CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh19G010280
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Microtubule-associated protein 6, putative
Genome location	Cmo_Chr19:9009305..9009994
RNA-Seq Expression	CmoCh19G010280
Synteny	CmoCh19G010280
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6572366.1 hypothetical protein SDJN03_29094, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.1e-120

97.39

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTD+KLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERE+VVKLDSAP+RSNPDDEAAGDR
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR

Query:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALF-DDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKV
        QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALF DDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRD SSEINGVCESVMKIVGEINDENTRG+KV
Subjt:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALF-DDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKV

Query:  NTERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
        NTERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
Subjt:  NTERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI

KAG7011977.1 hypothetical protein SDJN02_26885, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

1.9e-121

97.38

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTD+KLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERE+VVKLDSAP+RSNPDDEAAGDR
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR

Query:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN
        QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFM+LFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRD SSEINGVCESVMKIVGEINDENTRG+KVN
Subjt:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN

Query:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
        TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
Subjt:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI

XP_022952444.1 uncharacterized protein LOC111455131 [Cucurbita moschata]

7.0e-124

100

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR

Query:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN
        QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN
Subjt:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN

Query:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
        TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
Subjt:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI

XP_022969248.1 uncharacterized protein LOC111468305 [Cucurbita maxima]

1.7e-117

94.76

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYY D+KLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERE+VVKLDSAP+RSNPDDEAA DR
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR

Query:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN
        QFKKS S+SPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKG+QLKRD+SSEINGVCESVMKIV EINDENTRG+KVN
Subjt:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN

Query:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
        TERKRKS GKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
Subjt:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI

XP_023554607.1 uncharacterized protein LOC111811804 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.2e-121

97.38

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTD+KLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERE+VVKLDSAP+RSNPDDEAAGDR
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR

Query:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN
        QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKG+QLKRDRSSEINGVCESVMKIV EINDENTRGEKVN
Subjt:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN

Query:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
        TERKRKSGG+VETGSVSGTRTSPRLAKLI
Subjt:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0K3S4 Uncharacterized protein

4.2e-90

75.74

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVV-------KLDSAPRRSNPD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYY+D+K N+ER+DPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLR ERE+V        KLDSAP+RS+PD
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVV-------KLDSAPRRSNPD

Query:  DEAAGDRQFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLK--RDRSSEINGVCESVMKIVGEIND
          A   RQ KK++SV+PPPAP+A KRRR M LF +D+DD+G+ KEE GVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESK  QLK  +DRSSEINGV ESVMKIV EIN+
Subjt:  DEAAGDRQFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLK--RDRSSEINGVCESVMKIVGEIND

Query:  ENTRGEKVNTERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLA
        ENT+ +K N ERK K+GG VE+ SVSG+R+SPRLA
Subjt:  ENTRGEKVNTERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLA

A0A1S3C0M4 uncharacterized protein LOC103495510

3.2e-90

76.6

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVV-------KLDSAPRRSNPD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTD+KLN+ER+DPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLR ERE+V        KLDSAP+RS+PD
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVV-------KLDSAPRRSNPD

Query:  DEAAGDRQFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLK--RDRSSEINGVCESVMKIVGEIND
          A   RQ KK++SV+PPPAP+A KRRR M LF +D+DDVG+ KEE GVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESK +QLK  +DRSSEIN V ESVMKIV EIN+
Subjt:  DEAAGDRQFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLK--RDRSSEINGVCESVMKIVGEIND

Query:  ENTRGEKVNTERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLA
        ENT+ +++N E+K K+ GKVE+ SVSGTRTSPRLA
Subjt:  ENTRGEKVNTERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLA

A0A5A7SPW2 Uncharacterized protein

3.2e-90

76.6

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVV-------KLDSAPRRSNPD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTD+KLN+ER+DPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLR ERE+V        KLDSAP+RS+PD
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVV-------KLDSAPRRSNPD

Query:  DEAAGDRQFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLK--RDRSSEINGVCESVMKIVGEIND
          A   RQ KK++SV+PPPAP+A KRRR M LF +D+DDVG+ KEE GVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESK +QLK  +DRSSEIN V ESVMKIV EIN+
Subjt:  DEAAGDRQFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLK--RDRSSEINGVCESVMKIVGEIND

Query:  ENTRGEKVNTERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLA
        ENT+ +++N E+K K+ GKVE+ SVSGTRTSPRLA
Subjt:  ENTRGEKVNTERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLA

A0A6J1GLQ7 uncharacterized protein LOC111455131

3.4e-124

100

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR

Query:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN
        QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN
Subjt:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN

Query:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
        TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
Subjt:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI

A0A6J1I0F4 uncharacterized protein LOC111468305

8.0e-118

94.76

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYY D+KLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERE+VVKLDSAP+RSNPDDEAA DR
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR

Query:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN
        QFKKS S+SPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKG+QLKRD+SSEINGVCESVMKIV EINDENTRG+KVN
Subjt:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN

Query:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
        TERKRKS GKVETGSVSGTRTSPRLAKLI
Subjt:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAKLI

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G52270.1 unknown protein

5.9e-12

30.77

Show/hide

Query:  PGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDRQFKKSK
        P  FY + LPRPR++ + + N+ R+D P  VLDPLLSWA                                                       Q +KS 
Subjt:  PGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDRQFKKSK

Query:  SVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEI
            P AP+  KRRR++     DD+++G   E+ GVV  R+ +KL DDFDRVA ESK + ++ +   +I
Subjt:  SVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEI

AT4G28310.1 unknown protein

2.2e-43

47.14

Show/hide

Query:  VPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERER--VVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR
        + + P  FYG+ LPRPR++ + K N+ R+DPP  VLDPLLSWA +AHWSMGGL+F RLRLQGRIEGNV+KLRA+ E+   VKL+S              R
Subjt:  VPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERER--VVKLDSAPRRSNPDDEAAGDR

Query:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN
        + K+S S SPP AP+  KRRR++ L D DD++VG   E+ GVV  R+ +KL DDFDRVA ESK                    K+V E N ++ + E V 
Subjt:  QFKKSKSVSPPPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVN

Query:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAK
         +R  +    V+    S TR+SPRLAK
Subjt:  TERKRKSGGKVETGSVSGTRTSPRLAK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGTGGTTCCTCTCGGCCCCGGCAAGTTCTACGGCAGCAGCCTCCCTCGTCCACGCTATTACACCGATATCAAGCTCAACAACGAGCGTATTGATCCACCTACGCCGGT
CCTCGATCCGCTTCTCTCATGGGCAAACGAGGCTCATTGGTCTATGGGTGGCCTCAGCTTTAATCGCCTGAGGCTTCAAGGTCGAATCGAAGGTAATGTCCACAAACTTC
GAGCCGAGCGCGAGAGGGTTGTTAAGCTGGACTCTGCGCCAAGGAGATCTAACCCTGACGACGAAGCTGCGGGCGATCGCCAATTCAAGAAGTCGAAATCTGTATCTCCA
CCGCCGGCGCCGATGGCAGCAAAGAGACGGCGATTTATGGCTCTGTTTGACGACGACGATGATGATGTTGGCGTGTACAAGGAAGAGACTGGGGTTGTGAAGAGGAGGTT
GGTGAAGAAGCTGGGAGATGATTTTGATCGAGTGGCTGCAGAGAGTAAGGGAGATCAATTAAAGAGGGATAGAAGCTCGGAAATCAATGGGGTTTGTGAATCTGTAATGA
AGATCGTTGGAGAGATTAACGATGAAAATACAAGGGGGGAAAAGGTCAACACTGAAAGAAAACGGAAGAGTGGTGGAAAAGTGGAGACTGGTTCCGTTTCTGGGACAAGA
ACATCTCCCAGATTGGCTAAATTGATTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDIKLNNERIDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNVHKLRAERERVVKLDSAPRRSNPDDEAAGDRQFKKSKSVSP
PPAPMAAKRRRFMALFDDDDDDVGVYKEETGVVKRRLVKKLGDDFDRVAAESKGDQLKRDRSSEINGVCESVMKIVGEINDENTRGEKVNTERKRKSGGKVETGSVSGTR
TSPRLAKLI

CmoCh19G010280 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome