSQKPYYLALKLVYQGGQTEIKGIEIAEVGSDNWESMKRNYGAIWDTNKVLEGALQLKIVVASRYNNENIYWATYDLPDDWKNGEMYDTGVQIDDIVNEK

Query:  CPPKQCGDL
        C    CG +
Subjt:  CPPKQCGDL

AT3G45960.2 expansin-like A33.4e-7250.19Show/hide
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        Y+ ++ FL SS+   CDRC+H+SK +Y+   + +  GAC YGP+A     G++A  +PS+Y+ GAGCGACFQVRCKN + C++ GT V+ TD N  N+ D
Subjt:  YVGLLFFLVSSAAATCDRCVHQSKTAYYYDDTPIQHGACGYGPLAFELSNGYVAGVVPSLYRQGAGCGACFQVRCKNKRFCSTAGTKVVATDQNYDNRYD

Query:  FVLSKIAYSAMA--LKNKTKELLNLGTVDVEYKRIPCTYKNKNLMVRVEEWSQKPYYLALKLVYQGGQTEIKGIEIAEVGSDNWESMKRNYGAIWDTNKV
         VLS  A+ AMA  +    K LL  G VDVEY+R+PC Y  +NL VRVEE S+KP YLA+KL+YQGGQTE+ GI+IA VGS  W  M R++GA+W T+KV
Subjt:  FVLSKIAYSAMA--LKNKTKELLNLGTVDVEYKRIPCTYKNKNLMVRVEEWSQKPYYLALKLVYQGGQTEIKGIEIAEVGSDNWESMKRNYGAIWDTNKV

Query:  LEGALQLKIVVASRYNNENIYWATYDLPDDWKNGEMYDTGVQIDDIVNEKCPPKQCGDL
          GALQ K  V   Y+ + + W+   LP +W +G +YD GVQI DI  E C    CG +
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AT3G45970.1 expansin-like A12.9e-7151.39Show/hide
Query:  LLFFLVSSAAATCDRCVHQSKTAYYYDDTPIQHGACGYGPLAFELSNGYVAGVVPSLYRQGAGCGACFQVRCKNKRFCSTAGTKVVATDQNYDNRYDFVL
        ++ FL SS+   CDRC+H+SK AY+   + +  GAC YG +A     G++A  +PS+Y+ GAGCGACFQVRCKN + CST GT V+ TD N  N+ D VL
Subjt:  LLFFLVSSAAATCDRCVHQSKTAYYYDDTPIQHGACGYGPLAFELSNGYVAGVVPSLYRQGAGCGACFQVRCKNKRFCSTAGTKVVATDQNYDNRYDFVL

Query:  SKIAYSAMA--LKNKTKELLNLGTVDVEYKRIPCTYKNKNLMVRVEEWSQKPYYLALKLVYQGGQTEIKGIEIAEVGSD-NWESMKRNYGAIWDTNKVLE
        S  A+ AMA  +    K+LL  G VD+EY+R+PC Y NKN+ VRVEE S+KP YL +KL+YQGGQTE+  I+IA+VGS  NW  M R++GA+W T+KV  
Subjt:  SKIAYSAMA--LKNKTKELLNLGTVDVEYKRIPCTYKNKNLMVRVEEWSQKPYYLALKLVYQGGQTEIKGIEIAEVGSD-NWESMKRNYGAIWDTNKVLE

Query:  GALQLKIVVASRYNNENIYWATYDLPDDWKNGEMYDTGVQIDDIVNEKCPP
        GA+Q + VV   Y+ + I W+   LP +W+ G++YD GVQI DI  E C P
Subjt:  GALQLKIVVASRYNNENIYWATYDLPDDWKNGEMYDTGVQIDDIVNEKCPP

AT4G17030.1 expansin-like B12.2e-3938.46Show/hide
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        S+  YY   D      G CGYG    +++NG V+GV   L+  G GCGAC+QVRCK    CS  G  VVATD    +  DF+LS  AY  MA      +L
Subjt:  SKTAYY--YDDTPIQHGACGYGPLAFELSNGYVAGVVPSLYRQGAGCGACFQVRCKNKRFCSTAGTKVVATDQNYDNRYDFVLSKIAYSAMALKNKTKEL

Query:  LNLGTVDVEYKRIPCTYKNKNLMVRVEEWSQKPYYLALKLVYQGGQTEIKGIEIAEVGSDNWESMKRNYGAIWDTNKVLEGALQLKIVVASRYNNENIYW
         + G V+VEY+RIPC Y   NL+ ++ E S  P+YLA+ ++Y GG  +I  +E+ +     W  M+R +GA+ D      G L L+ +V   Y +  I W
Subjt:  LNLGTVDVEYKRIPCTYKNKNLMVRVEEWSQKPYYLALKLVYQGGQTEIKGIEIAEVGSDNWESMKRNYGAIWDTNKVLEGALQLKIVVASRYNNENIYW

Query:  --ATYDLPDDWKNGEMYDTGV
          +   +P DW  G  YD+ +
Subjt:  --ATYDLPDDWKNGEMYDTGV

AT4G38400.1 expansin-like A28.4e-7150.39Show/hide
Query:  LVSSAAATCDRCVHQSKTAYYYDDTPIQHGACGYGPLAFELSNGYVAGVVPSLYRQGAGCGACFQVRCKNKRFCSTAGTKVVATDQNYDNRYDFVLSKIA
        L SS+AA CDRC+H SK AY+   + +  GAC YG +A     G++A  +PS+Y+ G+GCGACFQVRCKN   CS+ GT V+ TD N  N+ D VLS  A
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Query:  YSAMA--LKNKTKELLNLGTVDVEYKRIPCTYKNKNLMVRVEEWSQKPYYLALKLVYQGGQTEIKGIEIAEVGSDNWESMKRNYGAIWDTNKVLEGALQL
        + AMA  +    ++LL  G VD+EY+R+PC Y NK + VRVEE S+ P YLA+KL+YQGGQTE+  I IA+VGS +W  M R++GA+W T+KV  GALQ 
Subjt:  YSAMA--LKNKTKELLNLGTVDVEYKRIPCTYKNKNLMVRVEEWSQKPYYLALKLVYQGGQTEIKGIEIAEVGSDNWESMKRNYGAIWDTNKVLEGALQL

Query:  KIVVASRYNNENIYWATYDLPDDWKNGEMYDTGVQIDDIVNEKCPPKQCGDLPW
        + VV + Y+ + + W+   LP +W+ G+ YD GVQI DI  E C P  C D  W
Subjt:  KIVVASRYNNENIYWATYDLPDDWKNGEMYDTGVQIDDIVNEKCPPKQCGDLPW


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCAACATGGGGCGTGTGGATATGGCCCTTTGGCATTTGAATTGTCCAATGGGTATGTCGCTGGCGTTGTGCCTTCCCTTTATAGACAAGGAGCTGGATGTGGCGCCTGTT
TCCAGGTAAGGTGCAAGAACAAGAGATTTTGTAGCACTGCTGGAACTAAAGTGGTTGCTACCGATCAAAACTACGATAACCGATATGATTTTGTTCTTAGTAAGATAGCG
TACTCCGCAATGGCTTTAAAGAATAAGACGAAAGAACTTTTGAATCTTGGAACAGTCGACGTGGAATATAAGAGGATACCTTGCACGTACAAAAACAAGAATTTGATGGT
ACGAGTAGAGGAATGGAGCCAAAAGCCATACTACTTGGCACTTAAGTTGGTATACCAAGGTGGGCAGACAGAAATAAAGGGCATAGAAATAGCTGAGGTTGGCTCTGATA
ATTGGGAATCCATGAAGAGAAACTATGGTGCCATTTGGGATACCAACAAGGTTCTTGAGGGAGCATTGCAGTTGAAAATAGTTGTAGCTTCAAGGTACAACAATGAGAAC
ATATATTGGGCAACCTACGACCTTCCCGATGATTGGAAGAATGGAGAGATGTACGATACTGGAGTTCAAATCGATGATATTGTCAACGAAAAATGTCCACCAAAGCAATG
TGGTGATTTGCCATGGAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACTCTCATCGAAAAACAATGGCTTTTTATGTCGGTCTTCTCTTCTTTCTCGTCTCTTCCGCCGCTGCTACTTGTGATCGTTGTGTTCATCAATCCAAAACTGCTTATTA
CTACGATGATACACCTATTCAACATGGGGCGTGTGGATATGGCCCTTTGGCATTTGAATTGTCCAATGGGTATGTCGCTGGCGTTGTGCCTTCCCTTTATAGACAAGGAG
CTGGATGTGGCGCCTGTTTCCAGGTAAGGTGCAAGAACAAGAGATTTTGTAGCACTGCTGGAACTAAAGTGGTTGCTACCGATCAAAACTACGATAACCGATATGATTTT
GTTCTTAGTAAGATAGCGTACTCCGCAATGGCTTTAAAGAATAAGACGAAAGAACTTTTGAATCTTGGAACAGTCGACGTGGAATATAAGAGGATACCTTGCACGTACAA
AAACAAGAATTTGATGGTACGAGTAGAGGAATGGAGCCAAAAGCCATACTACTTGGCACTTAAGTTGGTATACCAAGGTGGGCAGACAGAAATAAAGGGCATAGAAATAG
CTGAGGTTGGCTCTGATAATTGGGAATCCATGAAGAGAAACTATGGTGCCATTTGGGATACCAACAAGGTTCTTGAGGGAGCATTGCAGTTGAAAATAGTTGTAGCTTCA
AGGTACAACAATGAGAACATATATTGGGCAACCTACGACCTTCCCGATGATTGGAAGAATGGAGAGATGTACGATACTGGAGTTCAAATCGATGATATTGTCAACGAAAA
ATGTCCACCAAAGCAATGTGGTGATTTGCCATGGAAGTAATGCCCAAACGTTATTGGTTCCATATAGTACTCGTGATTTAGTTCCTCCTTACAATGTATCCAATAACTTT
ATGAACTCATTAGAGTTCCATTATCAAATAAAATGATACAATACTTAAAATTATTATTATAATATAATGTTTATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAFYVGLLFFLVSSAAATCDRCVHQSKTAYYYDDTPIQHGACGYGPLAFELSNGYVAGVVPSLYRQGAGCGACFQVRCKNKRFCSTAGTKVVATDQNYDNRYDFVLSKIA
YSAMALKNKTKELLNLGTVDVEYKRIPCTYKNKNLMVRVEEWSQKPYYLALKLVYQGGQTEIKGIEIAEVGSDNWESMKRNYGAIWDTNKVLEGALQLKIVVASRYNNEN
IYWATYDLPDDWKNGEMYDTGVQIDDIVNEKCPPKQCGDLPWK