; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh19G010650 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh19G010650
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionSignaling peptide TAXIMIN 1
Genome locationCmo_Chr19:9229324..9230338
RNA-Seq ExpressionCmoCh19G010650
SyntenyCmoCh19G010650
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGH9 Uncharacterized protein9.2e-3496.1Show/hide
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A0A1S3BLY0 uncharacterized protein LOC1034912881.6e-3394.81Show/hide
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A0A6J1ER78 uncharacterized protein LOC1114370714.6e-3392.21Show/hide
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A0A6J1GJJ0 uncharacterized protein LOC1114548651.7e-35100Show/hide
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A0A6J1I283 uncharacterized protein LOC1114683583.7e-3597.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O82275 Signaling peptide TAXIMIN 12.4e-3185.71Show/hide
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Q1G309 Signaling peptide TAXIMIN 21.9e-2056.94Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20562.1 unknown protein1.4e-2156.94Show/hide
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AT2G31090.1 unknown protein1.7e-3285.71Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGTTGCGGAGATGGCGATTGTAGGCCGCTCGGCTTCTTGCTCGGCTTGCCTTTTGCTTTCCTTTCTCTCATCCTTTCCATCATCGGCGTAATCATCTGGATTGTGGG
ATTGACGCTTACTTGCATATGTCCTTGTTGTTTGTGCTTGACGGTGATAGTGGAGCTTGCGCTGGGGCTGATCAAAGCCCCAATTCATGTCATGGAGTGGTTCACTTCCC
AGATTCCTTGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AGATTCCTTGTTGATCGTTCATATTTCTCTAACAGGAAAGTTGGAGAAGTCTTATAGTATGTAATCACCTTGTTTGTGTAAAATTTGCATTTGATATGAATATGTAGCTC
TGTGATTCCCATCGCTGAGTGATTCAGATGGTCTTTTTATGATTTTTTGTTCTTAGCTTCACTGAATTAGGCTTCCATTGATTGTTTATTTCATCAATAATCAATATAGA
ATCGAAGTTTTCTCTTACATTATTTCTGAATGCAAATTTTATTTCAAAGAAGTTGGTTCTATGATTTGTGAGGCTGCTAGGATAGAAATTCTACATGCACATATTGTAGC
TTAAGGCTTCCCATCATCTCTCTCATGATCTTCCAGCCGCCAAAAGCCATCAGCGTCTTGTACCATTCCTTTGTTTTGGACACACCACCATGAGGCAGGCACCAAATACT
CATCCTTGAGAGCATCCAAAGATTTGTTCACAAGTGCTATGTCCCTTTTCACTTCTAACAAAAACCCACCTTCAATTCCCTGTGTTCCTGCCACCCCATGAAGATAAGCC
TCCAAAGAGTGCCAGCTCCTGAAACATCCAGGACTCTTCAAGTATTTCGATTTTAGTGTGTCGATTACCAGCTCGACTCCAACATCCACATAACCCAACAGTGGGTATTC
TGGTACCAAGTCCAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MCCGDGDCRPLGFLLGLPFAFLSLILSIIGVIIWIVGLTLTCICPCCLCLTVIVELALGLIKAPIHVMEWFTSQIPC