; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh19G008980 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh19G008980
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionfimbrin-5-like
Genome locationCmo_Chr19:8479461..8484254
RNA-Seq ExpressionCmoCh19G008980
SyntenyCmoCh19G008980
Gene Ontology termsGO:0051017 - actin filament bundle assembly (biological process)
GO:0051639 - actin filament network formation (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005884 - actin filament (cellular component)
GO:0032432 - actin filament bundle (cellular component)
GO:0051015 - actin filament binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001589 - Actinin-type actin-binding domain, conserved site
IPR001715 - Calponin homology domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR036872 - CH domain superfamily
IPR039959 - Fimbrin/Plastin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572252.1 Fimbrin-5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]0.0e+0099.56Show/hide
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A0A6J1HV69 fimbrin-5-like0.0e+0098.53Show/hide
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O50064 Fimbrin-21.6e-24366.41Show/hide
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        TL LNSAKAIGCTVVNIGTQD++E R HL+LG+ISQIIKIQ+LADLNL KTPQLVELV DSK+VEEL+ L PEK+LL+WMNF L+K  Y+K VTNFSSDV
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        KD EAY  LLN LAPE   PS L VK   ERA +VLE A+K+ C+RYLT KDIVEGSPNLNLAFVA IFQ RNGLS  T ++SF E + DD++ SREE+ 
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        FR WINS   + Y+NNVFED+R GW+LL+ LDKVSPG V WK ++KPPIK+PF+KVENCNQVVKLGK L FSLVN+AGNDIVQGNKKLILA+LWQLMR++
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        +LQLL+NLR HS    GKEITDADIL WAN KV+  G  ++M  F+DK+LS+GVFFLELLSSV+PR VNW++VT G TDE+KK+NATY+IS+ARKLGCS+
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        FLLPEDIIEVNQKM+L LTASIMYW+L Q    ++ +   D   G++ D ST  S
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Q7G188 Fimbrin-11.5e-26570.61Show/hide
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        MS +VGV+VSDPWLQSQFTQVELRTL S+++SV++Q+G+VT+EDLPP++AKLKA S  F EDEIK  L E   D   ++ FE +L+ YL+L ++A EKS 
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        L LNSAKA+GC+VVNIGTQDL E RPHL+LGLISQ+IKIQVLADLNL KTPQLVEL++DS +VEEL+ L PEKVLLKWMNFHLKK GY+K V+NFS+D+K
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        D +AYA+LLN LAPE   P+TL+ KDP ERA +VL  AE++ CKRYLT ++IVEGS  LNLAFVAQIF +RNGL+ D  K +FAEMMT+DVET R+ERC+
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        RLWINS+GI +YVNNVFEDVR+GW+LLEVLDKVSP SV WK A+KPPIKMPFRKVENCNQV+K+GK L FSLVNVAGNDIVQGNKKLIL  LWQLMRF M
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Q9FJ70 Fimbrin-32.9e-26168.93Show/hide
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        MS FVGV+VSDPWLQSQ TQVELR+L S+F+++++QSG+VT+EDLP V  K+K+ S  F E EIKE L     D    +++DFES+L+ YL+L+ +A +K
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        +G   K+SSSFLKA TTT  H IN+SEK S+V HIN +LG+DPFLK +LPLDP +NDL++L KDGVLL  KLIN+AVPGTIDERAINTK+VLNPWERNEN
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        HTL LNSAKA+GC+VVNIGTQDL E RPHL+LGLISQ+IKIQ+LADL+L K PQLVELV+D++++EE + L PEKVLLKWMNFHLKK GY+K V NFSSD
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        +KD +AYAYLLN LAPE   P+TLN +D  ERANMVLE AE++ CKRYLT ++IVEGS  LNLAFVAQIF +RNGLS D  + SFAEMMT+D++T R+ER
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        C+RLWINS+GI +YVNNVFEDVR+GW+LLEV+DKV PGSV WKQA+KPPIKMPFRKVENCNQVVK+GK++ FSLVNVAGNDIVQGNKKLIL FLWQLMR 
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        +FLLPEDI+EVNQKMILILTASIMYWSL QQ+  SE  + +  + S  ST T+   T +S  A
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         SK +SSFLK +TTT HHAINESEKASYV+H+N++L +DPFLK+YLP+DPATN  FDL KDGVLL  KLINVAVPGTIDERAINTKK LNPWERNEN TL
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        GLNSAKAIGCTVVNIGTQD+ E RP+L+LGLISQIIKIQ+LADLN  KTP L +LVDD+++ EEL+GLAPEKVLLKWMNFHLKKAGYEKQVTNFSSD+KD
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        GEAYAYLLNALAPE S    L  KDPTERA  VLE AEKL+CKRYL+PKDIV+GS NLNLAFVAQIFQ RNGL+ D SK SFAEMMTDDVETSREERCFR
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        LWINS+G ATYVNNVFED+R+GWVLLEVLDKVSPGSV WK A KPPIKMPF+KVENCN+V+K+GK+L FSLVNVAGNDIVQGNKKL+LAFLWQLMR++ML
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        QLLRNLRSHSQ   GKEITDADILNWAN KVK+ GRTSQ + F+DKNLS+G+FFLELLS+VEPRVVNW++VT GET+EDKKLNATYIISVARKLGCS+FL
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        LPEDIIEVNQKM+LIL ASIMYWSL QQ+         +  VS+ +T+   DG  +S+A +   L+++  +E
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Q9SJ84 Fimbrin-47.3e-27373.47Show/hide
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        MSS+VGVLVSDPWLQSQFTQVELRTLKS+F S +++ GRVTV+ LPPV+AKLK F+G F E+EIK  L E+  +  +E++FE++LRA+L +Q+R      
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         SK +SSFLK +TTTFHH+INESEKASYV+HINS+L ++P LK+YLP++P TN LFDL KDGVLL  KLIN+AVPGTIDERAINTKK LNPWER EN +L
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         LNSAKAIGCTVVNIGTQD+ E  PHL+LGLI QIIKIQ+LADLNL KTPQLVELV+++++VEEL+GLAPEK+LLKWMNFHLKKAGYEKQVTNFSSDVKD
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        GEAYAYLLNALAPE S   TL +KDP+ERA  VLE AEKL+CKR+L+PKDIVEGS NLNLAFVAQ+F  RNGLS ++ K  +S AEM+T+D ETSREERC
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        FR W+NS+G  TYV+NVFEDVR+GWVLLEVLDKVSPGSV WK A KPPIKMPF+KVENCNQV+K+GK+LNFSLVNVAG+DI+QGNKKL+LAFLWQLMR++
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        MLQ+L NLRSH Q   GK+IT+ADILNWAN KVKK+GRTSQ   FKDKNL+NG+FFLELLS+VEPRVVNW++V+KGET E+K LNATYIISVARKLGCS+
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        FLLPEDI+EVNQ+M+LIL ASIM WS LQQ  ++E    +D +VS  + E S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04750.1 Actin binding Calponin homology (CH) domain-containing protein5.2e-27473.47Show/hide
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         LNSAKAIGCTVVNIGTQD+ E  PHL+LGLI QIIKIQ+LADLNL KTPQLVELV+++++VEEL+GLAPEK+LLKWMNFHLKKAGYEKQVTNFSSDVKD
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        GEAYAYLLNALAPE S   TL +KDP+ERA  VLE AEKL+CKR+L+PKDIVEGS NLNLAFVAQ+F  RNGLS ++ K  +S AEM+T+D ETSREERC
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        MLQ+L NLRSH Q   GK+IT+ADILNWAN KVKK+GRTSQ   FKDKNL+NG+FFLELLS+VEPRVVNW++V+KGET E+K LNATYIISVARKLGCS+
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        FLLPEDI+EVNQ+M+LIL ASIM WS LQQ  ++E    +D +VS  + E S
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AT4G26700.1 fimbrin 11.0e-26670.61Show/hide
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        MS +VGV+VSDPWLQSQFTQVELRTL S+++SV++Q+G+VT+EDLPP++AKLKA S  F EDEIK  L E   D   ++ FE +L+ YL+L ++A EKS 
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        G  KNSSSFLKA TTT  H I +SEK  +V HIN +LG+DPFLK +LPLDP +N L++L KDGVLL  KLINVAVPGTIDERAINTK+VLNPWERNENHT
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        L LNSAKA+GC+VVNIGTQDL E RPHL+LGLISQ+IKIQVLADLNL KTPQLVEL++DS +VEEL+ L PEKVLLKWMNFHLKK GY+K V+NFS+D+K
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        D +AYA+LLN LAPE   P+TL+ KDP ERA +VL  AE++ CKRYLT ++IVEGS  LNLAFVAQIF +RNGL+ D  K +FAEMMT+DVET R+ERC+
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        RLWINS+GI +YVNNVFEDVR+GW+LLEVLDKVSP SV WK A+KPPIKMPFRKVENCNQV+K+GK L FSLVNVAGNDIVQGNKKLIL  LWQLMRF M
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        LQLL++LRS +    GKE+TDADIL+WAN KV+  GR  Q+E FKDK+LS+G+FFL LL +VEPRVVNW +VTKGETD++K+LNATYI+SVARKLGCS+F
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        LLPEDI+EVNQKMILILTASIMYWSL + + ES        + S  ST T+   T SS A
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AT4G26700.2 fimbrin 11.0e-26670.61Show/hide
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        MS +VGV+VSDPWLQSQFTQVELRTL S+++SV++Q+G+VT+EDLPP++AKLKA S  F EDEIK  L E   D   ++ FE +L+ YL+L ++A EKS 
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        G  KNSSSFLKA TTT  H I +SEK  +V HIN +LG+DPFLK +LPLDP +N L++L KDGVLL  KLINVAVPGTIDERAINTK+VLNPWERNENHT
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        L LNSAKA+GC+VVNIGTQDL E RPHL+LGLISQ+IKIQVLADLNL KTPQLVEL++DS +VEEL+ L PEKVLLKWMNFHLKK GY+K V+NFS+D+K
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        D +AYA+LLN LAPE   P+TL+ KDP ERA +VL  AE++ CKRYLT ++IVEGS  LNLAFVAQIF +RNGL+ D  K +FAEMMT+DVET R+ERC+
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        RLWINS+GI +YVNNVFEDVR+GW+LLEVLDKVSP SV WK A+KPPIKMPFRKVENCNQV+K+GK L FSLVNVAGNDIVQGNKKLIL  LWQLMRF M
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        LQLL++LRS +    GKE+TDADIL+WAN KV+  GR  Q+E FKDK+LS+G+FFL LL +VEPRVVNW +VTKGETD++K+LNATYI+SVARKLGCS+F
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        LLPEDI+EVNQKMILILTASIMYWSL + + ES        + S  ST T+   T SS A
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AT5G35700.1 fimbrin-like protein 25.5e-29275.74Show/hide
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        MSS+VGVLVSDPWLQSQFTQVELRTLKS+F+S ++Q GR TV DLPPV+ KLKAF+G   EDEIK  L ++  +  +E+DFE +LRA+L +QAR  EKSG
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         SK +SSFLK +TTT HHAINESEKASYV+H+N++L +DPFLK+YLP+DPATN  FDL KDGVLL  KLINVAVPGTIDERAINTKK LNPWERNEN TL
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Query:  GLNSAKAIGCTVVNIGTQDLVEARPHLLLGLISQIIKIQVLADLNLNKTPQLVELVDDSKEVEELIGLAPEKVLLKWMNFHLKKAGYEKQVTNFSSDVKD
        GLNSAKAIGCTVVNIGTQD+ E RP+L+LGLISQIIKIQ+LADLN  KTP L +LVDD+++ EEL+GLAPEKVLLKWMNFHLKKAGYEKQVTNFSSD+KD
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        GEAYAYLLNALAPE S    L  KDPTERA  VLE AEKL+CKRYL+PKDIV+GS NLNLAFVAQIFQ RNGL+ D SK SFAEMMTDDVETSREERCFR
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        QLLRNLRSHSQ   GKEITDADILNWAN KVK+ GRTSQ + F+DKNLS+G+FFLELLS+VEPRVVNW++VT GET+EDKKLNATYIISVARKLGCS+FL
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Query:  LPEDIIEVNQKMILILTASIMYWSLLQQAGESELLTMNDGNVSDASTETSMDGTGSSLAAQTCALAMEDTAE
        LPEDIIEVNQKM+LIL ASIMYWSL QQ+         +  VS+ +T+   DG  +S+A +   L+++  +E
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AT5G55400.1 Actin binding Calponin homology (CH) domain-containing protein2.0e-26268.93Show/hide
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        MS FVGV+VSDPWLQSQ TQVELR+L S+F+++++QSG+VT+EDLP V  K+K+ S  F E EIKE L     D    +++DFES+L+ YL+L+ +A +K
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Query:  SGES-KNSSSFLKAATTTFHHAINESEKASYVAHINSFLGEDPFLKNYLPLDPATNDLFDLAKDGVLLWYKLINVAVPGTIDERAINTKKVLNPWERNEN
        +G   K+SSSFLKA TTT  H IN+SEK S+V HIN +LG+DPFLK +LPLDP +NDL++L KDGVLL  KLIN+AVPGTIDERAINTK+VLNPWERNEN
Subjt:  SGES-KNSSSFLKAATTTFHHAINESEKASYVAHINSFLGEDPFLKNYLPLDPATNDLFDLAKDGVLLWYKLINVAVPGTIDERAINTKKVLNPWERNEN

Query:  HTLGLNSAKAIGCTVVNIGTQDLVEARPHLLLGLISQIIKIQVLADLNLNKTPQLVELVDDSKEVEELIGLAPEKVLLKWMNFHLKKAGYEKQVTNFSSD
        HTL LNSAKA+GC+VVNIGTQDL E RPHL+LGLISQ+IKIQ+LADL+L K PQLVELV+D++++EE + L PEKVLLKWMNFHLKK GY+K V NFSSD
Subjt:  HTLGLNSAKAIGCTVVNIGTQDLVEARPHLLLGLISQIIKIQVLADLNLNKTPQLVELVDDSKEVEELIGLAPEKVLLKWMNFHLKKAGYEKQVTNFSSD

Query:  VKDGEAYAYLLNALAPEFSGPSTLNVKDPTERANMVLEVAEKLECKRYLTPKDIVEGSPNLNLAFVAQIFQQRNGLSADTSKMSFAEMMTDDVETSREER
        +KD +AYAYLLN LAPE   P+TLN +D  ERANMVLE AE++ CKRYLT ++IVEGS  LNLAFVAQIF +RNGLS D  + SFAEMMT+D++T R+ER
Subjt:  VKDGEAYAYLLNALAPEFSGPSTLNVKDPTERANMVLEVAEKLECKRYLTPKDIVEGSPNLNLAFVAQIFQQRNGLSADTSKMSFAEMMTDDVETSREER

Query:  CFRLWINSIGIATYVNNVFEDVRHGWVLLEVLDKVSPGSVIWKQATKPPIKMPFRKVENCNQVVKLGKDLNFSLVNVAGNDIVQGNKKLILAFLWQLMRF
        C+RLWINS+GI +YVNNVFEDVR+GW+LLEV+DKV PGSV WKQA+KPPIKMPFRKVENCNQVVK+GK++ FSLVNVAGNDIVQGNKKLIL FLWQLMR 
Subjt:  CFRLWINSIGIATYVNNVFEDVRHGWVLLEVLDKVSPGSVIWKQATKPPIKMPFRKVENCNQVVKLGKDLNFSLVNVAGNDIVQGNKKLILAFLWQLMRF

Query:  SMLQLLRNLRSHSQGKEGKEITDADILNWANNKVKKAGRTSQMEGFKDKNLSNGVFFLELLSSVEPRVVNWAVVTKGETDEDKKLNATYIISVARKLGCS
         MLQLL++LRS ++   GK++TD++I++WAN KV+  GR SQ+E FKDK+LS+G+FFL+LL +VEPRVVNW +VTKGE+D++K+LNATYI+SVARKLGCS
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Query:  LFLLPEDIIEVNQKMILILTASIMYWSLLQQAGESELLTMNDGNVSDASTETSMDGTGSSLAA
        +FLLPEDI+EVNQKMILILTASIMYWSL QQ+  SE  + +  + S  ST T+   T +S  A
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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